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微生物生态学（C002774）
该课程是主计划生物学中生态集群的一部分。课程一般微生物学；真菌学，社区和系统生态学；生物学学士学位课程的疾病和原始学为本课程奠定了基础。该课程概述了微生物在不同生态系统和分子技术中的作用，以研究微生物多样性（理论和实践），生态系统功能和进化。问题：微生物发生了什么类型的环境，微生物如何相互相互作用以及与其他生物相互作用，微生物在哪种方式影响环境，我们如何在管理环境（土壤卫生，水净化）中使用微生物的特性，在农业或生物技术中。
微生物组工程
厌氧消化（AD）是将富含碳的生物量（包括木质纤维素废物）转化为能量（富含甲烷的沼气）和增值产品（例如生物肥料）的最先进的技术。富含甲烷的沼气可以通过称为生物甲基化的过程进一步升级为天然气质量。木质纤维素降解。木质纤维素是植物生物量的主要结构成分，但是由于其顽固性，这种天然物质的很大一部分被浪费了。该小组的特征是来自生物质富裕栖息地的微生物群落，目的是进一步使其用于工业应用的木质纤维素分解能力。土壤微生物组。土壤微生物组重生主要是细菌，古细菌，病毒，真菌，生物和其他小真核生物，例如硅藻。土壤微生物通过分解土壤有机物并转化重要的养分来确定农业生态系统的生产率，从而在碳和养分循环中起关键作用。此外，尽管它们在粮食安全和气候变化中的重要性，但大多数土壤微生物在很大程度上都没有表征。废水处理和去除污染物，重点是生物学过程（例如有氧颗粒状污泥反应器）或通过吸附或膜操作去除顽固化合物。
特刊 - 健康感染和微生物群...
眼表面微生物组由细菌，例如凝固酶阴性葡萄球菌和corynebacterium spp。以及病毒，真菌和有时原生动物组成。正常的微生物群在捍卫病原物种的增殖方面起保护性免疫学作用。正常眼表面微生物群的破坏可能在眼科疾病的发病机理中作为辅助因子起重要作用。可以通过几种环境影响和病理状态来改变眼表面菌群，包括干眼症综合征，隐形眼镜磨损，角膜假体，抗生素和感染。在此特殊问题上，我们想向读者介绍Ocular Incotions and Microbobiota Health and Microbobiota Health and Disesase的最新读者。，我们邀请专家对菌群和眼感染的基础研究，无论是基本的还是临床的。作者还可以提交评论文章，描述了微生物组和眼病之间关系的科学发现演变。
特刊 - 益生元，益生菌和肠道微生物组...
“微生物”将非常小的思想与不断发展的生物体的思想融合在一起，是微生物学学科的统一原理。Our journal recognizes the broadly diverse yet connected nature of microorganisms and provides an advanced publishing forum for original articles from scientists involved in high-quality basic and applied research on any prokaryotic or eukaryotic microorganism, and for research on the ecology, genomics and evolution of microbial communities as well as that exploring cultured microorganisms in the laboratory.
分子和医学微生物学，文学学士学位
微生物学是涉及细菌，酵母和其他真菌，藻类，原生动物和病毒的生物学分支。这些微生物本质上是普遍存在的，并且在农业，生物技术，生态学，医学和兽医科学等领域中起着至关重要的作用。微生物学领域有助于基本探究区域，例如生物化学，细胞生物学，进化，遗传学，分子生物学，发病机理和生理学。对微生物的同时遗传和生化分析的轻松和力量导致了分子生物学和分子遗传学的新学科的出现，并产生了新的生物技术产业。
特刊 - 微生物组影响的基因组分析...
我们很高兴地宣布一个有关“微生物组对人类疾病的影响”主题的特殊问题，该问题旨在为研究人员提供一个平台，以提出其在微生物组的基因组分析领域的最新发现和进步，及其对人类健康和疾病的深远影响。人类微生物组在维持人类健康中起着至关重要的作用，并且与各种疾病的发展有关。基因组分析技术的最新进步已彻底改变了我们研究微生物组与人类疾病之间复杂关系的能力。本期特刊将着重于基因组分析工具的应用，包括宏基因组学，元文字组学和元蛋白质组学，以揭示微生物组的遗传和功能多样性及其对人类健康和疾病的影响。我们期待您对这一特殊问题的宝贵贡献，并相信其页面中共享的集体知识将极大地有助于我们对微生物组的基因组分析及其对人类健康和疾病的影响。
通过诱导的极化监测土壤柱实验中的原位微生物生长和衰减
自然界中的微生物广泛参与许多地球化学过程，例如矿物风化（Doetterl等，2018）和有机污染物的生物降解（Kimak等，2019）。为了更好地理解这些过程，对微生物的密度进行定量很重要，由于营养的可用性，尤其是在生长和衰减阶段的情况下，这大大变化。特异性生长与细菌的衰减速率与养分之间的关系通常是使用最初由Monod（1941，1949）开发的动力学模型来建模的。在多孔培养基中获取微生物密度的传统方法基于原位采样（一种侵入性方法）和废水孔隙 - 水微生物分析。由于细菌倾向于附着在晶粒表面上，因此孔隙水微生物分析低估了细菌计数（Drake等，1998）。因此，开发一种可以非侵入性监测微生物密度的方法被认为是重要的。
在五个同胞欧洲草食动物的Sun，X。的粪便中的微生物群落组成；保姆，朱迪思； Ruytinx，Joske； Wassen，Martin J.；
fi g u r e 5在草食动物粪便中不同模式的真菌群落的功能表征。（a）在营养模式下相对丰度（> 1％）。（b）公会模式下预测的功能分布的组成； （c）在公会模式下对应于功能组的家庭层面上特定主要的真菌分类单元的相对丰度（第一级标题是真菌物种及其所在的类别；次级标题是与真菌相对应的官能团）。不同的字母表示在p <.05级别（n = 6）的显着差异;表S14列出了真菌公会模式下的比较统计结果；表S15列出了确切的p值。
特刊 - 肠道微生物群在农场动物健康中的作用
肠道或胃肠道由一个复杂的微生物网络组成。这些微生物统称为肠道微生物群，已被确定为在动物健康中起重要作用，影响了代谢，行为以及动物的整体生理健康和表现。因此，本期特刊的目的是收集科学文章，以强调微生物组数据的使用和重要性，以促进我们对复杂生物系统的理解，例如免疫系统，营养，繁殖，疾病弹性和效率。此问题欢迎跨学科的原始研究和审查肠道菌群解决方案在动物健康中的应用。这可能关注肠道菌群与动物健康之间的关系，尤其是与特定疾病状况和动物生命阶段有关的健康。我们特别欢迎研究涵盖其他微生物群（即更多的整体/整个微生物群），而不仅仅是细菌种群。欢迎对所有农场动物进行研究。
脂肪因子和细菌代谢产物：连接肥胖和肠道菌群营养不良的关键分子桥与靶标
摘要：脂肪因子是脂肪组织产生的必需介质，并发挥多种生物学功能。特别是脂联素，瘦素，抵抗素，IL-6，MCP-1和PAI-1在脂肪组织与其他参与代谢，免疫和血管健康的器官之间的串扰中发挥了特定的作用。在肥胖症期间，脂肪因子失衡发生并导致低度促进症状状态，促进与胰岛素抵抗相关的糖尿病及其血管并发症。肥胖与肠道菌群营养不良之间的因果关系已证明。The deregulation of gut bacteria communities characterizing this dysbiosis influences the synthesis of bacterial substances including lipopolysaccharides and specific metabolites, generated via the degradation of dietary components, such as short-chain fatty acids, trimethylamine metabolized into trimethylamine-oxide in the liver and indole derivatives.新兴证据表明，这些细菌代谢物调节脂肪因子生产和作用涉及的信号通路。本综述总结了肠道细菌衍生的代谢产物与肥胖中脂肪因子失衡之间的分子联系的当前知识，并强调了它们在与氧化应激，炎性，炎症，胰岛素抵抗和血管疾病有关的关键病理机制中的作用。鉴于脂肪因子和细菌代谢物之间的这种相互作用，该评论强调了它们的相关性（i）是伴有临床生物标志物，以更好地探索肥胖和肠道菌群中的代谢，炎症和血管并发症和肠道微生物群体疾病的疾病，以及（ii）的目标，以实现新的抗毒性和抗抗Antipy Antipy Antipy Antiply Antipleant和（II）。