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研究论文评估多胺代谢产物在血液中的作用以及结核分枝杆菌的DNA甲基化对多药物的患者
背景：结核病（TB）是中国第二大传染病杀手，耐药性结核病患者的患病率不断增加，使治疗工作变得复杂并增加了相关成本。对耐药结核病的机制和特征的研究有助于发现新药物靶标和新的抗结核药物的发展。方法：在这项研究中，使用高性能液相色谱（HPLC）来检测多胺代谢产物的含量，而蛋白质印迹，qPCR和ELISA被用来检测与多胺代谢相关酶的表达。牛津纳米孔技术（ONT）测序被应用于耐多药结核分枝杆菌（MTB）中的剖面DNA甲基化。基因本体论（GO）分析和基因和基因组（KEGG）途径富集分析的京都百科全书在筛选的差异性高甲基化基因上进行。此外，使用字符串和细胞尺度软件用于构建蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络以识别关键基因。结果：结果表明，在结核病患者的外周血中，精子（SPD）和多胺代谢相关酶的升高升高。此外，多胺和代谢相关的酶的产生在多药耐药性结核病（MDR-TB）患者的外周血中增加。GO和KEGG分析表明，差异甲基化基因主要富含精氨酸代谢。PPI网络分析确定了最高程度的前五位关键基因：MoAx，vapc49，vapb49，higha3和nuoc。结论：MDR-TB患者的外周血中多胺代谢产物增加。多种耐药的MTB中差异性高甲基化基因参与精氨酸生物合成过程，差异甲基化基因可能在MTB的多药耐药性中起重要的生物学作用。
使用RNA生物标志物在结核分枝杆菌中加快药物易感性测试
科学和C服务细菌疾病 - 人类的传染病，科学疾病，朱丽叶·维特斯曼斯特拉特（Juliette wytsmanttrat），布鲁塞尔（Brussels），1050年，比利时B国家转诊和结核病的国家转诊，科学人，朱丽叶（Socientan），朱丽叶（Socient）里尔，CNRS，Inserm，Institute Pasteur de Lille，U1019 -UMR 9017-中心 - 里尔，里尔，59000，59000，法国D大学感染和免疫中心。里尔，CNRS，Inserm，Chu Lille，Institut Pasteur de Lille，US 41- UMS 2014 -PLBS，Lille，59000，法国E，MIT和哈佛大学，Main Street，Main Street 415，Cambridge，Cambridge，MA，MA，MA，02142，美国，美国，美国，MASSACHUSETS 4121142142 for Interventional Studies, Scienti fi c Direction Infectious Diseases in Humans, Sciensano, Rue Juliette Wytsmanstraat 14, Brussels, 1050, Belgium h Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, 55 Fruit Street, Boston, MA, 02114, USA i Laboratory of Microbiology, Parasitology and Hygiene, Faculty of Pharmaceutical, Biomedical and Veterinary Sciences, University of Antwerp, Universiteitsbaan 212, Antwerp, 2610, Belgium j Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 6047, Unit for Integrated Mycobacterial Pathogenomics, Paris, 75015, France k Division of Molecular Biology and Human Genetics, SAMRC Centre for Tuberculosis Research, DST/NRF生物医学结核病卓越中心研究，医学和健康科学学院，斯特伦博斯大学，泰格伯格，泰格伯格，7505，南非，l Sciensano，Sciensano，Sciensano，Juliette wytsmanttsmantsmanttraat 14，Brusstrait，Brussirenty，Belgium Mycobciiguim Mycobci，Mycobcii，Mycobcii，热带医学研究所，国家埃斯特拉特（Nationalestraat）155，安特卫普（Antwerp），2000年，比利时n分枝杆菌培养物收集比利时比利时比利时协调的微生物藏品，《国家埃斯特拉特155》，安特卫普，2000年，比利时，比利时
新确定的非洲分枝杆菌10，中非
由于广泛使用全基因组测序（WGS），对引起人类和动物结核病的细菌毒剂的限制性多样性的传统观点进行了修订。除了分枝杆菌CANETTII（代表东非东部结核杆菌的特殊，非克隆，进化的分支谱系）外，在过去的十年中，已经在AFRICA中鉴定出了几种以前未知的结核分枝杆菌谱的谱系。M.结核病复杂谱系7（L7）在非洲的角和非洲大湖地区的L8中发现（1，2）。Afri-Canum L9仅在吉布提和索马里发现。相比之下，其他2个主要的非洲主要菌落 - 相关的谱系对结核病Burden，L5和L6产生了基本贡献，主要是在西非的（3）。在芽孢杆菌的进化史上，东非和西非之间的途径尚不清楚。我们描述了与中非相关的新发现的L6和L9的姐妹谱系，并讨论了确定相关非洲谱系L5，L6和L9的进化历史的含义。我们基于公开数据的研究，因此不批准道德批准。
一种复合亚基疫苗赋予对分枝杆菌感染的小鼠脚下模型的全部保护
Buruli溃疡（BU）疾病是由分枝杆菌引起的被忽视的坏死性皮肤感染，是仅次于结核病和麻风病的第三种最常见的分枝杆菌疾病。感染主要发生在中非和西非的偏远，农村地区，也出现在澳大利亚，日本和巴布亚新几内亚。目前尚无针对Buruli溃疡疾病的疫苗，并且以前使用密切相关的细菌和亚基蛋白的所有尝试仅在部分成功。在这里，我们在小鼠中测试了一种复合亚基配方，该配方掺入了溃疡性分枝杆菌毒素霉菌乳元作为免疫调节剂，以及抗原AG85A和Polyketide Sythase酶酶A（KRA），用Quil-A辅助（KRA）形成。burulivac诱导了AG85A和KRA抗原特异性抗体，T细胞以及混合促疾病和抗炎的细胞因子反应，在14周的观察期间，在小鼠FOOTPAD模型中赋予了针对Buruli ulcer病的绝对保护。这两个都优于活体细菌疫苗，即BCG和缺乏霉菌性毒素（MUδ）的无毒的溃疡菌株。白介素10与保护密切相关。我们建议Burulivac是一名有前途的疫苗候选者，以抵抗Buruli溃疡疾病，需要进一步探索。
重新探索水杨酰基支架，以抑制结核分枝杆菌中的霉菌酸合成
全球结核病报告2023。（世界卫生组织，日内瓦，2023年）； Butler，M。S。等。对具有新作用模式的抗菌候选者的审查。ACS感染。dis。10，3440–3474（2024）; Gavalda，S。等。PKS13/FADD32串扰结核分枝杆菌中霉菌酸的生物合成。生物学杂志284，19255–19264（2009）; Galandrin，S。等。用于鉴定分枝杆菌FADD32活性抑制剂的测定开发。SLAS Discovery 18，576–587（2013）; Le，N.-H。等。针对分枝杆菌脂肪酰基 - A酰基 - AM-AMP连接酶FAAL32的药物筛查方法更新了Salicylanilide药物团在抗结结核病中的兴趣。生物有机和药物化学71，116938（2022）。
重新编程内源性 III-A 型 CRISPR-Cas 系统用于结核分枝杆菌的基因组编辑、RNA 干扰和 CRISPRi 筛选
。CC-BY 4.0 国际许可（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2020 年 3 月 9 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.03.09.983494 doi：bioRxiv 预印本
肠球菌的分泌组抑制结核分枝杆菌复合分枝杆菌的生长
肠球菌Mundtii是一种共生肠道细菌，可抑制某些结核分枝杆菌的生长（MTC）物种，引起人类和哺乳动物的结核病。为了进一步探索这一初步观察，我们使用标准化的定量琼脂良好的扩散测定法对五个MTC物种的五个E. mundtii菌株和七个MTC菌株代表。在10 Macfarland校准的所有五个E. mundtii菌株都抑制了所有具有各种敏感性曲线的结核分枝杆菌菌株的生长，但在较低的接种物中观察到没有抑制作用。Further, eight E. mundtii freeze-dried cell-free culture supernatants (CFCS) inhibited the growth of M. tuberculosis , Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis and Mycobacterium canettii , the most susceptible MTC species (inhibition diameter 25±1 mm), proportionally to CFCS protein concentra- tions.此处报告的数据表明，大肠杆菌的分泌组抑制了所有MTC的医疗利益物种的生长，该物种拓宽了先前报道的数据。在肠道中，大肠杆菌分泌组可能调节结核病的表达，表现出抗结核作用，在人类和动物健康中具有一些保护作用。
鉴定结核分枝杆菌的新CLPC1-NTD粘合剂
展出的CLPC1是针对结核病1-4的最有前途的药物靶标之一。这种AAA +进化酶与CLPP1P2蛋白酶合作起作用，是至少四种天然产物抗生素（NPA）的靶标：环粒蛋白5 - 8，Ecumicin 9，10，Lassymycin 11，12和Rufonycin 13-15。的确，艾普素，环瘤，鲁霉素和lassomycin均针对CLPC1，是最近出现的最强大的抗TB分子之一。例如，欧洲蛋白酶显示出有效的选择性抗结核活性，其MIC值比利福平或异尼氏酶低50倍，这是治疗结核病10的第一行药物。clpc1是II类AAA +蛋白质家族的成员，其中包含N末端结构域（NTD）和两个不同的ATP结合模块D1和D2。我们最近确定了CLPC1在其APO和2种不同抗生素结合状态2的全长结构2。尽管仅代表了全蛋白的一小部分，但所有NPA都被证明与CLPC1-NTD结构域结合，结合位点的高分辨率X射线结构可用于环粒蛋白，古素蛋白和rufomycin（图。1 A – C）5、9、12、13。最近，与lassomycin结合的CLPC1-NTD的X射线结构也发表了12。虽然这允许对NPA的结合口袋进行正确的映射，但仍不清楚与NTD结合如何转化为剩余蛋白质的功能障碍。
基于CRISPR的检测，结核分枝杆菌复杂谱系的鉴定和分类
摘要临床样品中基于聚合酶链反应（PCR）的检测是基于结核分枝杆菌（M.结核病）复合物（M. toberculosis）复合物（MTC），是一种诊断临床微生物学实验室中结核病的第一线方法。在这项研究中，使用繁荣的3,156个分枝杆菌基因组的全基因组培养确定了CRISPR-CSM4基因作为MTB的特定。实时（RT）-PCR和CRISPR-CSM4的PCR序列，对20 MTC和5个无效的分枝杆菌进行了测试，并确认了20个MTC分离株，而未检测到5个无效的分离株。此外，有65个剩余的临床样本，包括25个GenExpert阳性和40个GenExpert阴性样品，用于评估在临床微生物实验室环境中CRISPR-CSM4-MTB分析的评估，在每种情况下都会产生预期的预期结果，从而进一步允许M. tonberculculsis M. tonbercijing Lineage。rt-PCR和CRISPR-CSM4的PCR序列可以植入临床微生物学实验室，以补充当前使用的测定法，并有可能增加负责结核病的MTC病原体的规范。