在开发高通量测序仪后,环境原核生物群落通常是通过在16S域上用遗传标记来描述的。然而,由于底漆的选择和读取长度,简短读取测序遇到了系统发育覆盖率和分类分辨率的局限性。在这些关键点上,纳米孔测序(一种适用于长读的元编码的上升技术)被低估了,因为其每读的错误率相对较高。在这里,我们比较了模拟社区中的原核生物群落结构和两个对比的红树林遗址的52个沉积物样本,由16SV4-V5标记上的短读描述(Ca。0.4kpb)通过Illumina测序分析(Miseq,v3),由长读细菌对细菌的描述几乎完整16s(Ca。1.5 kpb)由牛津纳米孔(Minion,R9.2)分析。短读和长阅读从模拟中检索了所有细菌属,尽管两者都显示出与所期待的比例相似的偏差。从沉积物样品中,具有覆盖范围的读数稀有性,在单例过滤后,共同恩赐和Procrustean测试表明,从短读和长长读取的细菌社区结构显着相似,表明位点之间的相当对比度和站点内相干的海岸方向是可比的。在我们的数据集中,分别将84.7和98.8%的短阅读分别分别分配给了相同的物种和属,而不是长阅读所检测到的物种和属。长期16的底漆特异性使其能够检测到309个家庭中的92.2%,而在短16SV4-V5检测到的448属中,有87.7%。长阅读记录了973个未检测到的额外分类单元,其中91.7%被确定为该属等级,其中一些属于11个独家门,尽管仅占长期读数的0.2%。
ALA 的使命是向那些通过不懈努力将年轻女性培养为具有爱国主义和美国精神的未来领导者而为我们带来自由的人致敬。在参加该计划时,她们将了解民主进步以及我们的政府形式在州和国家层面的运作方式。学生扮演政府领导人的角色,在模拟派对中竞选成为 ALA 女子州的市长以及县和州官员。该计划是一个为期一周的学习体验,在索尔兹伯里大学校园举行,女孩们住在宿舍式的“城市”中。完成高三学业的女高中生由 ALA 单位通过竞争性选拔和赞助。
采购期间的批准标准 – 我们创建了 7 步评估,以确保执行过程中的敏捷性:1.通过白皮书选择供应商并邀请他们进入第 2 步 2.口头和演示 3.技术交流 – 选择 3 家供应商授予奖项并邀请他们进入第 4 步 - 证明强化 4.基础设施和 CICD 管道 – 选择邀请 5.演示数据转换和模拟以人为本的设计/敏捷实施(吞吐量/速度)6.与政府确定的第 7 步最佳价值团队进行技术交流 7.确定最佳价值团队和技术解决方案环境;执行数据基础和 MVP 迭代以实现初始有限部署
水传播植物的致病真菌和卵菌是温室生产系统中的主要威胁。对这些病原体的早期检测和量化将使我们能够及时治疗所需的经济和生物阈值,从而改善有效的疾病管理。在这里,我们使用了牛津纳米孢子的扩增子来分析从用于生长番茄,黄瓜和Aeschynanthus sp的温室收集的灌溉水中的微生物群落。真菌和卵形群落的特征是使用放大整体内部转录垫片(ITS)区域的引物。为了评估小兵测序的灵敏度,我们将串行稀释的模拟DNA刺激到图书馆制备之前从温室水样品中分离的DNA中。真菌和卵骨读数的相对丰盛在温室灌溉水中和来自番茄番茄的设置中的水样中与众不同。在相应的连续稀释样品中衍生出的源自真菌和卵形模拟群落的序列读数是成比例的,因此确认了最小值扩增子测序对环境监测的适用性。通过使用尖峰标准来测试使用小兵测试定量的可靠性,我们发现样品中尖峰ins的检测受到了真菌或卵形DNA的背景量的高度影响。我们观察到,与较长的尖峰(> 790bp)相比,我们大多数稀释液的长度较短(538bp)的尖峰在我们的大部分稀释液中产生。此外,相对于稀释序列,序列读数不均匀,并且在具有最高DNA浓度的背景样品中最不可检索,这表明性能的动态范围狭窄。我们建议对小兵测序进行连续的基准测试,以改善未来快速植物性诊断和监测的定量元编码工作。
结果:相对于模拟治疗或单独使用辐射处理的细胞,在与辐射和ATR抑制剂联合处理后的72小时后,所有细胞系的细胞外释放均在所有细胞系中增加。HMGB1释放在很大程度上与质膜完整性的丧失相关,但并非严格相关,并通过添加caspase抑制剂而被抑制。然而,尽管caspase抑制了caspase,但在该细胞系caspase抑制诱导的PMLKL中,一条细胞系显示了HMGB1的释放,这是坏死性的标记。ATP分泌发生在共同治疗后的48小时内,显然与质膜完整性的丧失无关。添加pan-caspase抑制作用进一步增加了ATP分泌。在辐照后24-72小时时,钙网蛋白的表面呈递增加,但通过ATR或caspase抑制进一步增加。
与心理学 381G 相同。介绍行为和生物科学中的拨款申请书撰写以及拨款申请书撰写技巧的培养。主题包括:寻找拨款机会、规划提案活动、成功的拨款申请书撰写策略以及如何与拨款计划官员交谈。撰写拨款申请书(例如,向 NSF 或 NIH 等联邦机构提交的申请书)并根据同行和教师的反馈修改申请书。通过参加模拟评审会议,了解如何审查拨款申请书。一学期每周三个讲座小时。以下课程中只有一个可以计算:神经科学 381G、394P(主题:行为和生物科学中的拨款申请书撰写)、心理学 381G、394U(主题:行为和生物科学中的拨款申请书撰写)。先决条件:研究生身份和教师同意。
Geiger,Katherine。预测和观察到的补给源水与地下水和土壤/含水层物质的化学相互作用:亚利桑那州西盐河谷和东盐河谷的两个案例研究。HydroSystems 分析。............. Greenslade,William。亚利桑那州、犹他州和科罗拉多州补给 N 含水层系统的估算。西南地下水顾问。.............................................................. Hanson,Don。地下水补给及其对非点源硝酸盐污染的影响。Clear Creek Associates。.............................................................. Huber,Ronald。Fountain Hills 卫生区:从处置到补给,亚利桑那州 Fountain Hills 镇的长期解决方案。HydroSystems,Inc....................................................................................................................... Jimenez,Blanca。对废水补给含水层作为供水源的评估。墨西哥大学。............................................................................................. Katen,Matthew。案例研究:加利福尼亚州阿拉米达县的湖泊链项目。阿拉米达县防洪区。...................................................................... Lara,Fernando。墨西哥科阿韦拉州 Comarca Lagunera 含水层人工含水层补给可行性研究。国家水资源委员会。.................... Light,Marie。使用指示参数确定药物的存在
2022 年秋季 讲师:Gergely Ujhelyi 办公时间:预约。 电子邮件:gujhelyi@uh.edu 讲座:周二、周四下午 1-2.30 在 S 102。 本研究生课程介绍现代政治经济学领域。 我们将讨论旨在了解政治行为(例如投票、竞选和游说)的正式理论和实证工作,以及这些行为对经济政策和机构的影响。 反过来,我们将研究“制度”(例如公务员规则或竞选财务法规)如何影响政府行为。 本课程对专门研究公共经济学或发展经济学的学生特别有用,并将为任何对公共政策感兴趣的人提供宝贵的背景知识。 先决条件 一年级研究生微观经济学和计量经济学,或经讲师许可。作业和评分 将会有 2 组侧重于理论的问题(30%)、一份侧重于实证的论文陈述和一份模拟裁判报告(40%)以及一次期末考试(30%)。在陈述中,每位学生将报名展示下面标有 ** 的论文之一。模拟裁判报告可以用研究项目代替。这必须事先得到我的批准。 课程政策和各种要求 不接受迟交作业。任何缺席考试的行为都必须由医生证明或事先得到我的批准。 如果您认为您的考试存在评分错误(分数总和除外),您可以在收到评分试卷后一周内提交重新评分。以书面形式简要描述错误;然后我将重新评分整个考试(而不仅仅是单个问题)。 学生有责任熟悉并遵守大学的学术诚信政策(https://www.uh.edu/provost/policies-resources/honesty/)。教师有责任举报涉嫌学术不诚实的事件。我不愿意这样做,但我会毫不犹豫地这样做,所以请不要让我陷入这种境地。为了让我们在一起的时间尽可能愉快,并确保每个人都能从这门课中得到最大的收获,请遵守以下要求。