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PTPMT1 的缺失会限制线粒体对碳水化合物的利用，并导致肌肉萎缩和心力衰竭
预印本（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此版本的版权所有者于 2023 年 2 月 13 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.01.09.523031 doi：bioRxiv 预印本
ptpn2在肠病和肠肠肠道e的小鼠模型中调节细菌清除率。大肠杆菌感染
引言肠上皮调节营养，液体和电解质吸收，充当防止细菌入侵宿主的物理障碍，并为潜在的免疫系统提供了重要的线索，以维持对食物抗原的耐受性和儿童抗原的耐受性（1-3）。反过来，免疫细胞通过提供刺激来促进肠上皮细胞（IEC）屏障功能和屏障密封分子的表达来影响上皮屏障的功能（4，5）。在胃肠道感染期间，肠中的免疫细胞诱导强烈的免疫反应以消除入侵的病原体（4、6、7）。这些免疫反应可能会对上皮产生不利的影响，启动IEC过早死亡，同时还促进液体分泌以帮助消除身体中的病原体（8）。除了引发强烈的免疫反应以消除感染剂外，还必须控制感染后对炎症反应的控制，以防止过度和/或慢性炎症反应（4，6）。属于IEC的肠道巨噬细胞通过促进IEC的屏障功能并防止违反上皮屏障的细菌的全身传播（4，6）来影响人体对入侵病原体的反应（4，6）。在生理条件下，肠道宏分泌大量的抗炎细胞因子和其他免疫细胞中的烙印耐受性（6、9、10），但在存在入侵病原体的情况下迅速获得炎症表型。因此，肠道巨噬细胞对于安装有效的保护性免疫反应是必不可少的（4，9）。Previous studies have investigated how macrophages and other mononuclear phago- cytes interact with other immune cells and how they directly react to bacterial products to provide pro- tection against pathogens (6, 11), but it is still poorly understood how macrophage–IEC interactions contribute to combating invading pathogens or how disturbed macrophage–IEC interplay affects the ability of the body to defeat infections.我们最近证明了蛋白酪氨酸磷酸酶非受体2型（PTPN2）的丧失从批判性的角度改变了IEC与巨噬细胞的相互作用，并损害了
PTPT：通过多目标贝叶斯优化进行物理设计工具参数调整
摘要 — 在先进的集成电路设计中，与电子设计自动化 (EDA) 工具相关的物理设计流程起着至关重要的作用。大多数情况下，输入物理设计工具的参数主要是基于专家的领域知识手动挑选的。然而，由于技术节点的不断缩小以及参数组合所跨越的设计空间的复杂性，甚至再加上耗时的仿真过程，这种对物理设计工具参数配置的手动探索变得极其费力。在设计流程参数调整领域存在一些工作。然而，非常有限的现有技术探索了多个感兴趣的结果质量 (QoR) 指标（例如延迟、功率和面积）之间的复杂相关性并同时明确优化这些目标。为了克服这些弱点并寻求物理设计工具的有效参数设置，在本文中，我们提出了一个多目标贝叶斯优化 (BO) 框架，以多任务高斯模型作为替代模型。采用基于信息增益的获取函数依次选择工具模拟候选对象，以有效逼近帕累托最优参数配置。在 7 纳米技术节点下的三个工业基准上的实验结果证明了所提出的框架相对于前沿作品的优越性。
PTPT：通过多物理设计工具参数调整...
摘要 — 在先进的集成电路设计中，与电子设计自动化 (EDA) 工具相关的物理设计流程起着至关重要的作用。大多数情况下，输入物理设计工具的参数主要是基于专家的领域知识手动挑选的。然而，由于技术节点的不断缩小以及参数组合所跨越的设计空间的复杂性，甚至再加上耗时的仿真过程，这种对物理设计工具参数配置的手动探索变得极其费力。在设计流程参数调整领域存在一些工作。然而，非常有限的现有技术探索了多个感兴趣的结果质量 (QoR) 指标（例如延迟、功率和面积）之间的复杂相关性并同时明确优化这些目标。为了克服这些弱点并寻求物理设计工具的有效参数设置，在本文中，我们提出了一个多目标贝叶斯优化 (BO) 框架，以多任务高斯模型作为替代模型。采用基于信息增益的获取函数依次选择工具模拟候选对象，以有效逼近帕累托最优参数配置。在 7 纳米技术节点下的三个工业基准上的实验结果证明了所提出的框架相对于前沿作品的优越性。
PTPMT1的损失限制了碳水化合物和铅的线粒体利用
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年1月9日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.01.09.523031 doi：Biorxiv Preprint
使用 CRISPR-Cas9 系统的免疫疗法治疗 PTPN22 R620W 突变的类风湿性关节炎并靶向 PD-1 和 CD20
摘要 类风湿性关节炎 (RA) 是一种引起关节疼痛和炎症的炎症性自身免疫性疾病。目前的 RA 治疗会使患者的免疫功能低下，并且可能有有害的副作用。作为 RA 背后机制的一部分，T 细胞向 B 细胞过度信号传导会导致炎症。特定基因，如 PTPN22，可以在 RA 患者免疫系统中 T 细胞信号传导过度活跃中发挥作用。酪氨酸磷酸酶非受体 22 ( PTPN22 ) 编码的蛋白质是淋巴酪氨酸磷酸酶 (LYP)，它对 T 细胞和 B 细胞都具有调节活性。特别是，这种蛋白质的 R620W 变体与 RA 有关，可能会增加个体免疫系统的整体敏感性。本综述将讨论 CRISPR/Cas9 破坏或表达特定基因以对抗 RA 患者炎症的机制。首先，CRISPR/Cas9 可用于破坏 T 细胞中的 PTPN22 以恢复体内平衡。其次，CRISPR/Cas9 可用于敲入 PDCD1 ，该基因编码的 PD-1 蛋白可抑制细胞因子产生和 T 细胞增殖，从而可能下调 T 细胞。T 细胞通过产生促炎细胞因子并与滑膜成纤维细胞和巨噬细胞相互作用在 RA 中发挥作用。第三，CRISPR/Cas9 可用于靶向 MS4A1 ，该基因编码 B 细胞上的 CD20，以便在不影响 T 细胞的情况下消耗 B 细胞。使用 CRISPR/Cas9 敲除 T 细胞中的 PTPN22 或敲入 T 细胞中的 PDCD1 和 B 细胞中的 MS4A1 可能可以治疗甚至逆转受 PTPN22 蛋白 R620W 变体影响的类风湿性关节炎患者的症状。
长链非编码 RNA PTPRG- AS1 的过度表达与上皮性卵巢癌预后不良相关
长链非编码RNA（lncRNA）长度超过200个核苷酸，是一类新发现的基因转录副产物，由于缺乏开放阅读框6，其蛋白质编码功能有限。越来越多的研究表明，lncRNA通过转录和转录后水平等多种机制在基因调控中起着潜在的调节作用7。鉴于lncRNA对肿瘤相关基因的积极影响，其可能参与癌症进展也就不足为奇了8,9。近年来，利用高通量测序技术发现了越来越多在各类肿瘤中失调的lncRNA，随后通过RT-PCR实验进一步证实10,11。随后，许多功能实验表明，lncRNA可以作为肿瘤启动子或抑癌基因来调节肿瘤细胞行为12,13。 lncRNA 的频繁失调及其在肿瘤进展中的重要作用凸显了 lncRNA 作为新型生物标志物的巨大潜力 14,15 。LncRNA PTPRG 反义 RNA 1 (PTPRG-AS1) 是一种新发现的 lncRNA，由 Yi 等人首次在鼻咽癌中阐明其功能。16 。此前，PTPRG-AS1 也在肺癌和乳腺癌中表达 17,18 。然而，它们在上述两种肿瘤中的功能仍有待探索。到目前为止，PTPRG-AS1 是否在 EOC 中异常表达尚未得到证实。在这项研究中，我们首次提供了 PTPRG-AS1 在 EOC 组织中高表达的证据，并有可能作为 EOC 患者的新型预后生物标志物。
抗糖尿病药物洛贝格列酮有可能抑制 PTP1B 活性
Ruth F. Rocha a , Tiago Rodrigues c , Angela CO Menegatti a, b* , Gonçalo JL Bernardes c,d* , HernánTerenzi a 5 a 结构分子生物学中心，生物化学系，圣卡塔琳娜州联邦大学，Trindade 校区，88040-900，弗洛里亚诺波利斯，SC，巴西 b 皮奥伊联邦大学，CPCE，64900-000，Bom Jesus，PI，巴西 c 分子医学研究所，里斯本大学医学院，Avenida Professor Egas Moniz，1649-028 Lisbon，葡萄牙 10 d 剑桥大学化学系，Lensfield Road，CB2 1EW，剑桥，英国
达沙替尼对急性髓系白血病的疗效与 FLT3 /ITD、PTPN11 突变和独特的基因表达特征相关
1 以色列特拉维夫阿苏塔医疗中心血液肿瘤科；2 以色列雷霍沃特魏茨曼科学研究所 G-INCPM；3 以色列雷霍沃特魏茨曼科学研究所免疫学系；4 以色列雷霍沃特魏茨曼科学研究所分子遗传学系；5 加拿大安大略省多伦多大学健康网络玛格丽特公主癌症中心；6 加拿大安大略省多伦多大学医学生物物理学系；7 加拿大安大略省多伦多大学医学系；8 加拿大安大略省多伦多大学健康网络医学肿瘤学和血液学分部；9 美国犹他州盐湖城犹他大学血液学和血液系统恶性肿瘤分部；10 美国犹他州盐湖城犹他大学亨茨曼癌症研究所和 11 以色列海法 Rambam 医疗保健园区血液学分部
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