提取核酸是任何分子生物学研究的起点,因此被认为是一个关键过程。质粒被认为是原核生物进化的主要驱动力,因为它们可以在人群之间迁移,使其成为侧向DNA转移和微生物战争的有效药物。质粒的重要性超出了微生物的进化,因为它们被广泛用作基础研究(例如随机诱变)的遗传工程载体,以及在生物技术学(例如胰岛素生产),合成生物学,农业,农业,农业工程(例如,Bioss的遗传工程)和医学(E. g.g.,g。由于质质剂DNA(pDNA)的有效生产方法的需求已响应于基因治疗和疫苗的快速进步,因为与病毒载体相关的有利安全问题,因此pDNA在基因治疗和疫苗中的快速进步。从细菌细胞中纯化的质粒DNA可以用内毒素污染至不同的扩展,具体取决于纯化方法。报告表明,内毒素可以降低许多真核细胞系中的转染效率。HIMEDIA的HIPURA®无内毒素质粒MIDIPREP DNA纯化试剂盒的预填充墨盒可提供无内毒素,高产量质粒DNA和无麻烦的自动化溶液,以萃取。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经Peer Review的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2024年1月23日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2024.01.23.576838 doi:Biorxiv Preprint
摘要 — 生物信息学和人工智能 (AI) 是快速发展的工具,它们促进了移动遗传元素 (MGE) 的注释,从而能够预测污染环境中的健康风险因素,例如抗生素抗性基因 (ARG)。本研究旨在评估四种基于 AI 的质粒注释工具 (Plasflow、Platon、RFPlasmid 和 PlasForest) 的性能,通过使用定义的性能参数来识别从哥斯达黎加维里拉河获得的一个沉积物样本的宏基因组中的 ARG。我们从样本中提取并测序完整的 DNA,组装宏基因组,然后使用每种生物信息学工具进行质粒预测,并使用抗性基因标识符网络门户进行 ARG 注释。计算了评估质粒的每个 ARG 预测结果的灵敏度、特异性、精确度、阴性预测值、准确度和 F1 分数。值得注意的是,Platon 在评估的工具中表现最高,获得了优异的分数。相反,Plasflow 似乎难以区分染色体和质粒序列,而 PlasForest 在处理小重叠群时遇到了限制。RF- Plasmid 表现出较低的特异性,并且其分类单元依赖的工作流程表现不佳。我们建议采用 Platon 作为抗性基因组研究的首选生物信息学工具
Donor Oligo 可置换约1 ~ 90nt 的长度Plasmid DNA donor Kit 可嵌入mKate Reporter 于任意指定位置应用: SNP/ insertion / deletion / protein fusion 研究
我们将follistatin(FST)344基因的聚乙烯胺(PEI)复合质粒注射到43位男女的43名成年人类志愿者,年龄23-88岁,中位年龄为46岁,以测试这种传递方法和靶基因的安全性和效果,作为反效率longe longe longe lorge longe longe longe longe longe longe longe longe longe longe longe interivessenty。患者在质粒载体中接受皮下注射到50 r g fst的腹部脂肪中。我们在治疗前和三个月后立即评估了几个指标:血清FST,身体组成,炎症的血液生物标志物,葡萄糖代谢,脂质代谢和表观遗传年龄的估计。血清FST,通过酶联免疫测定法测量,在第三个月的基线平均值从8.58 ng/ml的基线平均值增加到24.03 ng/ml(p = 0.001),后者在很大程度上是Suprypaperagyologicaly值。通过双能X射线吸收量扫描测量的身体成分,显着改善,平均无脂肪质量增加1.96磅(P = 0.001),平均体贴降低为-0.87%(P = 0.01)。最大无脂肪质量增加为12.15磅。高敏感性C反应蛋白和同型半胱氨酸,两种常见的炎症标志物,均显示出潜在降低的迹象,以改善。葡萄素代谢标记物趋向于临床上的不足增加。脂质面板的变化很小,在统计学上没有显着性,尽管少数受试者的低密度脂蛋白经历了很大的增加。端粒长度趋向增加,在老年阶段逐渐逐渐逐渐增加,但DunedInpace的衰老率没有明确的变化证据。内在的表观遗传年龄趋向于减少,外在表观遗传年龄(EEA)在统计学上显着降低了-7。10年的显着降低(p = 0.004);两种结果在老年阶段逐渐明显,最大EEA降低了-27.91岁。至关重要的是,没有据报道与治疗有关的严重不良反应。这项临床试验将FST的PEI复合物递送为PEI复合质粒递送,作为在接近最大的成人年龄范围内的男性和女性人类受试者的潜在安全,抗毛细管寿命疗法。
摘要:一种人畜共患病原体的衣原体Psittaci(C。Psittaci)对公共卫生保障和畜牧业的发展构成了潜在的威胁。传染病的基于疫苗的预防措施具有有希望的景观。DNA疫苗具有许多优势,已成为预防和控制衣原体感染的主要候选策略之一。我们先前的研究表明,CPSIT_P7蛋白是针对C. psittaci的疫苗的有效候选者。因此,本研究评估了BALB/C小鼠中PCDNA3.1(+)/CPSIT_P7对C. psittaci感染的保护性免疫。我们发现PCDNA3.1(+)/CPSIT_P7可以诱导强烈的体液和细胞免疫反应。用PCDNA3.1(+)/CPSIT_P7免疫的小鼠感染肺中的IFN-γ和IL-6水平大大降低。此外,PCDNA3.1(+)/CPSIT_P7疫苗减少了肺病变病变,并减少了受感染小鼠肺中的C. psittaci负荷。值得注意的是,pcDNA3.1(+)/cpsit_p7抑制了BALB/C小鼠中的C. psittaci传播。在一个单词中,这些结果表明,PCDNA3.1(+)/CPSIT_P7 DNA疫苗具有良好的免疫原性和免疫保护有效性,以针对BALB/C小鼠的C. psittaci感染,尤其是肺部感染,并为抗chlameldial viclection的DNA疫苗开发提供了必不可少的实用经验和见解。
MoBiTec GmbH pCasPP P. polymyxa 基因组编辑载体 本研究 pCasPP-pepFsg1 pepF 靶向敲除质粒不提供修复模板 本研究 pCasPP-pepFsg1-harms pepF 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-pepFsg2-harms pepF 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-pepF-harms 未靶向的 pCasPP 衍生物携带 pepF 同源区 本研究 pCasPP-pepCsg1-harms pepC 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-pepCsg2-harms pepC 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-pepJsg1-harms pepJ 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-pepJsg2-harms pepJ 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-ugdH1sg1-harms ugdH1 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-ugdH1sg2-harms ugdH1 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-manCsg1-harms manC 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-manCsg2-harms manC 靶向敲除质粒提供修复模板 本研究 pCasPP-clugBlock-harms 多重 pCasPP 变体,同时靶向两个不同位点,用于敲除 18 kb 片段;提供同源区域
基因克隆是指分离目标 DNA 序列以复制多个副本的过程。目标基因被分离(通过 PCR),然后插入质粒载体(通过消化和连接)。质粒载体能够在宿主细胞内自主复制,确保序列被克隆。重组载体可用于创建转基因生物 (GMO),进而可用于生产大量治疗性蛋白质(生物制药)。基因克隆的过程涉及多个步骤:•用聚合酶链式反应(PCR)分离和扩增目的基因(和质粒载体)•如果要将基因整合到细菌细胞中,则需要 cDNA 拷贝(逆转录)•用相同的特异性限制性酶(平端或粘端)消化基因和质粒载体•通过将目的基因连接到质粒载体(使用 DNA 连接酶)来创建重组质粒•通过凝胶电泳将重组质粒与正常质粒(没有目的基因)分离•通过载体递送方法(例如电穿孔)将重组质粒引入靶细胞•在抗生素培养基中培养细胞以选择修饰细胞(只有带有质粒的细胞才具有抗生素抗性)
1。重组质粒设计7 2。初始质粒提取7 3。消化和连接7 4。转换8 5。质粒提取,纯化和DNA测序8 6。蛋白质表达8 7。蛋白质纯化9
质粒 DNA(标记为红色)被选为我们在实验室中制备的单向导 RNA 的靶序列。马丁将这些单向导 RNA 添加到纯化的 Cas9 蛋白中,并将它们与质粒 DNA 分子一起在实验室试管中孵育。为了分析该实验的结果,他在琼脂糖凝胶系统中将不同的切割 DNA 产物彼此分离,如图所示。您可以在该凝胶系统的每个泳道中看到,根据向导 RNA 与质粒 DNA 相互作用的位置,Cas9 会产生切口。通过在不同的位置切割质粒,以便同时将两个双链断裂引入质粒,我们可以将这些切割的 DNA 片段释放到凝胶系统中。如您所见,每个切割的质粒 DNA 片段根据片段的大小迁移到不同的位置。