XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemMycobiome
ika：快速，分散且安全的互操作性由2pc-MPC
根据Tullio Simoncini博士的说法，癌症的主要原因是白色念珠菌，一种常见的真菌，可以用抗真菌剂进行治疗，不符合获得专利的资格。他认为，癌症和肿瘤是由人体内部的真菌生长引起的，支持癌症与真菌之间的联系。“癌症是一种真菌”一书概述了真菌感染如何始终形成肿瘤形成的基础，试图在整个生物体中散布而不会停止。这本书已翻译成英文，意大利语，荷兰语和法语。Simoncini博士使用碳酸氢钠（已知最强的抗真菌剂）成功治疗了许多癌症患者，观察到几周内肿瘤消失了。在他的书中，西蒙奇尼博士强调了面对慢性疾病的人类正直和永久性优先级的疗法的必要性，这是无法通过当前治疗方法有效解决的。与癌症的斗争是双重的：打击身体疾病本身，挑战社会态度和个人偏见，以抵制创新和进步。研究探讨了包括胃肠道，肺部和乳腺肿瘤在内的各种癌症中真菌生态与细菌组之间的相互作用。研究表明，真菌在肿瘤进展和结局中起作用，不同类型的癌症中存在不同的物种。例如，白色念珠菌与胰腺癌有关，而酿酒酵母与口服鳞状细胞癌有关。免疫。89，E00648-20）。 Med。 26，59–64; Nature 620，E1 – E6）。89，E00648-20）。Med。26，59–64; Nature 620，E1 – E6）。26，59–64; Nature 620，E1 – E6）。此外，已经发现人类肿瘤微生物组由肿瘤型特异性细胞内细菌组成。这些发现表明，肿瘤微环境中真菌与细菌之间的相互作用可能会影响癌症的结果。与人类微生物组有关的癌症相关发现已因错误而无效。这种批评得到了Biorxiv（doi：10.1101/2023.02.10.528049）的预印本的支持，研究人员对Pan-Cantcanter微生物结构的特殊性表示谨慎。先前的研究探索了微生物群中的细菌 - 真菌相互作用及其在人类健康和疾病中的潜在相关性及其致病影响（参考文献：肠道微生物14，2105610;微生物7，459）。这些相互作用可以跨越王国，影响宿主健康和疾病，这是由关于菌根和真菌 - 细菌相互作用的研究报告的（感染。研究表明，与癌症相关的真菌可以促进肿瘤发生，但是这些微生物在癌症中的作用仍然很少知道（参考文献：Nat。为了更好地了解癌症的癌症组，研究已经分析了其测序和全基因组测序数据来自各种癌症类型的患者（参考：MBIO E0160723）。此外，研究强调了模式识别受体增强癌症免疫疗法的潜力（Ann。oncol。28，1756–1766）。共生细菌激活HIF-1α和LL-37可以抑制白色念珠菌的定植（Nat。Med。21，808–814）。最近的研究表征了多种类型癌症的真菌，并揭示了它们的分布，与免疫细胞的关系以及可能的预后价值（细胞； Biorxiv doi：10.1101/2023.02.02.10.528049）。这些发现证明了微生物与癌症之间的复杂相互作用。在最近的研究中，研究人员在理解与各种类型癌症相关的真菌签名方面取得了长足的进步。通过整合四种不同的染色技术，科学家能够在多种癌症组织微阵列中可视化真菌。调查结果表明，真菌在癌症中无处不在，其组成因癌症类型而异。类似于肠道微生物中的多样性，发现真菌的丰度低于肿瘤组织中细菌的丰度。然而，与健康对照组相比，癌症类型的真菌症丰富度在癌症类型上显示出显着差异，肿瘤样品中的真菌表达明显更高。值得注意的是，某些类型的真菌被发现富含特定的癌症，例如乳腺肿瘤中的cladosporium sphaerospermum和cladosporium属，在乳腺癌中，曲霉和琼脂霉中的琼脂菌。此外，研究人员通过定义从20种不同类型的真菌循环真菌DNA的签名来开发了一种将癌症患者与健康个体区分开的策略。鉴于真菌与细菌之间的相互作用，科学家研究了肿瘤内的霉菌组和细菌组之间的关系。这是癌症分枝杆菌组的诊断和预后潜力的基础，突出了其在早期疾病检测中的价值。他们发现，大多数类型的真菌与特定细菌物种共存，这表明肿瘤可能有利于真菌和细菌的生长，从而产生非竞争性群落，与典型环境不同。使用多种机器学习策略和差异丰度测试，研究人员能够区分癌症类型中的癌性和非癌组织。在另一项研究中，使用来自各种癌症样品的全基因组测序数据的分析表明，与细菌DNA相比，真菌读数的比例要小得多。来自某些区域的组织，例如头部和颈部，结肠和胃，表现出相对较高的真菌DNA。为了准确捕获Mycobiome，研究人员采用了基于患病率的净化模型来消除可能导致假阳性信号的污染物真菌。这些发现还强调了了解癌症中真菌组成的重要性，与其他类型的癌症相比，胃肠道肿瘤显示出不同的模式。癌症可以广泛地分为两种类型：念珠菌（Ca-Type）和糖疗法（SA-Type）肿瘤，它们在真菌的丰富度上有所不同。这些真菌感染通常与T辅助2（Th2）型过敏反应有关。基因表达模式和免疫反应在两种类型的GI癌中有所不同。Ca-type肿瘤表现出促炎性细胞因子（例如白介素（IL）-1和IL-6）的过表达，表明17型签名。该研究还揭示了真菌与细菌之间的共存和关联。相比之下，念珠菌通常与胃癌有关，而爆炸性占主导地位的肺部肿瘤样本，而马拉西亚（Malassezia）在乳腺癌中普遍存在。念珠菌的存在已被确定为GI癌症晚期疾病的预测生物标志物，与存活率差有关。这些发现表明，真菌在宿主的免疫反应和癌症进展中起着至关重要的作用，强调了微生物组（包括Mycobiome）在癌症生物学中的重要性。需要进一步的研究来研究真菌诱导炎症并促进癌症进展的潜在机制。结果对癌症诊断，预后和药物发育以及癌症研究的其他方面具有影响。但是，必须解决这些研究中使用的样本池的局限性，需要消除污染物和假阳性真菌DNA。研究项目LD19C070001和来自GUSU的领先人才创新的计划ZXL2022505均已披露，没有任何利益冲突。
特刊 - 森林真菌和...
我们对这一特刊的兴趣源于以下事实：关于基因组学和分子生物学对森林真菌生活方式的机械理解及其相互作用的机械理解的影响很少，致病性，腐病性，腐烂性，内植血，相互性）与与森林生态系统的直接相关。最近的新技术进步和生物信息学方面已极大地促进了这一领域的进步。数百种真菌物种的基因组序列的可用性占据了多种生态位，代表各种分类群体为比较基因组学分析提供了无与伦比的机会。同时，下一代测序（NGS）和转录组学的应用促进了在林木和土壤微生物组上的大量数据及其分子相互作用的积累。对不同森林组织（内pophere，根际，浮游生石）定植的真菌组群落的研究也很感兴趣。
肺癌患者肠道中的念珠菌扩张与生态特征相关，该症状支持不良生物条件下的生长
人类肠道中的念珠菌物种过度生长被认为是侵入性念珠菌病的先决条件，但是我们对促进或限制这种过度生长的肠道细菌的理解仍然受到限制。通过从75名男性和女性癌症患者的粪便中整合横截面的真菌病和shot弹枪元基因组学数据，但没有全身性念珠菌病，高念珠菌样品中的细菌群落显示出比低念珠菌样本中的较高的代谢功能，但具有更高的贡献多样性。我们开发的机器学习模型仅使用细菌分类单元或功能相对丰度来预测外部验证队列中的念珠菌属和物种水平，而AUC为78.6 - 81.1％。我们提出了一种基于产生乳酸细菌的增加的肠道念珠菌过度生长的机制，该机制与调节短链脂肪酸和氧气水平的细菌的降低相吻合。在这些条件下，念珠菌将乳酸作为营养源的能力可能使念珠菌能够在肠道中占据其他真菌。
亲爱的同事，我非常高兴和荣幸...
MSGERC在教育，研究，奖学金和患者倡导的所有任务领域都经历了“文艺复兴”，我坚信它注定要飙升甚至比以往任何时候都更高，并且鉴于免疫促进性的患者的不断扩大。在美国的一项国家健康访谈调查中（JAMA 2013），有3％的美国成年人自我报告是免疫抑制的。 此外，新的免疫抑制和/或免疫调节药物已经不断开发，其使用范围超出了传统的肿瘤学，移植和风湿病的领域，将其扩展到衰老，代谢性疾病和神经病学等领域。 大型数据和基因组分析，微生物组/真菌型和个性化的风险评估，真菌对肿瘤发生的贡献，病毒后诱导的真菌免疫损害（如COVID19的流行病所教给我们的我们）以及生物物质研究的革命，所有领域的研究都在研究，并讨论了研究，并讨论了我们的领域。 通过引入几种非常有前途的新抗真菌剂和真菌诊断和免疫治疗策略的进步来扩大这种兴奋，这些抗体和免疫治疗策略旨在解决侵入性真菌感染的流行病学的重大变化，包括不断发展的抗真菌抗真菌抗性。在美国的一项国家健康访谈调查中（JAMA 2013），有3％的美国成年人自我报告是免疫抑制的。此外，新的免疫抑制和/或免疫调节药物已经不断开发，其使用范围超出了传统的肿瘤学，移植和风湿病的领域，将其扩展到衰老，代谢性疾病和神经病学等领域。大型数据和基因组分析，微生物组/真菌型和个性化的风险评估，真菌对肿瘤发生的贡献，病毒后诱导的真菌免疫损害（如COVID19的流行病所教给我们的我们）以及生物物质研究的革命，所有领域的研究都在研究，并讨论了研究，并讨论了我们的领域。通过引入几种非常有前途的新抗真菌剂和真菌诊断和免疫治疗策略的进步来扩大这种兴奋，这些抗体和免疫治疗策略旨在解决侵入性真菌感染的流行病学的重大变化，包括不断发展的抗真菌抗真菌抗性。
2024年3月
Schnabl博士接受了医师科学家的培训，将他的临床医学专业知识与慢性肝脏疾病领域的基础科学相结合。他的研究重点是了解肠道菌群和肝脏之间发生的复杂的多向相互作用。他的实验室开创了肝病患者肠道细菌微生物群，霉菌组和病毒蛋白的特征。他的研究导致了230多个期刊上的出版物，包括NEJM，细胞，自然医学，细胞宿主和微生物，PNA和PNA和临床研究杂志。近年来，他一直是引用的最高1％的高引人入胜的研究人员之一。认可这项工作，他当选为美国临床调查学会和美国医师协会，并在国家和国际会议上发表了主题演讲。他于2022年获得了哈灵顿学者创新奖。此外，他还将与Eckmann博士一起指导NIH资助的圣地亚哥消化疾病研究中心（SDDRC）。Schnabl博士是VA功绩奖，多个NIH赠款，基金会奖和行业赞助的项目的首席研究员。
e006284.full.pdf
抽象背景研究了肠道细菌与肝细胞癌（HCC）中对免疫检查点抑制剂（ICI）的反应之间的关联；然而，尚未完全了解ICI处理的HCC队列中的多Kingdom肠道微生物组的改变以及ICI处理的HCC队列中的相互作用。方法从2018年11月到2022年4月，预期接受了高级HCC治疗的ICI治疗的患者。在此，我们使用元基因组，IS2和80例ICI-Preated HCC患者的肠道微生物组和代谢组的肠道微生物组和代谢组进行了多振形微生物群的表征。结果我们的发现表明，耐用的临床益处（DCB）和不可耐性的临床益处（NDB）组之间的细菌和代谢产物显着差异，而真菌的差异较小。在DCB组治疗前的细菌和真菌的总体多样性高于NDB组，并且在6-8周后使用免疫疗法随着免疫疗法的使用而开始改变。We also explored the alterations of gut microbes in the DCB and NDB groups, established 18 bacterial species models as predictive biomarkers for predicting whether immunotherapy is of sustained benefit (area under the curve=75.63%), and screened two species of bacteria ( Actinomyces_sp_ICM47 , and Senegalimassilia_anaerobia ) and one metabolite （甘氨酸酮）作为预测用ICI治疗的HCC患者的预后生物标志物。我们的发现表明细菌分类群是ICI临床疗效的预测生物标志物，细菌及其代谢物作为预后生物标志物。在这项研究中得出的结论，包括肠道细菌，真菌及其代谢物在内的多象kingdom微生物群的状态和表征，首次通过ICI治疗的HCC患者进行了多组学测序。
梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染与转录活性微生物群落的差异有关
梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染（CDI）每年在美国约30万住院，相关的货币成本为数十亿美元。肠道微生物组营养不良对CDI很重要。据我们所知，元文字组合（MT）仅用于表征肠道微生物组组成和功能，在一项涉及CDI患者的先前研究中。因此，我们利用MT研究了CDI+（n = 20）和CDI-（n = 19）样品在微生物类群和表达基因方面的活性群落多样性和组成的差异。根据CDI状态，未检测到有关丰富性或偶数的显着（Kruskal-Wallis，p> 0.05）的显着差异。但是，基于CDI状态的聚类对于活性微生物分类群和表达的基因数据集都很重要（Permanova，P≤0.05）。此外，与CDI-样品相比，CDI+中的差异特征分析表明，机会性病原体的肠球菌病原体和Ruminococcus gnavus的表达更大。仅考虑真菌序列时，糖霉菌科在CDI-中表达了更多的基因，而其他31种真菌分类群则被确定为显着（Kruskal-Wallisp≤0.05，log（LDA）≥2）与CDI+相关。我们还检测到基于CDI状态的各种基因和途径（Kruskal-Wallisp≤0.05，log（LDA）≥2）显着差异。值得注意的是，与生物膜形成相关的差异基因通过艰难梭菌表达。这为艰难梭菌对抗生素的抵抗和体内频繁复发提供了另一个可能的贡献。此外，更多的CDI+相关真菌分类群构成了额外的证据，表明该分枝杆菌对CDI发病机理很重要。未来的工作将集中于确定艰难梭菌在感染过程中是否积极产生生物膜，以及任何特定的真菌分类群在CDI中是否特别有影响力。