此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 2 月 1 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.02.01.478672 doi:bioRxiv preprint
产品描述 成簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR)/Cas9 系统是基因组编辑中最新的 RNA 引导核酸内切酶工具,可实现非常具体的基因组破坏和替换。Cas9 核酸酶 NLS 与 GFP 的融合可实现转染的视觉确认以及随后的 Cas9 从细胞中清除的验证。Cas9 核酸酶-GFP 也可用于 FACS 应用和筛选。Cas9 核酸酶-GFP NLS 在蛋白质的 C 端包含 SV40 T 抗原核定位序列 (NLS)。
nd 32 DAE-BRNS国家激光研讨会(NLS-32)正在与印度激光协会(ILA)合作的Raja Ramanna先进技术中心(RRCAT)在1月29日至2024年2月29日与印度激光协会(ILA)合作组织。研讨会由印度政府原子能部(DAE)的核科学研究委员会(BRNS)举行。所有主要的印度激光实验室和学术机构都参加了国家激光研讨会(NLS)。每年在不同地点举行专题讨论会,以便研究人员和学生接触激光和相关技术领域的现代科学和技术进步。代表组织委员会,我很高兴向NLS-32的所有代表致敬,包括研究生,博士学位。学者,教职员工,科学家和行业参与者。
摘要:CRISPR-Cas9技术的出现彻底改变了基础和转化生物医学研究。为了使Cas9核酸酶发挥基因组编辑活性,通常将源自猿猴病毒40(SV40)T抗原的核定位信号(NLS)作为基因融合体安装,以引导细胞内的Cas9蛋白进入细胞核。值得注意的是,先前的研究表明,多个SV40 NLS融合可以提高Cas9衍生的基因组编辑和碱基编辑工具的靶向活性。此外,多NLS融合可以以组成性表达和直接递送Cas9-引导RNA核糖核蛋白(RNP)复合物的形式增加Cas9的细胞内活性。然而,NLS融合与细胞内Cas9活性之间的关系尚不完全清楚,包括活性对NLS融合数量或组织的依赖性。在本研究中,我们构建并纯化了一组在蛋白质的 N 端或 C 端含有 1 至 4 个 NLS 重复序列的化脓性链球菌 Cas9 (SpCas9) 变体,并系统地分析了多 NLS 融合对 SpCas9 RNPs 活性的影响。我们发现,多 NLS 融合可以提高脂质转染或核转染 Cas9 RNPs 的细胞内活性。重要的是,多 NLS 融合可以增强 SpCas9 RNPs 在原代细胞、干细胞/祖细胞和小鼠胚胎中的基因组编辑活性。
在西方的最近报告中,小儿急性肝衰竭(PALF)中的本地肝脏存活(NLS)已提高到48-68%,但印度的数据表明,仅在10%的肝移植(LT)中,NLS的NLS较低47.7%,较高的死亡率(42.2%),而肝移植(LT)少得多。这可能是由于诊断延迟,转诊系统不良以及有限的正式训练的小儿肝病学家,儿科强化学家和该国的儿科LT计划。我们介绍了印度儿科胃肠病学,肝病学和营养学会(ISPGHAN)关于PALF的诊断和管理[3]的最新共识建议。表1概述了当前PALF管理实践中建议的修改,而图1提出了一种管理PALF的算法方法。
saccharomyces cerevisiae pif1是一种多功能DNA解旋酶,在维持核和线粒体基因组的维持中起多种作用。PIF1的两个同工型通过使用替代的翻译起始站点从单个开放的阅读框架中产生。PIF1的线粒体靶向信号(MT)位于两个起始位点之间,但是尚未确定核定位信号(NLS)。在这里,我们使用序列和功能分析来识别NLS元素。在859氨基酸PIF1的羧基末端结构域中缺乏四个碱性氨基酸(781 kKRK 784)的PIF1(PIF1-NLSΔ)的突变等位基因在野生型水平上表达并保留野生型野生型线粒体界功能。然而,PIF1-NLSδ细胞在四个测试中的核功能中有缺陷:端粒长度维持,Okazaki碎片处理,突破性诱导的复制(BIR)以及与核靶位点结合。将NLS融合了NLS,从Simian病毒40(SV40)T-抗原融合到PIF1-NLSδ蛋白质,可减少PIF1-NLSδ细胞的核缺损。因此,绝大多数核PIF1功能需要PIF1羧基附近的四个碱性氨基酸。我们的研究还揭示了先前描述的功能PIF1-M2等位基因丧失与这项工作中产生的其他三个PIF1突变等位基因之间的表型差异,这对于研究核PIF1功能将很有用。
242 图 5:组蛋白 H2B 的 NLS 序列将厌氧荧光报告基因定位到真菌细胞的细胞核 243。A) 厌氧真菌在组蛋白 H2B 上具有独特的 5' 前导序列,与模型真菌谱系的前导序列不同。B) 保守厌氧真菌组蛋白 245 2B 前导序列或假定 NLS 的一致序列。C) 用含有潮霉素抗性和 iRFP 的构建体转化的真菌细胞的共聚焦显微镜检查能够选择和可视化 iRFP 表达。有关这些构建体的完整描述,请参阅表 2。248 249
该服务涉及用于 CRISPR-Cas3 基因组编辑的 crRNA 的设计以及 crRNA 与 Cas 蛋白复合物的创建(用于抗病毒防御的 Cas 复合物、Cascade-crRNA 复合物)。我们共同表达组成Cascade的五种蛋白质和一种crRNA,并传递纯化的Cascade-crRNA复合物。 此外,组成 Cascade(Cas11、Cas7 和 Cas6)的蛋白质含有核定位信号 (NLS)。 该服务制备的Cascade-crRNA复合物可与Cas3蛋白NLS(编号311-09441)的切割活性结合用于CRISPR-Cas3体系。
ATP ATP腺苷-5'-三磷酸凸轮钙调蛋白CARQ CAQ+激活的Rho蛋白,带有嵌入的IQP Ceru ceru cerulean,相当于CFP CFP CFP CyAn荧光蛋白 Dulbecco's modified eagle medium FBS Fetal Bovine Serum FKBP12 12-kDa FK506 and rapamycin-binding protein FRB FKBP-rapamycin binding domain FRET Fluorescence resonance energy transfer GST Glutathione S-transferase His Polyhistidine-tag IRES Internal ribosomal entry site LB Luria Broth LOV Light-oxygen-voltage域,lov2域Lovs1K Lov2结构域与刺激1 c末端碎片MCS多个克隆位点MLCKP肌球蛋白轻链激酶激酶肽MRFP单体红色荧光蛋白相当于RFP,相当于RFP NES核出口NLS NLS NLS信号NLS信号NLS核定位PBS PBS PBS磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐酶磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐磷酸盐反应pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu pdbu PKC Protein kinase C pLyn Palmitoylation sequence of Lyn kinase RFP Red fluorescent protein, equivalent to mRFP SDS-PAGE Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis SH3 SRC Homology 3 Domain TEV Tobacco etch virus TEVp Tobacco etch virus protease TS Temperature-sensitive tsTEVp Temperature-sensitive tobacco蚀刻病毒蛋白酶tvmvp烟草静脉斑点病毒蛋白酶蛋白酶ven venus,相当于YFP YFP YFP黄色荧光蛋白,相当于Ven