噬菌体(噬菌体)构成了地球上最丰富和遗传多样的实体。细菌与估计全球总数10³为病毒体的相互作用显着塑造了人类健康和环境生态系统(1)。噬菌体与其细菌宿主之间的生态相互作用的规模驱动了一种遗传武器种族,从而不断改变分子水平的微生物寿命(2)。在大型时间尺度上快速发展而产生的多样性为人类健康创新(例如噬菌体疗法)提供了基础,以及生物技术创新的基础,例如群集定期散布的短期短滴定重复序列(CRISPR)和CRISPR与CRISPPR相关(CAS)蛋白质系统(3-5)。然而,具有巨大的遗传多样性是伟大的未知数 - 对绝大多数噬菌体中的基因含量已知。与细菌对应物相比,噬菌体基因组编码具有已知或预测功能的基因的小部分,这构成了生物圈中最大的遗传暗物质(未知功能基因)之一(6)。尽管有可能使用经典的遗传技术将一些暗物质带到光线下,但仍需要更高的实验方法来简化和加快噬菌体基因组的遗传遗传含量的表征和加快表征。
在GFRA首席执行官Alejandra Capozzo的介绍之后,开幕式始于地方政府当局(F. K. Tumwesabaze)的演讲,该组织是东非国家动物健康组织(S. Wakhusama)世界动物健康组织(S. Wakhusama)的代表,Une(Fabrizio Rosso)和Grial(Cyr)随后,该计划升级到了第一个专门用于非洲FMD研究的课程。Susan Kerfua and Theo Night Jones chaired this session, addressing diverse topics such as the assessment of FMD vaccines in Uganda, heterologous protection against SAT1 strains in goats, the creation of FMDV SAT strains - specific peptide phage display libraries for epitope identification, and research on transmission dynamics and vaccine effectiveness in controlling endemic FMD in Ethiopia.
-Te impact of pollution on the development of brain diseases -Advancing knowledge on the impacts of micro- and nanoplastics on human health -Randomised controlled trials to test safety and efficacy of phage therapy for the treatment of antibiotic-resistant bacterial infections -Advancing innovative interventions for mental, behavioural and neurodevelopmental disorders -European Partnership for Brain Health - 基于细胞的秘密疗法 - 与合成生物学的增强细胞疗法 - 实施研究研究,用于在不可传染的疾病(全球慢性疾病联盟-GACD联盟-GACD联盟)的背景下进行多种长期条件的管理 - Pre -Pre -Commercial Procuroment for环境可持续性,气候中性和循环健康和司法
带有PCR纯化套件。此后,从含有IL-2和BI-特异性基因的预先形成的慢病毒F9质粒和BI-特异性F9质粒中扩增了IL-2信号肽和双特异性AVRAN-BIS或DURAN-BIS蛋白构建体。使用与KOD DNA聚合酶的PCR反应进行扩增,与噬菌体质粒同源的引物(补充表S1中的引物为G)。此后,使用吉布森装配方法的方案将PCR产物克隆到开放噬菌体质粒中,然后转化为电竞争性的大肠杆菌。使用Allin™Red Taq Mastermix进行了用于Gibson组装和质粒插入验证的菌落PCR,并将上述序列呈阳性的菌落转移到含有氨苄青霉素LB(25 µg/mL)和
原核生物与入侵的移动遗传因素之间的进化武器竞赛导致出现了无数的抗病毒防御系统,这些防御系统聚集在宿主基因组中的防御岛上。通过识别与已知防御操纵子2-4相邻的未知基因的簇,原核生物免疫系统的这种内在特征促进了新型防御系统的系统发现。使用这种方法,最近已经确定了许多推定的防御系统,包括BREX 5,DISMAL 6,SEPTU 2,RADAR 3和MOKOSH 4,其蛋白质成分与多种酶活性有关。这些“先天”免疫系统被认为提供了多层的宿主防御,并补充了诸如限制性限制,流产感染和适应性免疫系统等规范防御机制的活动,例如CRISPR-CAS 7,8。对于这些先天系统的一小部分,基于免疫力的分子触发因素和机制已被发现9-16。例如,CBASS系统通过检测高度结构化的噬菌体RNA 17提供免疫力,从而产生环状二核苷酸18,19,随后激活下游效应蛋白以触发感染宿主细胞的死亡18,20。与CBAS,Avast和Caprel SJ46相比,通过识别高度保守的噬菌体蛋白(例如门户,末端酶和主要的capsid蛋白)来激活其下游效应子,以中止噬菌体感染21,22。尽管免疫学角色
摘要 Öz 目的:近年来,许多重要细菌群落对抗生素的耐药性不断增加,导致人们对噬菌体分离和表征以及噬菌体不断扩大的临床潜力的文献兴趣日益浓厚。考虑到抗菌素耐药性特征,分离用于治疗鲍曼不动杆菌感染的噬菌体、确定其作用谱并进行表征非常重要。本研究旨在从环境水源中分离针对目标微生物鲍曼不动杆菌的特异性噬菌体。材料和方法:研究了 16 种不同的环境水样作为噬菌体的潜在来源。以具有多重耐药性的鲍曼不动杆菌临床分离株作为宿主细菌。使用单噬斑分离法分离针对目标细菌的特异性噬菌体。在体外研究期间,使用双琼脂法增加分离噬菌体的滴度,并评估其噬斑形态和宿主特异性。结果:噬菌体 vB_KlAcineto13 仅对目标细菌表现出溶解活性,不会感染其他细菌分离株。结论:根据本研究的结果,可以得出结论,噬菌体 vB_KlAcineto13 的宿主范围较窄,不会感染宿主细菌以外的其他测试细菌。然而,特性研究可能会提供有关噬菌体的更多详细信息。
人们崇拜恒河提供生态系统和环境,这对于赋予生命和维持生命至关重要。它对印第安人的精神,神话,社会文化和历史重要性增加了其重要性。这条河还支持各种各样的生命形式,包括植物,动物和微生物。当前的研究涉及对从河流长度的三个单独采样点采集的收集样品进行的宏基因组分析。使用CCMetagen和MG-Rast Web服务器,分析了宏基因组序列数据以理解微生物多样性。虽然Methano Regulaboonei,Methanosae tathermophila和甲那霉菌乙酰硫酸酯是最普遍的大古代人,但最丰富的细菌是Novosphingobium芳香虫,红细胞杆菌litoralalis和sphingopypopypopyxis acalassis。Malassezia Globosa,Ustilago Maydis和Neosartorya Fumigata是经过处理的读数数量最多的真菌,而前三种病毒是根茎噬菌体16-3,假单胞菌噬菌体噬菌体73和Phage Phijl001。根据系统发育分析得出,所鉴定的细菌物种非常多样化。这使正在研究的水样品的α多样性使我们能够根据它们在各个层次结构之间的相对分类学丰度(包括课程,订单和家庭)进行分类。从数据中也获得了不同层次级别的分类学丰富性和均匀性。这样的研究将提出对恒河的微生物多样性的深入分析。
我们开发了Ont-Cappable-Seq,这是一种专门的长阅读RNA测序技术,允许使用纳米孔测序[1]对主要的,未经处理的RNA进行端到端测序。我们应用了Ont-Cappable-seq研究一组噬菌体,提供了病毒转录起始位点,终结器位点和复杂的操纵子结构的全面基因组图,这些结构细调了基因表达。许多发现的启动子和终结者都是新颖的,尚未被识别或预测。新的启动子和终结器的强度差异很大,使其成为新合成DNA电路的理想选择。在程度上,由Ont-Cappable-Seq提供的更精致的操纵子组织可以给基因功能提供新的提示,并启用更好的知情噬菌体工程方法。ont-cappable-seq是一种更好地了解噬菌体生物学和推动合成生物学的有力方法。
该项目结合了微生物学、生物信息学和兽医学,以应对全球挑战。您将获得噬菌体生物学、细菌学、生物信息学和微生物群研究方面的实践经验,并与最先进的设施和支持团队合作。您的研究成果将为可持续家禽养殖的突破性干预铺平道路。培训机会:学生将参加全面的培训计划,以培养研究项目所必需的技能。这包括在首席导师的指导下,由萨里大学微生物群落研究小组提供的基因组学和宏基因组学课程。在贝尔法斯特女王大学为期 3 个月的实习将提供微生物群落转录组分析方面的专门培训,由联合导师监督。通过噬菌体生物学的重点培训,学生将掌握微生物系统中噬菌体的知识,并可以使用流式细胞术核心设施,提供细胞群分析技术培训,从而进一步提高实践专业知识。此外,监督团队将协助