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合成 DNA 与生物安全：预测致病性的细微差别以及筛选寡核苷酸的新计算方法的动力

DNA 合成技术推动了合成生物学领域的快速发展，该领域涉及新型生物成分的设计和制造。DNA 合成技术的巨大前景是毋庸置疑的，但它被故意或意外滥用的可能性也不容忽视。为了生物安全，美国卫生与公众服务部 (HHS) 于 2010 年发布了《合成双链 DNA 供应商筛查框架指南》，呼吁双链 DNA (dsDNA) 商业供应商自愿筛查所有订单。最值得注意的是，一组名为国际基因合成联盟 (IGSC) 的 dsDNA 合成公司已根据 HHS 指南实施了协调筛查协议 (HSP)。虽然 IGSC 所有成员并未使用单一的 DNA 筛查算法，但 DNA 筛查软件通常遵循 HSP 指南，将查询序列与相对较短的生物毒素列表进行比对，并选择药剂基因组、基因或蛋白质。我们在此描述了当前筛选过程中涉及的挑战、改进的想法，以及说明为什么克服当前的进步障碍如此关键的示例。