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蛋白质磷酸化过程是调节身体各种功能的关键,包括心脏泵血能力。该过程由一种称为蛋白激酶的酶控制,这种酶将磷酸基团添加到目标蛋白质上的特定氨基酸上。这种修饰会改变蛋白质的结构,导致其活性和与其他分子的相互作用发生变化。酶活性的破坏是心脏僵硬的关键原因。
MAPK和JAK/STAT途径的种族特异性分子变化早期发作结直肠癌Cecilia Monge,M.D.,M.P.H.,F.A.C.P.1,Brigette Waldrup,B.S。 2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。 尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。 MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。 本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。 此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。 方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。 该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。1,Brigette Waldrup,B.S。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。 尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。 MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。 本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。 此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。 方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。 该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。 尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。 MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。 本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。 此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。 方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。 该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。*通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。患者按年龄分层(EOCRC:<50岁,晚期结直肠癌 - locrc:≥50岁)和种族(H/L vs. NHW),以评估突变患病率的差异。卡方检验以比较组之间的突变率,并使用Kaplan-Meier生存分析来评估基于H/L和NHW EOCRC患者途径改变的总体生存差异。结果:比较H/L患者的EOCRC和LOCRC时,在MAPK途径相关基因中观察到显着差异。NF1 (11.6% vs. 3.7%, p = 0.01), ACVR1 (2.9% vs. 0%, p = 0.04), and MAP2K1 (3.6% vs. 0%, p = 0.01) were more prevalent in EOCRC, while BRAF mutations (18.3% vs. 5.1%, p = 9.1e-4) were significantly more frequent in LOCRC among H/L patients.此外,当将H/L患者的EOCRC与NHW患者的EOCRC进行比较时,关键MAPK途径基因(例如Akt1(5.1%vs. 1.8%vs. 1.8%,P = 0.03),MAPK3(3.6%,0.7%,P = 6.83E-3),NF1(11.6%vs. 6.1%,P = 0.0%,PD) = 0.02)在H/L EOCRC患者中显着富集。
此前,我们已经生成了肝脏和其他 45 种主要人体组织基因共表达网络 (CN),并确定了丙酮酸激酶 L/R (PKLR) 作为靶点,抑制该酶可选择性抑制肝脏中的 DNL (Lee et al., 2017)。丙酮酸激酶是糖酵解中的关键酶,PKLR 基因编码该酶的肝脏 (PKL) 和红细胞 (PKR) 同工型,并催化磷酸烯醇式丙酮酸和 ADP 生成丙酮酸和 ATP。PKL 和 PKR 同工型分别在肝脏和红细胞中特异表达。一项独立的小鼠群体研究也证实了 PKLR 在 NAFLD 发展中的驱动作用 (Chella Krishnan et al., 2018)。最近,我们在 HepG2 细胞中进行了抑制和过表达 PKLR 的体外实验,发现 PKLR 的表达与 FASN 、 DNL 、 TAG 水平的表达以及细胞生长呈显著正相关 (Liu et al., 2019)。基于这些发现,综合分析表明,可以针对 PKLR 开发一种对其他人体组织副作用最小的 NAFLD 治疗策略。
背景:胃癌(GC)治疗的最新进展并未显着提高5年的存活率,也没有显着降低高复发率。这凸显了需要进一步研究以探索GC的基本机制的必要性。细胞分裂周期5样蛋白(CDC5L)与肿瘤的各种恶性行为有关。方法:我们使用癌症基因组图集(TCGA)和临床标本的数据研究了胃癌(GC)中CDC5L的表达。为了探索CDC5L在GC中的作用,我们在体外和体内测定中进行了使用荧光素酶报告测定,共免疫沉淀(CO-IP)和质谱法(MS)的分子机制研究(MS)。结果:我们的发现表明,GC中CDC5L的显着升高,CDC5L的过表达与较差的生存率,晚期TNM阶段和GC患者的病理级别相关。体外,CDC5L的干扰显着抑制GC进展。 我们发现,前MRNA加工因子19(PRP19)直接与CDC5L启动子结合,增强其转录并抑制其溶酶体介导的降解。 此外,Co-IP和MS分析表明,CDC5L与MAPK1相互作用,激活MAPK信号轴并因此增强了GC中的同源重组。 结论:总而言之,我们的研究证实PRP19上调了与MAPK1结合的Cdc5l表达,从而通过MAPK途径介导的同源重组促进GC进展。 靶向CDC5L可能是GC精确治疗的一种有希望的策略。体外,CDC5L的干扰显着抑制GC进展。我们发现,前MRNA加工因子19(PRP19)直接与CDC5L启动子结合,增强其转录并抑制其溶酶体介导的降解。此外,Co-IP和MS分析表明,CDC5L与MAPK1相互作用,激活MAPK信号轴并因此增强了GC中的同源重组。结论:总而言之,我们的研究证实PRP19上调了与MAPK1结合的Cdc5l表达,从而通过MAPK途径介导的同源重组促进GC进展。靶向CDC5L可能是GC精确治疗的一种有希望的策略。
我们开发了一种基于自主量子热机的经典计算物理模型。这些机器由连接到不同温度的几个环境的少数相互作用的量子比特 (qubit) 组成。这里利用流经机器的热流进行计算。该过程首先根据逻辑输入设置环境的温度。机器不断发展,最终达到非平衡稳定状态,从中可以通过辅助有限尺寸储层的温度确定计算的输出。这种机器,我们称之为“热力学神经元”,可以实现任何线性可分函数,我们明确讨论了 NOT、3-MAJORITY 和 NOR 门的情况。反过来,我们表明热力学神经元网络可以执行任何所需的功能。我们讨论了我们的模型与人工神经元(感知器)之间的密切联系,并认为我们的模型提供了一种基于物理的替代神经网络模拟实现,更广泛地说,是一种热力学计算平台。
核糖体系的N末端乙酰转移酶A(NATA)乙酰酸盐含量为52%的拟南芥中可溶性蛋白。N末端的这种共同翻译稳定稳定的胞质植物蛋白。进化保守的亨廷顿酵母伴侣K(HYPK)促进了植物学中的NATA活性,但在体外,其N末端螺旋A 1抑制了人NATA活性。为了解剖体内Hypk蛋白结构域的调节功能,我们在遗传学工程师CRISPR-CAS9突变体表达了缺乏所有功能域(HYPK-CR1)的催眠片段(HYPK-CR1)或内部删除的HYPK trunct trunct truncing Helix A 1但仍保留了C-term-Nal ubiquitin-cripied(uba-crain-cripied(uba))。我们发现,Hypk的UBA结构域对于以器官特定方式稳定NATA复合物至关重要。HYPK的N末端,包括Helix A 1,对于从各种氨基酸开始的底物上的NATA活性至关重要。因此,在Hypk n末端内仅删除42个氨基酸会导致植物蛋白质组的实质性不稳定,并且较高的耐受性降低了干旱胁迫。
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