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单细胞水平的群体多样性
群体规模的单细胞基因组学是一种揭示遗传和细胞变异之间错综复杂联系的变革性方法。这种方法由尖端实验方法论推动，包括高通量单细胞多组学的发展以及多重环境和遗传扰动方面的进展。研究自然或合成遗传变异在细胞环境中的影响，可以深入了解遗传和环境在塑造细胞异质性方面的相互影响。计算方法论的发展进一步使得分子变异的详细定量分析成为可能，为研究随机、细胞间和个体间变异的各自作用提供了机会。未来的机会在于利用长读测序、改进与疾病相关的细胞模型以及采用预测和生成机器学习模型。这些进步有可能更深入地了解人类分子特征的遗传结构，这反过来对理解人类疾病的遗传原因具有重要意义。
工程周期性的双灯笼导向网络，具有可调能级对齐和磁各向异性的金属交换
在这方面，在过去几年中，已经对基于灯笼的单分子杂志（SMM）进行了深入研究，目的是针对分子水平的杂志稳定和较高密度存储应用的稳定。[5,12–19]缓慢的松弛时间，高磁矩和灯笼的可靠地面状态使其非常适合分子自旋的应用。[5,12,13]灯笼驱动的SMM方法的逻辑扩展将是包含灯笼的定期网络的工程，该网络可以充当主动磁性信息单位。在过去的几十年中，金属分子方案已成为一种强大的策略，用于设计嵌入金属元件的功能性网状材料。[20–22]这种合成范式也已经在表面上开发，能够设计2D金属 - 有机设计，主要采用过渡和碱金属。[23–25]
微生物11-01623.pdfIDR-14-2461.pdf
摘要：迅速实施适当的靶向抗生素疗法是改善重要化脓性患者临床和生态结果的一种有价值的方法。这本多学科意见文章着重于开发基于证据的算法，用于针对血液的靶向抗生素治疗（BSIS），复杂的尿路（CUTIS）和复杂的腹腔内感染（CIAIS）。目的是为重症监护医师提供适当放置新型抗生素或考虑保留最广泛的抗生素的策略的指导。A multidisciplinary team of experts (one intensive care physician, one infectious disease consultant, one clinical microbiologist and one MD clinical pharmacologist), performed several rounds of assessment to reach agreement in developing six different algorithms according to the susceptibility pattern (one each for multi-susceptible, extended-spectrum beta-lactamase-producing, AmpC beta-lactamase-producing, Klebsiella肺炎Carba Penemase（KPC） - 产生，OXA-48产生和金属β-内酰胺酶（MBL）-produ cing肠杆菌）。每当多种治疗选择是可行的，就建立了分层量表。关于抗生素优化的建议也被列出。为了检索算法中提出的治疗选择的基于证据的支持，从成立到2021年3月的PubMed-Medline研究人员进行了全面的文献搜索。根据研究设计的层次范围来实现证据的质量和强度。仅包括英文发表的文章。It is expected that these algorithms, by allowing prompt revision of antibiotic regimens whenever feasible, appropriate place in therapy of novel beta-lactams, implementation of strategies for sparing the broadest-spectrum antibiotics, and pharmacoki netic/pharmacodynamic optimization of antibiotic dosing regimens, may be helpful either in improving clinical outcome or in containing the spread of抗菌耐药性。关键字：重症患者，有针对性的抗生素治疗，抗菌管理，肠杆菌，多学科工作组，PK/PD给药优化
超导基底上外延 CrBr3 单层的电子和磁性表征
例如，我们可以将二维磁体的磁性印记到其他层上，而不改变它们的固有性质，从而创造出新型的自旋电子和磁子装置。[8–10] 这种设计概念可以用于将磁性与超导相结合的系统，以实现拓扑超导。[11,12] 由于它在构建用于拓扑量子计算的基于马约拉纳的量子比特模块中具有潜在作用，因此目前它正受到广泛关注。[12–14] 虽然很少有潜在的真实材料表现出拓扑超导性，[15–18] 但设计材料中所需的物理特性来自不同成分之间精心设计的相互作用。 对于拓扑超导，需要将 s 波超导与磁性和自旋轨道耦合相结合，以创造出人工拓扑超导体。 [12,19] 然而，组分之间的耦合对界面结构和电子特性高度敏感 [2,20]，因此，具有原子级清晰和高度均匀界面的范德华材料是一个具有吸引力的平台，可用于实现和利用设计材料中出现的奇异电子相。最近有研究表明，层状材料在单层 (ML) 极限下仍能保持磁性。[4,5,21] 虽然第一份报告依赖机械剥离进行样品制备，但相关材料三溴化铬 (CrBr 3 ) 和 Fe 3 GeTe 2 也在超高真空 (UHV) 下使用分子束外延 (MBE) 生长，[22,23] 这对于实现干净的边缘和界面至关重要。由于这些材料的层状性质，它们本身缺乏表面键合位点，从而阻止了层之间的化学键合，并导致对界面的更好控制。最近，我们利用MBE成功制备了基于vdW异质结构的超导铁磁混合体系。[24,25] 更重要的是，通过结合自旋轨道耦合、二维铁磁CrBr 3 和超导铌二硒化物（NbSe 2 ），我们利用低温扫描隧道显微镜（STM）和扫描隧道光谱（STS）证明了一维马约拉纳边缘模式的存在。[25] 然而，对于未来的应用，还需要进一步系统的研究，以更好地理解在NbSe 2 基底上生长的单层CrBr 3 的电子和磁性。
猿类：系统发育和进化分析
描述 用于读取、写入、绘制和操作系统发育树的函数，在系统发育框架中分析比较数据，祖先特征分析，多样化和宏观进化分析，计算 DNA 序列的距离，读取和写入核苷酸序列以及从 BioConductor 导入，以及多种工具，例如 Mantel 检验、广义天际线图、系统发育数据的图形探索（alex、trex、kronoviz）、使用平均路径长度和惩罚可能性估计绝对进化率和时钟树，使用非同时期序列确定树的年代，将 DNA 转化为 AA 序列，以及评估序列比对。系统发育估计可以用 NJ、BIONJ、ME、MVR、SDM 和三角法以及几种处理不完整距离矩阵的方法（NJ*、BIONJ*、MVR* 和相应的三角法）来完成。一些函数调用外部应用程序（PhyML、Clustal、T-Coffee、Muscle），其结果返回到 R 中。
表观遗传调节剂为理解疾病和治疗机会提供了途径
表观遗传学研究的是基因组的非遗传干扰产生的可遗传表型以及 DNA 核苷酸序列之上发生的机械过程。例如，对 DNA 的直接修饰、DNA 围绕构成染色质的组蛋白八聚体的组织以及翻译后修饰 (PTM) 在组蛋白尾部形成的直接能力会影响基因调控和细胞命运决定等可遗传特征。表观遗传状态不仅可遗传，而且可以动态且可逆（Jenuwein 和 Allis 2001）。新兴发现和尖端技术的使用为表观遗传调节剂控制的生理过程提供了见解。大量研究已经证实，蛋白质编码基因的异常表达以及种系和体细胞突变会影响 PTM、基因组组织格局的调控，进而影响发病机制，从而揭示出对抗多种疾病的生物标志物和新的治疗靶点（Dawson 和 Kouzarides 2012；Rando 和 Chang 2012；Sen 等人 2016；Dobson
表观遗传调节剂提供了了解疾病和治疗机会的途径
表观遗传学的领域解决了通过对基因组的非核扰动而产生的可遗传表型，以及在DNA的核肽序列上方发生的机械过程。例如，直接对DNA进行了直接修饰，组成染色质的组蛋白周围的DNA的组织以及翻译后修饰（PTM）在播音尾巴上形成的直接能力会影响基因调节和细胞命运诸如基因调节和细胞命运的决定。除了可遗传的epige-Netic国家可以是动态和可逆的（Jenuwein and Allis 2001）。新兴发现和尖端技术的使用为表观遗传调节剂控制的生理过程提供了见解。许多研究都记录了影响PTM的蛋白质编码基因中的异常表达以及种系和体细胞突变，调节基因组的组织格局以及发病机理，进而揭示了生物标志物和新颖的治疗靶标，以抗击许多疾病（Dawson and Kouzar-ides and and eN> 2012; rando and and and。2016; dobson
强力霉素诱导的过表达系统-Lirias
摘要强力霉素可诱导的过表达系统是用于体外和体内研究的高度灵活且广泛使用的工具。但是，在过去的十年中，使用此系统时明确要求谨慎。提出的担忧基于这样的观念：强力霉素会损害哺乳动物细胞的线粒体功能，并可以改变诸如细胞增殖之类的特性。因此，实验结果可能与强力霉素的副作用混淆，有效的解释可能会受到严重威胁。今天，似乎没有关于如何预言这些问题的共识。此外，一些用于应对这些困难的策略实际上可能引入与基因组不稳定性和细胞的GE网络修饰有关的其他问题。在这里，我们详细介绍了上述陈述，并通过我们个人湿lab体验中的一些基本示例来澄清它们。因此，我们提供了对强力霉素诱导的过表达系统的细微概述，其某些局限性以及如何处理它们。
针对肺癌的表观遗传学
癌症的特点是遗传、转录和表型异质性，这些异质性会影响癌症进展、转移和耐药性 (Lawson 等人 2018；Hinohara 和 Polyak 2019)。表观遗传变化是造成大部分转录异质性的原因，而这些转录异质性并非由潜在突变引起。表观遗传改变比体细胞突变更常见，但两者之间存在显著的相互作用，因为表观遗传沉默可导致基因突变，反之，基因突变可改变表观遗传过程 (Brzezia ń ska 等人 2013；Chatterjee 等人 2018)。肺癌尤其以明确的基因驱动突变以及全局和位点特异性表观遗传修饰为特征。表观基因组失调与吸烟相关和不相关的恶性转化有关，并在获得癌症特征（如细胞增殖增加、抗凋亡、血管生成和转移）中起关键作用
较长的白细胞端粒长度与心脏大小，功能和心力衰竭的关联
一部分参与者还接受了心血管磁共振（CMR）扫描。我们最近在UKB参与者中对LTL进行了大规模测量，并确定了与LTL相关的大量遗传变异，这对于潜在的因果推断很有用（MR分析）。4,12我们还使用基于人工智能的协议从CMR扫描中得出了心脏结构和功能的测量。13,14 Here, using these data sets, we have examined (1) observational associations be- tween LTL and cardiac morphology, function, and geometry, including LVM, global ventricular volume and size, left ven- tricular stroke volume (LVSV), right ventricular stroke vol- ume (RVSV), LVM to end-diastolic volume ratio (LVMVR), atrial maximum体积和心房排空体积，（2）LTL与观察性关联之间的ge-Netic关联，使用MRR，以及（3）LTL与HF的未来发展之间的PotentialCausal关联。