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简介：miRNA靶基因的预测和鉴定对于理解mir NAS的生物学至关重要。报告的长期编码RNA（LNCRNA），MicroRNA 195-497簇宿主基因（MIR497HG）调节是由多个非编码RNA（NCRNA）（例如microRNAS（miRNA））介导的。miR497Hg在各种癌症中被认为是肿瘤抑制剂。然而，miR497Hg及其衍生的miRNA的影响在很大程度上是未知的，仍然需要进一步探索。采用实验方法通常很具有挑战性，因为某些LNCRNA难以通过当前的隔离技术识别和隔离。因此，引入了生物信息学工具以帮助这些问题。这项研究试图搜索和识别针对MiR497Hg的3'untranslated区域（3'UTR）的miRNA。方法：在这里，采用了生物信息学工具来识别潜在针对miR497hg的3'UTR的独特miRNA列表。结果：使用MIRDB提取了靶向MiR497Hg的3'UTR的57个候选miRNA。同时，Starmir预测了291个miRNA，可能针对MiR497Hg的3'UTR。使用Venny 2.1.0获得了36个miRNA的共同列表，并使用Starmir的LogitProb评分进一步缩小。最后，确定了总共4个miRNA（HSA-MIR-3182，HSA-MIR-7156-5P，HSA-MIR-452-3P和HSA-MIR-2117）。通过Targetscan鉴定出鉴定的miRNA的mRNA靶标。最后，使用富集进行了基因和基因组（KEGG）富集分析的基因本体论（GO）和京都百科全书（KEGG）富集分析。结论：这一发现可能有助于理解miR497Hg及其调节性miRNA之间的复杂相互作用。此外，在本研究中还提供了计算miRNA-target预测的比较分析，可能会为miRNA用于癌症研究中的生物标志物的基础。马来西亚医学与健康科学杂志（2024）20（1）：161-167。 doi：10.47836/mjmhs.20.1.21马来西亚医学与健康科学杂志（2024）20（1）：161-167。 doi：10.47836/mjmhs.20.1.21
通过合成的 PEG12-KL4 肽将针对 PD-L1 和 EGFR 的 siRNA 共同递送至肺部，作为治疗非小细胞肺癌的潜在策略
背景：小干扰 RNA (siRNA) 在治疗各种肺部疾病方面具有巨大潜力，但缺乏安全有效的肺部 siRNA 递送系统阻碍了其进入临床。促进细胞增殖的表皮生长因子受体 (EGFR) 和在抑制细胞毒性 T 细胞活性中起关键作用的程序性细胞死亡配体 1 (PD-L1) 是治疗非小细胞肺癌 (NSCLC) 的两个重要靶点。在这里，我们探索了合成肽 PEG 12-KL4 将 siRNA 递送到小鼠的各种 NSCLC 细胞和肺组织的潜力。方法：使用 PEG 12-KL4 将针对 EGFR 和 PD-L1 的 siRNA 转染到 NSCLC 细胞中。使用免疫印迹法评估 siRNA 在 HCC827 和 NCI-H1975 NSCLC 细胞中的沉默效果。采用 CD8 + T 细胞介导的 NSCLC 细胞杀伤来证明 PD-L1 siRNA 敲低的功能效果。使用荧光 siRNA 来可视化细胞中的 siRNA 摄取，并在 BALB/c 小鼠中进行生物分布研究。结果：我们的结果表明，PEG 12 -KL4 可有效介导各种 NSCLC 细胞中 EGFR 和 PD-L1 的 siRNA 敲低。重要的是，PEG 12 -KL4 肽比商用 Lipofectamine 2000 试剂能够更好地实现 siRNA 递送。我们假设 PEG 12 -KL4 肽使 siRNA 能够逃脱或绕过内体降解，如共聚焦荧光成像所示。值得注意的是，在 NCI-H1975 细胞中联合敲低 EGFR 和 PD-L1 比单独敲低 PD-L1 产生更好的效应 T 细胞介导的癌细胞杀伤效果。此外，静脉给药后 PEG 12 -KL4/siRNA 复合物的生物分布表明肺部输送不良，荧光 siRNA 积聚在肝脏中。相反，气管内输送 PEG 12 -KL4/siRNA 复合物导致荧光 siRNA 在肺部被检测到，肾脏排泄延迟。结论：总之，我们证明了使用 PEG 12 -KL4 共同输送靶向 EGFR 和 PD-L1 的 siRNA 是可行的，并且代表了治疗 NSCLC 的一种有前途的未来策略，其中肺部 siRNA 输送有利于静脉给药。
病毒蛋白激活巴黎介导的tRNA降解和病毒TRNA救援感染Nathaniel Burman 1*，Svetlana Belukhina 2*，Florence de
（David.bikard@pasteur.fr），B.W。（bwiedenheft@gmail.com）和A.I.（artem.isaev@skoltech.ru）
Stathmin-2和UNC13A mRNA的隐秘剪接是TDP-43相关的阿尔茨海默氏病的病理标志
RNA结合蛋白TDP-43的抽象核清除率和细胞质积累是几乎所有肌萎缩性侧面硬化症患者（ALS）的病理标志，高达50％的额叶痴呆（FTD）患者和阿尔茨海默氏病。在阿尔茨海默氏病中，TDP-43病理在边缘系统中主要观察到，并且与认知能力下降和海马体积减少有关。核TDP-43功能的破坏会导致RNA剪接异常，并在许多转录本中掺入错误的隐性外显子，包括Stathmin-2（STMN2，也称为SCG10）和UNC13A，最近在ALS和FTD患者的组织中报道了UNC13A。在这里，我们在阿尔茨海默氏病患者中识别STMN2和UNC13A隐秘外显子，与TDP-43病理负担相关，但与淀粉样蛋白β或TAU沉积物无关。我们还证明，与UNC13A相比，STMN2前MRNA的处理对TDP-43功能丧失更敏感。此外，编码STMN2和UNC13A的全长RNA被抑制在由阿尔茨海默氏病后验尸脑组织产生的大型RNA-seq数据集中。共同开放了令人兴奋的新途径，将使用STMN2和UNC13A用作具有TDP-43蛋白质病（包括阿尔茨海默氏病）的广泛神经退行性疾病的潜在治疗靶标。
液体活检评估循环肿瘤 DNA、miRNA……
简介：液体活检是一种非侵入性方法，通过分析血液或其他体液中的癌症生物标志物来检测癌症并监测治疗反应。脑膜瘤是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤，生物标志物在其诊断、预后和治疗监测中起着至关重要的作用。世界卫生组织 (WHO) 根据肿瘤等级和基因的分子改变对脑膜瘤进行分类，例如 NF2、AKT1、TRAF7、SMO、PIK3CA、KLF4、SMARCE1、BAP1、H3K27me3、TERT 启动子和 CDKN2A/B。液体活检，特别是游离 DNA (cfDNA) 分析，已显示出监测脑膜瘤的潜力，因为它可以检测血液中的 ctDNA 释放，不受血脑屏障的影响。还发现，microRNA (miRNA) 在各种癌症（包括脑膜瘤）中失调，具有作为诊断生物标记物的潜力。此外，研究肿瘤微环境中的细胞因子可能有助于建立脑膜瘤的预后或诊断组。
前进的癌症治疗：体内提供治疗的小型非编码RNA
近年来，小型非编码RNA（NCRNA）已成为癌症治疗领域的新参与者。其独特的能力直接调节遗传网络并靶向癌症将其定位为对现有小分子药物的有价值的补充。同时，基于NCRNA的小型治疗剂的进步重新点燃了对体内递送策略的效率。在这篇综述中，我们概述了基于NCRNA的小型癌症治疗领域中最新的临床和临床前研究。此外，我们阐明了将这些有希望的疗法成功地转化为临床实践所面临的关键挑战，并特别着眼于递送方法，旨在刺激创新方法来解决癌症治疗的这一基础方面。
标题：人心力衰竭会改变线粒体和纤维3D结构触发代谢1偏移2
。CC-BY-NC 4.0国际许可证的永久性。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2023年12月16日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2023.12.16.571081 doi：Biorxiv Preprint
综述文章：设计 CRISPR 引导 RNA 用于可编程 RNA 传感器
作为CRISPR系统最有价值的特性，基于沃森-克里克碱基配对的可编程性已广泛应用于RNA传感器的工程设计。这些系统中的碱基配对提供了目标RNA和CRISPR效应子之间的连接，为体内和体外的RNA检测提供了高度特异性的机制。在过去的十年中，尽管在CRISPR爆炸式增长的时代开发了许多成功的RNA传感方法，但对CRISPR系统特性的深入了解和CRISPR家族成员的不断扩展表明，基于CRISPR的RNA传感器仍然是一个有前途的领域，可以从中设计出各种新功能和应用。在这里，我们系统地概述了设计CRISPR gRNA进行可编程RNA检测的各种策略，旨在阐明gRNA的可编程性在CRISPR支持的RNA传感器的现有局限性和未来发展中的作用。
microRNA 在血液疾病中的作用......
miRNA 参与各种生命过程，包括细胞生长、发育、凋亡、细胞分化和病理性细胞活动。循环 miRNA 可在各种体液中检测到，包括血清、血浆、唾液和尿液。值得一提的是，miRNA 在生物体液循环中保持稳定，并从膜结合囊泡（称为外泌体）中释放出来，保护它们免受 RNase 活性的影响。研究表明，miRNA 通过靶向紧密连接和粘附连接分子来调节血脑屏障的完整性，还可以影响炎症细胞因子的表达。最近的一些研究已经检查了多发性硬化症中某些常用药物对 miRNA 水平的影响。在这篇综述中，我们将重点关注 miRNA 在多发性硬化症中的作用的最新发现，包括它们在 MS 病因和疾病的分子机制中的作用、利用 miRNA 作为诊断和临床生物标志物、使用 miRNA 作为多发性硬化症的治疗方式或靶点以及患者的药物反应，阐明它们作为疾病进展预测指标的重要性，并强调它们作为未来 MS 治疗方法的潜力。
外泌体非编码RNA
结直肠癌 (CRC) 是世界第三大癌症，转移性 CRC 大大增加了全球癌症相关的死亡人数。转移涉及许多在分子水平上受到严格控制的复杂机制，而转移是 CRC 患者死亡的主要原因。最近，人们已经清楚，外泌体（由非肿瘤细胞和肿瘤细胞释放的细胞外小囊泡）在肿瘤微环境 (TME) 中起着关键的通讯介质作用。为了促进 TME 和癌细胞之间的通讯，非编码 RNA (ncRNA) 起着至关重要的作用，被认为是基因表达和细胞过程（如转移和耐药性）的有效调节剂。NcRNA 现在被认为是基因表达和许多癌症标志（包括转移）的有效调节剂。外泌体 ncRNA，如 miRNA、circRNA 和 lncRNA，已被证明会影响多种导致 CRC 转移的细胞机制。然而，将外泌体 ncRNA 与 CRC 转移联系起来的分子机制尚不清楚。本综述重点介绍了外泌体 ncRNA 在 CRC 转移性疾病进展中发挥的重要作用，并探讨了 CRC 转移患者可以选择的治疗方案。然而，外泌体 ncRNA 治疗策略开发仍处于早期阶段；因此，需要进一步研究以改进给药方法并找到新的治疗靶点，以及在临床前和临床环境中确认这些疗法的有效性和安全性。