Oracle ACFS 与 Oracle Multitenant 结合使用,使客户能够利用可插拔数据库技术的快照。使用写时复制技术,Oracle ACFS 允许创建可插拔数据库的快照克隆,从而进一步扩大客户在测试和开发环境配置方面的选择。客户可以使用可插拔数据库克隆来测试新应用程序、运行所有测试场景等,而不会危及生产数据。存储在 Oracle ACFS 上的数据库只需几个步骤即可利用此功能。此功能允许 SQLplus 与 ACFS 结合使用,使客户能够从 SQLplus 终端内部创建 PDB 快照克隆,而无需切换到 acfsutil 命令。有关更多信息,请参阅 Oracle ACFS 管理员指南 2 。
摘要背景:癌症是全球重大的公共卫生问题,是心血管疾病之后的第二大死亡原因。因此,本研究旨在从传统上用于治疗癌症的马达加斯加药用植物中识别新的天然化合物。方法:通过分子对接进行计算机模拟分析以模拟配体-蛋白质相互作用,并通过 SwissADME 和 ADMET 网络服务器建立四种研究化合物与血管生成靶蛋白 HIF-1α/乳腺癌 (PDB ID:3KCX) 和人类雄激素受体/前列腺癌 (PDB ID:1E3G) 相互作用的药代动力学特征。结果:对接结果显示,HIF-1α受体与化合物1(1′,4-二羟基-2,3′-二甲基-1,2′-联萘-5,5′,8,8′-四酮:-8.49kcal/mol)相互作用时结合能最好,其次是化合物3[(E)-5,6-二甲基-2-(2-甲基-3-(丙-1-烯基)苯基)-2H-色满:-8.43kcal/mol]、化合物2(6′-乙氧基-1′3′-二羟基-4,6-二甲基-1,2′-联萘-2,5′,8,8′-四酮:-7.80kcal/mol)和化合物4(甲基10-羟基- 2,4a,6a,9,12b,14a-六甲基-11-氧代-1,2,3,4,4a,5,6,6a,11,12b,13,14,14a,14b-十四氢吡啶-2-羧酸酯:-7.63 kcal/mol)。受体 1E3G 对所有测试化合物表现出较差的结合亲和能,能量值高于 -11.99 kcal/mol(共晶)。基于氢键相互作用,配体 1 和 2 对两个蛋白质靶标 3KCX 和 1E3G 均显示出良好的药效团特征。配体 3 不通过氢键与所选受体相互作用。这些植物化合物的药代动力学特征表明它们具有口服活性且安全。我们的团队之前使用色谱和光谱技术 (LC/MS/NMR) 分离了它们并阐明了它们的化学结构。结论:配体 1 和 2 可被视为热门药物,因为除了它们与受体的热力学稳定性之外,它们还表现出良好的药代动力学特征,因此可用作乳腺癌和前列腺癌的替代疗法。这项研究为开发新的、经济高效且安全的植物性天然抗癌药物提供了巨大的潜力。
PDB参考:SARS-COV-2主要蛋白酶,与CPD-1、7GRE复合;与CPD-2,7GRF复合;与CPD-3,7grg复合;与CPD-4,7GRH复合;与CPD-5,7Gri复合;与CPD-6,7grJ复合;与CPD-7,7grk复合;与CPD-8,7grl复合;与CPD-9,7grm复合;与CPD-10、7grn复合;与CPD-11、7Gro复合;与CPD-12、7GRP复合;与CPD-13、7grq复合;与CPD-14、7GRR复合;与CPD-15,7grs复合;与CPD-16、7grt复合;与CPD-17、7gru复合;与CPD-18、7GRV复合;与CPD-19、7grw复合;与CPD-20,7grx相关;与CPD-21、7Gry配合;与CPD-22、7grz复合;与CPD-23、7GS0复合;与CPD-24、7GS1复合;与CPD-25、7GS2复合;与CPD-26、7GS3复合;与CPD-27、7GS4复合;与CPD-28、7GS5复合;与CPD-29、7GS6
PXD037708。质谱蛋白质组学和 NTA 数据集的数据分析以及描述归纳策略的补充图表可在 https://github.com/duff-lab-team/AD-EV-characterisation 上访问。人类蛋白质组可从通用蛋白质资源 (UniProt) 获得,登录号为 UP000005640。图 3a 中显示的断层图像已存入电子显微镜数据库 (EMDB),登录号为 16064。单粒子低温电子显微镜数据集已存入电子显微镜公共图像档案 (EMPIAR),登录号如下:EV 数据集为 11300,细胞数据集为 11301。单粒子低温电子显微镜图谱已存入 EMDB,登录号如下:EV 图谱为 16035,细胞图谱为 16039。原子模型已存入蛋白质数据库 (PDB),登录号如下:EV 模型为 8BGS,细胞模型为 8BGV。任何其他数据均可向相应作者索取。
1 IRCCS Fondazione Santa Lucia,00143 罗马,意大利;eugenia.landolfo@uniroma1.it(EL);davide.decandia91@gmail.com(DD);a.nobili@hsantalucia.it(AN);mt.viscomi@hsantalucia.it(MTV);livia.labarbera@gmail.com(LLB);p.debartolo@unimarconi.it(PDB);m.damelio@hsantalucia.it(MD);laura.petrosini@uniroma1.it(LP)2 罗马大学“Sapienza”心理学系,00185 罗马,意大利;stefano.sacchetti@uniroma1.it(SS); annacarmencurci@gmail.com (AC) 3 意大利罗马市“Campus Biomedico”大学医学和外科科学系,邮编 00128 4 意大利罗马市天主教圣心大学生命科学系和公共卫生组织学与胚胎学专业,邮编 00168 5 意大利罗马市古列尔莫·马可尼大学人文科学系,邮编 00193 6 意大利罗马市 CNR 生物化学和细胞生物学研究所,邮编 00015 蒙特罗通多;stefano.fariolivecchioli@cnr.it * 通讯地址:debora_cutuli@yahoo.it;电话:+ 39-06501703077 † 行为神经科学博士课程。
蛋白质和核酸的分子模型;工作表和动手探索。b) 数据库和数据本身:熟悉 PDB(蛋白质数据库)、EDS(电子密度服务器)以及不同类别分子数据的特性、注意事项和可靠性。c) 研究和描述大分子的计算方法:结构生物学中的模型构建、Molprobity 和全原子接触分析,以及多种构象、集合和移动性的方法。d) 学生项目:使用 kinemages 或其他分子图形程序对大分子的一些科学观点进行交互式 3D 说明,通常带有简短的非交互式介绍。学期末提供报告,定期显示进度。每周一次的课堂演示、讨论和使用物理和计算机分子模型的动手工作。家庭作业包括工作表和个人学生项目。3 个单元/评分
PSIPRED工作台是生物科学数据存储库和Web服务的全球生态系统的一部分。这些涵盖了主要数据存储库,例如NCBI,EBI和RCSB PDB(1-3),派生的数据资源,例如字符串,CATH,KEGG,INTERPRO和UNIPROT(4-8),以及诸如EBI WebServices,NCBI Webservices,NCBI Webservices等网络服务。可以通过Elixir Biotools网站(https://bio.tools/)(9)来发现大量的工具和服务作为代码和网络服务。我们已经开发了Psipred Workbench已有近25年了。我们的网站服务提供了各种基于机器学习的工具,专注于表征蛋白质的结构和功能特征。近年来,我们在整合新的基于深度学习的工具和技术方面取得了重大进展。在2018年,我们替换了网络服务器中的每一条代码,并显着改进了这两个工具运行
图2。概述了导致BI-5232的计算设计方法。将两个“种子”结构内置在THIM适体的TPP结合袋中。al(PDB代码2GDI(10),左侧面板):种子结构1和2提供了将芳族环系统投射到Aptamer焦磷酸盐(PP)螺旋的两个不同区域的可能性。右侧侧面板:这两个种子是计算机探索搜索的起点,导致合成8、9和10。安装一个新的头部组的结合亲和力增加了100倍(化合物11)。对“尾巴”组的SAR探索导致BI-5232的KD值为1.0 nm。得出了BI-5232的结合模型,该模型与SAR观察结果一致,并且在分子动力学模拟中被证明是稳定的(有关详细信息,请参见图4)。
受体分子的位点,然后生成对接参数文件(DPF)。这些文件用作网格映射和对接的输入文件。使用受体和配体的PDB文件用于生成PDBQT文件,以使用AutoDdock Tools 1.5.7执行对接研究。对每个配体进行了独立的运行,每个表观构象体以随机顺序对接到CDK1激酶的结合袋中。在扩展坞研究中,分配了遗传算法和lamarckian通用算法进行配体构象搜索。分析了从每个对接受体配体配合物的Autodock4对数文件(DLG)获得的数据[26]。随后,使用Ligplot+ V.4.5.3软件来计算结合位点中配体和CDK1激酶之间疏水和氢键的数量。通过Ligplot + 4.5.3软件鉴定了结合位点中存在的氨基酸的类型和数量[27]。
这是北大西洋公约组织 (NATO) 下属的北约通信和信息局 (NCIA) 的一个职位;NCI 机构的成立旨在最大程度地满足部分或所有北约国家在能力交付和服务提供方面的集体需求,这些领域涉及咨询、指挥和控制以及通信、信息和网络防御功能,从而促进情报、监视、侦察、目标获取功能及其相关信息交换的整合。北约网络安全中心 (NCSC) 负责规划和执行网络安全的所有生命周期管理活动。在履行这一职责时,NCSC 提供专业的网络安全相关服务,涵盖科学、技术、采购、运营、维护和持续支持等各个方面,贯穿北约通信和信息系统 (CIS) 的整个生命周期。NCSC 确保北约在 C4ISR 的背景下安全开展联盟的运营和业务。 NCSC 为 NCI 机构客户和用户以及机构的所有其他部门提供网络安全服务;这包括所有服务线、项目办公室、CIS 支持部门/部门和机构运营中心。NCSC 负责在以下专业安全领域提供广泛的服务:CIS 安全、Cyb