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KRAB-dCas9 + DNMT3 和 Ezh2-dCas9 + DNMT3 命中并逃逸表观基因组编辑的可遗传基因沉默决定因素
精准表观基因组编辑作为一种在不改变遗传信息的情况下调节基因表达的方法，已引起广泛关注。然而，一个主要的限制因素是基因表达变化往往是暂时的，不像自然界中经常发生的终生表观遗传变化。在这里，我们系统地探究了基于 CRISPR / dCas9 的表观基因组编辑器 (Epi-dCas9) 设计持久表观遗传沉默的能力。我们阐明了有助于表观遗传重编程差异稳定性的顺式调控特征，例如活跃转录组蛋白标记 H3K36me3 和 H3K27ac 分别与对短期抑制的抵抗力和对长期沉默的抵抗力密切相关。H3K27ac 与 DNA 甲基化的增加呈负相关。有趣的是，仅当使用 KRAB-dCas9 和可靶向 DNA 甲基转移酶 (DNMT3A-dCas9 + DNMT3L) 组合时才观察到对 H3K27ac 的依赖，而当用可靶向 H3K27 组蛋白甲基转移酶 Ezh2 替换 KRAB 时则未观察到。此外，可编程 Ezh2 / DNMT3A + L 处理显示出增强的局部 DNA 甲基化工程，并且对不同的染色质状态不敏感。我们的结果强调了局部染色质特征对于可编程沉默的遗传性的重要性以及对基于 KRAB 和 Ezh2 的表观遗传编辑平台的差异响应。本研究获得的信息为理解上下文线索以更可预测地设计持久沉默提供了基本见解。
NMT 头皮脑电图数据集：用于预测模型的健康和病理脑电图记录的开源注释数据集
脑电图 (EEG) 广泛用于诊断癫痫、神经退行性疾病和睡眠相关疾病等神经系统疾病。正确解释 EEG 记录需要训练有素的神经科医生的专业知识，而这种资源在发展中国家非常稀缺。神经科医生花费大量时间筛选 EEG 记录以寻找异常。由于 EEG 测试的产量低，大多数记录结果完全正常。为了最大限度地减少这种时间和精力的浪费，可以使用自动算法提供诊断前筛查，以区分正常和异常 EEG。数据驱动的机器学习提供了一种前进的方向，然而，现代机器学习算法的设计和验证需要经过适当策划的标记数据集。为了避免偏见，基于深度学习的方法必须在来自不同来源的大型数据集上进行训练。这项工作提出了一个新的开源数据集，名为 NMT 头皮 EEG 数据集，由来自不同参与者的 2,417 条记录组成，跨越近 625 小时。每条记录都由一组合格的神经病学家标记为正常或异常。还包括患者的性别和年龄等人口统计信息。我们的数据集主要针对南亚人口。我们在 NMT 上实施和评估了几种为 EEG 诊断前筛查而开发的最先进的深度学习架构，并将其与著名的天普大学医院 EEG 异常语料库的基线性能进行了比较。我们还研究了基于深度学习的架构在 NMT 和参考数据集上的泛化。发布 NMT 数据集是为了增加 EEG 数据集的多样性，并克服 EEG 研究缺乏准确注释的公开可用数据集的问题。
紫檀芪可导致乳腺癌细胞中 DNMT3B 介导的 DNA 甲基化和 OCT1 靶向致癌基因的沉默
转录因子 (TF) 介导的基因调控通常在致癌过程中被破坏。TF 结合位点的 DNA 甲基化状态可能决定相应基因的转录活性。研究表明，芪类多酚，如紫檀芪 (PTS)，可通过重塑 DNA 甲基化和基因表达发挥抗癌作用。然而，这些影响背后的机制仍不清楚。本文探讨了 PTS 处理的 MCF10CA1a 侵袭性乳腺癌细胞中致癌 TF OCT1 结合与从头 DNA 甲基转移酶 DNMT3B 结合之间的动态关系。使用染色质免疫沉淀 (ChIP) 和下一代测序，我们确定了 47 个基因调控区，这些区域在 PTS 作用下 OCT1 结合减少，DNMT3B 结合丰富。大多数这些基因被发现具有致癌功能。我们选择了三个候选基因 PRKCA、TNNT2 和 DANT2，以进一步研究机制，同时考虑 PRKCA
旅行和移动技术领域的初创企业投资趋势 - TNMT
纵观整个疫情期间，旅行和移动技术中非地面交通领域的表现，可以发现只有一个类别能够在危机期间增加其相对融资份额：航空。事实上，航空相关初创公司在 2020 年新冠疫情高峰期筹集了超过一半的投资资金，而 2021 年迄今为止筹集了 65% 的投资资金。考虑到疫情对航空旅行的巨大影响，这似乎极为令人惊讶。哪种航空初创公司最能引起投资者的兴趣，为什么？为了找出答案，我们将包括航空在内的六大初创公司类别分成更小的公司集群，以确定赢家和输家。
2021-2022 NMT 课程目录
新墨西哥矿业技术学院致力于推行一项政策，即所有人都有权享受学院的课程、设施和就业机会，不论其种族、年龄、宗教、肤色、国籍、血统、性别、性取向、身体或精神残疾或严重医疗状况、配偶关系或性别认同，这均符合《新墨西哥州人权法案》、《1964 年民权法案》第六章和第七章及其修正案、1866 年民权法案、第 11246 号行政命令、1973 年康复法案第 503 和 504 节、《美国残疾人法案》、《1990 年就业年龄歧视法案》、《1974 年越战退伍军人重新适应援助法案》、《1975 年教育修正案第九章》、《移民改革和控制法案》或其他适用法律法规的规定。有关合规性的问询可直接联系：Randy Saavedra，平权行动主任，新墨西哥矿业技术学院布朗厅 20D 室，801 Leroy Place，新墨西哥州索科罗 87801；电话 505.835.5005。电子邮件：Randy.Saavedra@nmt.edu。
硬脂酰辅酶 A 去饱和酶 1 活性决定胰腺 β 细胞中 DNMT1 介导的 DNA 甲基化模式的维持
1 波兰科学院 Nencki 实验生物学研究所细胞信号传导和代谢紊乱实验室，02-093 华沙，波兰；a.dobosz@nencki.edu.pl (AMD)；j.janikiewicz@nencki.edu.pl (JJ)；a.dziewulska@nencki.edu.pl (AD) 2 波兰科学院核物理研究所跨学科研究部，31-342 克拉科夫，波兰；anna.maria.borkowska@uj.edu.pl (AMB)；Ewelina.Lipiec@ifj.edu.pl (EL)； Wojciech.Kwiatek@ifj.edu.pl (WMK) 3 波兰克拉科夫雅盖隆大学物理、天文与应用计算机科学学院，30-348 4 波兰科学院 Nencki 实验生物学研究所分子医学生物化学实验室，02-093 华沙，波兰；p.dobrzyn@nencki.edu.pl * 通讯地址：a.dobrzyn@nencki.edu.pl © 检查 ^ x 更新
议定书 DFMO 第二阶段 NMTRC 003B A ...
注意：第 18 组是 CGIRB 和 WIRB 的共享组。第 19 组是 Aspire 和 WIRB 的共享组。协议标题：DFMO（盐酸依氟鸟氨酸）作为单一药物在缓解期高风险神经母细胞瘤患者中的 II 期预防性试验。以下项目已获批准：DFMO（盐酸依氟鸟氨酸）作为单一药物在缓解期高风险神经母细胞瘤患者中的 II 期预防性试验。请注意有关本次审查的以下信息：所有 IRB 批准的研究人员必须遵守以下规定：根据 AAHRPP 关于其对 IRB 认证的要求，提交研究的个人和/或组织应及时向 IRB 传达或提供以下与保护人类受试者相关的信息，并在必要时促使每位研究人员及时传达或提供这些信息：• 应 IRB 要求，提供申办方或 CRO 与研究中心之间的书面计划副本，该计划说明是否将报销因研究相关伤害而产生的人类受试者的医疗费用，如果是，谁将负责，以确定与同意书中的语言一致。• 任何直接且实质性影响受试者安全或其继续参与意愿的研究中心监测报告。此类报告将在 5 天内提供给 IRB。• 任何数据监测委员会、数据和安全监测委员会或数据和安全监测委员会根据研究方案中指定的时间范围提交的报告。 • 已结束研究的任何发现，如果这些发现对过去受试者的安全和医疗护理有重大影响。研究结果将在研究结束后 2 年内报告。联邦法规要求 IRB 对已批准的研究进行持续审查。到期日临近时，您将收到来自此 IRB 的持续审查报告表格。感谢您使用此 WCG IRB 监督您的研究项目。副本分发：联系人，公司 Genevieve Bergendahl，RN，NMTRC
