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Curaçao的暮光区中与海绵相关的微生物
位于海洋“暮光区”中的抽象中性礁是珊瑚礁，存在于相对深的水域，范围从表面以下约30至150 m不等。这些礁石位于常规水肺潜水的范围之外，通常使用先进的潜水技术或借助潜水员进行探索。在本研究中，我们使用了可属于11种物种的26个海绵样品的最先进的潜水器。高（HMA）或低（LMA）微生物丰度状态根据TEM图像分配给物种。与这些海绵相关的原核生物群落还使用高通量测序进行了评估。蛋白杆菌，叶绿素，放线杆菌和酸杆菌是最丰富的门。HMA/LMA状态被证明是原核生物组成的高度重要预测指标。HMA海绵在丰富度和均匀性方面也比LMA海绵更加多样化。使用基于机器学习的探索技术鉴定了14个预测类，包括门内的类（例如，dehalocococococoidia和JG30-KF-CM66）和酸眼杆菌（Thermoanaerobaculia and superobaculia and Subgroups 11和21））。先前的研究表明，浅水和最近的深海中HMA/LMA二分法的流行。我们的结果证明了它在中间的领域的普遍性。
微生物多个染色体区域的定向诱变
定向进化可以有效地改造蛋白质、生物合成途径和细胞功能。传统的基于质粒的方法通常对一个或偶尔多个感兴趣的基因进行诱变，需要耗时的人工干预，并且进行诱变的基因在其原生基因组背景之外。其他方法不加选择地诱变整个基因组，这可能会扭曲结果。最近的重组工程和基于 CRISPR 的技术通过允许在其原生基因组背景下的多个预定位点上实现极高的突变率，从根本上改变了这一领域。在这篇综述中，我们重点介绍了最近的技术，这些技术可能允许在这些目标序列的原生基因组背景下在多个基因组位点上加速可调诱变。这些技术将通过四个主要标准进行比较，包括诱变规模、对多种微生物物种的可移植性、脱靶诱变和成本效益。最后，我们讨论这些技术进步如何为基础研究和生物技术开辟新的途径。
1海绵共生：微生物成为...
这些方法允许估计海绵生理特征（泵送，呼吸和进食）原位和实验室中。孵化室：估计孵化水中养分和氧气浓度变化速率的间接方法。可以估计的生产率或去除率。IN-EX方法：通过同时对海绵Holobiont吸入和呼出的水来估计感兴趣化合物的摄入/排泄速率的直接方法。应用IN-EX方法应用的一个示例是VACUSIP设备。dfs：是一种染料技术，可以直接估算海绵处理的水量。
亚马逊雨林中受威胁的土壤微生物
放大测序的靶向测序方法分析特定基因和/或区域的遗传变异。微生物群落及其分布模式的功能特征功能性状（代谢潜力）。功能冗余的独立分类单元共存，能够执行相同的功能。全球变暖电位（GWP）累积辐射强迫在特定时间范围内由于指定温室气体的单位质量相对于二氧化碳（CO 2）而产生的。甲烷（CH 4）的GWP 100 of 28。将富含钙和镁的材料施加到土壤中，作为酸性土壤中的基础反应，以中和它们的酸度并启用植物发育。元基因组组装基因组（MAGS）草稿或从元基因组数据中回收的完整基因组。甲烷呼吸（有机物降解）的甲烷发生形式，该形式产生气体甲烷作为最终产物。甲烷剂的微生物能够产生甲烷。大多数是厌氧古细菌，它使用二氧化碳和氢，乙酸和/或甲基化化合物作为主要底物产生甲烷。甲烷营养的微生物能够氧化甲烷。大多数是有氧细菌，它们使用甲烷作为其唯一的碳和能量来源。微生物核心功能可以由几种微生物执行的常见微生物功能（有关更多信息，请参见[7]）。OMICS是指在不同级别上的生物系统研究，包括基因（“基因组学”），转录本（“转录组学”），蛋白质（“蛋白质组学”）和代谢产物（“代谢组学”）。生物多样性的系统发育多样性量度，结合了物种之间的系统发育差异。给定样品中所有抗生素耐药基因的抗抗性集。二级森林森林至少被清除一次。在亚马逊中，二级森林通常是由于放弃森林砍伐地区而产生的。shot弹枪元基因组测序从给定样品中的生物体进行直接DNA测序。土壤结构是指土壤颗粒和相关孔的排列。病毒素在给定样本中的整个病毒社区。
作物残留物燃烧：土壤微生物的后果
作物残留物是植物营养素的良好来源，并且是农业生态系统稳定性的重要组成部分。从土壤中失去碳的损失将导致微生物活性降低，影响土壤养分循环潜力，土壤排毒能力和其他土壤功能。在作物残留物中保留了约25％的N和P，谷物摄取的50％和75％的K摄取，使其可行的营养来源（Gupta等，2004）。在燃烧期间，大约90％的N和S和15-20％的P和K含有。在印度西北地区燃烧2300万吨大米残留物，每年损失约920万吨的C同等含量（CO 2-相当于约3400万吨），每年损失约1.4×10 5 t N（相当于200亿卢比）（Naas，2017年）。
PDF 293.01 K-微生物和传染病
背景：食用动物尤其是家禽中抗生素耐药的微生物的存在在全球范围内引起了极大的关注。目的：这项研究是为了检测和表征来自尼日利亚埃基蒂州Ado Ekiti的肉鸡，层和Noilers鸡肉的肠杆菌科的质粒和轮廓。方法：总共收集了93个直肠样品，并使用标准微生物技术进行了分离和鉴定。使用DNA测序分析鉴定了细菌分离株。使用Oxoid单盘多粘蛋白B，庆大霉素，Fosfomycin，硝基氟氨基素，Meropenem和Tigecycline进行抗生素敏感性测试。质粒谱和质粒固化，以确定分子量和抗性途径是否质粒。结果：总共7种细菌分离株，包括肉鸡的Br1（pseudomonas monteilii）和Br7（Escherichia Coli）。cl29（Shigella flexneri）Cl33（proteus mirabilis）和Cl33W（proteus mirabilis）从层中分离出来，并从Ado Ekiti中的Noiler中分离出CN 3和CN14（Cn14和CN14）（CN 3和CN14（CN14），它们对MeropeNem具有抵抗力。从质粒分析分析中，揭示了所有分离均具有质粒。 质粒大小的范围约为8000-10000bp，抗性主要是质粒介导的。从质粒分析分析中，揭示了所有分离均具有质粒。质粒大小的范围约为8000-10000bp，抗性主要是质粒介导的。结论：这项研究的结果证明了抗生素耐药性及其在Poultries中的用途令人震惊，质粒与抗生素耐药性的关系需要在发展中国家（尤其是在家禽农场）对抗生素使用的适当监视。
微生物在鸟类化学签名和抗菌保护中的作用
共生微生物已被证明可以与它们的宿主共存，并在各种动物分类单元中共存，并实质上影响宿主生理，行为，健身和健康。在鸟类中，在Preen腺和羽毛上发现的细菌群落知之甚少。preen油被发现含有有机化合物（VOC）和抗菌化合物，可有助于宿主的抗菌防御，并可以在交流过程中充当化学信号。假设PREEN腺微生物组可以合成这些化合物，但是，关于Preen Gland微生物组是否涉及VOC和抗菌化合物的产生，知识有限。我们将执行微生物组移植实验，在其中我们将从自由生活供体物种中收集preen腺和羽毛微生物组，并将这些微生物组移植到圈养的Java麻雀（Lonchura oryzivora）上。我们的目标是：1。测试preen腺微生物组是否确定preen油的抗菌和VOC曲线2。确定preen腺，羽毛，口服和肠道微生物组之间的相互作用3。Investigate how the preen gland and feather microbiomes affect feather quality and preening behaviour Methods: - Experiments in captivity - Fieldwork - Preparation and application of microbiome inocula - Behavioural observations and analyses (preening behaviour) - Feather quality analysis in vitro (damage of feather microstructures, feather brightness, feather degradability) - Data analysis in R
利用植物和土壤微生物净化室内空气
植物修复是植物及其根部微生物去除空气和水中污染物的过程。这些净化特性是在太空居住实验中发现的：20 世纪 80 年代，约翰·C·斯坦尼斯航天中心的科学家揭示了室内植物从密封室中去除挥发性有机化学物质 (VOC) 的能力。进一步的研究，包括建造一个专用设施 Biohome，带来了科学突破，并有助于了解如何最大限度地发挥室内植物净化空气的能力。实验表明，由于植物叶子和根部微生物的共同作用（通过代谢、转移和/或蒸腾），室内植物能够去除封闭系统中不断释放的 VOC。
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