1。Delgado,L.F。,Andersson,A.F。评估生物组特异性基因目录的宏基因组装方法。微生物组10,72(2022)。2。Luis F. Delgado,Marco Vicari,Simon Kebede Merid,Gilbert Osena,Samah Abousharieha,Matthias Labrenz,Lasse Riemann,Jarone Pinhassi,Anders F. Anders F. Andersson。袋装闪光:一种基于网络的交互式工具,用于探索波罗的海微生物基因集。手稿。3。Luis F. Delgado,David J. Riedinger,VictorFernández-Juárez,Daniel P. R. Herlemann,Theodor Sperlea,Christian Pansch,Christian Pansch,Marija Katar都史,Marija Katar都Gyraitė,Detlef Schulz-Bull,Heike Benterbusch-Brockmöller,Susann Dupke,Holger Scholz,Sandra Kube,Sandra Kube,Lasse Riemann,Matthias Labrenz,Anders F. Andersson F. Andersson F.基于基于基于颤音的比较基因组的比较基因组将遗传性特征链接到遗传特征性。 手稿。 4。 Jurdzinski KT*,Mehrshad M*,Delgado LF,Deng Z,Bertilsson S,Andersson AF。 水生细菌的大规模系统基因组揭示了适应盐度的分子机制。 科学进步。 2023 5月26日; 9(21)。Luis F. Delgado,David J. Riedinger,VictorFernández-Juárez,Daniel P. R. Herlemann,Theodor Sperlea,Christian Pansch,Christian Pansch,Marija Katar都史,Marija Katar都Gyraitė,Detlef Schulz-Bull,Heike Benterbusch-Brockmöller,Susann Dupke,Holger Scholz,Sandra Kube,Sandra Kube,Lasse Riemann,Matthias Labrenz,Anders F. Andersson F. Andersson F.基于基于基于颤音的比较基因组的比较基因组将遗传性特征链接到遗传特征性。手稿。4。Jurdzinski KT*,Mehrshad M*,Delgado LF,Deng Z,Bertilsson S,Andersson AF。水生细菌的大规模系统基因组揭示了适应盐度的分子机制。科学进步。2023 5月26日; 9(21)。
活的多细胞生物,包括人类,通常不仅由单个物种的细胞组成,而是宿主细胞及其相关微生物组的复合物。值得注意的是,与人体相关的微生物细胞数量远远超过了人类细胞的数量,这一事实导致一些人提到人类“超生物”。微生物组包含在给定生态位中发现的微生物的收集,以及其相关的遗传材料,代谢能力和环境影响。人类在人体的各个壁ches中都有独特的微生物组,其中肠道中至少已经认可了最大的二十年。在本文中,我们将主要关注这个人类的肠道微生物组,其中研究的爆炸表明该特定微生物组与不仅胃肠道系统的功能的变化以及其他机器人和/或系统或病理状态的变化。然而,基于这些关联的功能信息,它们的方向性及其对健康和疾病的影响仍然相对稀疏。对于与人类受试者直接相关的信息尤其如此,在该信息中,个体之间的微生物组的复杂性和多样性也使研究具有挑战性。具体来说,仍然需要了解每个人的“微生物指纹”的特定组成部分的特定组成部分,并共同行动,以及如何操纵人类微生物组以治疗和预病毒疾病,改善健康状况,改善健康,甚至缓慢衰老。
人类健康与疾病之间的微妙界限可能由宿主和微生物因素之间的相互作用所驱动。这种“宏基因组”调节癌症的发生、发展和对治疗的反应。除了不同微生物物种调节化疗药物药效学的能力外,上皮屏障与其微生物生态系统之间的共生关系对局部和远端免疫系统有重大影响,显著影响癌症患者的临床结果。使用抗生素可以降低免疫检查点抗体的癌症免疫疗法的疗效,而特定肠道微生物的存在可以观察到更好的疗效。精准医疗的未来策略可能会依赖于新的诊断和治疗工具,以识别和纠正影响治疗效果的微生物群缺陷。C
对肠道菌群的研究强调了某些细菌菌株的重要性,特别是坚硬的菌株和细菌植物。失调与肥胖的变化有关,在体重指数增加(BMI)的个体中,经常观察到Firmicutes to-bacteroidetes比率升高。值得注意的细菌种类,包括akkermansia粘菌,粪便核酸杆菌和双歧杆菌,已成为肥胖相关的代谢危险的潜在减轻剂。相反,诸如梭状芽胞杆菌和大肠杆菌的精选成员之类的菌株与促炎性状态和肥胖性增强相关。
图5在胃肠道中产生的微生物代谢产物具有多种功能。GI微生物组可以调节可能影响人类健康的人体内(微生物 - 微生物)和kInter-Kingdom(微生物宿主)相互作用。细菌参与了法定人数的感应,可以释放细菌素,过氧化氢和乳酸,这些氢在肠道微生物组和病原体上产生效率。In addition, bacteria can produce gamma-aminobutyric acid (GABA), tryptophan metabolites, histamine, polyamines, serpins, lactocepin, vitamins, short chain fatty acids (SCFA), long chain fatty acids (LCFA), and outer membrane vesicles (OMVs), which can have efects on the human host epithelium, immune细胞,间充质和肠神经元
大多数关于人类微生物组的初步研究主要集中在细菌群落上。鉴于真菌是泛质的,并且与人体共生,研究人员现在正在积极研究霉菌组在人类健康和疾病中的作用。测序技术的最新进步使真菌的社区概况得到了分析;但是,与宏基因组测序分析相关的复杂性突出了参考材料的需求。为了解决这个问题,ATCC开发了基因组和全细胞真菌模拟社区标准,其中包括10种不同的和临床相关的真菌。
人类肠道微生物组是一个复杂的微生物社区,对人类健康和疾病产生了深远的影响。杀菌剂和公司构成了正常人肠道菌群的大多数。这些微生物对我们的生理功能产生了相当大的影响,从而影响了我们的福祉和对疾病的易感性。在过去十年中,对肠道微生物组的兴趣激增非常出色。一旦被忽视,胃肠道的微生物群在维持最佳健康方面的重要性就获得了认可。食品行业已经利用了这一点,并用“益生菌”和“发酵”产品淹没了市场。本文旨在对当前有关肠道微生物组的文献进行批判性综述及其在人类健康中的重要性,特别关注饮食选择,尤其是垃圾食品对肠道微生物群的组成和功能的影响。微生物具有显着的能力,可以使养分从其他不可消化的物质中解脱出来。食用健康食品和喜欢垃圾食品的人的肠道微生物组差异很大。健康饮食可促进多样化和有益的肠道微生物组,而垃圾食品消耗通常会导致微生物组不那么多样化,对健康造成了负面影响。