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对改变转录因子间距的自然插入和缺失的系统分析可识别耐受性和敏感的转录
基因表达的抽象调节需要在启动子和增强子上对序列特异性转录因子（TFS）的联合结合。先前的研究表明，TF结合位点之间间距的改变会影响启动子和增强子活性。然而，由于自然发生的插入和删除（Indels）导致的TF间距改变的重要性尚未系统地分析。为了解决这个问题，我们首先表征了通过ChIP-Seq（Chro-Matin免疫沉淀测序）确定的人类K562细胞中73 TF的全基因组间距关系。我们发现了协作因素之间放松的间距的主要模式，其中包括45个TFS专门与其结合伴侣展示了放松的间距。接下来，我们利用了遗传多样的小鼠菌株和人个体提供的数百万个indels来研究间距改变对TF结合和局部组蛋白乙酰化的影响。这些分析表明，与直接影响TF结合位点的遗传变异相比，通常可以容忍自然存在的插入的间距改变。为了实验验证这一预测，我们在巨噬细胞系中的六个内源基因组基因座上引入了PU.1和C/EBPβ结合位点之间的合成间距改变。在这些位置，PU.1和C/EBPβ的合作结合明显，可耐受的间距的变化范围从5 bp增加到> 30 bp的降低。总的来说，这些发现对理解增强子选择的机制以及对非编码遗传变异的解释具有影响。
多元化农业的共同环境和社会利益
Laura Vang Rasmussen Christa M. Kennedy，Gourez 25，David Gonthier Martyna Kotowska 38，Holger Kreft 39，Ramiro Llanque 40，Christian Levers Melo 44，Melo 44，Melo 43，Elissa M. Olympus 46 Sclicious 51，Snapp 51，William E. Snyder 53，56.57，Vogel Cassandra 48.58，Claire Cream 59
多元化农业的共同环境和社会利益
劳拉·冯·拉斯穆森（Laura Vang Rasmussen）克里斯塔·肯尼迪（Christa M. Kennedy）， Gonemez 25，David Gonthier 24，鲤鱼34，Yodit Gebede 35，Carmen 36，Sussanna Class 15：16,37， 23，西德尼·麦德森9，玫瑰贝里修女44，马丁44 44，梅洛43，heiber惩罚25 45，莎拉46，莎拉雷德里奇48，克里斯托夫·舍伯Vivian Valence 56.57，语音Cassandra 48.58，Claire Cream 59
法国陆军的美洲狮 - aha-helicopters-air
1970 年圣诞节前不久，来自斯堪的纳维亚半岛的冷空气席卷了法国。圣诞节那天，整个国家都处于寒冷状态，包括南部地区。格勒诺布尔的最低气温为 -27°C，汝拉地区的最低气温为 -40°C。 4天后，12月29日晚，1917年以来最严重的暴风雪使地中海北部地区陷入瘫痪。尽管积雪已经掩盖了整个罗讷河谷中部（蒙特利马尔降雪量达到 60 厘米），但太阳高速公路仍然开放，6,000 辆汽车被困在 53 公里的路段上。然后我们就接近灾难了。 12月30日上午，法国四分之三的地区被大雪覆盖，罗纳-阿尔卑斯大区、奥弗涅和下罗纳河谷与世界其他地区隔绝。德龙省或阿尔代什省的村庄和小村庄被隔离数周。有些被困在 4 至 6 米深的雪堆下，由高山猎人和直升机提供补给。
印度人类遗传学学会第48届年度会议和国际会议2024：促进稀有疾病研究社区中的合作印度人类遗传学学会第48届年度会议和国际会议2024：促进稀有疾病研究社区中的合作
由Frige的人类遗传学和古吉拉特邦生物技术研究中心共同组织的印度人类遗传学学会第48届年会和国际会议于2024年1月21日至24日在印度艾哈迈达巴德举行。今年的会议很特别，因为它拟人化了人类遗传学的核心宗旨：萨尔瓦·曼加拉姆·巴瓦图（Sarva Mangalam Bhavatu），这意味着所有人的和平，健康与繁荣。会议有700多名代表参加了会议，其中包括来自13个国家的130家学院和36个生物技术公司，他们讨论和审议了基本遗传学的进展以及转化性的培训，包括筛查，诊断，预防和新颖的治疗方法。有7000多种此类疾病，据估计，印度可能患有约7,000万病例，其中大多数情况仍未诊断，并且在其中约95％的情况下，没有批准的治疗方法。这些令人震惊的统计数据反映了受到罕见遗传疾病深深影响的患者，家庭和医疗保健兄弟会的繁重生活。涵盖了诸如光学基因组映射，端粒到telomere参考基因组的发展和泛基因组分析等新兴遗传技术的演示文稿，这些分析有助于人类基因组和疾病疾病的未产生隐藏复杂性。1埃文·艾希勒（Evan Eichler）通过使用基于牛津纳米孔的甲基化肛门来分享非分离事件背后的最新理解；约翰·伯恩（John Burn）对CAPP2试验的令人兴奋的结果，该试验证明了阿司匹林和抗性淀粉为林奇综合征2、3中的癌症化学预防剂； Stylianos Antonarkis讨论了致病变体的表型结构，与FoxI3相关的颅面微粒体的渗透性以及三体三体分析的杂质结构；乔里斯·韦尔特曼（Joris Veltman）阐述了关于从头变体在神经系统疾病和男性不育症4中的作用的二十年数据；以及有关全球出生缺陷负担的令人震惊的数据
提高基因组技术和临床意识会加速发现与疾病相关的串联重复序列
破译非编码基因组的调节功能是现代生物学的巨大挑战。模型物种长期以来一直处于生物发现和生物医学创新的最前沿，但是我们对顺式调节逻辑的了解仍然不完整（Manolio等人。2017）。许多重要的问题 - 主要：我们应该如何以组织特异性的方式变异蝇剂以改变其活性？哪些小鼠疾病基因的调节变体功能性？我们如何预测地编辑ge-Nome来有效指导实验？回答这些问题需要解释任何基因组变体的特定效应，包括对染色质状态，组蛋白修饰和转录因子（TFS）的结合的变化。在整个基因组变异范围内应对这一挑战需要从实验研究（例如CHIP-SEQ数据）中概括以了解调控代码，从而可以预测任何基因组变体的效果。这些影响必须在特定的文本中预测，包括发育阶段，细胞和组织类型以及药物治疗。模型生物的现有方法未达到这个目标。一种常见的方法是扫描具有位置重量矩阵的高度保守的结合位点。然而，这种主题的上下文信息有限，并且未能考虑经常描绘组蛋白标记或征用访问性的多个相互作用因素（Zhou and Troyanskaya 2015; Wagih等>2018）。2015; Avsec等。2021）。相反，基于序列的深度学习模型已成功地用于人类基因组学中，以从大规模测序数据中学习这种特定于文本的顺式调节代码，而无需使用手工设计的功能。特别是，这些模型中使用的许多连续的卷积层使它们可以学习相对复杂的主题，我们认为它们之间的相互作用（Lecun等人。这种灵活性，结合了允许这些模型的效率
HDAC1 和 PRC2 介导 SPI1/... 中的组合控制
转录调控是一个复杂的过程，涉及特定染色质环境中的一系列蛋白质活动。转录因子 (TF) 是此过程的主要贡献者，它们与伙伴、辅激活因子或表观遗传因子一起发挥作用，其中一些被称为先驱 TF，能够使染色质结构允许辅激活因子和表观遗传因子的作用。表观遗传景观在造血稳态和分化程序中起着重要作用；因此，有可能从染色质动力学构建一个完整的造血模型 ( 1 , 2 )。编码表观遗传修饰因子 (TET2、IDH1 / 2、DNMT3A 和 ASXL1) 的基因突变在急性髓系白血病 (AML) 患者中很常见，进一步表明这种类型的成分在驱动 AML 发展中起着重要作用。 TF SPI1 / PU.1 属于 E26 转化特异性 (ETS) 家族，是造血控制的主要贡献者，在髓系和 B 淋巴系的特化和分化中发挥积极作用 ( 3–5 )。SPI1 最初被描述为一种转录激活因子，被认为是一种先驱 TF，因为它能够结合或接近封闭的核小体构象，并使辅因子能够结合染色质 ( 6–9 )。例如，在巨噬细胞中，SPI1 通过结合封闭的染色质来激活其靶基因的转录，在那里它通过募集表观遗传修饰因子（如 CBP/P300 或 SWI/SNF 复合物）来驱逐核小体 ( 6 、 7 、 10 、 11 )。这一动作指示创建一个新的增强子，使组蛋白 3 的赖氨酸 4 (H3K4me1) 单甲基化，并在增强子位点募集额外的 TF (6,7)。SPI1 通过表观遗传调控控制转录激活的功能在 B 淋巴细胞和破骨细胞分化中也有描述 (12,13)。因此，除了与谱系决定辅因子协同控制基因表达方面发挥众所周知的作用外，SPI1 对转录活性的影响还与表观遗传调节因子协同介导。最近有报道称，SPI1 在正常造血、控制适当的中性粒细胞免疫反应 (14)、早期 T 细胞 (15,16) 和破骨细胞 (12) 中抑制转录。实现更好的
新闻稿 - 武装部队部
10月4日星期二上午，防空护卫舰“保罗骑士”号在模拟接近战区海空形势的环境中，成功发射了由法国、意大利和英国合作研制的“紫菀-30”防空导弹。因此，对高速空中威胁的消除是在拒止环境中进行的，因为骑士保罗号的火控雷达被故意干扰了。在第二阶段，10月4日星期二下午，仍在导弹威胁和拒止环境下部署航空母舰战斗群（GAN）的设想中，戴高乐号又成功发射一枚紫菀-15导弹，摧毁了空中目标。此次试射证明了航空母舰和防空护卫舰的技术和作战能力，依靠训练有素、高效的水兵以及对工具的熟练掌握和防空要求，确保在拒止环境中心地带实现海军陆战队防空。这些射击、准备、执行以及经验教训的分析都得益于军备总局 (DGA) 的支持。
严重而持久的神经性厌食症
基因表达可以使用CRISPR -CAS9系统激活或抑制。然而，缺乏无需使用外源转录调节蛋白的基因表达激活的剂量依赖性激活的工具。在这里，我们描述了化学表观遗传学修饰剂（CEMS），旨在通过募集内源性染色质激活机械的合并来激活靶基因的表达，从而消除了对外源转录激活器的需求。该系统有两个部分：与FK506结合蛋白（FKBP）复合的催化无活性CAS9（DCAS9）和由与细胞表观遗传机械相互作用的分子相关的FK506的CEM。我们表明，根据基因，CEM在目标内源性基因座的基因表达上调高达20倍或更多。我们还证明了对转录激活的剂量依赖性控制，跨多种基因的功能，CEM活性的可逆性以及我们在整个基因组中最佳一流CEM的特异性。真核基因组被组织并包装成不同程度的压实，这有助于基因表达的调节。蛋白质 - 蛋白质和蛋白质-DNA相互作用的网络调节基因表达的适当水平。对该法规网络的破坏驱动了许多人类疾病，包括癌症1、2。雕刻染色质景观的重要因素是翻译后组蛋白尾巴修饰。赖氨酸乙酰化是一种具有生物物理和间接蛋白质摄取效应的修饰。受这些研究的启发，我们试图开发一种能够作家（组蛋白乙酰转移酶（帽子）），橡皮擦（组蛋白脱乙酰基酶（HDACS））和读取器（例如，溴结构域和染色体域）的蛋白质家族均匀控制基因表达3，4。几个小组已经证明了募集外来染色质修饰机械的能力，以一种以基因特异性方式控制扩张水平的一种方式5 - 11。随着CAS9和DCAS9技术的重大进展，精确诱导表达变化的能力迅速发展。Liszczak及其同事的开创性工作证明了使用DCAS9系统结合染色质调节蛋白的抑制剂12募集内源性机械的能力。ANSARI及其同事的其他工作使用了可编程的DNA结合配体，并结合了溴结构域抑制剂来调节转录13。
强迫流离失所，心理健康和儿童发展
* Kienzler，Hannian Kienzler，Colenic Costas，Close，Irant，Mushfiq，Kiridk Muridahan。 。。 （握）。 ASA 2022（一个空心和田间天数。该研究已从BRAC大学（2019-028-ER）注册。我们还要感谢BRAC教育开发学院的Erum Marium和Sakila Yesmin，以及罗兴亚难民营的BRAC野外工作者，为整个项目提供了广泛的支持和协作。该项目获得了乐高基金会和门廊基金会的干预资金，并提供了开放社会基金会提供的研究和评估资金。†发展经济与可持续性中心（CDE）和澳大利亚莫纳什大学经济学系； J-pal。电子邮件：asadul.islam@monash.edu