XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemPGX
药物基因组引导的功效和安全性...
抑郁症是造成残疾和自杀的最大贡献者之一，全球每年约有80万自杀（1）。在十年中，抑郁症的患病率增加了25％以上（2005-2015）（2，3）。这种增加与每年耗资数十亿美元的社会经济负担有关（4）。此外，COVID-19大流行进一步增加了病例，估计全球流行率为28％（2）。药物治疗是中度至重度抑郁症的第一线治疗方法（5）。但是，患者的显着比例未能对药物做出反应（6）。多达60％的抑郁症患者对他们的初始治疗没有反应，并且通常从第一种处方药转换为其他替代药物（6，7）。随后的治疗方法，患者具有临床阳性反应的可能性大大降低（6）。在某些个体/人群中，相同的抗抑郁药可能有效，但不具体，或者可能导致其他人的不良药物反应（ADR）（8）。因此，新策略专注于个性化抗抑郁药的处方。这是在临床实践中广泛努力的一部分，以使用精确药物技术（包括精确给药）改善患者的结果（9，10）。使用个体的基因型来帮助药物选择，称为药物基因组学，是一种有前途的方法，具有改善抑郁症治疗的潜力（9-13）。在非癌症药物中，精神病药物具有最高比例的药物，并具有FDA批准的PGX信息（17）。该领域最初被称为药物遗传学，因为它涉及单个基因或相对较少的基因的组合，但是它演变成药物基因组学（PGX），以适应整个基因组中许多基因的基因，从而影响基因相互作用（13）。有许多可用的商业PGX测试面板，包括Genesight，NeuroidGenetix，CNSDOSE，Neuropharmagen和Genecept（12）。一些面板除了提供PGX测试外，还提供与精神病药物有关的临床解释和决策支持工具（14、15）。医生可以主动为患者要求PGX测试，以指导新的药物处方，或者如果治疗失败。此外，还有监管机构（美国食品和药物管理局，FDA）和研究联盟（临床药物遗传学实施联盟，CPIC）提供了针对处方的建议和准则（12、14-16）。FDA标记了38种具有PGX预防措施的精神病药物，这些药物主要由两种主要的肝酶CYP2D6和CYP2C19代谢，分别由高度多型CYP2D6和CYP2C19基因编码（18）。然而，精神病学中PGX测试的临床使用仍然很低（19），由于许多原因，包括CYP酶反应，对药物治疗方案的依从性不佳，负面生活方式的影响（例如，烟草吸烟）以及有限的先例知识（20）。许多临床试验，荟萃分析和系统评价检查了PGX引导的药物选择以治疗抑郁症的效率和安全性。例如，Han等人。（24），报道了PGX指导治疗导致了A大多数研究发现，PGX引导的抗抑郁药处方优于治疗方法（处方不考虑PGX测试结果（21 - 24）。
药物基因组学简介 - ENCePP
ICH 定义：药物基因组学 (PGx) 定义为：研究与药物反应相关的 DNA 和 RNA 特征变化。药物基因组学 (PGt) 是药物基因组学 (PGx) 的一个子集，定义为：研究与药物反应相关的 DNA 序列变化。
卑诗省的范围摘要公共部门温室气体排放 药物基因组学测试 不列颠哥伦比亚省的旧生长森林 地方政府气候行动计划传统服务报告边界和范围指南 药物基因组学测试 BC指导文件 保护免受住宅单元过热 B.C.森林碳偏移协议 2023 PSO气候变化责任报告 2023 PSO气候变化责任报告 Nirmatrelvir/Ritonavir（Paxlovid）5天治疗包处方 PSO气候变化问责制报告 里士满学区 在森林碳偏移项目中证明添加性的指南 2023年不列颠哥伦比亚省气候进度报告 成为碳中性-B.C。的省级公共部门 2023 PSO气候变化责任报告 中央公立学校（SD23）2023 PSO气候变化问责制报告 Ghgenius 5.02b用户指南谷物乙醇 洪水碎片管理秘书处（FDMS） 信息隐私与安全版本3.6 2024-09-19 BC指导文件 2023气候变化问责制报告 TSBC EPR计划和批准信2024 意图纸：碳捕获和存储 湖采样器 - 2024年秋季
PGX探讨了个体的基因如何影响他们对药物的反应方式。一个人从父母那里继承了基因。基因就像说明身体如何成长，发展和功能的指示。就像有一些基因确定眼睛颜色和血型一样，也有一些基因告诉人体如何对药物反应。有时这些基因的差异会导致某些药物的工作速度或缓慢的速度或可能导致患者具有更多（或更少）的副作用的差异。PGX测试探讨了个体的基因如何影响其对药物的反应。PGX测试有可能帮助患者和提供者选择最有可能起作用并限制副作用的药物，并减少对找到合适药物的试验方法的需求。
药物遗传学面板测试（仅适用于俄亥俄州）
服务药物遗传学的描述（也称为药物基因组学）研究基因的变异如何影响个人对某些药物的反应方式。基因上的差异可以解释某些人从特定药物中受益而其他人可能却没有受益的原因。这些差异也会影响某些人患有药物的副作用，而其他人则没有（Medlineplus，2023）。一项药物遗传学测试旨在根据其在特定临床环境中预测治疗反应的能力来指导治疗策略，临床评估和决策。针对测试以评估个人对特定药物的反应时，通常只分析一个基因。对于华法林（也称为香豆素），测试了两个至三个基因。但是，实验室已经开发了多基因面板，包括五个或更多基因，以主动评估个人对许多药物的可能反应。此策略旨在解决多基因面板测试。临床证据可以通过遗传变异（Tansey等，2013）来解释，重大抑郁症（MDD）的治疗反应方差高达42％的临床证据，这导致了药物遗传学（PGX）测试的发展，以告知某些精神药物的使用。当前，多个组合PGX测试（面板）可商购；但是，现有的已发表证据不支持使用组合PGX工具来进行精神病学适应症。在2024年，Baum等人。只有一项试验审查了作为主要结果的不利影响。还采用完全盲目的设计，并着重于有效的，循证的工具的设计，这些工具既评估不良药物效应的可能性又需要疗效。发布了对APA研究工作组2018年的报告的最新报告，该报告在用于抑郁症患者的治疗选择中使用药物基因组学（PGX）测试的新型治疗方法。工作组审查了自先前报告以来新发布的证据（11例临床试验和五个荟萃分析），所有这些都侧重于速度和/或对治疗反应的效率的主要结果。只有三个试验（使用三个不同的PGX检验）表现出有效性，对主要结果指标具有统计学意义。两项表明功效的研究是小的单盲试验，一项是开放标签。所有检查的研究都有重大局限性，例如缺乏完全盲目的局限性。工作组得出的结论是，最近已发布的数据不支持当前市场上销售的多基因面板的使用来指导MDD的疗法选择。他们建议使用完全盲目的研究进一步研究，包括评估当前市场上销售的药物基因组学测试中未包含的有希望的变体。研究还建议针对药物基因组学测试的其他目的，例如评估不良药物影响的可能性。Saadullah Khani等。（2024）发表了一项系统评价，评估了PGX测试对接受抗精神病药物治疗的个体的影响。分析中总共包括13项研究。（2024）。作者确定，尽管现有证据没有差异或临床结果，而PGX引导的处方却没有差异或临床结果，但所确定的研究却有方法论上的局限性。几项研究并未盲目或随机分析，所有研究的参与者少于300名。审阅者表明，也低估了诸如选择偏见之类的混杂因素。有了这些局限性，研究人员建议谨慎解释结果。需要高质量的研究来评估PGX测试对心理健康状况的特定益处。从预临界药物基因组学测试中针对预防药物反应（PROPARE）研究的研究结果（Skokou等人）。准备是对PGX引导处理的临床实用性的多中心，开放标签的前瞻性研究，该研究采用了12种基因PGX面板，并研究了不良药物反应（ADRS）的发生。在本出版物中，描述了专门针对患有精神分裂症，MDD或躁郁症的1076名患者的结果。这项研究的主要目的是评估PGX引导疗法对受上述精神病患者影响的个体不良药物反应发生率的影响。尽管将每个样品用于12个基因的基因分型，但仅将CYP2C19和/或CYP2D6视为该分析的一部分，因为这是与精神病药物代谢有关的两种药物基因。在对照组中报告了9例死亡，而PGX引导的手臂中只有1人死亡。研究人员发现，与对照组相比，研究的PGX引导臂中具有可操作表型的个体（n = 25）显示出34.1％的不良药物反应（n = 36）。此外，PGX引导的手臂的住院治疗少了41.2％（n = 124个个体在PGX引导的手臂中至少有4种精神药物，而在对照组中n = 143）。作者确定PGX引导的治疗可能对具有精神病诊断的人有帮助。然而，这项研究中具有可行基因型的个体的比例很小（约25％），这影响了统计显着性。这项研究仅着眼于出现不良药物反应。未评估药物疗效。因此，额外的研究重点是药物疗效以及
用于预测重症监护症患者急性肾脏损伤的机器学习
全球精神分裂症的负担为23.6（95％置信区间：20.2-27.2）数百万[1]，印度精神分裂症的患病率为0.3％（95％置信区间：0.2-0.3％）[2]。对抗精神病药疗法的反应是高度可变的，不可能预测那些会或不会反应药物的患者。此外，这些患者中约有30％具有治疗性[3]。在几项研究中，已经发现，接受抗精神病药多药物的患者比例在15.9-60.5％的范围内接受氯氮平，这是最后一个药物治疗胜地[4]。对这些患者的治疗给患者，护理人员和卫生系统造成了巨大负担。典型和非典型抗精神病药主要来自多巴胺（D 2）和5-羟色胺（5-HT 2A）受体的拮抗作用。这些化合物中的许多都与常见和杂物不利影响有关[例如代谢综合征，高嗜血杆菌血症（女性）症状症状，抗胆碱能作用，镇静等。][5]对依从性产生负面影响。药物基因组学（PGX）因子在决定对抗精神病药的治疗反应中起着重要作用[3]。多项研究研究了PGX方法，以鉴定基因型特异性剂量并预测抗精神病药反应和/或不良反应[6]。目前，美国食品药品监督管理局在其药物标记9种抗精神病药中提供了有关PGX生物标志物的信息[7]。具有PGX信息的药物标签可用于特定的抗心理。同样，药物基因组学知识基网站列出了十种抗精神病药，在该抗精神病药中，建议细胞色素2d6（CYP2D6）代谢物的患者谨慎行事[8]。荷兰皇家协会在药房 - 含量药物遗传学工作组的促进协会提供了基于六种抗精神病药的CYP2D6基因型的PGX药物给药指南[9]。但是，也报道了负结果。在丹麦人群中，发现常规的CYP测试不会影响抗精神病药物治疗的持续性[10]。药物优化干预措施（例如PGX辅助治疗）基于精神病患者在多药疾病中的精确医学的概念是复杂且有限的；有必要采用更全面和综合的方法[11，12]。几项观察性研究报告了遗传变异与治疗反应之间的关联。但是，有限的研究使用PGX作为一种介入的工具来帮助选择抗精神病药及其剂量以优化精神分裂症治疗。在种族多样化的印度背景下，这尤其重要，因为抗精神病药物的差异药代动力学和小型动力学会导致对其作用产生重大影响。此外，评估在印度这样的中低收入国家的精神分裂症中PGX辅助治疗的成本效益也很重要。最后，重要的是从患者，护理人员和精神科医生对实施PGX-
XSL•fo
背景：由于基因的区别，许多药物对每个人的工作方式都不相同。药物基因组学（PGX）旨在了解遗传变异如何影响药物疗效和毒性。通常被认为是个性化医学范式中最可行的领域之一。然而，几乎没有其他工作包括对药物使用，剂量调整等的深入探索和描述。目的：我们提出了一种药物基因组学知识模型，以发现PGX实体（例如药物，基因和疾病）之间的隐藏关系，尤其是精确药物的细节。方法：PGX开放数据，例如药品银行和RXNOM，以及美国食品药品监督管理局发表的药物标签。我们为实体和人际关系手动注释了190个药物标签。基于注释结果，我们培训了3种不同的自然语言处理模型以完成实体识别。最后，详细描述了药物基因组学知识模型。
利用牛津纳米孔技术公司的自适应采样技术进行药物基因组学中的靶向单倍型分析
药物基因组学 (PGx) 研究个体间基因组变异对药物反应的影响，从而有机会为每位患者量身定制给药方案。目前有针对性的 PGx 测试平台主要基于微阵列、聚合酶链式反应或短读测序。尽管这些检测在识别单核苷酸变异 (SNV) 和插入/缺失 (INDEL) 方面表现出巨大价值，但它们无法识别大的结构变异，也无法进行明确的单倍型分型以进行星号等位基因分配。在这里，我们使用 Oxford Nanopore Technologies 的自适应采样来丰富从药物基因组学知识库 (PharmGKB) 中提取的具有充分记录的 PGx 相关性的 1,036 个基因面板。通过评估与现有真实集的一致性，我们展示了对五个瓶中基因组参考样本的准确变异和星号等位基因调用。我们表明，最多可以在一个 PromethION 流动槽上复用三个样本，而不会显著降低变异调用性能，从而分别实现 99.35% 和 99.84% 的目标变异召回率和精确度。这项工作推动了纳米孔测序在临床 PGx 环境中的使用。
amp_dpyd_final.pdf
罗克维尔，马里兰州- 2024年7月22日 - 全球全球分子诊断专业社会的分子病理学协会（AMP）今天发表了共识建议，以帮助设计和验证临床DPYD基因分型测定，促进对不同实验室的测试标准化，并改善患者护理。手稿，“ DPYD基因分型建议：美国医学遗传学与基因组学院（ACMG），美国病理学家（CPIC）的临床药物遗传学实施联盟（CPIC）的联合共识建议（ESPT），药物基因组学知识库（PharmGKB®）和药物变异财团（PharmVar），”在《分子诊断杂志》发表之前在线发布。建立了AMP临床实践委员会的药物基因组学（PGX）工作组，以定义推荐用于临床测试的药物遗传学等位基因的关键属性，以及应包含在临床PGX基因分型测定中的最低变体。新的DPYD报告是AMP PGX工作组开发的一系列建议中的最新报告，旨在帮助标准化常用基因分型测定法的临床测试。它基于对CYP3A4 / CYP3A5，TPMT / NUDT15，CYP2D6的早期临床基因分型建议，对于华法林测试，CYP2C9和CYP2C19重要的基因。可选变体的第2层列表符合至少一个但不是全部标准的列表。对于医疗保健提供者而言，重要的是要实施这些建议以及其他相关的临床准则，例如CPIC和DPWG发布的建议，这两者主要着重于解释PGX测试结果并为特定药物对的治疗建议提供治疗建议。“Testing for variants in the DPYD gene can help identify individuals who may be at increased risk for severe fluoropyrimidine-related toxicity,” said Victoria M. Pratt, PhD, Co-Chair of the AMP PGx Working Group, Director of the Scientific Affairs for Pharmacogenetics at Agena Bioscience, and Adjunct Professor of Clinical Pharmacology at Indiana University School of Medicine.“这份新报告旨在改善临床实验室的临床实践，并促进临床实验室的标准化，并确保将适当的变体包括在临床PGX DPYD分析中。”与以前的临床PGX基因分型测定建议一样，AMP PGX工作组使用了建议包含的变体的两层分类。之所以选择，是因为它们对蛋白质和/或基因表达的功能活性具有良好的特征性作用，在人群/祖先组中具有明显的次要等位基因频率，具有可用的参考材料，可用于测定验证，并且对于使用标准分子测试方法进行疑问的临床实验室在技术上是可行的。 这些有关临床基因分型测定的建议不包括对蛋白质功能或基因表达不明的变体。 它们是作为参考指南而不是限制性列表。，是因为它们对蛋白质和/或基因表达的功能活性具有良好的特征性作用，在人群/祖先组中具有明显的次要等位基因频率，具有可用的参考材料，可用于测定验证，并且对于使用标准分子测试方法进行疑问的临床实验室在技术上是可行的。这些有关临床基因分型测定的建议不包括对蛋白质功能或基因表达不明的变体。它们是作为参考指南而不是限制性列表。
圣伊丽莎白药房居住计划
St. Elizabeth Healthcare的PGY2临床药物基因组学院居住地是美国健康系统药剂师学会（ASHP）认证候选人。居留权是一个为期12个月的结构化培训计划，旨在培养能够使用患者特异性药物基因组学（PGX）概况的胜任和创新的从业人员，以设计整个护理过程中的安全有效的药物治疗方案。PGY2临床药物基因组学居民将在基因组学，PGX，实施科学，信息学和运营领导力方面开发专业知识，使他们能够促进医疗保健中精密医学的实施。