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马赛克：一种基于人工智能的框架，用于稀有癌症中的多模式分析，分类和个性化预后评估
在这种情况下，建立有效的分类和预后系统将立即提供临床实用性，从而为改善临床决策过程提供稳定的基础。癌症中的常规分类/预后工具主要依赖于临床和组织病理学特征，这些特征是基因组特征补充的，以更好地捕获临床病理学性能并预测感兴趣的临床结果。7基因组促进在分类中的潜在影响和罕见癌症的临床管理在于三个关键方面：（1）能够将肿瘤定义为形态学上定义的肿瘤分类为形态上不同的基因组子组，并以不同的基因组疾病疾病的疾病疾病和不同的基因组进行分类，并且是生物疾病的基础，（3）识别（3）识别（2）forning-fying（2）（2）（2）and-fying（2）（2）。用于个性化治疗。尤其是，临床和基因组数据的联合使用可以使能够创建能够产生临床结局的人性化预测的预后模型。8
嵌合性染色体变异/体细胞拷贝数变异：复杂疾病遗传关联研究的新前沿
全基因组关联研究已发现许多与复杂疾病相关的常见和罕见种系遗传变异，包括单核苷酸多态性 (SNP)、拷贝数变异 (CNV) 和其他组成结构变异。然而，很大一部分疾病易感性仍无法解释，通常称为缺失遗传性。一个越来越受关注的领域是受精后出现的遗传变异，称为嵌合体突变，发生在细胞分裂过程中。携带有害突变的细胞可能通过修复机制、细胞凋亡或免疫监视被消除，而其他细胞可以将其突变传递给子细胞。因此，在早期胚胎发育过程中，每次细胞分裂都会保留一个或多个合子后突变。随着发育的进展，这些突变不断积累，导致细胞间基因组景观多样化。因此，大多数细胞最终携带独特的基因组。虽然许多嵌合体突变可能是中性的，但某些突变可能是致病的。嵌合体可发生在体细胞和生殖细胞中，体细胞嵌合体最近因其在神经遗传疾病中的潜在作用而受到关注。合子后突变涵盖所有主要的突变类型，包括染色体非整倍体、大规模结构异常、CNV、小插入/缺失和单核苷酸变异。其中，嵌合性染色体改变，也称为体细胞CNV（sCNV），通常是由于胚胎发生过程中的染色体不稳定性造成的。这些突变主要发生在合子后或胚胎发育早期，偶尔由合子后对减数分裂错误的部分挽救而引起，导致细胞亚群携带这些突变。值得注意的是，sCNV 在人类神经元中大量存在（1）。大脑主要从外胚层发育而来，而血细胞起源于中胚层。细胞比例高的体细胞突变更有可能发生在发育早期。如果这些突变出现得足够早，例如在原肠胚形成期间或之前，它们可能同时存在于脑细胞和血细胞中。随着个体年龄的增长，克隆性造血会导致血细胞中积累大量高细胞分数体细胞突变，而这些突变可能不存在于其他组织中。因此，分析年轻个体血液的基因组数据可以识别与大脑共有的体细胞突变，为了解脑部疾病的遗传易感性提供有价值的见解（图 1）。目前至少有 8 个实验平台可用于检测 sCNV。表 1 比较了这些分子检测的分辨率、优点和缺点。其中，
DNA损伤通过锥虫瘤的镶嵌变体表面糖蛋白（VSG）驱动抗原多样化。
图2。DNA双链破裂时，当同源性可用时触发镶嵌VSG形成a）沿Antat1.1转录本鉴定出的独特重组事件的直方图。Cas9 DNA断裂位点由垂直线表示。相对于VSG转录本的5'端的剪切位置为：243、369、694、894、978和1459。截面有色，以指示已确定的供体VSG。r表示与反向链结合的指南。绘制了ANTAT1.1与供体VSG之间的完美同源性的中点。如果镶嵌序列匹配> 1个潜在的供体VSG，则绘制平均重组位置。b）定量由DNA断裂引起的镶嵌重组事件。与从该区域的未经常规读数计数相比，该区域内检测到的250bp或下游中检测到的重组事件的数量被归一化，并具有最小的覆盖范围，以控制测序深度。（n = 2，两个独立的克隆）统计显着性是用带有事后Tukey HSD（** p <0.01）平均值的单向方差分析确定的。c）在ANTAT1.1内断裂后分离出的寄生虫克隆的镶嵌VSG示意图。显示的代表序列。d）在所有分离的镶嵌表达克隆中鉴定出的供体VSG插入长度的直方图。插入长度仅包括新插入的序列，不包括重组位点。e）atat1.1家族的示意图与antat1.1转录本排列。灰色序列与atat1.1的完美匹配。f）在每个重组位点，ANTAT1.1和供体VSG之间共享身份长度的直方图。g）量化Eatro1125和Lister427寄生虫的VSGNOM中VSG类型。lister427 vsgnome具有5个vsgs，可以完全复制，没有任何其他家庭成员。sl = 5'剪接领导者序列，14-mer = 3'序列在所有VSG转录本中保守
建立三克taqman定量实时PCR测定法，用于同时检测马赛克病毒，odontoglossum ringspot病毒和Cymbidium ringspot病毒
兰花是重要的观赏植物，其病毒感染会导致大量经济损害。Cymbidium Mosaic病毒（Cymmv），Odontoglossum Ringspot病毒（ORSV）和Cymbidium Ringspot病毒（CYMRSV）代表三种重要且普遍存在的兰花病毒。本研究中提出的检测系统使用三QMAN定量实时PCR测定法以同时方式识别CYMMV，ORSV和CYMRSV。我们为Cymmv，ORSV和CYMRSV设计了特定的引物和探针，分别为156 bp，148 bp和145 bp的放大序列。cymmv和cymrsv的三重QRT-PCR分析的最小检测极限为1拷贝/测定，最小检测极限为ORSV的10副本/测定。CYMMV，ORSV和CYMRSV的最小稳定检测极限分别为10、10 2和10 2拷贝/分析。因此，该系统比RT – PCR具有更高的灵敏度（约10至10 4倍）。CQ值的内部和跨间隙CV分别小于0.55和0.95％，这表明三重测定法是高度可靠且准确的。此外，使用已建立的测定和基因芯片分析了来自五个不同兰花属的66个样品。检测结果表明，与基因芯片相比，三重探针QRT-PCR具有更高的灵敏度，表明可以将三重实时PCR分析用于检测现场样品。我们的发现表明，三元实时RT – PCR检测系统代表了一种快速，简单，准确的工具，用于在兰花上检测Cymmv，ORSV和CYMRSV。
EDF 2021-项目摘要
MoSaiC——实时监控和采样 CB 威胁以改进威胁、漏洞和响应能力的动态映射 MoSaiC 项目将提供对 CBRN 事件的实时监控和创新采样技术，以增强威胁、漏洞和响应能力的动态映射。
开发和优化大麦条纹花叶病毒 (BSMV) 介导的基因编辑系统以提高小麦对镰刀菌赤霉病 (FHB) 的抗性
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 2 月 26 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.02.25.481987 doi：bioRxiv preprint
Nuage Therapeutics 任命生物技术企业家兼高管 Judit Anido 为首席执行官
Judit Anido 是一位医疗保健企业家和高管，在领导生物技术公司活动直至临床阶段方面拥有丰富的国际经验。她创立了 Mosaic Biomedicals 公司，并担任首席执行官领导该公司的发展，该公司专注于为癌症患者开发创新的个性化治疗方法。2016 年，在 Mosaic 与加拿大公司 Northern Biologics 合并后，Judit 担任 Northern 的运营和企业事务副总裁。Mosaic 开发的临床阶段药物 MSC-1 于 2020 年与该企业集团的临床前项目一起被收购。Judit 还是 CataloniaBio & HealthTech 的总裁兼首席执行官，该协会是加泰罗尼亚生物医药和健康领域领先公司的协会。
新的基因组技术
Promoter 35s from the cauliflower mosaic virus (CAMV P35S) Promoter 35s from the leper mosaic virus (FMV P35S) Promoter NOS NOS from Agrobacterium Tumefaciens (PNOS) Terminator nose from AGROBACTERIUM Tumefaciens (tnos) Hygroscopicus Gen Barnase from Bacillus Amyloliquefaciens Gen EPSPS from Agrobacterium Tumefaciens, Szczep CP4 Gen GOX with Ochrobactrum Anthropi Gen Pat from Streptomyces Viridochromogenes NPTII gene from Escherichia coli Gen Cry1AB/AC Construct Promoter 35s from the Cauliflower mosaic病毒/Gen PAT与链霉菌的病毒蛋白色，CAMV p35s/pat）构造CTP2-CP4 EPSPPNOS/NPTIA构建体CAMV
病毒-LMS -Apada印度尼西亚
•烟草摩西疾病阻碍烟草植物的生长，并给叶子带有镶嵌色彩•在1800年代后期，研究人员假设，小于细菌的粒子引起了该疾病•1935年，温德尔·斯坦利（Wendell Stanley）在1935年，温德尔·史丹利（Wendell Stanley）证实了这一假设，通过结晶的传染性粒子，现已闻名为tobacco Mosaic Mosaic Virus（TMV）
病毒编码的蛋白酶和Nidovirales中的蛋白水解加工
在宿主植物中传播病毒感染包括两个分离和顺序的阶段：从最初感染的细胞转移到相邻的邻近细胞中，这是一种称为局部或细胞间移动的过程，共同称为全身性运动的事件链，与进入血管组织，系统性地分散的系统性流入和无效的组织中，无效地分散了无效的组织。为了实现细胞间运输，病毒利用质量肿瘤，复杂的胞质桥构成了植物细胞。通过病毒代码蛋白，运动蛋白（MPS）的病毒传递通过质量化的质量传递，该蛋白（MPS）通过两种不同的机制起作用：MPS结合V- ral核酸的通过，并介导了所得运动复合物（M-complexes）在细胞之间的传播和MPS的一部分，或者通过构成孔的一部分渗透到宿主的一部分。颗粒。 在第一个机制中，M-复合物进入相邻的细胞，而不会破坏或不可逆地改变质量症，而在第二个机构中，plasmodesmata被管子替换或显着调节。 在这里，我们总结了有关病毒的局部和系统运动的当前知识，这些知识以非破坏性方式从细胞到细胞发展为M-复合物。 对于本地运动，我们主要关注30 K超家族病毒的运动功能，该病毒用结构同源地编码30 kDa Mosaic Mosaic病毒MP的MP，这是研究最广泛的植物病毒之一，而全身运动之一主要是针对两个良好的模型模型系统，tobaCco Mosaic Mosaic cirus andbocco tobus tobus tody tobacco tobacco tobus tody boty boty tobacco eTy。病毒传递通过质量化的质量传递，该蛋白（MPS）通过两种不同的机制起作用：MPS结合V- ral核酸的通过，并介导了所得运动复合物（M-complexes）在细胞之间的传播和MPS的一部分，或者通过构成孔的一部分渗透到宿主的一部分。颗粒。在第一个机制中，M-复合物进入相邻的细胞，而不会破坏或不可逆地改变质量症，而在第二个机构中，plasmodesmata被管子替换或显着调节。在这里，我们总结了有关病毒的局部和系统运动的当前知识，这些知识以非破坏性方式从细胞到细胞发展为M-复合物。对于本地运动，我们主要关注30 K超家族病毒的运动功能，该病毒用结构同源地编码30 kDa Mosaic Mosaic病毒MP的MP，这是研究最广泛的植物病毒之一，而全身运动之一主要是针对两个良好的模型模型系统，tobaCco Mosaic Mosaic cirus andbocco tobus tobus tody tobacco tobacco tobus tody boty boty tobacco eTy。因为局部和全身运动与宿主细胞的分子基础设施密切相关，