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有理药物发展中的反义和功能性核酸
摘要：本综述集中于反义和功能性核酸，用于完全合理的药物设计和药物靶标评估，旨在减少时间和金钱，并增加成功的药物开发率。核酸具有独特的特性，可以在药物发育中作为药物靶标和药物发挥两个重要作用。药物靶标可以是信使，核糖体，非编码RNA，核酶，核糖开关和其他RNA。此外，各种反义和功能性核酸可能是药物发现中的宝贵工具。在亲核和工程方法中基于RNA的基因表达控制基因表达的许多机制开放了具有关键作用的药物发现的新途径。本综述讨论了在药物输送和设计中反义和功能性核酸的设计原理，应用和前景。这种核酸包括反义寡核苷酸，合成核酶和siRNA，可用于有效的有效抗菌药物开发。反义和功能性核酸的重要特征是使用有理设计方法进行药物开发。本评论旨在普及这些新颖的方法，以使制药业和患者受益。
金纳米粒子用于癌症治疗的核酸矢量化
摘要：癌症仍然是一个复杂的医学挑战，也是全球主要的死亡原因之一。纳米药物已被提议作为应对这些复杂疾病的创新平台，其中几种治疗策略的结合可能会提高治疗成功率。在这些纳米药物中，纳米粒子介导的核酸递送已被提出作为调节基因表达的关键工具，无论是靶向基因沉默、干扰 RNA 机制还是基因编辑。这些新型递送系统强烈依赖于纳米粒子，特别是金纳米粒子 (AuNPs) 为有效的递送系统铺平了道路，因为可以微调它们的尺寸、形状和表面特性，再加上易于用不同的生物分子进行功能化。在此，我们将讨论调节致癌基因和肿瘤抑制基因表达的不同分子工具，并讨论 AuNP 功能化在体外和体内模型中用于核酸递送的最新进展。此外，我们将重点介绍这些基于球形 AuNP 的结合物在基因传递方面的临床应用、当前的挑战以及纳米医学的未来前景。
用于将核酸转移到 ATCC 细胞中的转染试剂
阳离子脂质有助于将核酸递送到真核细胞中。它们的基本结构由带正电的头部基团和一条或两条烃链组成。带电的头部基团介导脂质与核酸带负电的磷酸骨架之间的相互作用。据推测，这些相互作用导致核酸-脂质体复合物的形成，该复合物随后可能与靶细胞的质膜接触并通过内吞作用被吸入。或者，核酸-脂质体复合物可能与质膜融合并混合，将核酸沉积到细胞质中。
核DHX9与STAT1合作以转录干扰素刺激的基因
RNA解旋酶DHX9已被广泛地描述为转录调节剂，这与其主要是核定位置一致。它也参与了识别细胞质中的RNA病毒。但是，没有体内数据来支持DHX9的抗病毒作用。同时，作为一种核蛋白，IF以及核DHX9如何促进抗病毒免疫仍然在很大程度上未知。在这里，我们产生了髓样特异性和肝细胞 - 特异性DHX9敲除小鼠，并确认DHX9对于体内RNA病毒感染的宿主抗性至关重要。通过DHX9缺乏小鼠的其他基因敲除MAV或STAT1，我们证明了核DHX9在调节I型干扰素下游的干扰素刺激的基因（ISG）表达中起着积极的作用。Mech-在干扰素刺激下，DHX9直接与STAT1结合，并将POL II招募到ISG启动子区域，以参与ISGS的STAT1介导的转录。共同发现了核DHX9在抗病毒免疫中的重要作用。
1985 年第 13 卷第 2 期核酸研究
摘要 研究了由根癌农杆菌菌株 15955 引起的克隆烟草冠瘿肿瘤 1595501。通过南方转移和杂交技术对 T-DNA 组织进行分子分析表明，1595501 肿瘤有大约 10 个 TL DNA 拷贝，其中 5 个是完整的 TL DNA，而大多数章鱼碱肿瘤只有 1 到 2 个完整的 TL DNA 拷贝。杂交研究和基因组克隆表明，T-DNA 的某些片段已发生缺失。其中一个克隆含有两个 T-DNA 拷贝，它们的方向相互颠倒。对 1595501 肿瘤系的两个 TL DNA 左端和章鱼碱质粒的相应区域进行了测序。将各种克隆的 T-DNA 序列与 Ti 质粒序列进行比较，表明虽然与 25 个碱基对的直接重复有关，但 T-DNA 中没有特定的碱基对集合与 Ti 质粒序列出现分歧。
dnazure®蓝核酸凝胶染色，100x
图2。生物生物的现成1 kb DNA梯子以两倍的稀释液在1％琼脂糖凝胶上加载，范围从200 ng到3.125 ng总梯子。标记了每个车道中1500 bp带（由箭头标记）的质量。将凝胶用Dnazure®蓝色核酸凝胶染色染色30分钟，然后使用白色LED灯开发可见的蓝色DNA波段30分钟。左：使用带有白光转换器板和Visi-Blue™滤光片的UV Transilluminator在UVP Geldoc-It®成像系统上成像的可见蓝带。右：在700 nm通道中的Li-Cor®Odyssey®近红外成像系统上成像的近红外荧光。将凝胶面朝下成像，增益设置为8。dnazure®染色带也在Odyssey®800nm通道中的荧光（未显示）。此凝胶在获取这些图像之前，将其存储在台式上的染色缓冲液中六周。
用于基因治疗/核酸递送的非病毒载体
在19世纪，格雷戈尔·门德尔（Gregor Mendel）确定了可遗传的单元，如今被称为基因，并为新兴治疗形式奠定了一种称为基因疗法（GT）的形式。随后，从对双链DNA的描述到人类基因组项目的完成，GT已成为多种基于基因疾病的强大治疗选择。gt涉及细胞内引入核酸（NA） - 材料，用于改变宿主蛋白表达以治愈患病状态。但是，尽管正在进行近3,000次临床试验（完成或正在进行），但GT仍仅在实验阶段仍然存在。使它无法实现其真正潜力的主要挑战是将靶基因/NA传递到细胞或组织中（Ginn等，2018； Pan等，2021）。需要一个被称为“矢量”的输送系统才能在细胞内携带此类货物。传统上，由于较高的转染效率，使用了病毒或基于病毒的系统。然而，由于免疫原性，细胞毒性，非靶向插入，不足的长期研究以及非常高的成本，临床应用受到限制。在这种情况下，非病毒载体正在出现，随着绕过病毒系统致病性的更安全替代方案的相关性越来越高。基于脂质的纳米颗粒和阳离子聚合物代表有助于NA递送的常规化学物质。这种纳米/微系统是临床试验中唯一的非病毒载体，但仍因其在血清中汇总的趋势而阻碍（Pan等，2021）。在有希望的票据中，在综合共同疫苗的前所未有的全球努力中，成功实施的实施最近得到了强调。其中一些使用脂质纳米颗粒来影响疫苗本身的总体免疫调节特性，除了货物输送和保护外（Guerrini等，2022）。然而，对于其他疾病和治疗学中的可比临床应用，临床前研究阶段，类似材料，例如脂质体，poly（2-（N，N，N-二甲基氨基）甲基丙烯酸乙酯）或聚（L-赖氨酸）或聚（l-赖氨酸）仍然因降低和矛盾的结果而受到矛盾的结果，并保持了偏见，并且伴随着extragitiation，并且会导致疾病的矛盾性，并且伴随着extragitiation and extrications Hemaggrutation and hemaggglutation decornitiation and Hemaggglutiation and。 Escape（Poddar等，2019a）。因此，转染效率，货物保护和全身聚集的挑战是需要进一步改善该领域的关键领域。但是，涉及输送系统的研究文章不到1％，专注于非病毒选择。这种松弛正在拾起，作为多种新颖策略，例如独特的材料，配方和
淀粉样蛋白-β阳性在认知无损的klotho kl-vs杂合子中较少普遍抑制ALKB核酸脱甲基酶-UCL发现抑制ALKB核酸脱甲基酶-UCL发现
摘要：核酸脱甲基酶的ALKB家族目前具有强烈的化学，生物学和医学兴趣，因为它们在几个关键的细胞过程中具有关键作用，包括表观遗传基因调节，RNA代谢和DNA修复。新兴证据表明，ALKB脱甲基酶的失调可能是几种人类疾病的发病机理，尤其是肥胖，糖尿病和癌症。因此，对这些酶开发选择性抑制剂的浓厚兴趣是促进其机械和功能研究并验证其治疗潜力的兴趣。在这里，我们回顾了过去二十年来ALKB脱甲基酶抑制研究所取得的显着进步。我们讨论了报告的抑制剂的合理设计，它们的结合方式，选择性，细胞活性和治疗机会。我们进一步讨论了ALKB亚家族的未开发的结构元素，并提出了潜在的策略以实现亚家族选择性。希望这种观点能够激发新型抑制剂设计并推进该领域的药物发现研究。
dnaforge：核酸线框纳米结构的设计工具
strands”在DNA折纸中，接吻环和RNA折纸中的其他连接器图案）。两种方法都已用于设计各种2D形状和3D结构（5，6）。大多数当前的3D折纸设计遵循在彼此顶部包装几层二维螺旋或螺旋束的方法，和/或弯曲的螺旋束如（7，8）中最初建议。3D设计的替代路径是创建一个线框结构，该结构仅包含3D模型的边界边缘和顶点。在这个方向上有几个值得注意的前虫前旅行（9，10），但是随着柔性且坚固的折纸技术的发展，它大多开始获得追随者（6，11）。与螺旋装箱相比，线框设计的一些优势包括使用链的经济，这允许建造较大的结构，并在低盐条件下更好地折叠。一些挑战是结构的刚性较低，尤其是对于大型的单螺旋边缘设计（可以通过使用多螺旋边缘来减轻，以增加链的使用来缓解）和大型复杂设计的产量低。已经存在几种核酸纳米结构设计工具（8、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21）。Most of these however address helix-packing designs, with the more recent ones oriented towards wireframe structures including vHelix (14), DAEDALUS (15) and ATHENA (18) for 3D DNA wireframes, Sterna (20) for single-stranded 3D RNA wireframes and PyDAEDALUS (21) for 3D RNA/DNA hybrid wireframes.这些工具主要支持一种特定的设计方法，每个工具也都处于离线状态，需要一个单独的过程来安装工具及其辅助库，有时可能很难找到或在最坏的情况下弃用。