。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经Peer Review的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2023年1月23日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2023.01.23.525193 doi:Biorxiv Preprint
摘要 功能性宏基因组文库是一种物理细菌文库,可以高通量捕获和表达微生物组基因,在无需测序和不依赖培养的宏基因组探索中发挥了重要作用。然而,这些文库的制备往往受到其高 DNA 输入要求和低克隆效率的限制。在这里,我们描述了一种新方法,即镶嵌末端标记 (METa) 组装,用于高效的功能性宏基因组文库制备。我们将标记技术应用于来自土壤和肠道微生物组的宏基因组 DNA,以制备 DNA 插入物,从而高通量克隆到功能性宏基因组文库中。所得 DNA 片段中镶嵌末端序列的存在与基于同源性的组装克隆协同作用,使克隆效率与传统的基于平头克隆的协议相比提高了 300 倍。我们表明,与使用最新协议制备的已发表文库相比,METa 组装的效率平均高出约 20 到 200 倍,只需 200 ng 输入 DNA 即可制备千兆碱基大小的文库。我们首先通过使用标准 5 mg 质量的土壤宏基因组 DNA 制备出一个 700 Gb 的文库来展示 METa 组装的实用性,这使得我们发现了新的诺尔丝菌素抗性基因和一种潜在的新抗性模式;其次通过使用仅 300 ng 的鹅粪便宏基因组 DNA 制备出一个 27 Gb 的文库,该文库捕获了大量四环素和粘菌素抗性基因。METa 组装为制备功能性宏基因组文库提供了一种简化、灵活且有效的方法,为低生物量或稀缺微生物组的遗传和生化研究开辟了新途径。
和药物输送。23,24在这里我们建立了这些设计概念,并开发了针对PSMA的TMV,以增强药物递送焦油焦油前列腺癌。特定的cally,我们使用了TMV的T158K突变体,25,它在外表面上呈现2130个反应性赖氨酸残基,而内部通道内衬有4260个谷氨酸残基。这允许将外部赖氨酸残基的主要胺用于N-羟氧化二酰亚胺(NHS)介导的生物结合,而内部谷氨酸的羧酸酯基团可以通过1-乙基-3--(3-二氨基甲基氨基氨基氨基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基酸)来解决带电的腔体,用于构成带正电的分子货物的凹入。Using a two-step bio- conjugation protocol (installation of an azide by conjugation of an NHS reactive linker to the surface lysines, followed by conjugation of an alkyne-terminated targeting ligand using copper-free click chemistry), we conjugated and displayed ((( S )- 5-amino-1-carboxypentyl)carbamoyl)- L -glutamic acid (DUPA),一种与PSMA结合的小靶向配体。26用近红外urophore cy5共价标记TMV通道,以启用纳米颗粒的成像和跟踪,或用抗肿瘤剂Mitoxantrone(MTO)(一种II型拓扑酶酶抑制剂)加载。27我们使用PSMA +和PSMA前列腺癌细胞在体外测试了焦油的特定城市和药物递送的效率。
和药物输送。23,24在这里我们建立了这些设计概念,并开发了针对PSMA的TMV,以增强药物递送焦油焦油前列腺癌。特定的cally,我们使用了TMV的T158K突变体,25,它在外表面上呈现2130个反应性赖氨酸残基,而内部通道内衬有4260个谷氨酸残基。这允许将外部赖氨酸残基的主要胺用于N-羟氧化二酰亚胺(NHS)介导的生物结合,而内部谷氨酸的羧酸酯基团可以通过1-乙基-3--(3-二氨基甲基氨基氨基氨基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基酸)来解决带电的腔体,用于构成带正电的分子货物的凹入。Using a two-step bio- conjugation protocol (installation of an azide by conjugation of an NHS reactive linker to the surface lysines, followed by conjugation of an alkyne-terminated targeting ligand using copper-free click chemistry), we conjugated and displayed ((( S )- 5-amino-1-carboxypentyl)carbamoyl)- L -glutamic acid (DUPA),一种与PSMA结合的小靶向配体。26用近红外urophore cy5共价标记TMV通道,以启用纳米颗粒的成像和跟踪,或用抗肿瘤剂Mitoxantrone(MTO)(一种II型拓扑酶酶抑制剂)加载。27我们使用PSMA +和PSMA前列腺癌细胞在体外测试了焦油的特定城市和药物递送的效率。
摘要:苹果镶嵌病毒(APMV)的感染会严重损害苹果叶的细胞结构,从而导致叶叶绿素含量(LCC)降低和果实产量降低。在这项研究中,我们提出了一种新的方法,该方法利用高光谱成像(HSI)技术来无损地监测APMV感染的苹果叶子,并预测LCC作为疾病严重程度的定量指标。LCC数据是从360个APMV感染的叶片中收集的,并使用竞争性自适应重新加权采样算法选择最佳波长。基于增强和堆叠策略构建了高精度LCC倒置模型,其验证集R 2 V为0.9644,表现优于传统的集合学习模型。该模型用于反转LCC分布图像,并计算每个叶子的LCC变异(CV)的平均和系数。我们的发现表明LCC的平均和简历与疾病的严重程度高度相关,并且与敏感波长的结合使疾病严重程度的准确鉴定(验证集合集合= 98.89%)。我们的方法考虑了植物化学成分的作用,并在叶片尺度上对疾病严重程度进行了全面评估。总体而言,我们的研究提出了一种有效的方法来监测和评估苹果叶的健康状况,提供了可以帮助疾病严重程度的量化指数,可以帮助预防和控制疾病。
对传染病药物的疫苗接种是医学医学的最大成就之一;它的死亡率大大降低并导致人口增长。即使疫苗接种是高度有效的,严重的全身不良事件发生率很低,但许多报道也提出了一个问题,即疫苗是否会引起自身免疫疾病(表I)。这些报告的重点是神经系统表现(Guillain-Barre综合征,多发性硬化症,自闭症),关节表现(关节炎,类风湿关节炎)和其他自身免疫现象(全身性狼疮(全身性狼疮),糖尿病的糖尿病和各种液压均不及时[2均与2次组合,尽管已经据报道了狂犬病,小毒素,天花,腮腺炎,红宝石,
卵巢癌在女性的癌症死亡中排名第五,大多数患者被诊断出患有晚期和传播疾病。手术延迟和化学疗法消除了大部分肿瘤负担,并提供了短暂的缓解。但是,大多数患者经历了癌症复发,并最终屈服于该疾病。因此,迫切需要开发疫苗以促进抗肿瘤免疫力并防止其复发。在这里,我们开发了由辐照的癌细胞(ICC,提供抗原)和cow豆马赛克病毒(CPMV)佐剂组成的疫苗制剂。更具体地说,我们比较了ICC和CPMV的共同成型与混合物的疗效。具体而言,我们比较了ICC和CPMV通过天然CPMV –细胞相互作用或化学耦合与Pegypation CPMV和ICC的混合物键合的共配制,其中CPMV的脉络化会导致ICC相互作用。流式细胞仪和共聚焦成像提供了对疫苗组成的见解,并使用散布卵巢癌的小鼠模型测试了疫苗的组成及其功效。67%接受共同成型CPMV-ICC的小鼠在初始
卵巢癌在女性的癌症死亡中排名第五,大多数患者被诊断出患有晚期和传播疾病。手术延迟和化学疗法消除了大部分肿瘤负担,并提供了短暂的缓解。但是,大多数患者经历了癌症复发,并最终屈服于该疾病。因此,迫切需要开发疫苗以促进抗肿瘤免疫力并防止其复发。在这里,我们开发了由辐照的癌细胞(ICC,提供抗原)和cow豆马赛克病毒(CPMV)佐剂组成的疫苗制剂。更具体地说,我们比较了ICC和CPMV的共同成型与混合物的疗效。具体而言,我们比较了ICC和CPMV通过天然CPMV –细胞相互作用或化学耦合与Pegypation CPMV和ICC的混合物键合的共配制,其中CPMV的脉络化会导致ICC相互作用。流式细胞仪和共聚焦成像提供了对疫苗组成的见解,并使用散布卵巢癌的小鼠模型测试了疫苗的组成及其功效。67%接受共同成型CPMV-ICC的小鼠在初始
一名患有摩西特纳综合症的四岁女孩出现在日本东京的Jikei Katsushika医院,在那里她已经接受了GH疗法一年以提高自己的身高。她抱怨腹痛和恶心。在上腹部检测到一个明显的质量,超声检查显示8厘米的质量。因此,该患者被转诊到东京的吉基大学医院进行进一步评估。患者的病史很重要。由于身材矮小(-3.34 SD)在一个年龄和10个月时进行的细胞遗传学分析,确定了异常的核型,包括45,X 8/30细胞和47个细胞和47个细胞,XXX 22/30细胞,确认了摩西旋转综合征的诊断。她没有表现出翼状颈或幼崽外才的证据,这些颈部通常与特纳综合症有关。此外,在启动GH治疗之前进行的腹部超声检查表明,没有肾脏形态异常,例如马蹄形肾脏或肾上腺形态异常通常与该疾病有关。
多发性骨软骨瘤 (MO) 是一种罕见的常染色体显性骨骼疾病,其特征是多发性良性肿瘤(称为骨软骨瘤)的发展。该病主要由 EXT1 或 EXT2 基因的功能丧失变异引起,通过既定的诊断标准可以相对准确地进行临床诊断。尽管如此,在对两个基因的编码区进行测序和拷贝数分析后,仍有相当一部分 MO 病例(10% - 20%)未得到解决。在我们的研究中,我们在两例患者中发现了马赛克结构变异,这两名患者最初在 MO 的标准基因分析中得到了阴性结果。具体而言,检测到了影响 EXT1 基因中外显子 8 - 11 和外显子 2 - 11 的马赛克缺失。一例进行了 RNA 分析,两例均进行了基因组测序。迄今为止,仅报告了与 MO 相关的六种马赛克拷贝数变异,在两个基因的已知变异中占少数。我们的报告对这些发现进行了详细的分析,强调了先进的基因检测技术在检测 EXT1/2 基因中的嵌合变异方面的重要性。