该检测采用单一 DNA 提取方法,从常规 FFPE 活检或手术切除标本中提取 50-1000 ng DNA,构建全基因组散弹枪文库,并基于杂交捕获 309 个癌症相关基因的所有编码外显子、1 个启动子区域、1 个非编码 RNA (ncRNA) 以及 34 个常见重排基因的选定内含子区域,其中 21 个还包括编码外显子(请参阅下表 2 和表 3,了解 F1CDx 中包含的基因完整列表)。因此,该检测总共可检测到 324 个基因的变异。使用 Illumina ® HiSeq 4000 平台,杂交捕获选定的文库可进行高均匀深度测序(目标中位覆盖率 > 500X,覆盖率 > 100X 时外显子覆盖率 > 99%)。序列数据使用定制的分析流程进行处理,该流程旨在检测所有类型的基因组变异,包括碱基替换、插入/缺失、拷贝数变异(扩增和纯合缺失)和选定的基因组重排(例如基因融合)。此外,还将报告基因组特征,包括微卫星不稳定性 (MSI)、肿瘤突变负担 (TMB) 和阳性同源重组缺陷 (HRD) 状态(tBRCA 阳性和/或 LOH 高)。
最初的PMA(P170019)用于基础CDX于2017年11月30日批准,用于检测可能受益于非小细胞肺癌(NSCLC),黑色素瘤,乳腺癌,结婚癌症(CRC)和Ovarian Cancer的15种FDA批准疗法之一。随后,批准了九种PMA补充剂以扩大F1CDX的适应症,因为它是其最初批准的。PMA补充(P170019/S005)用于添加杂合性基因组损失(LOH)的PMA补充剂(P170019/S004)在2019年7月1日批准了BRCA1/2改变的卵巢癌患者中添加Lynparza®(Olaparib)指示的指示。PMA补充(P170019/S008)在NSCLC患者中添加Tagrisso®(Osimertinib)的指示EGFR EXON 19缺失和EGFR EXON 21 L858R变化的指示,于2019年7月1日获得批准。PMA补充剂(P170019/S006)在2019年12月3日批准了PIKRAY®(Alpelisib)对PIK3CA改变的乳腺癌患者的指示(Alpelisib)的指示。PMA补充(P170019/S010)在北卡罗来纳州莫里斯维尔添加第二个网站,该网站将于2019年12月16日批准。PMA补充(P170019/S013),用于在2020年4月17日批准使用FGFR2融合的胆管癌患者中添加Pemzyre®(Pemigatinib)的指示(pemigatinib)。PMA补充(P170019/S011)在NSCLC患者中添加了MET单核苷酸变体(SNV)和导致MET 14跳过的NSCLC患者中添加TabRecta®(Capmatinib)的指示。
