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使用 AlphaFold 进行可溶性感知蛋白质结合肽设计
摘要：新的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）正在不断被发现，但PPI 与传统靶标相比具有不同的物理化学性质，这使得使用小分子变得困难。肽为靶向 PPI 提供了一种新的方式，但通过计算设计合适的肽序列具有挑战性。最近，AlphaFold 和 RosettaFold 使得从氨基酸序列预测蛋白质结构成为可能，并且精度极高，从而实现了从头蛋白质设计。我们使用 AfDesign 的“结合剂幻觉”协议（一种使用 AlphaFold 的从头蛋白质设计方法）设计了可能以 PPI 为靶蛋白的肽。然而，这些肽的溶解度往往较低。因此，我们使用氨基酸的溶解度指数设计了溶解度损失函数，并开发了可感知溶解度的 AfDesign 结合剂幻觉协议。使用新协议设计的序列中肽的溶解度随着溶解度损失函数的权重的增加而增加；此外，它们还捕捉到了溶解度指数的特征。此外，通过对接结合亲和力评估，新协议序列往往比随机或单残基替换序列具有更高的亲和力。我们的方法表明，可以设计出能够结合PPI界面同时控制溶解度的肽序列。
直接和延迟的超敏反应...
Proton pump inhibitors (PPIs) are widely pre scribed for managing acid-related gastrointestinal con ditions such as gastric and duodenal ulcers, dyspepsia, gastroesophageal reflux disease (GERD), Zollinger-El lison syndrome, Helicobacter pylori ( H. pylori ) erad ication, and the prevention and management of与非甾体类抗炎药（NSAIDS）相关的溃疡（1）。这些药物通过不可逆地抑制胃顶细胞中的H⁺/k⁺-ATPase酶来抑制胃酸促进（2）。尽管通常被认为是安全有效的，但PPI与一系列不良反应相关联（1）。其中，超敏反应引起了重大的临床关注，其中包括从轻度皮肤病症状到严重的全身并发症的一系列表现（3）。
不适当的质子泵抑制剂在老年人群中的不利结果 - 审查
简介。我们检查了老年人在质子泵抑制剂（PPI）的广泛使用，重点是不合适的处方。目标。我们的目的是强调由于潜在的不利影响而需要重新考虑老年人开处方的PPI处方。材料和方法。对老年患者的现有文献和PPI使用的临床数据进行了广泛的综述。我们分析研究和案例报告，以确定PPI在这一老年人口的风险和益处。结果。我们的发现表明，老年患者PPI过度的明显趋势，伴随着健康风险的增加，从轻度不适到严重的并发症。数据在扩展不适当的PPI使用与老年人的健康风险之间建立了明显的联系。结论。我们主张在老年人中更加谨慎地开处方PPI。有需要定期监测和重新评估PPI治疗。我们建议对减轻不良后果风险的可行策略进行排序，从而强调了对老年人的个性化，基于证据的药物管理的重要性。（Gerontol Pol 2024; 32; 41-48）doi：10.53139/ gp.20243206 div>
阶梯疗法-质子泵抑制剂（PPI）
1. 背景：质子泵抑制剂 (PPI) 已获 FDA 批准用于治疗多种疾病，包括十二指肠溃疡、幽门螺杆菌相关十二指肠溃疡、胃溃疡、糜烂性食管炎、成人和儿童胃食管反流病 (GERD)、佐林格-埃利森综合征等高分泌疾病、GERD 相关喉炎，以及改善 CF 患者的胰酶吸收（非 FDA 批准的适应症）。阶梯疗法计划用于鼓励使用某些治疗类别的低成本替代方案。该计划要求会员先尝试低成本 PPI，然后才能获得 Nexium 悬浮液、Prevacid SoluTab* 和 Zegerid* 悬浮液的承保。对于 6 岁以下的患者，Nexium 混悬液和兰索拉唑口腔崩解片（通用 Prevacid SoluTabs）的索赔将自动处理。2. 承保标准 a：A. 授权
Cheetah-MS：使用串联交联质谱数据
摘要：蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）在许多生物过程中都是核心，但很难表征，尤其是在复杂的，未分离的样品中。化学交联结合质谱（MS）和计算建模正在成为蛋白质相互作用研究中可行的工具。在这里，我们介绍了Cheetah-MS，这是一种用于预测样品复杂混合物中PPI的Web服务器。它结合了MS与蛋白质 - 蛋白质对接的功率和分辨率分析复杂样品的能力和敏感性。它通过分析串联MS/MS数据（也称为MS2）来产生感兴趣的PPI的第四纪结构。将MS分析和建模结合起来提高了灵敏度，重要的是，促进了结果的解释。可用性和实现：Cheetah-MS可以作为Web服务器免费获得，网址为https://www.txms.org。联系人：hamed.khakzad@ens-cachan.fr或lars.malmsstrom@med.lu.se
anatolian质子泵抑制剂对...
目的：在这项研究中，我们旨在研究静脉内（IV）F-18前不久给药的质子泵抑制剂（PPI）（PPIS）的影响，该脂肪脱氧葡萄糖（FDG）对生理FDG注射对胃肠道（GIS）的生理FDG摄取（GIS）的生理FDG的影响（GIS），用于f-18 fdg Positron copsection（GIS）。目的。材料和方法：我们回顾性评估了350例在2020年11月至2021年6月之间在我们的诊所中接受18f-fdg PET/CT的患者。其中，在扫描之前给出了178名患者IV PPI，其余172名具有相似特征的患者没有。在视觉和定量上分析了胃肠道中的 FDG摄取。 结果：患者的平均年龄为51.7±15岁。 两组在年龄和性别方面没有显着差异。 定量评估表明，在接受IV PPI的组中，胃，十二指肠，回肠和横向结肠中的FDG摄取量明显较低（P <0.05）。 在视觉评估中，静脉内PPI组的胃和回肠摄取显着降低（p <0.05）。 结论：我们的发现表明，在FDG PET/CT成像之前，静脉内给药可以减少胃肠道中的FDG摄取。 我们认为，这种做法可以减少胃肠道系统中的假阳性发现，并通过减少背景活动来帮助识别胃癌和肠癌。FDG摄取。结果：患者的平均年龄为51.7±15岁。两组在年龄和性别方面没有显着差异。定量评估表明，在接受IV PPI的组中，胃，十二指肠，回肠和横向结肠中的FDG摄取量明显较低（P <0.05）。在视觉评估中，静脉内PPI组的胃和回肠摄取显着降低（p <0.05）。结论：我们的发现表明，在FDG PET/CT成像之前，静脉内给药可以减少胃肠道中的FDG摄取。我们认为，这种做法可以减少胃肠道系统中的假阳性发现，并通过减少背景活动来帮助识别胃癌和肠癌。
对老年患者的质子泵抑制剂的额定分泌
在老年患者中广泛观察到质子泵抑制剂（PPI）的过度处方。临床发现表明，不分类的服务显着降低了不适当的PPI使用。我们旨在从香港公共医疗保健提供商的角度研究PPI划分服务的成本效益。构建了一个决策分析模型，以检查PPI划分的术语（分类组）和常规护理（UC组）的临床和经济结果（UC组），该假设是在房地产护理环境中65岁的老年PPI-PPI-PPI-PPI-PPI-PPI-PPI-PPI。模型输入是从文献和公共数据中检索出来的。模型时间框架为一年。基础案例分析和灵敏度分析。主要模型结果是直接医疗成本和质量调整后的终身损失（Qalys）损失。在基础案例分析中，划分服务（与UC）将总直接医疗费用降低了235美元，并评估了PPI用户的0.0249 QALY。基本案例结果对所有模型输入的变化在一种方式敏感性分析中具有鲁棒性。在概率敏感性分析中，在10,000个蒙特卡洛模拟中，100％在100％的概率分析组中被接受为具有成本效益的（与UC组）。总而言之，PPI划分的服务节省了Qalys，并减少了PPIS使用者的总直接医疗费用，并且从香港的公共医疗保健提供商的角度来看，很有可能被接受为具有成本效益的选择。
最新更新12/23/2024赠款机会：
•非常重要！LSU兽医学院（MPI：Tammy Dugas和Stephania Cormier）的NIH/NIHM/NIGMS资助的路易斯安那州肺部生物学与疾病中心（CLBD）邀请PILOT项目研究人员（PPIS）提交该中心研究项目的申请。CLBD的主题重点包括传染病（细菌，病毒，真菌）和非传染性（例如环境，香烟，电子烟，气溶胶，气溶胶，过敏原）引起的呼吸道疾病的机理研究。新调查人员链接。
最新更新08/19/2024赠款机会：
•非常重要！LSU兽医学院（MPI：Tammy Dugas和Stephania Cormier）的NIH/NIHM/NIGMS资助的路易斯安那州肺部生物学与疾病中心（CLBD）邀请PILOT项目研究人员（PPIS）提交该中心研究项目的申请。CLBD的主题重点包括传染病（细菌，病毒，真菌）和非传染性（例如环境，香烟，电子烟，气溶胶，气溶胶，过敏原）引起的呼吸道疾病的机理研究。新调查人员链接。
质子泵抑制剂的使用与骨关节炎风险之间的关联：一项横断面研究
PPI 被广泛用于治疗胃食管反流病和消化性溃疡病等胃肠道疾病，其作用是抑制胃酸分泌，从而缓解症状并促进胃肠道愈合(10)。尽管 PPI 的临床疗效已得到充分证实，但新出现的担忧凸显了长期使用 PPI 可能对健康产生的潜在长期影响(11)。最近的研究表明，长期使用 PPI 治疗会增加不良后果的风险，包括骨折和肾脏疾病(12)。然而，PPI 对骨关节炎进展或加重的影响仍未完全了解。一些证据表明，PPI 可能会影响骨骼完整性和矿物质吸收，可能导致关节退化(13)。此外，PPI 治疗与低镁血症有关(14)。一项研究报告称，膳食镁摄入量或血清镁水平与膝关节骨关节炎患病率呈正相关(15)，而另一项横断面分析发现镁耗竭评分与骨关节炎发病率之间存在剂量反应关系(16)。这些发现提出了有关延长 PPI 治疗安全性的关键问题，特别是对于易患 OA 的人群。