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神经科学家使用小鼠大脑图谱进行高效分析和透明报告的指南
脑图谱在神经科学中被广泛用作开展实验研究以及整合、分析和报告动物模型数据的资源。有各种各样的脑图谱可供选择，找到适合特定目的的最佳脑图谱并进行有效的基于脑图谱的数据分析可能具有挑战性。比较使用不同脑图谱报告的结果也并非易事，并且是可重复科学的障碍。通过这篇观点文章，我们提供了如何使用小鼠和大鼠脑图谱来分析和报告数据，符合 FAIR 原则，该原则提倡数据可查找、可访问、可互操作和可重复使用。我们首先介绍如何解释脑图谱并将其用于导航到大脑位置，然后讨论如何将它们用于不同的分析目的，包括空间配准和数据可视化。我们提供了有关神经科学家如何比较映射到不同脑图谱的数据并确保透明地报告结果的指导。最后，我们总结了选择图集时需要考虑的关键因素，并对基于图集的工具和工作流程对于 FAIR 数据共享的相关性进行了展望。
甜菜红素和甜菜黄素对小鼠巨噬细胞氧化应激和炎症反应的不同影响
范围：甜菜红素色素因其生物活性和抗炎特性而日益受到重视，尽管缺乏研究来证明单个甜菜红素的贡献。本文旨在比较四种主要甜菜红素对炎症和细胞保护标志物的影响，并强调两个主要亚类：甜菜红素和甜菜黄素之间潜在的结构相关关系。方法和结果：小鼠 RAW 264.7 巨噬细胞在与浓度为 1 至 100 µ M 的甜菜红素 (甜菜红素、新甜菜红素) 和甜菜黄素 (印度黄素、淡黄素 I) 孵育后，受到细菌脂多糖的刺激。所有甜菜红素均抑制促炎标志物 IL-6、IL-1 𝜷 、iNOS 和 COX-2 的表达，且甜菜红素的效果比甜菜黄素更强。相反，HO-1 和 gGCS 表现出混合且仅适度的诱导作用，而甜菜红素的效果更为突出。虽然所有甜菜红素都抑制了超氧化物生成酶 NADPH 氧化酶 2 (NOX-2) 的 mRNA 水平，但只有甜菜红素能够抵消过氧化氢诱导的活性氧 (ROS) 生成，这与它们的自由基清除潜力一致。此外，甜菜红素具有促氧化特性，使 ROS 生成量超过过氧化氢刺激。结论：总之，所有甜菜红素都表现出抗炎特性，尽管只有甜菜红素表现出自由基清除能力，这表明在氧化应激条件下可能存在不同的反应，这需要进一步研究。
卡博替尼可有效将载中性粒细胞的纳米颗粒靶向递送至小鼠前列腺肿瘤
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者，此版本于 2020 年 4 月 14 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.04.13.037531 doi：bioRxiv 预印本
内源性钙蛋白酶抑制剂calpastatin减弱了鼠鼠bar综合征的轴突变性
图1内源性HCAST表达可保护急性离体损伤模型中的轴突完整性。三角形（TS）的神经肌肉制剂（WT，n = 3）和Hcast（n = 3）小鼠用抗绞中AB（AGAB）在体内进行内部化研究（A，B），以及（损伤）或没有（对照）正常人（nHs）（nhs）的position（Corsem and Huspect）（CORCE）（CORCE）（cosect）（conterum and）（nhs），以供应（nhs），以供应（nhs），以供介绍。a）WT和Hcast TS运动神经末端（MNT）在37 C下孵育60分钟时，表面AGAB显着降低，而不是0分钟。（b）在用Triton X-100通透性后，在60分钟组中，MNT的总AGAB强度在两种基因型中都恢复正常，这表明AGAB内在化。（c）与对照相比，受伤的WT和Hcast TS的MNT的补体（绿色，E）强度显着增加。（d）神经丝（NF-H，洋红色，E）与对照相比，受伤的WT组织中MNT处的免疫染色强度显着降低，但受到Hcast受伤组织的对照水平的保护。（e）远端神经染色的说明性图像。btx（星号，橙色）和髓磷脂碱性蛋白（MBP，箭头，橙色）分别用于识别Ranvier（Nor）的Mnt和远端节点。虚线的大纲表示没有NF-H染色的位置。比例尺=5μm。 dotplots =平均±S.E.M.在比较治疗效果的数据上进行了未配对的一尾t检验（A，B＆C）； *表示p <.05。双向方差分析比较治疗（对照与损伤）或基因型（WT vs Hcast），然后对D.的数据进行了Tukey的事后多重比较测试。 * p <.05，***表示p <.001
表观遗传读取器 PHF21B 调节小鼠社会记忆和突触可塑性相关基因
简介 哺乳动物大脑中突触连接的形成是一个高度协调的过程，涉及通过各种整合的表观遗传调节器和转录因子精确控制基因表达。突触发育、功能和可塑性失调会导致神经回路缺陷，从而导致多种神经行为障碍 (1, 2)。突触功能障碍是神经发育障碍（如自闭症谱系障碍、智力障碍和精神分裂症）和神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）的共同特征 (2-4)。例如，NMDA 受体介导 (NMDAR 介导) 和 α -氨基-3-羟基-5-甲基-4-异恶唑丙酸受体介导 (AMPAR 介导) 的传递在自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病中受到不利影响。此外，编码突触后支架蛋白 SH3 和多个锚蛋白重复域 (SHANK) 家族成员的基因突变是自闭症和精神分裂症的风险因素 (1)。此外，患者队列的全外显子组测序和靶向候选基因测序以及家族谱系研究已发现与神经行为障碍相关的罕见变异和遗传风险因素 (2)。虽然这些研究有助于了解与突触失调有关的下游蛋白质，但关于上游调节因子和控制其表达的分子机制仍有许多未知之处。
表观遗传读取器 PHF21B 调节小鼠社会记忆和突触可塑性相关基因
简介 哺乳动物大脑中突触连接的形成是一个高度协调的过程，涉及通过各种整合的表观遗传调节器和转录因子精确控制基因表达。突触发育、功能和可塑性失调会导致神经回路缺陷，从而导致多种神经行为障碍 (1, 2)。突触功能障碍是神经发育障碍（如自闭症谱系障碍、智力障碍和精神分裂症）和神经退行性疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病）的共同特征 (2-4)。例如，NMDA 受体介导 (NMDAR 介导) 和 α -氨基-3-羟基-5-甲基-4-异恶唑丙酸受体介导 (AMPAR 介导) 的传递在自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病中受到不利影响。此外，编码突触后支架蛋白 SH3 和多个锚蛋白重复域 (SHANK) 家族成员的基因突变是自闭症和精神分裂症的风险因素 (1)。此外，患者队列的全外显子组测序和靶向候选基因测序以及家族谱系研究已发现与神经行为障碍相关的罕见变异和遗传风险因素 (2)。虽然这些研究有助于了解与突触失调有关的下游蛋白质，但关于上游调节因子和控制其表达的分子机制仍有许多未知之处。
利用 CRISPR/Cas9 在小鼠多能干细胞中进行快速、无整合的基因组编辑方法
CRISPR/Cas9 系统前所未有地革新了基因组编辑技术，该技术已成功应用于几乎所有生物科学分支。尽管在基因操作方面取得了很大成功，但大多数方法仍然费力且需要整合，并且需要长时间来扩增突变细胞库/克隆，而表现出功能性敲除效率的细胞较少。为了克服这些障碍，我们在此描述了一种高效、廉价、无整合且快速的一步式方案，用于小鼠多能干细胞 (PSC) 中的 CRISPR/Cas9 辅助基因敲除。我们的方案简化了基于脂质体的转染系统和筛选策略，使其能够更有效地处理少量 PSC（~2.0 × 10 4 个细胞），并最大限度地减少慢病毒包装、转导和单克隆传代等繁琐的步骤。在我们的方法中，约 90%（CI = 95%，79.5230% – 100%）的 PSC 菌落具有蛋白质表达方面的功能性敲除。因此，目前的方案在技术上可行、省时且高效，可用于多能干细胞中的基因组编辑。
直接移植天真的鼠Cas9+ T细胞的快速有效基因编辑
原代T细胞的基因编辑是一项困难的任务。但是，对于研究，尤其对于临床T细胞转移非常重要。crispr/cas9是最强大的基因编辑技术。必须通过逆转录病毒转导或核糖核蛋白复合物的电穿孔来应用于细胞。只有静息T细胞才有可能后者。在这里，我们使用Cas9转基因小鼠，并证明仅使用GuiderNA的幼稚CD3 + T细胞的预刺激，重要的是。这被证明是迅速而有效的，无需进一步选择。同时靶向。il-7在体外支持了生存和天真，但T细胞在核反射后也可以立即移植，并像未经处理的T细胞一样引起其功能。因此，代谢重编程在几天内达到了正常水平。在GVHD的主要不匹配模型中，不仅是NFATC1和/或NFATC2的消融，而且在幼稚的原代鼠Cas9 + CD3 + T细胞中，NFAT-target基因IRF4也通过GRNA唯一的核反理放大GVHD。然而，在单个NFATC1或NFATC2敲除时，预激活的鼠T细胞无法长期保护GVHD。这强调了同种异性造血干细胞移植期间基因编辑和转移未刺激的人T细胞的必要性。
使用 CRISPR/Cas9 破坏起始密码子可预防小鼠 Fuchs 角膜内皮营养不良症
摘要 VIII 型胶原蛋白 α2 链 (COL8A2) 基因的错义突变导致早发性福克斯内皮性角膜营养不良 (FECD)，这种疾病通过角膜内皮细胞的丢失逐渐损害视力。我们证明基于 CRISPR/Cas9 的出生后基因编辑在 FECD 小鼠模型中实现了结构和功能挽救。单次眼内注射编码 Cas9 基因和向导 RNA 的腺病毒 (Ad-Cas9-Col8a2gRNA) 可有效降低角膜内皮细胞中突变型 COL8A2 的表达，防止内皮细胞丢失，并挽救成年 Col8a2 突变小鼠的角膜内皮泵送功能。组织学或视网膜电图没有不良后遗症。Col8a2 起始密码子破坏是一种非手术策略，可防止早发性 FECD 中的视力丧失。由于这证明了 Ad-Cas9-gRNA 具有恢复成人有丝分裂后细胞表型的能力，因此该方法可能广泛应用于成人发病的疾病，甚至适用于受非生殖细胞疾病影响的组织。
card9和myd88差异调节鼠皮肤中的Conconsal酵母Malassezia的Th17免疫力
皮肤微生物组的真菌群落由单一属Malassezia主导。除了其在宿主界面的共生生活方式外，这种共同的酵母还与人类和宠物动物的各种炎症性皮肤疾病有关。稳定的定殖通过17型抗真菌型免疫维持。然而，驱动TH17对Malassezia的反应的机制仍不清楚。在这里，我们表明C型凝集素受体Mincle，Dectin-1和Dectin-2识别Malassezia细胞壁中的保守模式，并在体外诱导树突状细胞活化，而在体外，TH17激活只需要Dectin-2，而在体内实验性皮肤化合物期间，TH17激活。相反，在这种情况下，类似Toll样受体识别是多余的。相反，通过MyD88的燃料IL-1家族细胞因子信号传导也与T细胞固有方式有关Th17激活。综上所述，我们表征了有助于保护皮肤最丰富成员的途径。这种知识有助于理解屏障免疫及其对Censals的调节，并且考虑到异常免疫反应与严重的皮肤病理相关。