过去二十年爆发了许多病毒性疾病,如基孔肯雅热、埃博拉、寨卡、尼帕、H7N9 禽流感、H1N1、SARS 和 MERS。这十年来,世界因一场新的疾病爆发而醒来。2019 年 12 月,中国湖北省武汉市爆发了一种新型冠状病毒。大多数最初确诊的患者都追溯到屠宰和销售活体动物的“海鲜市场”。该市场可能扮演了一个放大热点的角色,病毒从这里传播到中国其他地区,随后在很短的时间内传播到 213 个国家和地区。世界卫生组织于 2020 年 2 月 11 日将此疾病命名为“COVID-19”,这是 2019 冠状病毒病的缩写。截至 2020 年 8 月 17 日,全球共报告确诊病例 2120 万例,死亡人数 761,000 人 [1] 。美国、印度、巴西和俄罗斯报告了最严重的 COVID-19 疫情,这些国家的病例数已超过中国的确诊病例数。世界卫生组织于 2020 年 1 月 30 日将当前爆发的 COVID-19 宣布为“国际关注的突发公共卫生事件”,并于 2020 年 3 月 11 日宣布为“大流行”。尽管严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2;2.9%) 的死亡率远低于 SARS-CoV (9.6%) 和 MERS-CoV (34.4%),但 SARS-CoV-2 与其他冠状病毒相比的高传染性已成为全球关注的问题。研究发现,男性的 COVID-19 死亡率和易感性高于女性,这可能归因于吸烟等其他性别行为 [2] 。COVID-19 的死亡率随年龄梯度而变化,也受到潜在合并症的影响,换句话说,糖尿病、高血压、癌症、心血管疾病和慢性呼吸系统疾病等疾病 [3–5] 。未观察到 COVID-19 母婴垂直传播 [6] 。儿童易感染 COVID-19,但往往只表现出轻微症状 [7] 。
指南指出,许多人畜共患毒剂被归类为风险组4,常见的例子是病毒出血剂(Ebola,Marburg,Lassa),Nipah,Tick-Borne脑炎和疱疹 - 脑膜炎和疱疹替代病毒。因此,在收集样品之前,请先咨询MOH和Proflab微生物学家在患者管理和标本收集指令之前。如果不确定代理人是否是风险组4,请咨询Alberta Precision Laboratories测试目录 @ Alberta Precision Laboratories |实验室服务(Albertahealthservices.ca)以获取全面信息。狂犬病测试:•免疫状况 - 仅针对有风险的职业进行暴露的职业,并接受了接种疫苗,例如兽医,公园和公园和野生动物官员。如果可用,请指定狂犬病疫苗的职业和日期。对于紧急请求,例如接种疫苗的人,接触可疑动物,请与MOH讨论一旦讨论,请联系微生物学家以加快测试。•暴露于狂犬病 - 首先与区域MOH咨询以管理案例和测试指导,以显示下表中的许多代理人被转交给国家微生物学实验室进行测试,并需要临床信息以防止拒绝。提供的信息还将有助于确定哪种测试或算法将提供实验室诊断。分子(NAT测试)在蚊子传播感染的急性症状阶段中通常存在病毒血症,偶尔会出现毒素,当时通过分子(NAT/PCR)在血液和尿液中检测到感染剂,然后在血清学检测抗体中检测到血液和尿液。因此,建议在症状发作时收集样品,对于分子和血清学检查,此阶段后,通常在7至10天后,仅7至10天后,仅血清学检查就应该足够了。对血液和尿液进行分子(PCR)测试的实验室算法是基于症状发作的日期,并返回艾伯塔省或加拿大(如果适用)。提供此信息对于实验室选择适当的测试组合至关重要。对于立克和磨砂鼠伤寒感染,经常在tick/mite咬伤部位发现ESCHAR。以少量的病毒运输培养基(粉红色培养基)的形式发送整个结ab以及其下方面积的拭子,因为这些样品通常可能会产生阳性结果。
与许多其他热带国家一样,马来西亚在 COVID-19 疫情开始之前就已经拥有丰富的应对传染病经验,包括应对登革热、尼帕病毒、肺结核和钩端螺旋体病等病毒和疾病,有时甚至被称为“新发和再发传染病的中心”(Kit,2002 年)。为了应对这一问题,多年来,马来西亚设计了其公共卫生和公立医院基础设施,以便能够应对和服务大众。例如,尽管不同密度的社区之间存在很大差异,城乡之间的服务提供也存在很大差距,但公民通常能够通过遍布全国的政府运营的诊所获得初级卫生保健(Hazrin 等人,2013 年)。话虽如此,马来西亚的医疗支出仅为 3%。 2019 年,马来西亚的疫情占国内生产总值 (GDP) 的比重为 9.8%,远低于世界平均水平的 9.83%,但与其地区邻国相似,例如新加坡(4%)和泰国(3.8%)。1。因此,该国在进入大流行时,已经具备应对过去传染病的知识,但公共医疗系统负担过重(尽管功能正常)——面对 SARS-CoV-2 病毒,这两种特点可能会改变该国的命运。2020 年 1 月 25 日,一名中国旅客从新加坡抵达马来西亚半岛最南端的柔佛州,导致马来西亚出现首例 COVID-19 病例。2在发现首例病例几周后,迅速控制住了由这例病例引发的疫情。然而,2020 年 2 月中下旬,大量海外旅行者参加了一场伊斯兰宗教“传教”活动,导致 2 月 26 日爆发了更大规模、更难追踪的聚集性疫情(Hashim 等人,2021 年)。2020 年 3 月 18 日起,马来西亚实施了严格的全国封锁——行动控制令 (MCO),以帮助减少疾病的传播。这与该地区和世界制定的类似政策一致。在马来西亚,MCO 意味着所有学校、工作场所和非必要经济部门都完全关闭。公共交通和社会生活停止,所有家庭外的聚会都被禁止,居民被要求待在家里以防止传播。图 1 显示了
自 2015 年 G-FINDER 调查中纳入埃博拉病毒以来,G-FINDER 新发感染性疾病调查的范围一直在演变,并将随着世卫组织研发蓝图和专家共识的变化而继续演变。G-FINDER 项目追踪的首要新发感染性疾病病原体是埃博拉病毒,为应对 2014-15 年西非埃博拉疫情,2015 年 G-FINDER 调查(收集 2014 财年数据)中也纳入了该病毒。新发感染性疾病数据收集的第一年还获得了针对多种丝状病毒疾病(包括埃博拉)的资助。2016 年 G-FINDER 调查(收集 2015 财年数据)扩大到包括另外四种病毒性出血热 - 马尔堡病毒、克里米亚刚果出血热 (CCHF)、裂谷热 (RVF) 和拉沙热 - 以及寨卡病毒。扩大的范围还涵盖了针对多种丝状病毒、布尼亚病毒或沙粒病毒的研发以及专注于除埃博拉和马尔堡以外的丝状病毒和除 CCHF 和 RVF 以外的布尼亚病毒的研发。这些 EID 的研发资金与传统的 G-FINDER 被忽视疾病分开分析。2017 年(收集 2016 财年数据),G-FINDER 项目正式开始根据新制定的世卫组织研发蓝图单独跟踪重点 EID 病原体的研发投资。今年增加的疾病有严重发热伴血小板减少综合征 (SFTS)、冠状病毒疾病(包括中东呼吸综合征 (MERS) 和严重急性呼吸综合征 (SARS))和亨尼帕病毒疾病(包括尼帕病毒)。2017 年还纳入了非疾病特异性(疾病 X)资金和多 EID 组织的核心资金。 2018 年(收集 2017 财年数据),疾病 X 和核心资金支出的范围扩大到包括用于支持被忽视疾病和新发传染病研究的全部资金,包括核心资金、平台技术和其他研发,这些资金以前在被忽视疾病和新发传染病资金总额之间按比例分配。作为纳入新发传染病和被忽视疾病综合资金的一部分,创建了一个新类别,即多病媒控制产品,用于捕获不针对某一特定媒介传播疾病的研发资金。新类别捕获针对目标媒介传播被忽视疾病和新发传染病的媒介控制产品研发的资金。例如,埃及伊蚊既传播登革热病毒(一种被忽视的疾病),又传播寨卡病毒(一种新发传染病)。对于 2017 财年报告的资金,此类资金的全部价值包括在多病媒控制产品类别下,而 2017 年之前的资金则按目标疾病按比例分配。
应用微生物学硕士课程将于 2020-2021 学年开始。该课程是根据应用微生物学硕士学生 GATE、ICAR-NET、ICMR-NET 和 CSIR-NET 教学大纲的独特要求而准备的。重点是向学生提供最新信息,并适当重视经典应用微生物学的概念,以便他们能够理解和欣赏当前的跨学科方法,特别是在微生物学、生命科学和生物科学的研究和创新领域及其在社会发展中的作用。该学科融合了传统成分和现代生物化学、分子生物学、遗传学、工业、医学、环境和农业微生物学、免疫学和生物技术。多年来,由于各方面的大量研究投入,该学科在信息和应用方面取得了巨大的进步。因此,课程内容还列出了新的实践练习,以便学生能够亲身体验目前正在使用的最新技术。应用微生物学硕士的四个学期。教学大纲是一个均衡的、精心设计的课程结构,涵盖了微生物学的不同方面,即微生物学基础、微生物多样性、微生物生理学和分子生物学、微生物生态学和遗传学、免疫学、生物统计学和仪器技术、微生物生物技术、农业微生物学和植物病理学、工业微生物学、环境微生物学、制药和临床微生物学。所有这些方面在四个学期中都得到了应有的重视,并在最后一个学期特别强调某些方面。应鼓励学生从植物学、环境科学、动物学和生物技术等其他生命科学课程中选择一篇相关的选修课,以增加跨学科的理解和应用方法。近几十年来,不同地理区域出现了几种新的疾病,病原体包括埃博拉病毒、寨卡病毒、尼帕病毒和冠状病毒 (CoV)。最近,一种新型病毒感染出现,被称为严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2),对全球公共卫生构成严重威胁。鉴于目前的情况,本课程将探索微生物学领域的新领域,并将激励学生在研究、卫生、教学专业等各个领域继续攻读微生物学的高等学位。本课程还将使学生能够成为企业家并在多个行业就业。总体而言,该课程是大量信息的来源,并有丰富的资源材料支持。代表应用微生物学硕士,这个新课程将满足在不同行业就业的学生的基本要求,为整个世界服务。
摘要 人畜共患病占新发传染病的 60%,其中 70% 来自野生动物。蝙蝠是许多传染源的宿主,特别是导致人类人畜共患病的病毒,如埃博拉病毒、尼帕病毒或亨德拉病毒。在过去的二十年中,源自蝙蝠的新病毒在人类和动物种群中出现,对公众和兽医健康以及经济产生了重大影响。严重急性呼吸综合征 (SARS)、中东呼吸综合征 (MERS) 和急性猪腹泻综合征 (SADS) 等冠状病毒 (CoV) 的情况尤其如此,它们导致数千人死亡以及大量死亡。养猪场的死亡率。尽管大量研究已在全球范围内发现了蝙蝠冠状病毒,但目前对热带岛屿生态系统中冠状病毒出现的多样性和风险的了解仍有待准确评估。本论文的目的是研究蝙蝠种群中冠状病毒的生态和进化。最初,我们对宿主接触 x CoV 的程度以及这些病毒在西印度洋岛屿的系统发育地理学背景下的进化历史感兴趣。基于对 1088 个样本的分子生物学分析,这项研究首次强调了 εayotte、εozambique、留尼汪岛和马达加斯加的食虫蝙蝠中存在 CoV。蝙蝠感染冠状病毒的总体患病率为 8.0% ± 1.2%,非洲大陆和岛屿之间以及蝙蝠科之间也存在显着差异。我们发现了 α-CoV 和 β-CoV 的巨大遗传多样性,其中一些在系统发育上与人类 CoV 接近(例如HCoV-NL63、HCoV-229E、MERS-CoV)。最后,这些 CoV 在系统发育上由蝙蝠家族构成,支持西印度洋蝙蝠与其 CoV 之间共同进化的悠久历史。然后,我们对留尼旺岛特有物种小莫洛瑟尔 (Mormopterus francoismoutoui) 产妇群体中 CoV 感染的动态进行了纵向研究。基于对环境样本(粪便和鸟粪)中病毒基因组的检测,我们探讨了连续两年内人口结构对感染动态的影响。结果显示,蝙蝠感染率在季节变化中存在非常明显的变化,存在两个感染高峰:在产房洞穴定殖期间(与宿主密度增加有关),以及大约一个月分娩后(与新生儿免疫力丧失有关)。所有这些工作表明,西印度洋蝙蝠体内冠状病毒的进化主要是由于宿主与其病毒之间的共同进化,尽管岛屿环境也可能导致蝙蝠家族内岛屿内的物种形成。在种群水平上影响感染动态的生态和生物因素的识别突出表明,冠状病毒传播给其他宿主的风险因每个岛屿上现有的蝙蝠群落而异,也取决于宿主种群的结构和它的时间变化。
概要 人畜共患病 60% 是突发传染病,70% 是野生动物的人畜共患病。 Les chauves-souris sont les hôtes de nombreuxagents infectieux, notamment deviruses responsables de Zoonoses chez l'Hommecomme 病毒埃博拉病毒、 尼帕病毒或亨德拉病毒。近期,新冠病毒在人类和动物群体中蔓延,对公共健康产生重要影响,并成为经济发展的主要动力。冠状病毒 (CoV) 与严重呼吸综合征 (SRAS)、中东呼吸综合征 (MERS) 和猪肉腹泻综合征 (SADS) 相关,人类负有责任猪的死亡率很高。还需要研究世界各地冠状病毒的识别、多样性的实际情况以及热带岛屿生态系统中冠状病毒的危险关联 精确。这些目标是研究冠状病毒在年轻人中的生态学和演化。在第一时间,我们将密切关注新冠病毒的爆发,以及印度洋西部岛的病毒进化史。对 1088 个生物学分子的分析,以证据为基础,首次展示了来自塞约特岛、桑比克岛、留尼汪岛和马达加斯加的冠状病毒的存在。冠状病毒感染的全球流行率为 8.0% ± 1.2%,在非洲大陆和岛屿之间存在显着变异,主要是在非洲大陆和岛屿之间。我们可以识别α-冠状病毒和β-冠状病毒的遗传多样性,但不能确定人类冠状病毒的系统发育过程(例如HCoV-NL63、HCoV-229E、MERS-CoV)。 Enfin是冠状病毒家族的系统发育史,支持了冠状病毒与印度洋和西方冠状病毒之间的长期共同进化历史。我们正在第二次研究冠状病毒动态感染的纵向研究,特别是留尼汪岛特有的小莫洛斯母体殖民地。根据在环境预防措施(粪便和鸟粪)中检测基因组病毒的情况,我们探索了连续几年的感染动态对人口结构的影响。蒙特伦特的一系列变化结果显示,感染流行情况是在季节中出现的,并且存在两张感染图片:lors de la colonization de la grotte de maternité (associé à uneauguration de la densité des hôtes), et en mois après le début de la parurition (associé à la perte d'immunité chez les nouveaux -nés)。冠状病毒在印度洋西部的冠状病毒进化合奏是主要由于病毒与病毒的共同进化而产生的,在岛屿内的环境下,它与岛内的物种形成了联系。肖韦苏里斯家庭。生态学和生物学事实证明了人口流动性感染的动态性,它是冠状病毒传播的风险,与其他国家的社区功能不同 - 澳大利亚查克岛的最新报道人口结构和时间变化。