Compatible with single - stranded AAV (ssAAV ) and self - complementary AAV (scAAV ) • AAV DNA sample extraction is performed using third - party methods• Multiplexing is performed using SMRTbell barcoded adapter plate 3.0 (102 - 009- 200)• A total of 1 μg of pooled AAV DNA is required for SMRTbell library preparation.每个单个AAV样本的输入DNA需求取决于多重水平,并且范围从
图 1:在 Sciclone G3 NGSx 工作站上,Watchmaker® DNA 文库制备试剂盒的自动化流程。96 个样本的总处理时间(包括试剂和平台设置)在 3.5 到 4.5 小时之间,具体取决于 Frag/AT 和 PCR 参数。所有自动化步骤都标为紫色,手动干预标为粉色。
请注意,单个SRE/剪切自动化运行中不能包括高质量和低质量样品。如果可用0.5–1.25 µg gDNA并使用Revio Sprq化学,则低质量工作流将为Revio SMRT细胞(+SPRQ)提供足够的库;但是,如果需要过多的文库,则高质量参数也可以用于Revio Sprq化学。对于Revio非SPRQ化学和VEGA,仍建议使用2 µg GDNA输入来加载1个SMRT细胞。
•第1部分:这些方案不需要您准备纳税申报表。仔细阅读每个场景的采访说明,并使用您的培训和资源材料来回答方案之后的问题。•第2部分:这些情况要求您准备纳税申报表。阅读面试笔记,并使用练习实验室完成纳税申报表。使用您的资源材料成功完成退货后,请根据您刚刚准备的纳税申报表回答相应的问题。示例:一个问题可能是“ 1040-Line 8a上列出的金额是多少?”
注意:此处提供的Spriselect或Nebnext样品纯化珠的体积可与此步骤中的精确缓冲液中包含的样品一起使用(71.5 µL;步骤1.2.5。)。也可以使用Ampure XP珠。如果使用Ampure XP珠,请在使用前至少30分钟将珠子温暖至室温。这些珠子量可能无法正常工作以在工作流程的不同步骤中进行清理,或者在此步骤中是第二个清理。对于在不同缓冲条件下包含的样品的清理,可能需要实验确定体积。
将组织活检基因组分析的结果与补充液体活检数据相结合,可以全面了解肿瘤生物学。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 是一种多功能文库制备试剂盒,可用于从循环无细胞 DNA (cfDNA) 或从 FFPE 组织样本中提取的基因组 DNA (gDNA) 制备可用于测序的文库 (图 1)。该工作流程包括用于纠正错误和减少假阳性的唯一分子标识符 (UMI),从而能够准确、灵敏地检测 FFPE 肿瘤样本中的低频突变。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 与 Illumina 和第三方富集探针或面板兼容,以支持灵活的实验设计。本应用说明展示了 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 在生成高质量 NGS 文库和从 FFPE 样本中鉴定低频体细胞变异方面的优异性能。
组织活检的基因组分析结果与液体活检的互补数据的结合提供了有关肿瘤生物学的详尽信息。用富集来照亮无细胞的DNA制备是一种多功能试剂盒,可用于准备准备从循环DNA(CFDNA,无细胞DNA)和基因组DNA(GDNA,GDNA,基因组DNA)从FFPE织物中提取的书架(图1)。工作流程包括唯一的分子标识符(UMI,唯一的分子标识符),以校正误差和误报降低,从而可以准确且敏感地检测FFPE肿瘤样品中的低频突变。用ENRIGHMP照亮无细胞的DNA Prep与探针或富集面板照明和第三方,以支持灵活的实验设计。该应用程序上的注释表明,在高质量的NGS书店的一代中,没有光明细胞的DNA准备表现出色,并确定了FFPE冠军的低频体细胞变体。
程序和清单 - 使用SMRTBELL PREP KIT 3.0(102-166-600)准备整个基因组和元基因组库,描述了使用SMRTBELL PREP KIT 3.0在PACBIO上进行pacBio的Semecencing Systems semect in semect in基因组和元基因组DNA中构建整个基因组测序(WGS)库的工作流程。可以手动执行此过程,也可以使用SMRTBELL PREP套件3.0的众多合格自动化方法之一。
2024 年 6 月,注射用雷那卡韦 (LEN) 的开发商吉利德科学宣布,独立监测委员会对 PURPOSE 1 试验的数据进行了早期审查,发现作为预防措施的 LEN 对艾滋病毒是安全且高效的。该产品正在乌干达和南非 5,300 名年龄在 16-25 岁之间的 HIV 阴性顺性别女性中进行测试。接受 LEN 治疗的患者中未发现感染。伴随疗效试验 PURPOSE 2 同样在 2024 年 9 月公布了积极的安全性和疗效数据。PURPOSE 2 包括阿根廷、巴西、墨西哥、秘鲁、南非、泰国和美国的与出生时被指定为男性的伴侣发生性关系的顺性别男性、跨性别男性、跨性别女性和性别非二元个体。中期分析发现,与背景艾滋病毒发病率相比,雷那卡韦使艾滋病毒感染率降低了 96%。
织物活检基因组分析的发现与互补的液体活检数据的结合提供了有关肿瘤生物学的全面信息。富含富集的无细胞DNA制备是一种多功能文库制备套件,可用于根据FFPE组织样品提取的基于无细胞的DNA(CFDNA)或基因组DNA(GDNA)来制备现成的库(图1)。工作流程包括用于误差校正和误差降低的独家分子标识符(UMIS),从而可以精确且敏感地检测FFPE肿瘤样品中的低频突变。带有富集的无细胞DNA制备与照明或第三方富面板或面板兼容,提供了灵活的实验设计。本申请说明证明了Illumina无细胞DNA准备的出色性能,并在高质量的NGS库生成中富集并确定了FFPE样品的低频体细胞变体。