摘要在人类基因组中具有超过270个独特的发生,肽识别的PDZ结构域在调节极化,信号传导和传统途径中起着核心作用。PDZ结构域中的突变导致癌症和囊性纤维化等疾病,从而使PDZ结构域成为治疗干预的有吸引力的靶标。 D肽抑制剂作为治疗剂具有独特的优势,包括代谢稳定性提高和免疫原性。 在这里,我们介绍了DexDesign,这是一种基于鱼鹰的新型算法,用于计算设计从头D肽抑制剂。 dexDesign利用了三种新型技术,这些新技术广泛适用于计算蛋白设计:最小柔性集,基于K ∗的突变扫描和逆丙氨酸扫描。 我们应用这些技术和脱氧设计来生成两个生物医学上重要的PDZ域靶标的新型D肽抑制剂:CAL和MAST2。 我们引入了一个用于分析从头肽的框架 - 沿复制/恢复轴的评估 - 并将其应用于右启动生成的D肽。 值得注意的是,我们生成的肽被预测将其靶标比其靶标的内源配体结合,从而验证了肽的潜力作为铅抑制剂。 我们还提供了免费和开源计算蛋白设计软件Osprey中dexdesign的实现。PDZ结构域中的突变导致癌症和囊性纤维化等疾病,从而使PDZ结构域成为治疗干预的有吸引力的靶标。D肽抑制剂作为治疗剂具有独特的优势,包括代谢稳定性提高和免疫原性。在这里,我们介绍了DexDesign,这是一种基于鱼鹰的新型算法,用于计算设计从头D肽抑制剂。dexDesign利用了三种新型技术,这些新技术广泛适用于计算蛋白设计:最小柔性集,基于K ∗的突变扫描和逆丙氨酸扫描。我们应用这些技术和脱氧设计来生成两个生物医学上重要的PDZ域靶标的新型D肽抑制剂:CAL和MAST2。我们引入了一个用于分析从头肽的框架 - 沿复制/恢复轴的评估 - 并将其应用于右启动生成的D肽。值得注意的是,我们生成的肽被预测将其靶标比其靶标的内源配体结合,从而验证了肽的潜力作为铅抑制剂。我们还提供了免费和开源计算蛋白设计软件Osprey中dexdesign的实现。
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附录 A:V-22“鱼鹰”事实...................................................................................................... 41 飞机特性...................................................................................................................... 41 机组人员...................................................................................................................... 42 速度...................................................................................................................... 42 航程/半径...................................................................................................................... 42 有效载荷...................................................................................................................... 42 救援绞车...................................................................................................................... 42 机身...................................................................................................................... 42 发动机系统...................................................................................................................... 43 燃油系统...................................................................................................................... 43 驱动系统/螺旋桨系统............................................................................................. 43 液压系统...................................................................................................................... 43 桨叶折叠机翼收起。
V-22“鱼鹰”事实,,............................................................................................................. 39 飞机特性...................................................................................................................... 39 机组人员...................................................................................................................... 40 速度............................................................................................................................. 40 航程/半径...................................................................................................................... 40 有效载荷............................................................................................................................. 40 救援绞车............................................................................................................................. 40 机身............................................................................................................................. 40 发动机系统............................................................................................................................. 41 燃油系统............................................................................................................................. 41 驱动系统/螺旋桨系统............................................................................................. 41 液压系统............................................................................................................................. 41 桨叶