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Illumina单元3'RNA准备数据表
Illumina单细胞3'RNA Prep的简单基于涡旋的方法提供了具有成本效益的可扩展性。对于更大的单元格数，请使用较大的体积PIP管。1从数百到数十万个细胞的广泛处理范围从飞行员和低细胞多样性项目到复杂的组织分析，都支持研究应用需求。1当前的套件配置每个样品最多可介绍2000个单元（T2试剂盒），每个样品10,000个单元（T10试剂盒），每个样品20,000个单元格（T20套件）或每个样品100,000个单元格（T100套件）。测定能力增加细胞吞吐量可以更好地揭示稀有细胞类型（图5）。使用96个唯一双重索引，示例多路复用允许用户并行运行许多样本（表2）。（a）冷冻保存的人外周血单核细胞（PBMC）的均匀歧管近似和投影（UMAP），检测到的31,613个细胞和79％的捕获速率，使用Illumina单细胞3ʹRNA RNA PREP T20 KIT。（b）从冷冻组织中的小鼠脑核的UMAP，检测到155,000个核和78％的捕获率，使用Illumina单细胞3ʹRNA Prep T100 kit。
旧目标的新作用：用于乳腺癌免疫疗法的CD45
抽象的乳腺癌亚型尚未显示对当前免疫调节疗法的显着反应。尽管大多数亚型都是可以治疗的，但三重阴性乳腺癌（TNBC），一种侵略性的高度静态癌，占乳腺癌的10-20％，但仍然是未满足的医疗需求。为了克服对当前TNBC疗法的反应能力，需要采取新的策略。我们的目的是：首先，确定新型免疫调节肽C24D在TNBC上的效应，以阐明C24D诱导免疫调节肿瘤杀死的分子机制。使用质谱分析，我们将CD45识别为C24D结合受体。体外和体内TNBC模型用于评估C24D在逆转TNBC诱导的免疫抑制和触发免疫调节肿瘤细胞杀伤方面的效率。通过Western印迹和FACS分析评估CD45信号转导途径。我们透露，从健康的女供体中添加PBMC到TNBC细胞会导致一系列抑制性CD45细胞内信号。与CD45在TNBC抑制的白细胞上结合，C24D肽会重新激活酪氨酸激酶的SRC家族，从而导致特定的肿瘤免疫反应。在体外，C24D的免疫再活化导致CD69 + T和CD69 + NK细胞的增加，从而触发了TNBC细胞的特定杀伤。体内，C24D诱导CD8+和活化的CD56+肿瘤填充细胞，导致肿瘤凋亡。我们的结果应更新针对CD45的分子（例如C24D肽），作为TNBC免疫疗法的新策略。
d-galacto-d-mannan介导的dectin-2激活将有效的细胞和体液免疫作为病毒疫苗辅助
脚和口径疾病（FMD）是一种高度传染性的牲畜病毒疾病，会造成严重的经济损失。FMD病毒（FMDV）属于Picornaviridae和Aphthovirus家族，分为七个血清型（1，2）。七个FMDV血清型之间的交叉保护无法使其预防和控制复杂化（3，4）。fmd通常由症状（例如高烧，口腔中的水泡以及粘性或泡沫状唾液的过度分泌）来鉴定（5）。此外，成年动物可以体重减轻，几个月内无法恢复，雄性睾丸肿胀，并显着减少牛奶的产量。尽管几只感染的动物仍然无症状载体，但它们可以携带病毒并将其传播给其他动物（6，7）。许多国家建议进行疫苗接种，以防止FMD急性扩散；但是，可用的疫苗有几个局限性，例如低抗体滴度和注射部位的局部反应。因此，我们研究了有效的佐剂，以增强疫苗的细胞和体液免疫反应并解决安全问题。韩国属于FMDV血清型池1，主要暴露于FMDV血清型O，A和亚洲1（8）。自2000年以来，韩国的FMD爆发主要归因于血清型O和A。的确，从2017年到2023年，FMD最近发生的FMD爆发是由O型（ME-SA拓扑）和A型（A/ASIA/SEA-97拓扑型）引起的。因此，在这项研究中，使用FMD抗原O PA2（ME-SA拓扑型）和YC（A/Asia/Sea-97拓扑型）制备了测试疫苗。佐剂与特定的疫苗抗原结合使用时会增强和延长免疫反应（9）；因此，要开发一种新型的FMD疫苗，必须对各种佐剂进行研究。大多数FMD疫苗都涉及使用灭活的病毒抗原。矿物油基佐剂和氢氧化铝[AL（OH）3]，有或没有皂苷，已用作FMD疫苗的传统佐剂，以改善灭活病毒抗原的稳定性和递送（10-13）。已经报道了含有粗皂苷的FMD疫苗，包括在疫苗接种位点进行溶血并引起短寿命抗体反应。因此，比皂苷更安全并可以诱导强烈的免疫反应的Quil-A用作FMD疫苗辅助（14）。尽管有改善的FMD疫苗，但建议重复进行疫苗接种，这是由于低和短寿命的抗体滴度。重复的疫苗接种可能会在注射部位引起局部副作用，这是由于FMD疫苗中包含的矿物油基辅助剂（11、13、15-17）。因此，当前在FMD疫苗中使用的佐剂，特定的免疫刺激性组合需要改进以增强效率和安全性。在先前的研究中，我们确认用树突状细胞（DC）相关的C型凝集素-2（Dectin-2）激动剂诱导的PBMC增殖（18）处理猪外周血单核细胞（PBMC）（DC）相关的C型凝集素-2（DC）相关的C-Type凝集素2（DC）。因此，我们假设Dectin-2激活引起了猪中强大的免疫反应。基于先前的研究，我们使用了Dectin-2激动剂D-Galacto-D-Mannan作为本研究中新型FMD疫苗的辅助。dectin-2是包含
通过工程改造的人类 Treg 稳定表达 FOXP3 和核心耐受性基因
FOXP3+ 调节性 T 细胞 (Tregs) 在预防致命自身免疫和维持组织稳态方面发挥着关键作用。Tregs 的功能稳定性对于其对免疫耐受而非失控免疫的贡献仍然至关重要，特别是对于细胞疗法而言，炎症微环境可能会影响 FOXP3 和相关耐受性基因的表达。为了解决潜在的 Treg 不稳定性，我们通过 PBMC 分离的 CD4+ T 细胞的基因编辑方法生成了人类工程化 Tregs (EngTregs)，从而导致稳定的 FOXP3 表达和雷帕霉素激活信号复合物，可提供可调的 IL-2 信号，从而有效地将 FOXP3 表达与已知在炎症条件下促进 Treg 不稳定的现有调节元件分离。使用转录组分析，我们评估了培养的分选 Tregs (cTregs) 与 EngTregs 相比的稳定性。基于大量和单细胞 RNA 测序分析，我们发现 EngTregs 表达的关键“核心 Treg”和“FOXP3 协同”基因水平更高，这通过流式细胞术得到证实。此外，与 cTregs 相比，在 EngTregs 中观察到关键 Treg 稳定性标志物 CD27、CD70 和 IKZF4 (EOS) 的有利表达模式。相反，与 EngTregs 相比，cTregs 表达更高水平的细胞毒性基因，包括 GZMA 和 PERFORIN1 以及其他炎症基因。最后，我们观察到这些相关性具有功能意义，这通过与 cTregs 相比，EngTregs 中关键耐受性标志物的表达更高来证明。这项研究有力地支持了 EngTregs 是稳定的、耐受性的 FOXP3+ T 细胞，从而为治疗危及生命的自身免疫和自身炎症疾病提供了宝贵的资产。
在活性和潜在结核病期间对IFN-γ产生T细胞的蠕虫特异性影响
对结核病（TB）的防护性免疫需要对TNF和IFN-γ等细胞因子的TH-1反应，该反应在免疫细胞的募集和激活中起着关键作用。蠕虫感染可能导致调节性T细胞的诱导，而Th-2偏斜的反应降低了T细胞中IFN-γ的降低。TH-1反应的降低可以有利于潜在结核感染（LTBI）的重新激活，尽管尚未对活性肺结核（PTB）患者的IFN-γ + CD4 + T细胞的蠕虫特异性影响以及与TB疾病严重程度的联系。因此，使用健康对照组，LTBI个体和PTB患者的血细胞（PBMC）评估不同蠕虫对IFN-γ + CD4 + T细胞在Gondar ethio-PIA中的影响。健康控制中的Ascaris lumbricoides，Mansoni和钩虫感染也同样有助于降低IFN-γ + CD4 + T细胞的频率，而在LTBI和PTB患者中s s s n s s n s n s s s s n s s s s s s cocaris。Mansoni共感染对降低T细胞的IFN-γ产生能力的影响最大。仅在蠕虫共感染的PTB患者中，TB细胞的IFN-γ产生能力与TB疾病的严重程度的增加相关，而在两个月的随访中，抗抑郁治疗恢复了T细胞的IFNγ产生能力。
建议引用：Gorgulho，J.，Roderburg，C.，Beier，F.，Bokemeyer，C.，Brümmendorf，T。H.，Loosen，S.H。，＆Lüdde，T。（2024）。可溶性淋巴细胞A
背景：寻找生物标志物以识别合适的免疫检查点抑制剂（ICI）疗法的候选者。我们评估了下一代免疫检查点淋巴细胞激活基因-3（SLAG-3）的可溶水平，以及其与循环T淋巴细胞亚群的关联可能会构成一种新型的生物标志物，以预测ICI疗法的结果。方法：使用多重免疫测定法分析了n = 84例接受ICI治疗的晚期固体癌症患者的循环水平，并伴随着外周血单核细胞（PBMC）的流量细胞仪分析。RESULTS: Uni- and multivariate analysis shows that patients with higher sLAG3 concentrations before ICI therapy had a signi fi cantly impaired progression-free (PFS) and overall survival (OS) (HR PFS : 1.005 [95%CI: 1.000 – 1.009], p = 0.039; HR OS : 1.006 [95% CI: 1.001 – 1.011], p = 0.015).与具有增加相比的患者相比，基线和1-2个周期之间的比率降低的患者的CD4/CD8细胞比率及其在治疗过程中的动力学是PFS和OS的强烈预测指标（P = 0.012，HR：3.32）。结合Slag3和CD4/CD8比的免疫学评分显示出最高的预测潜力（HR OS：10.3）。结论：未来的前瞻性验证，SLAG3和相关的循环T细胞子集可以用作非侵入性预测标记，以预测ICI疗法的结果，以帮助将来识别理想的ICI候选者。
乳酸菌益生菌菌株的粘附能力有所不同
摘要：益生菌应用领域正在迅速扩展，包括用于控制呼吸道感染的使用。然而，益生菌能够定居肺部环境并与肺病原体竞争。在这项研究中，我们旨在评估许多商业益生菌菌株对人肺上皮细胞系A549的粘附能力。此外，我们评估了益生菌的能力，以防止囊性纤维化中主要的肺部病原体之一，铜绿假单胞菌的宿主细胞粘附，并在囊肿上释放人类外周血单核细胞（PBMCS）的病原体诱导的病原体诱导的炎症反应。乳杆菌对A549细胞的粘附能力最高。与这种观察结果一致，嗜酸乳杆菌是防止与CF痰液中铜绿假单胞菌分离物的A549细胞粘附的最有效的。A549细胞，铜绿假单胞菌和嗜酸乳杆菌的三色荧光标记以及共聚焦微透镜图像分析表明，活的和紫外菌的嗜酸乳杆菌朝向铜绿假单胞菌产生了排除效应。通过CFU计数确认了此类结果。与PBMC共同培养时，活的和UV杀死的嗜酸乳杆菌都以统计学上显着的方式减少了培养上清液中IL-1β和IL-6的量。总体而言，获得的结果指向了嗜酸乳杆菌，作为对控制铜绿假单胞菌感染的潜在加速施用的进一步研究的有趣候选者。
VACCIMEL 是一种同种异体黑色素瘤疫苗，可有效触发针对新抗原和同种抗原以及肿瘤相关抗原的 T 细胞免疫反应
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针对 SARS-CoV 的 mRNA 疫苗
摘要 背景 严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) Omicron 变体具有高度传染性，并能逃避预先建立的免疫力。针对祖先毒株刺突蛋白的信使 RNA (mRNA) 疫苗接种可以诱导针对 Omicron 变体的完整 T 细胞免疫力，但晚期肺癌患者对包括抗程序性细胞死亡蛋白 1 (PD-1)/程序性死亡配体 1 (PD-L1) 在内的免疫调节剂进行加强疫苗接种的疗效尚未阐明。方法 我们使用改进的活化诱导标志物测定法结合高维流式细胞术分析来评估 T 细胞反应。用各种病毒肽刺激外周血单核细胞 (PBMC)，并使用流式细胞术评估抗原特异性 T 细胞反应。结果 加强疫苗在非癌症受试者和肺癌患者中均诱导了针对祖先 SARS-CoV-2 毒株和 Omicron 变体的 CD8 + T 细胞反应，但仅检测到 CD4 + T 细胞的边际诱导。重要的是，与非癌症受试者相比，肺癌患者的抗原特异性 T 细胞表现出不同的亚群动态，分化程度不同，并有功能障碍的证据。值得注意的是，观察到女性偏向的 T 细胞反应。结论 我们得出结论，接受免疫治疗的肺癌患者在对 mRNA 疫苗的 T 细胞反应方面与非癌症受试者存在显着的定性偏差，这凸显了对癌症患者加强保护措施的必要性，以最大限度地降低 Omicron 和其他未来变体突破性感染的风险。
由于双重SAMDH1突变而引起的三名患有AICARDI-GOUTIères综合征的三名患者的诱导多能干细胞系
aicardi-gouti` eRes综合征（AGS）是一种系统性的炎症性疾病，并且在婴儿早期开始时（Aicardi and Goutieres，1984）。患者通常患有白细胞症状，其特征是易怒，肌张力障碍，癫痫发作和发烧，导致严重的发育延迟和小头畸形。脑成像显示基底神经节钙化和进行性脑萎缩。ags模仿子宫内获得的病毒感染。一些患者会出现自身免疫性疾病全身性红斑狼疮患者的体征，包括肝炎，血小板细胞减少症，抗核抗体以及皮肤恐龙病变（Ramantani等，2010）。淋巴细胞增多症和抗病毒细胞因子干扰素（IFN）-α在脑脊液中通常在疾病病程初期观察到。全身激活I型IFN，如外周血细胞中IFN刺激的基因的上调所示（也称为IFN信号）通常可以连续检测到。ags是一种由至少九种不同基因（AGS1-AGS9）突变引起的遗传异质性疾病，该疾病在核酸代谢和免疫识别的过程中起作用（Crow and Stetson，2022）。在这项研究中，使用无整合的仙台病毒方法来重新编程源自皮肤活检或外周血单核细胞（PBMC）的成纤维细胞（来自SAMHD1中的常染色体隐性突变（AGS5）的三名AGS患者（AGS5）（AGS5）（Rice等，2009）。SAMHD1编码SAM结构域和含HD结构域的蛋白1，一种依赖于DGTP的三磷酶氢化酶，将脱氧核苷Tri磷酸盐（DNTPS）转换为组成型脱氧核苷和甲磷酸甲磷酸盐。SAMHD1缺乏会导致内部lular DNTP池失衡，导致基因组不稳定性（Kretschmer等，