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心脏的细胞RNA-seq揭示了细胞间交流...
抽象的心肌纤维化是糖尿病引起的心肌病的特征病理学。因此，对心脏异质性和细胞间相互作用的深入研究可以帮助阐明糖尿病心肌纤维化的发病机理，并确定治疗该疾病的治疗靶标。在这项研究中，我们研究了小型触发/链霉菌素诱导的单细胞分辨率的小鼠心脏心脏心脏心脏纤维化的细胞间通信驱动因素。间膜和蛋白质 - 蛋白质相互作用网络揭示了配体 - 受体相互作用的关键变化，例如PDGF（S）–pDGFRA和EFEMP1 – EGFR，在促进熟悉熟悉的启发型熟悉熟悉的过程中，促进了熟练的启发，以促进锻炼的发展。 PDGFRA轴的特定抑制作用可以显着改善糖尿病心肌纤维化。 我们还鉴定了与病理外基质基质重塑相关的表型不同的HRC HI和HI成纤维细胞亚群，其中发现HRC HI成纤维细胞在糖尿病条件下是最有成熟的。 最后，我们验证了ITGB1中心基因介导的HRC HI成纤维细胞中糖尿病性心肌纤维化的细胞间通信驱动因素，并通过AAV9介导的ITGB1敲低糖尿病小鼠心脏确认了结果。 总而言之，心脏细胞图提供了对糖尿病心肌纤维化过程中参与病理细胞外基质重塑的细胞间通信驱动因素的新见解。间膜和蛋白质 - 蛋白质相互作用网络揭示了配体 - 受体相互作用的关键变化，例如PDGF（S）–pDGFRA和EFEMP1 – EGFR，在促进熟悉熟悉的启发型熟悉熟悉的过程中，促进了熟练的启发，以促进锻炼的发展。 PDGFRA轴的特定抑制作用可以显着改善糖尿病心肌纤维化。我们还鉴定了与病理外基质基质重塑相关的表型不同的HRC HI和HI成纤维细胞亚群，其中发现HRC HI成纤维细胞在糖尿病条件下是最有成熟的。最后，我们验证了ITGB1中心基因介导的HRC HI成纤维细胞中糖尿病性心肌纤维化的细胞间通信驱动因素，并通过AAV9介导的ITGB1敲低糖尿病小鼠心脏确认了结果。总而言之，心脏细胞图提供了对糖尿病心肌纤维化过程中参与病理细胞外基质重塑的细胞间通信驱动因素的新见解。
卫生福利部食品药物管理署精准医疗分子检测实验室列册...
ABL1 AKT1 AKT3 ALK AR AXL BRAF CCND1 CDK4 CDK6 CTNNB1 DDR2 EGFR ERBB2 ERBB2 ERBB3 ERBB3 ERG ESR1 ESR1 ETV1 ETV1 ETV4 ETV4 ETV5 ETV5 ETV5 ETV5 FGFR1 MAP2K2 MET MTOR MYC MYCN NRAS NTRK1 NTRK2 NTRK3 PDGFRA PIK3CA PPARG RAF1 RAS ROS1 SMO
p53 作为胃肠道间质瘤的生物标志物和潜在靶点
KIT 和 PDGFRA 在胃肠道间质瘤 (GIST) 的致癌过程中起着重要作用，小分子已被用于靶向这种癌症中的 KIT 和 PDGFRA 通路并取得了巨大成功。然而，大约 10% 的 GIST 患者对目前的靶向药物治疗有抗药性。有必要探索其他潜在靶点。尽管 p53 变异在大多数癌症中经常发生，但关于 GIST 中 p53 的研究却很有限。CDKN2A/MDM2/p53 轴调节细胞周期进程和 DNA 损伤反应，进而控制肿瘤生长。该轴是从低风险到高风险 GIST 转变所需的主要事件。通常，p53 突变在 GIST 中并不常见，但据报道 p53 过表达与高风险 GIST 和不良预后有关，这意味着 p53 应该在 GIST 中发挥关键作用。此外，Wee1 还调节细胞周期，据报道，Wee1 抑制的抗肿瘤活性依赖于 p53 突变体。此外，据报道，Wee1 通过调节 KIT 蛋白在 GIST 中具有潜在活性，这种机制可能依赖于 p53 状态。在本文中，我们回顾了以前关于 p53 在 GIST 中的作用的报告，并提出针对 p53 通路作为 GIST 的一种新的额外治疗策略。
分析提供获得的疾病（血液学）
leukemiutringbenmärg/blod mylood面板*（ABL1，ANKRD26，ASXL1，ATRX，BCOR，BCOR，BCORL1，BRAF，CALR，CALR，CBL，CBL，CBL，CBL，CDKN2A，CDKN2A，CEBPA，CEBPA，CEBPA，CSF3R，CSF3R，CSF3R，CUX1，DDX41，DDX41，DNMT3A fbxw7, FLT3, GATA1, GATA2, GNAS, HRAS, Idh1, Idh2, Ikzf1, jak2, jak3, kdm6a, kit, kraas, kmt2a, mpl, myd88, NF1, Notch1 (INKLUSIVE 3´UTR), NPM1, NRAS, PDGFRA, PHF6, PPM1D, Pten, Ptpn11, Rad21, Runx1, Samd9, SAMDL9, Setbp1, SF3B1, SMC1A, SMC3, SRSF2, Stag2, Stat3, Stat5B, Tet2, TP53, U2AF1, WT1, ZRSR2, BTK, plcg2, terc) Div>
海报目录*（通过海报编号）
64 Manav C. Parikh Assessment of Interstitial Fibrosis and Tubular Atrophy on Kidney Biopsy Using Urine Uromodulin Levels 65 Sydney Delman Characterizing the role of PDGFRa as the primary cause of pulmonary disease 66 Nathan Brown Hybrid Formative-Additive Manufacturing (HyFAM) 67 Thea Angela Calahatian Hypusination of Eukaryotic Initiation Factor 5A controls成纤维细胞中的泛素化68 derosh George Microfluidic壳，用于胚胎启发的3D化学图案69 Xirnan A工程可溶性神经蛋白用于治疗角膜新血管生成
肿瘤学 - cabometyx事先授权策略
被认可的疗法“在某些情况下有用”（2A类）。2,4批准的疗法是伊马替尼和ayvakit®（avapritinib片；用于PDGFRA突变）作为一线疗法； Sunitinib或sprycel®（Dasatinib片剂；对于PDGFRA外显子18突变，对伊马替尼不敏感的突变（包括PDGFRA D842V突变）作为二线治疗；stivarga®（regorafenib tabletts）（regorafenib片剂）作为第三线治疗；Qinlock®（ripretters®）;4•肝细胞癌：NCCN指南（版本2.2023 - 2023年9月14日）推荐Cabometyx（Child-Pugh a Class A Class A Class a Class o;类别1）作为后续治疗选项，以及许多其他代理商。5•肾癌：NCCN指南（版本3.2024 - 2024年3月11日）指出，对于有利风险的患者或IV期肾脏细胞癌（RCC）的一线治疗的“首选方案”，具有透明透明细胞学的肾细胞癌（RCC）是：InlytaInflyta®（AxitiNib rifusion®） Cabometyx + Opdivo，Lenvima®（Lenvatinib胶囊） + KeyTruda（所有类别1）。cabometyx（2B类）是这种情况下的“其他推荐方案”之一。6对于较差/中等风险分组的患者，“首选方案”为Inlyta + KeyTruda； cabometyx + opdivo; Yervoy（ipilimumab静脉输注） + opdivo; Lenvima + KeyTruda（所有类别1）;也建议使用Cabometyx单一疗法（2A类）。随后的治疗是根据先前的免疫肿瘤学（IO）治疗状况分类的。没有首选方案。该建议是针对卵泡，癌细胞（以前为Hürthle细胞）和乳头状癌亚型（所有类别1）。Cabometyx均在幼稚治疗和先前的IO治疗的“其他推荐方案”下列出；在“在某些情况下有用”下，Cabometyx + Opdivo也是一种选项（两个类别2a）。对于非清晰细胞组织学RCC，Cabometyx和临床试验的入学率的患者被认为是首选疗法（2A类，首选）； Keytruda，Opdivo，Opdivo + Cabometyx和Lenvima + Everolimus均在“其他推荐方案”（所有2A类）下。 许多其他代理商被列为“在某些情况下有用”。 •非小细胞肺癌：NCCN指南（版本3.2024 - 2024年3月12日）推荐Cabometyx进行RET重排阳性肿瘤（2A类）。 7•子宫肿瘤：NCCN指南（版本2.2024 - 2024年3月6日），建议Cabometyx作为第二或随后的复发性子宫内膜癌（类别2A）的第二或随后治疗的“其他推荐方案”之一。 8•甲状腺癌：NCCN指南（版本2.2024 - 2024年3月12日）指出，如果患者在Lenvima或Sorafenib之后患者的进展，可以考虑使用Cabometyx，以治疗局部复发，高级和/或转移性疾病，这是对放射性碘治疗无法修复的。 9 P Olicy S Tatement建议在Cabometyx的处方福利范围内进行事先授权。 除非以下另有说明，否则所有批准的持续时间为1年。被认为是首选疗法（2A类，首选）； Keytruda，Opdivo，Opdivo + Cabometyx和Lenvima + Everolimus均在“其他推荐方案”（所有2A类）下。许多其他代理商被列为“在某些情况下有用”。 •非小细胞肺癌：NCCN指南（版本3.2024 - 2024年3月12日）推荐Cabometyx进行RET重排阳性肿瘤（2A类）。7•子宫肿瘤：NCCN指南（版本2.2024 - 2024年3月6日），建议Cabometyx作为第二或随后的复发性子宫内膜癌（类别2A）的第二或随后治疗的“其他推荐方案”之一。8•甲状腺癌：NCCN指南（版本2.2024 - 2024年3月12日）指出，如果患者在Lenvima或Sorafenib之后患者的进展，可以考虑使用Cabometyx，以治疗局部复发，高级和/或转移性疾病，这是对放射性碘治疗无法修复的。9 P Olicy S Tatement建议在Cabometyx的处方福利范围内进行事先授权。除非以下另有说明，否则所有批准的持续时间为1年。
抗癌药物针对FDA在2020年批准的蛋白激酶
癌症是一大批疾病，由于人类细胞中许多不同基因的无法控制的作用，主要出现了。 有可能导致癌症发展的基因融合，缺失，扩增，过表达和其他异常。 癌症发育中的一组罪魁祸首是蛋白激酶，蛋白激酶是催化蛋白质磷酸化的大型酶。 人类基因组包含500多个蛋白激酶基因。 激酶调节各种细胞功能，例如增殖，细胞周期，凋亡，分化等。 [1]。 激酶活性的放松管制会导致这些过程的惊人变化，对于癌细胞的存活和传播可能很重要[2]。 因此，许多激酶正在被研究为药物靶标，例如ABL [3] CDKS [4-6]，ERBB2（HER2）[7]，Aurks [8，9]，MAPKS [10]等。 许多药物（即小分子抑制剂或单克隆抗体）已经获得了卫生与公共服务部联邦机构美国食品和药物管理局（FDA）的批准。 此类其他许多药物都在临床试验或临床前开发中。 在这篇评论中，我们将讨论FDA在2020年批准的药物。 avapritinib（Blu-285）（品牌名称Ayvakit）（图1 A）于2020年1月9日获得FDA批准，用于治疗无法切除或转移性胃肠道基质肿瘤（GIST）。 它用作对人PDGFRA受体激酶的抑制剂，该疾病中有D842V突变。癌症是一大批疾病，由于人类细胞中许多不同基因的无法控制的作用，主要出现了。有可能导致癌症发展的基因融合，缺失，扩增，过表达和其他异常。癌症发育中的一组罪魁祸首是蛋白激酶，蛋白激酶是催化蛋白质磷酸化的大型酶。人类基因组包含500多个蛋白激酶基因。激酶调节各种细胞功能，例如增殖，细胞周期，凋亡，分化等。[1]。激酶活性的放松管制会导致这些过程的惊人变化，对于癌细胞的存活和传播可能很重要[2]。因此，许多激酶正在被研究为药物靶标，例如ABL [3] CDKS [4-6]，ERBB2（HER2）[7]，Aurks [8，9]，MAPKS [10]等。许多药物（即小分子抑制剂或单克隆抗体）已经获得了卫生与公共服务部联邦机构美国食品和药物管理局（FDA）的批准。此类其他许多药物都在临床试验或临床前开发中。在这篇评论中，我们将讨论FDA在2020年批准的药物。avapritinib（Blu-285）（品牌名称Ayvakit）（图1 A）于2020年1月9日获得FDA批准，用于治疗无法切除或转移性胃肠道基质肿瘤（GIST）。它用作对人PDGFRA受体激酶的抑制剂，该疾病中有D842V突变。该决定取决于Nav-Igator（NCT02508532）的结果，这是一项多中心，单臂，开放标签试验，招募了43例携带PDGFRA外显子18突变的患者，其中包括38例PDGFRA D842V突变患者[11]。selumetinib（AZD6244，Arry-142886）（品牌Koselugo）（图1 A）由FDA于2020年4月10日证明，用于治疗I型神经纤维瘤I型（NF1），这会导致沿着大脑的肿瘤的生长以及其他部分的肿瘤生长。它被用作对具有V600E突变的BRAF激酶的抑制剂。该决定取决于50名2-18岁儿童的临床试验（NCT01362803）的结果[12]。tucatinib（ONT-380，Arry-380）（品牌Tukysa）（图1 A）于2020年4月17日批准了FDA，用于治疗不可切除或转移性的HER2阳性乳腺癌。它被用作人ERBB2受体激酶的抑制剂。该决定是根据HER2CLIMB临床试验的结果（NCT02614794）做出的，这是一项关于Tucatinib与安慰剂的研究，并与Capecitabine和Trastuzumab结合使用，招募了612名患者[13]。pemigatinib（incb054828）（品牌pemazyre）（图1 A）于2020年4月17日批准了FDA，用于治疗高级/转移性或外科手术无法切除的胆管癌。它用作人FGFR2受体激酶的抑制剂。
胶质母细胞瘤的个性化治疗方法
胶质母细胞瘤似乎特别适合生物标志物驱动的个性化基因组医学。它是癌症基因组图谱计划中第一个接受全面基因组分析的癌症（23），基因和通路变异的特征迅速积累（24-26）。此外，胶质母细胞瘤表现出高度的肿瘤间和肿瘤内空间和时间基因组异质性（27-29），预测靶向联合疗法可能比不加选择的单一药物具有更高的疗效。例如，在胶质母细胞瘤细胞的混合亚克隆中，互斥的 EGFR 和 PDGFRA 致癌基因扩增（30）需要同时抑制两者才能在体外抑制通路（31）。此外，基因组异质性的动态性质似乎会加剧复发和耐药性；治疗会由于新的突变事件和耐药亚克隆的选择而推动克隆进化（32）。纵向生物标志物监测可能有助于个性化治疗的动态调整（图 1C），目前重点关注非侵入性方法（33, 34）。
抗KIT DNA适体用于胃肠道间质瘤的靶向标记
胃肠道间质瘤 (GIST) 是最常见的肉瘤，其特征是 KIT 蛋白过度表达，肿瘤通常由致癌 KIT 突变驱动。针对性抑制 KIT 彻底改变了 GIST 治疗，开启了治疗实体恶性肿瘤的精准医疗时代。在这里，我们首次使用 KIT 特异性 DNA 适体进行 GIST 的靶向标记。我们发现抗 KIT DNA 适体以 KIT 依赖的方式结合细胞，并且在体外对 GIST 细胞标记具有高度特异性。在功能上，KIT 适体以类似于 KIT 单克隆抗体染色的方式结合细胞外 KIT，并在体外在细胞内运输。KIT 适体以突变不可知的方式结合分离的原代人类 GIST 细胞，因此标记了具有 KIT 和 PDGFRA 突变的肿瘤。此外，KIT 适体还特异性标记了完整的人类 GIST 组织（体外），以及小鼠腹膜异种移植，灵敏度高。这些结果代表了首次使用基于适体的方法在体外和体内进行 GIST 的靶向检测。
订单 – 分子病理学/免疫组织化学
NGS小组，FFPE融合分析（RNA），FFPE☐结肠（BRAF/KRAS/NRAS/PIK3CA）☐肺（ALK，ROS1和RET）☐CLL突变分析☐肺（BRAF/kras/kras/nras/nras/pik3ca/fuson and eff in nraver/exnaly nrative） IST（BRAF/KIT/PDGFRA- POSIGNA/PAM50☐igh☐黑色素瘤（BRAF/KIT/NRAS/HRAS）（子类别和风险得分）☐TCR☐MTC（BRAF/KRAS/HRAS/HRAS/RET） BRCA2/PIK3CA）☐LOH1P19Q （包括 IDH1/2- ☐ B-ALL ☐ 乳腺（PIK3CA）突变分析），诊断时的 FFPE 母细胞比例：NGS 面板，cfDNA/血浆 ☐ TERT 启动子突变分析 ☐ MRD 随访，☐ 肺（EGFR/KRAS/NRAS/BRAF）（c.1-124C>T / c.1-146C>T）天：