在人类中,β-珠蛋白的特异性畸变会导致镰状细胞病和β-地中海贫血,而这些疾病的症状可以通过增加胎儿珠蛋白 (HbF) 的表达来改善。最近进行的两次 CRISPR-Cas9 筛选以 ~1500 种带注释的序列特异性 DNA 结合蛋白为中心,在表达成人血红蛋白的人类红系细胞中进行,发现了四组 HbF 基因表达的候选调节因子。它们是 (1) 已知可用于控制 HbF 的核小体重塑和去乙酰化酶 (NuRD) 复合蛋白的成员;(2) 七种 C2H2 锌指 (ZF) 蛋白,其中一些 (ZBTB7A 和 BCL11A) 已知可直接沉默成人人类红系细胞中的胎儿 γ-珠蛋白基因;(3) 一些其他不同结构类别的转录因子,它们可能间接影响 HbF 基因表达; (4)DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 维持 DNA 甲基化标记,这些标记将 MBD2 相关的 NuRD 复合物吸引到 DNA 上,以及相关的组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化。本文我们简要讨论了这些调节剂(特别是 C2H2 ZF)在诱导 HbF 表达以治疗 β 血红蛋白疾病方面的作用,以及开发安全有效的小分子疗法以调节这种高度保守的血红蛋白转换的最新进展。
感谢您提交了有关NURD复杂角色在DNA双链断区域中的染色质边界中的手稿,以响应R-loop组。这项研究现已由三名专家裁判进行了审查,我在下面抄袭您的信息以获取您的信息。您会看到,审稿人会欣赏全面的分析和工作的整体兴趣,但同时也不相信所有主要结论都得到当前数据的决定性支持。尤其是裁判1和2提出了许多重叠的关键问题,包括未解决的差异与已发表的文献,替代解释的可能性,对真正的核心核心Nurd和R-Loop角色的不确定性;以及过度依赖或不足以控制可能易于人工制品的实验方法。由于尚不清楚在常规的重大修订期间是否以及如何充分解决这些问题,因此,在这种情况下,我将有很大的决定 - 有兴趣考虑暂时的暂定暂定响应,详细说明您如何解决裁判的主要问题,如果您有机会为EMBO日记提供此工作的机会。基于这样的修订提案,我可以确定EMBO期刊的重大修订是否看起来很现实,或者不那么实质性的修订版本至少可能适合我们的姐妹期刊之一。,如果需要,我也很乐意与您讨论这样的修订建议。
Results: Among known genes whose deletion preferentially or mostly affected plasmablast formation were the transcription factors Prdm1 (BLIMP1), Irf4 and Pou2af1 (OBF-1), and the Ern1 gene encoding IRE1a, while deletion of XBP1, the transcriptional master regulator that speci fi es the expansion of the secretory program in plasma cells, had no effect.由ERN1缺失引起的缺陷浆形形成无法通过XBP1的活跃的,拼接的形式来挽救其处理取决于IRE1A的下游和下游,这表明在早期的血浆细胞分化中,IRE1A在XBP1独立于XBP1独立于XBP1。此外,我们刚鉴定出涉及NF-KB信号传导(NFKBIA),囊泡Traffiffiffiffiking(ARF4,PERB)和表观遗传调节剂的几个基因,这些基因构成了NURD COMPLEX(HDAC1,MTA2,MBD2)的一部分。ARF4的缺失,ARF4是Copi囊泡形成所需的小GTPase,浆膜形成受损和抗体分泌阻塞。HDAC1缺失后,浆质分化始终降低约50%,而密切相关的HDAC2基因的缺失无效。HDAC1敲除导致控制浆细胞与B细胞身份的拮抗转录因子的强烈扰动蛋白表达(通过降低IRF4和Blimp1以及增加Bach2和Pax5)。
引言Ca 2+对于心脏电导传导和收缩至关重要(1,2)。虽然激发反应耦合触发了Ca 2+从肌浆网(SR)释放到通过Ryanodine receptors(Ryrs)到细胞质的,但SR Ca 2+将Ca 2+摄入Ca 2+在很大程度上由SR Ca 2+ -Atpase 2A(Serca 2a(Serca2a)(2,2,2,2,3)。在SR中,Ca 2+由最丰富的Ca 2+结合蛋白(Calsequestrin 2(Casq2)(4)保留。casq1与CASQ2高度同源,这两种蛋白质的作用类似于调节肌肉细胞中Ca 2+的稳态(5)。尽管CASQ1和CASQ2都存在于骨骼肌中,但仅在心肌细胞中发现CASQ2。小鼠遗传学研究表明,尽管SR Ca 2+稳态调节受到破坏,但CASQ1或CASQ2的丧失未能引起致命性心肌病(5)。相反,心肌细胞中具有CASQ2过表达的转基因小鼠患有严重的心肌病,并在16周的时间内过早死亡(6,7)。液泡心肌病是一种罕见但致命的心脏病,具有肌纤维中突出液泡的特征。它通常与溶酶体功能性缺陷有关,包括储存障碍(即富含酸α-葡萄糖苷酶缺乏症)和蛋白质缺乏症(即,Danon疾病,由LAMP2缺乏症引起)(8-10)。然而,经常观察到非散糖体相关的液泡心脏病,其发病机理需要研究(11,12)。染色质复制复合物调节大量基因表达(13)。以前,有报道称SWI/SNF染色质复合物调节心脏发育和产后心脏的生长(14)。例如,SWI/SNF染色质重塑剂的核心成分BRG1促进胚胎心肌细胞增殖并保留心脏分化(15)。在成年小鼠中,心脏应激激活的BRG1诱导病理α -MHC到β -MHC转移,导致肥大(15)。除了SWI/SNF染色质复合物复合物外,哺乳动物还存在其他3种其他染色质重塑剂(ISWI,NURD和INO80/SWR复合物)(13)。但是,与SWI/SNF复合物相比,这3种染色质复合物在产后心脏中的功能仍然未知。含锌手指命中域 - 含有含蛋白的蛋白1(Znhit1;补充表1;本文在线提供的补充材料; https://doi.org/10.1172/jci.insight.1487752ds1),是一个键
