杂合性缺失 (LOH) 是癌症基因组的一个标志性特征,可减少等位基因变异,从而产生可用于治疗目的的肿瘤特异性弱点。我们之前报告过,8p22 处的 LOH 导致药物代谢芳胺 N -乙酰转移酶 2 (NAT2) 活性丧失,可作为结直肠癌 (CRC) 的附带致死抗癌疗法的靶点。在这里,我们报告了一种新型化合物 CBK034026C,它对具有高 NAT2 活性的 CRC 细胞表现出特异性毒性。连接图分析显示,CBK034026C 引发了与 ATPase 抑制剂相关的反应模式。与 Na + /K + -ATPase 的强效抑制剂乌巴因类似,CBK034026C 激活了 Nf-kB 通路。进一步的代谢组学分析表明,在具有高 NAT2 活性的 CRC 细胞中,与抗氧化防御和线粒体代谢相关的通路下调,从而削弱了对 CBK034026C 诱导的氧化应激的保护性反应。鉴定出一种针对由 NAT2 活性引起的代谢脆弱性的小分子,为开发抗癌药物提供了新途径。
背景:N-乙酰基转移酶2(NAT2)酶是一种代谢不同化合物的II期药物代谢酶。Nat2中遗传变异会影响酶的活性,并可能导致某些疾病的发展。 目的:本研究旨在研究NAT2变体与约旦患者的II型糖尿病(T2DM)和脂质概况的风险。 方法:我们使用Sanger的方法在45名约旦T2DM患者和50名对照组的样本中使用Sanger的方法对整个蛋白质编码区进行了测序。 此外,我们分析了患者的脂质谱,并检查了与Nat2变体的任何潜在关联。 结果:这项研究表明,在T2DM(44%)中,杂合NAT2*13 C/T基因型比非T2DM受试者(23.5%)更为常见(P = 0.03)。 此外,与非T2DM受试者(11%)相比,T2DM患者的纯合NAT2*13 T/T基因型的频率明显更高(P = 0.03)(26.7%)。 在T2DM患者(11.1%)中仅观察到杂合Nat2*7 g/A基因型,在对照非T2DM组中不存在。 此外,在T2DM患者中,具有纯合NAT2*11 T/T基因型的患者在甘油三酸酯(381.50±9.19 ng/dl)中表现出明显更高的水平,P值为0.01,与具有杂合NAT2*11 C/T(136.23-.23-23-yg 2 ng或wriel of nat2*11 c/t)相比C/C(193.65±109.89 ng/dl)基因型。 结论:这项研究的发现表明,Nat2基因是约旦人中T2DM发展和甘油三酸酯水平变化的潜在生物标志物。遗传变异会影响酶的活性,并可能导致某些疾病的发展。目的:本研究旨在研究NAT2变体与约旦患者的II型糖尿病(T2DM)和脂质概况的风险。方法:我们使用Sanger的方法在45名约旦T2DM患者和50名对照组的样本中使用Sanger的方法对整个蛋白质编码区进行了测序。此外,我们分析了患者的脂质谱,并检查了与Nat2变体的任何潜在关联。结果:这项研究表明,在T2DM(44%)中,杂合NAT2*13 C/T基因型比非T2DM受试者(23.5%)更为常见(P = 0.03)。此外,与非T2DM受试者(11%)相比,T2DM患者的纯合NAT2*13 T/T基因型的频率明显更高(P = 0.03)(26.7%)。在T2DM患者(11.1%)中仅观察到杂合Nat2*7 g/A基因型,在对照非T2DM组中不存在。此外,在T2DM患者中,具有纯合NAT2*11 T/T基因型的患者在甘油三酸酯(381.50±9.19 ng/dl)中表现出明显更高的水平,P值为0.01,与具有杂合NAT2*11 C/T(136.23-.23-23-yg 2 ng或wriel of nat2*11 c/t)相比C/C(193.65±109.89 ng/dl)基因型。结论:这项研究的发现表明,Nat2基因是约旦人中T2DM发展和甘油三酸酯水平变化的潜在生物标志物。T2DM纯合NAT2*12 g/g基因型的患者的甘油三酸酯水平明显高于甘油三酸酯水平(275.67±183.42 ng/dl)比杂合子Nat2*12 a/g(140.02±49.53 ng/dl)和109. 12 a/g(140.02±49.53 ng/dl) ng/dl)。但是,重要的是要注意我们的样本量有限。因此,需要进行较大队列的进一步临床研究以验证这些发现。关键字:II型糖尿病,N-乙酰基转移酶2,Nat2,甘油三酸酯,遗传变异,约旦人口
针对体细胞旁观者遗传事件的疗法代表了癌症治疗的新途径。我们最近发现了一组结直肠癌 (CRC) 患者,他们对一个野生型和一个低活性等位基因 (NAT2*6) 是杂合的,但由于 8p22 的杂合性缺失 (LOH),他们的肿瘤中缺少野生型等位基因。这些肿瘤对用 NAT2 的细胞毒性底物(6-(4-氨基苯基)-N-(3,4,5-三甲氧基苯基)吡嗪-2-胺,APA)治疗敏感,并指出 NAT2 缺失是 CRC 肿瘤在治疗上可利用的弱点。为了更好地估计可治疗的 CRC 患者的总数,我们在此确定了 LOH 后还保留其他 NAT2 低活性变体的肿瘤细胞是否对 APA 治疗有反应。发现普遍存在的低活性等位基因 NAT2*5 和 NAT2*14(而非 NAT2*7)是低代谢物,对 APA 具有高敏感性。通过分析两个不同的 CRC 患者队列,我们在约 24% 的肿瘤中检测到 APA 可靶向的 NAT2 等位基因的杂合性以及指向 LOH 的等位基因失衡。最后,为了在临床环境中对肿瘤和患者匹配的正常样本中的 NAT2 基因座进行单倍型分析,我们开发并展示了一种基于长读测序的检测方法。每年共有 > 79,000 名 CRC 患者符合对 NAT2 LOH 疗法具有高敏感性的遗传标准,并且可以通过临床测序评估他们的资格。
摘要:我们报告了沉积在石墨烯上的 5,5′-双(萘-2-基)-2,2′-联噻吩 (NaT2) 薄膜的微观结构、形貌和生长,以掠入射 X 射线衍射 (GIXRD) 为特征,并辅以原子力显微镜 (AFM) 测量。NaT2 沉积在两种类型的石墨烯表面上:定制样品,其中我们将化学气相沉积 (CVD) 生长的石墨烯层转移到 Si/SiO 2 基底上,以及常见的商业转移 CVD 石墨烯到 Si/SiO 2 上。原始 Si/SiO 2 基底用作参考。NaT2 晶体结构和取向在很大程度上取决于下面的表面,分子主要位于石墨烯表面(面向取向),并在 Si/SiO 2 参考表面上几乎位于平面外(边缘取向)。生长后的 GIXRD 和 AFM 测量表明,晶体结构和晶粒形态会根据石墨烯表面是否有聚合物残留而有所不同。原位 GIXRD 测量表明,在沉积过程开始时,结晶边缘相的 (111) 反射强度的厚度依赖性不会与零相交,这表明在表面 - 薄膜界面处形成了对应于 1-2 个分子层的初始润湿层。相比之下,在整个沉积过程中,结晶正面相的 (111) 反射强度以恒定的速率作为薄膜厚度的函数增长。■ 简介
抽象客观炎症性肠病(IBD)是一种多因素免疫介导的肠道疾病,包括克罗恩病和溃疡性结肠炎。通过表征粪便中的代谢产物,结合粪便宏基因组学,宿主遗传学和临床特征,我们旨在揭示IBD代谢改变。设计,我们在424例IBD患者和255个非IBD对照组的凳子样品中测量了1684种不同的粪便代谢产物和8个短链和分支链脂肪酸。回归分析用于比较病例和对照之间的代谢物浓度,并确定代谢物与每个参与者的生活方式,临床特征和肠道菌群组成之间的关系。此外,在粪便代谢物水平上进行了全基因组关联分析。结果,我们确定了300多个分子,这些分子在IBD患者的粪便中差异很大。鞘脂和L-尿蛋白之间的比率可以区分IBD和非IBD样品(AUC = 0.85)。我们发现胆汁酸微生物群落患者的胆汁酸池的变化以及粪便代谢组和肠道微生物群之间的牢固关联。例如,大量的Ruminococcus gnavus与色胺水平呈正相关。此外,我们发现了代谢物与饮食模式之间的158个关联,以及Nat2附近的多态性与咖啡代谢密切相关。考虑了微生物组对粪便代谢产物的影响,我们的结果为针对肠道炎症的将来的干预措施铺平了道路。在这项大规模分析中的结论中,我们确定了IBD患者代谢组的改变,这些变化与常见的混杂因素,例如饮食和外科史。
