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Tiago de Paula Peixoto教授
推断和重建复杂网络摘要：网络数据为我们提供了广泛的复杂系统的描述，包括社会动态，人脑，细胞代谢，生态系统，气候动态，流行病扩散，用户行为，文本语料库，信息基础架构等。过去二十年来，几乎所有科学，技术和工业领域的网络数据中都有越来越多的洪水泛滥。是高维，稀疏，构造且通常是大的关系对象，网络数据提出了特定的挑战，需要特殊的分析和方法论框架。尤其是这些属性阻止了我们直接检查大型网络的结构，而要求我们开发生成模型和推理算法来描述它们的大和中尺度结构。此外，引起系统功能行为的成对相互作用通常无法直接访问，因为它们是不可能直接测量的。在这种情况下，我们需要从间接信息中推断或重建隐藏的交互网络。在本演讲中，我回顾了一种基于大规模生成模型和贝叶斯统计推断的全面，原则性和可扩展的方法，可从网络数据中提取科学理解。我将重点介绍模块化结构的原则提取以及从动力学行为中重建网络，从而利用统计物理和信息理论的分析框架。与统计物理学的联系尤其富有成果，因为它揭示了与自旋系统的等效性，包括与可检测性和计算硬度基本限制相关的相变的现象学。
扩展了珊瑚霍洛比特斯的自然自适应能力
引用Voolstra，C。R.，Suggett，D.J.，Peixoto，R.S.，Parkinson，J.E.，Quigley，K.M.，Silveira，C。B.，…Aranda，M。（2021）。扩展了珊瑚霍洛比特人的自然自适应能力。自然评论地球和环境。doi：10.1038/s43017-021-00214-3
心律失常：心律不齐的机制，诊断和治疗方法：机制，诊断和治疗方法心律不齐
Originals Received: 06/19/2024 ACCEPTance for Publication: 07/09/2024 Christovam Abdalla Neto Graduating in Medicine Institution: Faculty of Higher Education of the Amazon (FES) Address: Redenção, Pará, Brazil E-mail: Christovaneto@gmail.com Juliana Fernandes Areal Graduate in Medicine Institution: University of West Santa Catarina （UNOESC）地址：巴西的Joaçaba，圣塔卡塔琳娜电子邮件：Carrizo.jfa@gmail.com Amanda da Silva Peixoto毕业于医学机构：Tira-Dental（University Center Tira-Dental（单位）地址：Maceió Maranhão（UFMA）的地址：巴西圣路亚岛电子邮件castro.jonathan154@gmail.com luma de souza vieira Vieira毕业于医学机构：Uninovafapi大学中心（UNINOVAFAPI）Originals Received: 06/19/2024 ACCEPTance for Publication: 07/09/2024 Christovam Abdalla Neto Graduating in Medicine Institution: Faculty of Higher Education of the Amazon (FES) Address: Redenção, Pará, Brazil E-mail: Christovaneto@gmail.com Juliana Fernandes Areal Graduate in Medicine Institution: University of West Santa Catarina （UNOESC）地址：巴西的Joaçaba，圣塔卡塔琳娜电子邮件：Carrizo.jfa@gmail.com Amanda da Silva Peixoto毕业于医学机构：Tira-Dental（University Center Tira-Dental（单位）地址：Maceió Maranhão（UFMA）的地址：巴西圣路亚岛电子邮件castro.jonathan154@gmail.com luma de souza vieira Vieira毕业于医学机构：Uninovafapi大学中心（UNINOVAFAPI）
Embc 2021程序
Almasri，AMT'S Mount，Oliver Bonato，Paolfield，Brian Choi，Jin-Woo Dienzo，Marco Eskofer，Bjoe M Fang，Qiang Fortino，Youot，Youot拜尼·麦克弗森（Byny MacPherson）。史蒂夫·郑（Steve Zheng），Yali，Yali。
内分泌腺及其主要疾病
agathathoméIgarashi * 1高中医学高级ana beatriz酸味2 teles 2高医学伊曼纽尔·坎帕斯·戈利尼（Emanuel Campos ugolini）2毕业于医学毕业于医学Medicine Gabriel Domingues dos Santos 6 Graduating in Pharmacy Lucas Klaus Agostini 7 Graduating in Medicine Marcus Vinicius Rocha Soares 8 Graduating in Medicine Daniel Felipe Monteiro da Silva 9 Graduating in Medicine Ayron César Xavier 10 Generalist Pharmaceutical Feliph Cássio Brito 11 Graduated in Physiotherapy Tássia Peixoto Ribeiro医学博士学位Jhony LucasinácioDeAlmeida 12毕业于大学医院医学诊所的医学医学R2 -MT
不同认知任务中前额皮质投射神经元类别的差异编码
Jan H. Lui, 1,6,* Nghia D. Nguyen, 1,5,6 Sophie M. Grutzner, 1 Spyros Darmanis, 2 Diogo Peixoto, 3 Mark J. Wagner, 1 William E. Allen, 1,4 Justus M. Kebschull, 1 Ethan B. Richman, 1,4 Jing Ren, 1 William T. Newsome, 3 Stephen R. Quake, 2,* 和 Liqun Luo 1,7,* 1 斯坦福大学霍华德休斯医学研究所生物系，斯坦福，加利福尼亚州 94305，美国 2 斯坦福大学陈扎克伯格生物中心生物工程和应用物理系，斯坦福，加利福尼亚州 94305，美国 3 斯坦福大学神经生物学系，斯坦福，加利福尼亚州 94305，美国 4 斯坦福大学神经科学博士项目，斯坦福，加利福尼亚州 94305，美国 5神经科学，哈佛大学，美国马萨诸塞州波士顿 02115 6 这些作者贡献相同 7 主要联系人 *通信地址：janlui@stanford.edu (JHL)、steve@quake-lab.org (SRQ)、lluo@stanford.edu (LL)
EMT 和 CSC 在癌症中的相互作用及潜在的治疗策略
细胞类型在人体内转换，通过分子谱识别，并导致人类疾病（Regev et al., 2017）。上皮-间质转化（EMT）被定义为细胞表型从上皮型变为间质型，N-钙粘蛋白和波形蛋白高表达，发生在正常细胞和癌细胞等各种条件下（Tanabe, 2015a; Noh et al., 2017）。EMT 在细胞过程中发挥各种作用，如迁移、细胞外基质 (ECM) 改变和细胞凋亡 (Song and Shi, 2018; Peixoto et al., 2019)。EMT 还能驱动细胞可塑性并导致肿瘤内异质性 (Krebs et al., 2017; Wahl and Spike, 2017)。癌症在不同恶性阶段存在实体特异性差异和群体多样性 ( Dawood 等，2014；Fatima 等，2019 )。癌症干细胞 (CSC)，即癌症中的干细胞群体，可通过 CD44 等标志物检测，而迄今为止尚未确定 CSC 的独特标志物 ( Yan 等，2015；Ghuwalewala 等，2016 )。癌症产生的两种可能性，例如随机模型和层次模型，已被长期讨论，但仍然存在争议。CSC 由具有干细胞样特征的癌细胞组成，这些癌细胞具有自我更新、在癌细胞中分化的能力 ( Sato 等，2016 )。此外，已知一些 CSC 群体具有 EMT 样细胞特征 ( Shibue and Weinberg，2017 )。 EMT 和 CSC 之间的潜在联系是癌症药物耐药性获得的关键，也是癌细胞可塑性的关键，癌细胞可塑性是指癌细胞转化为恶性细胞，反之亦然 ( Loret et al., 2019 )。要揭示癌症药物耐药性的机制，必须了解 EMT 和 CSC 的特征
KMT5B神经发育中的单倍症的机制。 Sheppard，S.E。；科比，L。 Wickramasekara，R.N。； Vaccaro，C。；罗伯逊 分子医学时代的肉瘤治疗 Zhiqiang人脑sha的白质连接组的遗传结构； Schijven，d。; S.E. Fisher； Francks，C。2023，文章 /字母T < / div> 眼睛追踪技术支持视觉筛选... 在外太空的军备竞赛？ 预言与广泛的CRISPR – CAS ... 使用来自婴儿宇宙的中性氢的21 cm信号与低频空间干涉仪凝视到黑暗（年龄） 睾丸癌幸存者的心血管疾病 脾脏在训练有素的免疫力模型中的作用有限：对中性粒细胞增生的影响。 Uijen，R.F。; Bulut，O。;琼·乔奇（M.I.） de; doming 社会游戏行为以特定于区域的方式Bijlsma，Ate塑造前额叶抑制的发展； Vanderschuren，L。； Wierenga，Corette J. 地图集文档 神经肿瘤学进步
KMT5B的机制和人类神经发育的机制。 Sheppard，S.E。 ; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。 ;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.） ; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。 ; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。 ; Lim，C.Y。 ;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr ; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。 ;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。 ;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。 ; Kamstean，E.J。 ; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals ; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。 ;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。 ;亨德森（L.B.）KMT5B的机制和人类神经发育的机制。Sheppard，S.E。 ; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。 ;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.） ; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。 ; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。 ; Lim，C.Y。 ;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr ; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。 ;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。 ;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。 ; Kamstean，E.J。 ; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals ; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。 ;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。 ;亨德森（L.B.）Sheppard，S.E。; Brying，L。; Wickramascaker，R.N。;疫苗接种，c。罗伯茨，b。简，J。; Hulen，J。；沃森（C.J.）; Faunds，V。; duffourd，y。 Lee，P。;西蒙，M.C。; Cruz，X。 N。Patilla；弗洛雷斯·梅德（Flores-Mend）； Akizu，n。;微笑，J。；来自R. Silva的Pellemino；仪式。;月，米；玫瑰，a。; Barcelo-Serts，i。 Choa，Z.X。; Lim，C.Y。;杜布格，c。日记，H。； Demurger，f。; Mulhern，M。；阿克曼，c。 Lippa，n。;安德鲁斯（M。）； Baldridge，D。君士坦丁，J。；毛发，A。Van； Snoeck-streef，i。 Chow，P。; Hing，A。; J.M. Graham Jr; au，m。; Faivre，L。; Shen，W。;毛。 J。Palubos； Viscope，d。; Gahl，W。； tifft，c。; Mamamara，E。； Hauser，n。; Miller，R。； Maffeo，J。； Afenjar，A。; Doummar，d。; Keren，b。 Arn，P。; Macklin-Mania，S。；消息，i。 Callewaert，b。对，a。; Zweier，c。; Brewer，C。； Saggar，A。; Smeland，M.F。;库马尔，阿吉斯； Elmslie，F。; Deshpand，c。很好，m。 Cogne，b。 Ierland，Y。Van；威尔克（M。）； Slegtenst，M。Van；海岸Chhen，J.Y。;干燥，d。码头，d。 Wormanmann，S.B。; Kamstean，E.J。; Coch，J。； Haynes，d。;污染，L。； Tither，H。; Ranguin，K。； Pitch-Man，A.S。；韦伯，葬礼的佩雷斯，a。 Sanchez del Pozo，J。； J.M. Rosals; Jose，P。;标准，K。；劳赫（Rauch） Mei，D。；玛丽，f。; Guerrini，r。 Lesin，J。； Tran Mau-Them，f。;菲利普，c。 Dauriat，b。雷蒙德（L. Raymond）； Moutton，S。； Quiet-Gonzal，A.M。；火灾，T.Y。;朋友，c。格罗托（Grotto）肾脏，f。; Drive，T.G。;伊斯兰教。 Sidlik，J.A。;亨德森（L.B.）; Hennessy，L。； Raper，A。;父母，我。 Caiser，F.J。;有时，一个。布克，Ø.L。; Juusola，J。；人，r。 Schnur，R.E。; Vitobello，A。;银行； Bhoj，E.J。; Stepman，H.A.F。2023，文章 /编辑（Adventure Science，9，10，（2023），pp。EADE1463，第1463条）
简单而强大的电转染方案，可在人类 B 细胞中实现有效的异位基因表达和基因组编辑
1. Zhao N、Qi J、Zeng Z、Parekh P、Chang CC、Tung CH 等。使用简单的阳离子聚合物纳米复合物转染难以转染的淋巴瘤/白血病细胞。《Journal of Controlled Release》。2012；159(1)：104-10。2. Meacham JM、Durvasula K、Degertekin FL、Fedorov AG。细胞内递送的物理方法。《Journal of Laboratory Automation》。2014 年 2 月；19(1)：1-18。3. Kaestner L、Scholz A、Lipp P。转染和基因递送的概念和技术方面。《Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters》。2015 年 3 月；25(6)：1171-6。4. Mosier DE。“逆转录病毒载体的安全注意事项：简要回顾”简介。《Applied Biosafety》。2016；9(2)：68-75。 5. Glover DJ、Lipps HJ、Jans DA。《面向人类安全、非病毒治疗性基因表达》。《自然遗传学评论》。2005 年 4 月 10 日；6(4)：299-310。6. Kim TK、Eberwine JH。《哺乳动物细胞转染：现在和未来》。《分析和生物分析化学》。2010 年；397(8)：3173-8。7. Rols MP。《电通透化：一种将治疗分子递送到细胞中的物理方法》。《生物化学与生物物理学报》（BBA）-生物膜。2006 年 3 月；1758(3)：423-8。8. Jordan ET、Collins M、Terefe J、Ugozzoli L、Rubio T。《优化原代细胞和其他难以转染的细胞中的电穿孔条件》。《生物分子技术杂志》。2008 年； 9. Chicaybam L、Barcelos C、Peixoto B、Carneiro M、Limia CG、Redondo P 等人。一种用于哺乳动物细胞遗传改造的有效电穿孔方案。生物工程与生物技术前沿。2016；4：99。10. Machy P、Lewis F、McMillan L、Jonak ZL。通过电穿孔将基因从靶向脂质体转移到特定淋巴细胞。美国国家科学院院刊。2006；85(21)：8027-31。11. Maurisse R、De Semir D、Emamekhoo H、Bedayat B、Abdolmohammadi A、Parsi H 等人。将 DNA 转染到来自不同谱系的原代和转化哺乳动物细胞中的比较。BMC 生物技术。2010；10。 12. Gahn TA、Sugden B. 电穿孔显著、短暂抑制伯基特淋巴瘤细胞系中 Epstein-Barr 病毒潜伏膜蛋白基因的表达。J Virol。1993；67(11)：6379-86。13. Goldstein S、Fordis CM、Howard BH。电穿孔 G2/M 同步细胞并用丁酸钠处理后，转染效率提高，细胞存活率提高。Nucleic Acids Research。1989；17(10)：3959-71。14. Liew A、André FM、Lesueur LL、De Ménorval MA、O'Brien T、Mir LM。使用方波电脉冲对人类间充质干细胞进行可靠、高效、实用的电基因转移方法。人类基因治疗方法。2013 年 10 月；24(5)：289-97。 15. Kreiss P, Cameron B, Rangara R, Mailhe P, Aguerre-Charriol O, Airiau M 等。质粒 DNA 大小不影响脂质体的理化性质，但可调节基因转移效率。核酸研究。1999；27(19)：3792-8。16. Lesueur LL, Mir LM, André FM。克服体外原代细胞大质粒电转移的特殊毒性。分子疗法 - 核酸。2016；5：e291。17. Germini D、Saada YB、Tsfasman T、Osina K、Robin CC、Lomov N 等人。基于一步法 PCR 的检测方法用于评估基因组 DNA 编辑工具的效率和精度。分子疗法 - 方法与临床开发。2017 年 6 月；5（六月）：43-50。18. Georgakilas AG、Martin OA、Bonner WM。p21：双面基因组守护者。分子医学趋势。2017 年 4 月；23（4）：310-9。