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通过浅的全基因组测序评估的循环肿瘤DNA的动态变化与NSCLC中检查点抑制剂的临床功效相关
针对PD-1/PD-L1轴的免疫检查点抑制剂（ICIS）是晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者的主要治疗选择，而无需吸毒致癌性改变。尽管如此，只有一部分患者受益于这种治疗。在这里，我们评估了浅层全基因组测序（SWG）对等离子体样品的值，以监测ICI的好处。我们将SWG应用于从45例用ICIS治疗的转移性NSCLC患者的血浆样品中提取的无细胞DNA（CFDNA）。在ICI治疗开始之前，在整个治疗过程中获得了150多个样品。从SWGS数据中，我们计算了肿瘤分数（TFX）和体拷贝数变化（SCNA）负担，并将其与ICI的有益和临床特征相关联。TFX与骨骼和肝脏的转移性病变相关，与ICI有益相关的高TFX（≥10％）相关。此外，无论基线时TFX水平如何，其在治疗样品中的评估能够更好地预先临床效率。最后，对于可以计算出SCNA负担的患者的一部分，负担增加与ICI治疗后的好处减少相关。因此，我们的数据表明，SWG对CFDNA的分析可以以具有成本效益的方式对ICI的两种潜在生物标志物（TFX和SCNA负担）进行构成，从而促进了多个串行样本分析。将需要较大的队列来确定其临床潜力。
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稀有同位素梁（FRIB）的设施资源是科学用户设施的DOE办公室，根据奖励编号DE-SC0000661。这项工作得到了NSF PHY-11102511（NSCL），NSF PHY-103519（职业），NSF 1430152（Jina-Cee）（Jina-Cee），NNSA奖。
对设计的苯咪唑衍生物的分子对接分析为EGFR
摘要非小细胞肺（NSCL）和结直肠癌经常与表皮生长因子受体（EGFR）的致癌激活相关，这是受体酪氨酸激酶（RTK）家族的成员。当前的酪氨酸激酶抑制剂（TKI）容易受到耐药性突变的影响，并诱导了对正常EGFR S的细胞毒性作用。带嘌呤的苯咪唑的同余性质具有模仿基于嘌呤的ATP的结合模式并防止其与EGFR活性位点的接触的巨大潜力。在这里，我们报告了50种设计的苯咪唑衍生物以及Gefitinib和ATP的分子对接，以分析和比较EGFR WT和T790M活性位点的结合模式。配体的设计基于我们先前的研究，我们建议评估与双键接头的酮和氨基 - 苯并咪唑，以及在各个位置附有电子捐赠和电子撤回的苯基基团。对接模拟表明，酮苯并咪唑在两个EGFR配合物中占据了前十名最高结合亲和力。与其他具有-8.1（7C）和-7.8（11C）KCAL/MOL在EGFR WT中的结合能相比，具有更稳定的复合物的磺酰基取代基的存在，eGFR WT中的结合能，-8.3（7d）和-8.4（7d）和-8.4（1c）kcal/mol for t790m t790m for T790m。对苯咪唑的取代影响不仅有助于氢键和疏水相互作用，而且还对经常被转化的范德华力的力，这些力是负责苯并咪唑与EGFR结合口袋的形状互补性的负责。