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Daniel W. Rosenberg博士NEAG癌症中心结肠癌预防计划的癌症生物学医学和健康网教授Daniel W. Rosenberg博士NEAG癌症中心结肠癌预防计划的癌症生物学医学和健康网教授
Daniel W. Rosenberg博士 NEAG癌症中心医学系（小学）的医学和健康网癌症生物学预防计划主任（小学）；遗传学和发育生物学系（次要）分子和细胞生物学系 - 斯特尔斯校园（辅助教师）个人信息业务地址：康涅狄格大学康涅狄格大学健康中心分子肿瘤学中心，康涅狄格州法明顿，康涅狄格州商业电话：（860）679-8704 FAX：（860）679-76-76-7639 HOMER：4 TIFF NIFF：4 TIFF NIFF：4 TIFF。电话：（860）922-7322公民身份：美国出生地点：伊丽莎白，新泽西州的电子邮件地址：rosenberg@uchc.uchc.edu纽约州立大学，纽约州锡拉丘兹大学环境科学与林业学院 生物化学国家纽约大学布法罗，布法罗，纽约州布法罗，1977年M.S. 分子和细胞生物学，UCONN，Storrs兼职教授，UConn，Storrs，Storrs，2004年康涅狄格大学健康中心医学教授，2004年，2004年遗传学和发育生物学系教授，UCHC奖和会员资格Daniel W. Rosenberg博士NEAG癌症中心医学系（小学）的医学和健康网癌症生物学预防计划主任（小学）；遗传学和发育生物学系（次要）分子和细胞生物学系 - 斯特尔斯校园（辅助教师）个人信息业务地址：康涅狄格大学康涅狄格大学健康中心分子肿瘤学中心，康涅狄格州法明顿，康涅狄格州商业电话：（860）679-8704 FAX：（860）679-76-76-7639 HOMER：4 TIFF NIFF：4 TIFF NIFF：4 TIFF。电话：（860）922-7322公民身份：美国出生地点：伊丽莎白，新泽西州的电子邮件地址：rosenberg@uchc.uchc.edu纽约州立大学，纽约州锡拉丘兹大学环境科学与林业学院生物化学国家纽约大学布法罗，布法罗，纽约州布法罗，1977年M.S.分子和细胞生物学，UCONN，Storrs兼职教授，UConn，Storrs，Storrs，2004年康涅狄格大学健康中心医学教授，2004年，2004年遗传学和发育生物学系教授，UCHC奖和会员资格环境健康，毒理学 - 密歇根大学，安阿伯，密歇根州安阿伯，1982 Ph.D.环境健康，毒理学 - 密歇根大学，密歇根州安阿伯大学（论文研究（论文研究）（在洛克菲勒大学与密歇根大学的联合安排在洛克菲勒大学进行）专业经验1978年的专业经验，访客调查员，纽约洛克菲勒大学，纽约，纽约，1982年，1982年，1982年，纽约州洛克凯菲勒大学，纽约州纽约州纽约州纽约州哥伦比尔大学，1986年，纽约州哥伦比尔大学。纽约州洛克菲勒大学教授，纽约纽约，纽约市亨特学院辅助助理教授，纽约，纽约，纽约，1991年，纽约州洛克菲勒大学兼职助理教授，纽约大学，纽约州纽约大学，康涅狄格大学康涅狄格大学康涅狄格大学助理教授康涅狄格大学康涅狄格大学药学学院的辅助副教授，CT，CT，1996年，纽约州洛克菲勒大学访问科学家，纽约，纽约（夏季），1997年，纽约州纽约市的访问科学家，纽约，纽约（夏季）2000年，2000年，2000年，2000年，2000年，2000年，2000年，纽约州哥伦比亚特学。 UCHC 2003 UCHC的联合创始人兼科学总监预防结肠癌计划，UCHC兼职教授，
基因组和生物信息学 - 拟南文 -
Genomic and bioinformatic profiling of mutational neoepitopes reveals new rules to predict anticancer immunogenicity Fei Duan 1 , Jorge Duitama 2 , Sahar Al Seesi 2 , Cory M. Ayres 3 , Steven A. Corcelli 3 , Arpita P. Pawashe 1 , Tatiana Blanchard 1 , David McMahon 1 , John Sidney 4 , Alessandro Sette 4 , Brian M. Baker 3，I. Mandoiu 2和Pramod K. Srivastava 1 1 1 1免疫学和Carole和Ray Neag Neag Neag综合癌症中心，康涅狄格大学医学院，法明顿大学，CT 06030 2计算机科学与工程系，康涅狄格大学，康涅狄格大学，CT 06269 306269 3.巴黎圣母院（Notre Dame），在46556 46556 4 Lajolla过敏和免疫学研究所，La Jolla，CA 92037癌症的突变曲目创造了使癌症免疫原性的新皮特。在这里，我们介绍了两个新型工具，这些工具以相对较高的精度识别了一小部分的新皮特（在数百种潜在的新皮上）通过抗肿瘤T细胞响应保护宿主。这两个工具由（a）突变序列与未分离的对应物之间的NetMHC得分的数值差异称为差分激光指数（DAI），以及（b）MHC I肽相互作用的构象稳定性。从机械上讲，这些工具识别出突变以创建用于MHC结合的新的锚固残基的新皮特，并使整体肽更加刚性。这些结果大大扩展了目标癌抗原的宇宙，并确定了人类癌症免疫疗法的新工具。我们将方法应用于mutliple独立肿瘤。令人惊讶的是，此处鉴定出的保护性新皮肤引起了CD8依赖性免疫力，尽管它们对KD的亲和力是比500 nm的阈值低的数量级，但被认为合理的这种相互作用。实际上，包括DAI算法在内的管道首先是在肿瘤细胞系的甲基甲基细胞系中进行经验得出的，然后在CMS5细胞系上进行了测试。通过DAI算法预测的抗肿瘤活性在CMS5中明显强大。这种变化很可能是甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲基苯甲酸酯特有的免疫抑制机制的反映，因此与DAI算法本身的优点无关。此后，DAI算法在另一种小鼠肿瘤B16黑色素瘤和该系中T细胞反应的数据中进行了测试，与仅NETMHC的显着优越性一致。尽管本研究的重点是鉴定CD8 T细胞的MHC I限制表位，但该分析也可以扩展到CD4 T细胞的MHC II限制表位。