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基于 PAM50 的化疗的独立验证...
摘要 ◥ 目的：我们尚未找到经过验证的生物标志物来预测激素受体阳性/HER2 阳性 (HR + /HER2 + ) 乳腺癌的治疗反应和结果。基于 PAM50 的化疗内分泌评分 (CES) 可预测激素受体阳性/HER2 阴性 (HR + /HER2 ) 乳腺癌的化疗内分泌敏感性。在这里，我们评估了 CES 与 HR + /HER2 + 乳腺癌的治疗反应和生存期之间的关系。实验设计：从七项研究中获得了内在亚型和临床病理学数据，这些研究中的患者接受了 HER2 靶向治疗，包括内分泌治疗 (ET) 或化疗 (CTX)。CES 被评估为连续变量，并按从低到高分数分类 [CES-C（化学敏感）、CES-U（不确定）和 CES-E（内分泌敏感）]。我们首先单独分析每个数据集，然后合并所有数据集。多变量分析用于测试 CES 与病理完全缓解 (pCR) 和无病生存期 (DFS) 的关联。
潜在功能性circrna的生物信息学分析...
乳腺癌（BC）是发病率和病情高的女性中最常见的癌症。因此，生物标志物检测仍然需要新的研究。GSE1124和GSE182471数据集，以评估差异表达的圆形RNA（CIRCRNA）。使用乳腺癌国际联盟（代表）数据库的癌症基因组图集（TCGA）和分子分类学用于鉴定明显的失调的microRNA（miRNA）和基因，并考虑了对微阵列分类的预测分析（PAM50）的预测分析。使用癌症特异性的circrna，mirdb，mirtarbase和mirwalk数据库研究了cirna-miRNA-mRNA关系。使用基因和基因组（KEGG）途径数据库的基因本体论（GO）分析和京都百科全书使用基因分析（GO）分析和京都百科全书来注释CircrNA – MiRNA -MRNA调节网络。蛋白质 - 蛋白质相互作用网络是由字符串数据库构建的，并通过Cytoscape工具可视化。然后，根据PAM50亚组中的特定表达水平，使用某些选择标准对RAW miRNA数据和基因进行过滤。使用Cytohubba Cytoscape插件来获得一种瓶颈方法来获得高度相互作用的集线器基因。在我们的研究中，在miRNA和circrna轴内检测到的这些枢纽基因进行了无病生存和整体生存分析。我们确定了可能在卑诗省起重要作用的三个circrnas，三个miRNA和十八个候选靶基因。另外，已经确定这些分子在BC的分类中可以有用，尤其是在确定基础样乳腺癌（BLBC）亚型时。我们得出的结论是，在BC的BLBC亚组中，HSA_-CRIC_0000515/mir-486-5p/sdc1轴可能是诱因患者的重要生物标志物候选者。
订单 – 分子病理学/免疫组织化学
NGS小组，FFPE融合分析（RNA），FFPE☐结肠（BRAF/KRAS/NRAS/PIK3CA）☐肺（ALK，ROS1和RET）☐CLL突变分析☐肺（BRAF/kras/kras/nras/nras/pik3ca/fuson and eff in nraver/exnaly nrative） IST（BRAF/KIT/PDGFRA- POSIGNA/PAM50☐igh☐黑色素瘤（BRAF/KIT/NRAS/HRAS）（子类别和风险得分）☐TCR☐MTC（BRAF/KRAS/HRAS/HRAS/RET） BRCA2/PIK3CA）☐LOH1P19Q （包括 IDH1/2- ☐ B-ALL ☐ 乳腺（PIK3CA）突变分析），诊断时的 FFPE 母细胞比例：NGS 面板，cfDNA/血浆 ☐ TERT 启动子突变分析 ☐ MRD 随访，☐ 肺（EGFR/KRAS/NRAS/BRAF）（c.1-124C>T / c.1-146C>T）天：
雌激素受体状态对 HER2 阳性早期乳腺癌的预后和治疗有何真正的影响？
HER2+ 早期乳腺癌是一种异质性疾病，包括所有内在乳腺癌亚型。目前可用于抗 HER2 治疗选择的唯一生物标志物是 HER2 状态本身，但雌激素受体 (ER) 状态正在成为 HER2+ 疾病中强有力的预测标志物。在本文中，我们讨论了 HER2+/ER 阳性 (ER+) 疾病患者与 HER2+/ER 阴性 (ER-neg) 肿瘤患者之间的生物学和临床差异，即短期和长期 (诊断后 5 年以上) 预后、对新辅助治疗的反应以及辅助抗 HER2 靶向治疗的益处。我们还讨论了未来临床试验中可用于患者选择的其他可能生物标志物，如基因特征、PAM50 亚型、肿瘤浸润淋巴细胞、PIK3CA 突变和治疗期间 Ki67 评分的变化，并讨论了它们的局限性。最后，我们建议采用新的临床试验设计，以对临床实践产生影响，旨在分别测试 HER2+/ER+ 和 HER2+/ER-neg 肿瘤患者的治疗降级。我们还提出了 HER2+ 疾病的综合分类，包括 DNA、RNA、蛋白质表达和微环境特征，以便识别那些真正“HER2 成瘾”且可能从抗 HER2 治疗中获益最多的肿瘤。
多参数分子分类器可预测对HER2+乳腺癌中没有化学疗法的新辅助Lapatinib加曲妥珠单抗的反应
利益冲突C. Gutierrez报告持有Genetex股票。C. de Angelis报告了Roche，Eli Lilly，Gsk，Novartis，Pfizer，Astrazeneca的个人费用（作为顾问和/或发言局）；和从诺华给该机构的研究赠款。H. Nitta是Roche的雇员。M. Kapadia是Roche的雇员，并报告了Roche Stock。A. Forero-Torres是Seagen的雇员。I. E. Krop报告在Bristol Myers Squibb，Daiichi Sankyo，Macrogenics，Genentech/Roche，Seagen，Seagen，Astrazeneca的顾问委员会上报告；诺华和默克的数据监测委员会；从Genentech/Roche，Pfizer，Macrogenics研究机构的资助。R. Nanda报告在阿斯利康，超越，富士，吉利德，吉利德，无穷大，iteos Therapeutics，Merck，Obi Pharma，Obi Pharma，Oncosec，Oncosec，Seagen，Seagen；以及来自Arvinas，Astrazeneca，Celgene，Corcept Therapeutics，Genentech/Roche，Gilead/Immunomedics，Merck，Obi Pharma，Obi Pharma，Oncosec，Oncosec，pfizer，pfizer，seagen，seagen，seagen，suegen，sun pharma，taiho的研究资金。M. P. Goetz是Erivan K. Haub家庭癌症研究教授，以纪念Richard F. Emslander，M.D。并报告了从研究到实践，临床教育联盟，Medscape的CME活动的个人费用；作为小组成员的个人费用，进行了全面健康会议的小组讨论；担任Curio Science的主持人的个人费用；从Arc Therapeutics，Astrazeneca，Biovica，Biotheranotics，Blueprint药物，Eagle Pharmaceuticals，Lilly，Novartis，Pfizer，Sanofi Genzyme，Sermonix向Mayo诊所咨询费用；以及从辉瑞（Pfizer），讲道者（Sermonix）向梅奥诊所（Mayo Clinic）进行研究资助。J.S.J.S.J. R. Nangia报告报告了Paxman Coolers Ltd. B. Weigelt报告在本研究范围之外重新培养治疗剂的研究资金。Reis-Filho报告收到高盛，贝恩资本，Repare Therapeutics，Paige.ai，Saga Diagnostics和个人的个人/咨询费；科学咨询委员会的成员：VolitionRX，Repare Therapeutics，Paige.ai和personis； Grupo Oncoclinicas董事会成员； Roche Tissue Diagnostics，Daiichi Sankyo，Merck和Astrazeneca的科学咨询委员会的临时成员； Paige.ai中的股票期权；以及在本研究范围之外重新培养治疗剂的库存。A. Prat报告从辉瑞，诺华，罗氏，MSD肿瘤学，莉莉，Daiichi Sankyo，Amgen，Amgen，Guardant Health获得酬金； Amgen，Roche，Novartis，Pfizer，Bristol-Myers Squibb，Boehringer，Puma Biotechnology，Oncolytics Biotech，Daiichi Sankyo，Abbvie，Astrazeneca，Astrazeneca，NanoString Technologies（对机构）咨询; Roche，Novartis，Incyte，Puma Biotechnology向机构进行研究；揭示基因组学的股票和其他所有权权益；在诺华（直系亲属）的工作；专利PCT/EP2016/080056（HER2作为缺乏细胞毒性疗法的双重HER2封锁的反应指标），WO/2018/096191（基于PAM50的化学内分泌评分（CES），基于PAM50的乳腺癌受体，具有阳性激素受体，具有即时的阳性激素受体，具有复发性及其复发剂的阳性风险）和HERS2DXDXDXDXDXDXDXDXDXDX。 Daiichi Sankyo的旅行和住宿费用；以及与Oncolyticts和Pseptomyc S.L.的其他关系C. K. Osborne报告了持有Genetex股票并参与阿斯利康咨询委员会的参与。R. Schiff收到/已从阿斯利康，葛兰素史克，PUMA Biotechnology Inc和Gilead Sciences（向机构）那里获得了研究资金； Eli Lilly的临时咨询委员会成员；过去的咨询/咨询委员会成员；沃尔特·克鲁沃（Wolters Kluwer）/uptodate（通过机构）的特许权使用费。M.辉瑞的研究资金。J. Veeraraghavan，C。Gutierrez，J。S。Reis-Filho，S。G。Hilsenbeck，A。Prat，A。Prat，C。K。Osborne，R。Schiff，R。Schiff，M。F。Rimawi在未决的专利申请中也是＃PCT/US21/70543（由乳房癌症治疗的方法）和预测的方法，并在培训中进行了预测和预测。所有其余的作者都没有宣布利益冲突