数千年来,人类一直享受着微生物在发酵食品和饮料中提供的新口味、更长的保质期和营养价值。最近的发酵测序调查已经绘制了跨空间、时间和生产实践的微生物多样性模式。但对发酵食品微生物组如何组装的机制理解直到最近才开始出现。以三种食物(表面成熟的奶酪、酸面团发酵剂和发酵蔬菜)为例,我们使用生态和进化框架来确定微生物群落在发酵过程中的组装方式。通过将原位测序调查与体外模型相结合,我们开始了解扩散、选择、多样化和漂移如何产生发酵食品群落的多样性。大多数食品生产商并不知道他们的生产环境中正在发生的生态过程,但生态学和进化的理论和模型可以为管理从农场到发酵的发酵食品微生物组提供新方法。
在共生中与宿主共存的多种微生物,形成人类微生物组(1)。微生物组在控制宿主生理的各个方面(包括免疫系统开发,调节和维持稳态)方面起着重要作用(2)。另一方面,由抗生素使用,饮食变化引起的菌群改变。(3,4,5)。由于微生物组营养不良而引起的对环境过敏原反应发展的机制非常复杂。在本节中,我们审查并简化了与微生物组与免疫系统相互作用有关的重要当前知识和关键概念。之后,我们将简要描述过敏性疾病中的微生物组中断。
抽象支气管扩张以支气管扩张,复发性感染和明显的发病率为特征,这是微生物失调和免疫失调之间的复杂相互作用的基础。鉴定不同的内表型已经完善了我们对其发病机理的理解,包括影响治疗和预后反应的异质疾病机制。下一代测序(NGS)已彻底改变了我们观看气道微生物学的方式,从而可以深入了解“难以培养”。通过靶向扩增子测序和/或shot弹枪元基因组理解支气管扩张微生物组,它提供了有关微生物组相互作用和宿主免疫的关键信息,这是疾病进展的主要特征。现在,支气管扩张的转化和临床研究的快速增加为应用精确医学的应用提供了范围,并更好地理解了旨在恢复微生物平衡和/或调节免疫反应的干预措施的功效。这些见解的整体整体整合正在推动我们对支气管扩张的理解中不断发展的范式转移,其中包括微生物组的关键作用及其与临床,炎症,免疫和代谢因素的独特相互作用。在这里,我们回顾了当前的感染状态和支气管扩张中的微生物组,并就该领域的未来方向提供了观点。
1,格拉纳达大学药学与医学院生理学系,18071年,西班牙格拉纳达; lourdesherrera@ugr.es(L.H.-Q.); Hectorvazquez@ugr.es(H.V.-L。)2 Granada的健康科学技术公园生物医学研究中心,18016年,西班牙格拉纳达,西班牙3个生物医学集团(BIO277),物理治疗系,健康科学系,格拉纳达大学,格拉纳达大学,18171年,格拉纳达,格拉纳达,西班牙,西班牙; Maloga@ugr.es 4通过体育活动研究小组(Profith),体育与健康大学研究所(IMUDS),格拉纳达大学,18016年,西班牙格拉纳达,促进健身和健康; acortesmartin@ugr.es 5 APC Microbiome Ireland, School of Microbiology, University College Cork, T12 YT20 Cork, Ireland 6 Department of Biochemistry and Molecular Biology II, School of Pharmacy, University of Granada, Campus de Cartuja s/n, 18071 Granada, Spain 7 Instituto de Investigaci ó n Biosanitaria IBS.GRANADA, Complejo Hospitalario de Granada,18014年格拉纳达,西班牙8个儿童医院,安大略省东部研究所,渥太华,加拿大K1H 8L1,加拿大K1H 8L1 *通信:jrplaza@ugr.es;电话。: +34-958241000(Ext。41599)†这些作者对这项工作也同样贡献。
“微生物”将非常小的思想与不断发展的生物体的思想融合在一起,是微生物学学科的统一原理。Our journal recognizes the broadly diverse yet connected nature of microorganisms and provides an advanced publishing forum for original articles from scientists involved in high-quality basic and applied research on any prokaryotic or eukaryotic microorganism, and for research on the ecology, genomics and evolution of microbial communities as well as that exploring cultured microorganisms in the laboratory.
虽然有广泛的信息有关肠道菌群如何改变正常人与糖尿病个体之间的组成,但几乎没有证据表明在糖尿病前期发生的变化是否显而易见(T2DM的初步状态对T2DM的变化,这些变化与这些变化相对于正常的eugglycemempiations and themiabiaia而在e -euglycemempiation中的特征),以及与正常的链接有关)以及 糖尿病。在这篇综述中,我们的目标是总结肠道微生物组中的组成转移的所有发现,这些发现与尤金血糖状态相比,这些发现显示在糖尿病前和糖尿病的个体中发生。我们的综述还强调了由于肠道中存在不同微生物环境而导致的新陈代谢改变的潜在病理生理机制。此外,我们还收集了有关各种因素所起的作用的可用证据,例如饮食变化和运动,以及它们在诱导肠道微生物组变化中的潜在作用。最后但并非最不重要的一点是,我们的审查还评估了随后的益生菌和共生,二甲双胍和acarbose带来的微生物群的变化。此外,我们还评估了上述干预措施在减轻糖尿病前期糖尿病的进展中的使用。我们认为,这项综述可以帮助了解肠道微生物组在糖尿病前期发作的动态作用,以及是否有可能通过正确的措施恢复到尤格利西亚。
心血管疾病(CVD),包括冠状动脉疾病,中风,心力衰竭和高血压,是全球主要的死亡原因,占全球死亡人数的30%以上。尽管已经了解了CVD的危险因素,并且已经建立了各种治疗方法和预防措施,但由于生活方式的变化以及现代一代的预期增加,CVD的死亡率和CVD的财务负担预计会随着时间的推移而成倍增长。宏基因组学和代谢组学分析的最新进展已确定肠道微生物组及其相关代谢物是CVD的潜在危险因素,这表明有可能开发针对CVD的更有效的新型治疗策略。此外,越来越多的证据表明,企业与细菌植物的比率发生了变化以及微生物依赖性代谢产物的失衡,包括短链脂肪酸和三甲胺N氧化物,在CVD的病原体中起着至关重要的作用。然而,到目前为止,确切的作用机理仍未确定。在这篇综述中,我们关注肠道微生物组的组成变化和
