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文章探讨了青光眼中的眼表面微生物组和撕裂蛋白质组
摘要：尽管青光眼是全球不可逆性失明的主要原因，但其发病机理尚不完全理解，而眼内压（IOP）是靶向这种疾病的唯一可修改的危险因素。已经提出了包括IOP在内的肠道微生物组和青光眼之间的几个关联。越来越多的证据表明，在眼表面上的微生物之间的相互作用称为眼表面微生物组（OSM）和泪液蛋白质（统称为泪液蛋白质组），也可能在诸如青光眼等眼疾病中起作用。这项研究旨在在青光眼患者中找到OSM和撕裂蛋白的特征。32个结膜拭子的全元基因组shot弹枪测序鉴定出肌动杆菌，富公司和蛋白质细菌是同类中的主要门。该物种仅在健康对照中发现，与青光眼患者相比，它们的结膜微生物组可能富含磷脂酶途径的基因。尽管OSM在OSM中存在较小的差异，但与对照组相比，患者表现出与免疫系统相关的许多撕裂蛋白的富集。与OSM相反，这强调了蛋白质组的作用，并可能引起免疫过程在青光眼中的参与。这些发现可能有助于设计针对青光眼和其他相关疾病的新治疗方法。
运动员的微生物组：其特征和多样性
摘要。运动员的微生物组在研究人员中最感兴趣，因为结肠的微生物组成在养分的吸收，维生素的合成和宿主体内的免疫反应中起着关键作用。这篇综述的目的是研究高性能运动员中的肠道微生物群与低活动性生活方式的人之间的关系，以及这些变化对与运动员的身体表现和运动表现相关的微生物代谢产生的影响。总共分析了42篇研究论文，其中包括11项专业研究，研究了不同类型的强烈体育活动对肠道微生物组成的影响，以及19项研究的重点是个人细菌和身体性能的相关性。肠道微生物组成已被发现与运动表现有关，并且可能会提高性能和恢复。体育活动已被证明会增加α多样性和微生物代谢产物，例如短链脂肪酸。运动之间的α多样性没有显着差异。运动员的微生物组的特征是较高量的短链脂肪酸，这可以是运动过程中的能量底物。短链脂肪酸的产生与直肠菌群spp有关。，粪便核酸杆菌。运动员的微生物组也证明了Prevotella spp。的存在，在运动员中，这可能与表现相关。已经表明，运动员中的Veillonella antypica的存在与耐力正相关。尽管发现这一发现是矛盾的，但专门从事各种运动的运动员的运动成就和健康与诸如Akkermansia Municiphila，Faecalibacterium prausnitzii，Eubacterium cantale，Eubacterium thacterium contale，Roseburia hominis，faecalibacterium prausnitzii有关。此外，已经表明，肠道的微生物组成和酶之间存在联系，这被认为是与运动员健康相关的代谢产生的关键
基于微生物组调节肠道生态学和免疫系统的干预措施
肠道微生物组在环境与宿主之间的交集，能够改变对疾病相关的暴露和刺激的宿主反应。这在肠道微生物与免疫系统相互作用的方式中很明显，例如，通过调节免疫反应或影响免疫细胞群体及其介体的影响，支持早期的免疫成熟，影响药物效率。许多因素在日常生活中调节肠道生态系统动力学，我们才刚刚开始实现基于微生物组干预措施的治疗和预防潜力。这些方法的应用，目标和作用机制各不相同。有些人修改了整个社区，例如营养方法或粪便菌群移植，而另一些人，例如噬菌体疗法，益生菌和益生元，诸如靶标特异性类群或菌株。在这篇综述中，我们评估了基于微生物组的干预措施的实验证据，特别关注其临床相关性，生态效应和免疫系统的调节。
生物信息学和微生物组中的硕士论文
项目背景：微生物组在人类健康和疾病中起重要作用。下一代16S rRNA基因测序是一种强大的技术，用于表征粪便，诸如感染，癌症，糖尿病，神经退行性疾病和肥胖等疾病的样品中的细菌组成。微生物组分析有望有望诊断和整合常规临床微生物学。但是，16S测序数据所需的生物信息学分析的复杂性仍然是一个主要障碍。开发简化的管道来简化此分析对于常规诊断使用至关重要。目标：该项目的目的是通过一般微生物组组成输出来构建和验证16S rRNA基因测序分析的标准化生物信息学管道和工作流程。方法：Qiime2将与NextFlow结合使用，以创建标准化的16S rRNA测序工作流，用于微生物组分析。微生物组测序和常规诊断的分析数据将用于测试和验证工作流程。
在健康血管脂肪组织中的微生物组
RESULTS ........................................................................................................................................3
食品系统，微生物瘤和健康项目...
主角：Harry Sokol（Inserm/ap-HP），共同领导的Sylvie Claeysen（Inserm）合作伙伴：Celine Versuyft（Biobanques 2030），Yves-Edouard Herpe（BRC国家网络）（BRC国家网络），Christian Morabito（INRAE），AP-HP BARM BRC，INRAE SAMBO BRC SAMI，INRAEB BRC SAMBO SAMI的企业，来自目标
特刊 - 微生物组研究
“微生物”将非常小的思想与不断发展的生物体的思想融合在一起，是微生物学学科的统一原理。Our journal recognizes the broadly diverse yet connected nature of microorganisms and provides an advanced publishing forum for original articles from scientists involved in high-quality basic and applied research on any prokaryotic or eukaryotic microorganism, and for research on the ecology, genomics and evolution of microbial communities as well as that exploring cultured microorganisms in the laboratory.
肠道微生物组对慢性肾脏疾病患者尿毒毒素减少的影响：系统评价和网络荟萃分析
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