自2012年完成以来,人类微生物组项目(HMP)已提供有关人体中广泛特征的微生物群落(共同称为人类微生物组)的参考数据。这些微生物群落居住在身体的各个部位,包括口腔,肠道,皮肤,阴道以及最近,可能是胎盘(人类微生物组计划2012,Aagaard等2014,Kim 2015)。 当前的研究表明,存在“正常”的人类微生物组,并且对“正常”微生物组(称为营养不良)的改变与慢性疾病有关(Kim 2015)。 人类肠道微生物组的改变与包括肥胖症在内的多种疾病的发病机理有关(Gomez-Arango等人。2014,Kim 2015)。当前的研究表明,存在“正常”的人类微生物组,并且对“正常”微生物组(称为营养不良)的改变与慢性疾病有关(Kim 2015)。人类肠道微生物组的改变与包括肥胖症在内的多种疾病的发病机理有关(Gomez-Arango等人。2016)和2型糖尿病(T2DM)(Barlow等人2015),这是本综述的重点。
使用特殊配方的缓冲液MB1和裂解矩阵E与MP BioMedicals的FastPrep®仪器结合使用,可以在几秒钟内实现各种样品的有效裂解。在套件中提供的列MB和套件缓冲液旨在提供高产量和纯度的GDNA,并与QPCR,限制消化和测序等下游应用兼容。
1 ryan M.J.*,2 Schloter,M.,3 Berg,G.,4 Kostic,T.,5 Kinkel,L.L.,6 Eversole,K.,7 Macklin,J.A. N.,R.S. 15 McClure,16 Charles,T.C.,17 De Souza,R.S.C.,Seghal 18。K.G.,3 Krug,H.L,3 Taffner,L.,12 Roume,H.,19 Selvin,J.,1 Smith,D.,3 Rybakova,D。K.G.,3 Krug,H.L,3 Taffner,L.,12 Roume,H.,19 Selvin,J.,1 Smith,D.,3 Rybakova,D。
靶向微生物组的疗法的进步,包括益生菌,益生元和粪便微生物移植,为骨科护理提供了令人兴奋的可能性。益生菌,在发酵食品中发现的生物有益微生物,例如酸奶,开菲尔,酸菜,泡菜,泡菜和奶酪,有助于维持健康的肠道微生物组。益生元和富含纤维的食物,例如洋葱,大蒜和全谷物,滋养这些细菌,以支持其生长和活性。,这些疗法共同调节肠道健康,促进免疫弹性,降低感染风险并加速愈合 - 骨科结局的关键因素[1,2]。肠道微生物组是微生物的多样化生态系统,在维持整体健康方面起着关键作用[3]。超越消化,它会影响免疫调节,炎症控制和肌肉骨骼健康[4]。肠道健康显着影响骨科结局,包括感染控制,骨骼愈合和维持骨密度。这个生态系统中的不平衡,称为营养不良,可以损害恢复并增加感染风险[5]。通过饮食修饰,益生菌或益生元来支持肠道健康有可能提高患者预后[6]。
摘要:肠道微生物组及其功能的重要性直到最近才得到更深入的认识和研究。人类肠道微生物组的建立始于子宫,在生命的第2-3年中形成了其成人表型。几个因素会影响和改变肠道微生物组组成及其代谢功能,例如母乳喂养的早期发作,分娩方式,抗生素给药或暴露于化学物质等。现有数据支持健康状况与肠道微生物组稳态之间的重要联系。在这种平衡受到干扰的情况下,可能会出现几种疾病,例如导致应场,湿疹或过敏性哮喘的炎症反应。所谓的肠脑轴是指中枢神经系统与胃肠道系统之间的复杂生化途径。正在进行的研究中最迷人的领域之一是广泛的神经发育障碍(NDDS)以及肠道健康如何与此类疾病有关。近年来,NDD的患病率(例如自闭症谱系障碍或注意力疾病)有所增加。肠道菌群稳态是否在这些疾病中起作用,尚未完全了解。本叙事评论的目的是提供有关肠道健康如何与这些疾病联系在一起的当前知识。我们进行了文献综述,以识别和合成可用的数据,从而在组成和适当的功能方面突出了NDD与平衡的肠道微生物组之间的潜在关联。肠道微生物组和NDD之间的联系为未来的研究提供了有希望的新机会。
摘要:炎症性肠病(IBD)患者的管理旨在通过使用针对炎症性级联反应中各个点的免疫抑制治疗方法来控制炎症。但是,从长远来看,这些疗法的功效是有限的,并且通常与严重的副作用有关。尽管尚未完全了解该疾病的病理生理学,但IBD被认为是一种多因素疾病,由于遗传易感性个体的免疫反应不当而发生。肠道微生物组被认为是IBD发展中的主要参与者之一。肠道营养不良,其特征是肠道菌群的组成和功能发生重大变化,通常会导致细菌多样性和抗炎厌氧菌细菌的降低。同时,具有促炎潜能的细菌。尽管已经观察到微生物组组成对生物剂使用的变化,但它们作为生物标志物的作用仍不清楚。虽然大多数关于IBD的研究都集中在肠道细菌种群上,但最近的研究强调了其他微生物种群在肠道营养不良中的重要性,例如病毒和真菌。为了调节IBD患者的异常免疫反应,研究人员开发了针对肠道微生物组不同参与者的疗法。这些创新的方法对IBD治疗的未来有希望,尽管安全问题是主要局限性,因为它们对人类的影响仍然未知。
摘要和原理纳米框微生物组A颗粒利用与亲和力诱饵耦合的独特水凝胶聚合物来吸引,捕获和浓缩完整的病毒和类似病毒的颗粒在许多样本类型中的低丰度中。这些纳米颗粒捕获的微生物可用于下游RNA提取,纯化和分析。纳米图微生物组A颗粒与许多商业核酸提取试剂盒兼容,或者无需核酸提取试剂盒即可使用。
引言微生物组是人类生理学的关键组成部分,它可以在组织中的微生物(例如胃癌睾丸(GI)区域,皮肤和肺部)中产生微生物(Dethlefsen等,2007; Ley等,2006)。许多微生物与宿主有共同的关系,对于障碍物的适当发展和功能至关重要(B.Ackhed等,2005; Hooper和Macpherson,2010)。微生物组有助于健康状况和疾病,例如癌症,肥胖和炎症状况,并影响宿主对治疗干预的反应(Cryan和Dinan,2012; Gopalakrishnan et al。,2018a; Maeda and Tebeda; Maeda and theeda; Maeda and thea and takeda,2019; rajili’c-Stojanovi al al al al ant; et eet eT; Al。,2008)。这已经充分证明了癌症,其中微生物组会影响对免疫疗法,化学治疗,放射治疗和干细胞移植的反应(Abu-Sbeih等,2019; Chang等,2021b; 2021b; DeRosa et al。 Taur等人,2014年,Tonneau等人,2021年;由于微生物组是可修改的,并且与造成恶性肿瘤的遗传变化相比,可能更适合改变,因此可以操纵其改善癌症结局的潜力促使人们对不存在的微生物组(宿主相互作用,它们对肿瘤生长的影响)以及与癌症治疗的相互作用引起了兴趣。免疫疗法是几十年来癌症护理中最重要的进步,将免疫反应重定向以影响耐用的肿瘤控制。免疫检查点抑制剂(ICIS)目标负
摘要:龋齿和牙周病是全球最常见的疾病之一。其病因根源在于口腔内的微生物活动,通过产生有害代谢物并引发潜在的不良宿主免疫反应。由于抗菌素耐药性的威胁日益增加,需要采取替代方法来重新平衡这种平衡。测序技术的进步已经确立了疾病与口腔菌群失调之间的联系,商业企业正在寻求鉴定益生菌和益生元配方,以通过定植或促进有益微生物的生长来应对可预防的口腔疾病。常驻菌种的代谢特性和免疫调节能力是健康状况的基础。对口腔代谢环境的研究已经阐明了共生菌和致病菌之间的关系,例如,可发酵碳水化合物的连续代谢被认为是致龋性产酸的关键。因此,关注口腔环境的生态稳态维护可能是最合适的健康保护方法。在这篇评论中,我们讨论了维持健康口腔环境的生态方法,并讨论了益生菌和益生元补充剂的潜在用途,特别是针对维持口腔环境以保持微妙平衡的微生物群。
Rob Knight是微生物组创新中心的创始主任,以及加州大学圣地亚哥分校的儿科,生物工程和计算机科学与工程学教授。他是Rady Children's Microbiome Research的Wolfe家族椅子。他是美国科学发展协会和美国微生物学会的会员。他因其微生物组研究而获得2019年NIH导演先驱奖,并获得了2017年Massry奖,通常被认为是诺贝尔的预测指标。他是“遵循您的肠道:微生物的巨大影响”(Simon&Schuster,2015年)的作者,他的合着者是“污垢是好的:细菌的优势,对于孩子开发的免疫系统的优势”(St. Martin's Press,2017年,2017年),以及书面的700多种科学文章。他在2014年在TED上发言,这是超过200万次的。 他的实验室生产了许多软件工具和实验室技术,这些技术和实验室技术使高通量微生物组科学(包括Qiime Pipeline)(引用了30,000次,包括Qiime 2)和Unifrac(引用了超过10,000次,包括其网络界面)。 他是地球微生物组项目,美国肠道项目和公司Biota,Inc。的联合创始人,该公司使用了从次级表面的微生物中的DNA来指导油田的决策。 他的工作将微生物与包括肥胖症在内的一系列健康状况联系起来他在2014年在TED上发言,这是超过200万次的。他的实验室生产了许多软件工具和实验室技术,这些技术和实验室技术使高通量微生物组科学(包括Qiime Pipeline)(引用了30,000次,包括Qiime 2)和Unifrac(引用了超过10,000次,包括其网络界面)。他是地球微生物组项目,美国肠道项目和公司Biota,Inc。的联合创始人,该公司使用了从次级表面的微生物中的DNA来指导油田的决策。他的工作将微生物与包括肥胖症在内的一系列健康状况联系起来
