抽象的人群物种,尤其是trichocarpa,长期以来一直是基因组研究的模型树,这是由于完全测序的基因组。然而,高杂合性和重复区域的存在,包括丝粒和核糖体RNA基因簇,剩下了59个未解决的间隙,占三分法P. trichocarpa基因组的3.32%。在这项研究中,改进了愈伤组织诱导方法,以从P. ussuriensis花药中得出双倍的单倍体(DH)愈伤组织。利用长阅读测序,我们成功地组装了一个几乎没有间隙的,端粒到telomere(T2T)P。ussuriensis基因组,跨越了412.13 MB。该基因组组件仅包含7个间隙,其重叠n50长度为19.50 MB。注释显示该基因组中有34,953个蛋白质编码基因,比trichocarpa多465个。值得注意的是,中心区域的特征是高阶重复序列,我们在所有DH基因组染色体中鉴定了和注释的中心粒区域,这是杨树的第一个。衍生的DH基因组表现出与毛thocarpa的高共线性,并显着填补了后者基因组中存在的空白。此T2T P. ussuriensis参考基因组不仅会增强我们对基因组结构的理解,并在杨树属内的功能增强了我们的功能,而且还为杨树基因组和进化研究提供了宝贵的资源。
许多植物物种和基因型对转化和再生 (TR) 的适应性存在很大差异,这对基因工程在研究和育种中的应用提出了挑战。为了帮助了解这种变异的原因,我们使用 1204 棵野生黑杨树种群进行了关联作图和网络分析。为了对愈伤组织和嫩枝 TR 进行精确和高通量的表型分析,我们开发了一种计算机视觉系统,可以交叉引用互补的红、绿、蓝 (RGB) 和荧光高光谱图像。我们使用单标记和组合变异方法进行了关联作图,然后对已发表的多组学数据集进行了上位性和整合的统计检验,以确定可能的调控中心。我们报告了 409 个与编码序列 5 kb 范围内的关联有关的候选基因,上位性测试表明其中 81 个候选基因是彼此的调节因子。与蛋白质 - 蛋白质相互作用和转录调控相关的基因本体术语被过度使用。除了长期确定对 TR 至关重要的生长素和细胞分裂素通路之外,我们的结果还强调了应激和伤害通路的重要性。这些通路内和跨通路的潜在信号调节中心包括生长调节因子 1 (GRF1)、磷脂酰肌醇 4-激酶 β 1 (PI-4K β 1) 和 OBF 结合蛋白 1 (OBP1)。
Highly efficient CRISPR-mediated homologous recombination via 1 NHEJ deficiency rather than HDR factors overexpression in Populus 2 3 Ali Movahedi 1§* , Hui Wei 1§ , Zhong-Hua Chen 2 , Weibo Sun 1 , Jiaxin Zhang 3 , Dawei Li 1 , Liming 4 Yang 1* , and Qiang Zhuge 1* 5 6 1 College of Biology and the Environment,中国南部7号的可持续林业共同创新中心,森林遗传学与生物技术主要实验室,教育部,南京林业大学8号,南京210037,210037,9 2霍克斯伯里环境学院,霍克斯伯里环境学院,西悉尼悉尼大学,10佩里斯大学,新南威尔士州佩里斯2751,新南威尔士州2751,澳大利亚11 3 n and NANJ and nanj andial andical Instriciting andical Sciention and nan Junan Junlan andical Instriciting Synormitics Squartring Synormitics Squarnion,NAN NAN NAN NAN NAN SACEITIC 210046,中国13 14 15 *应将信件发送给Qiang Zhuge,Ali Movahedi和Liming Yang:生物学与环境学院16,南部17中国可持续林业中心共同创新中心,中国森林遗传学与生物技术的主要实验室,教育部,Nanjing 18 Forestry University,Nanjing 18 Forestry University,Nanjing University,Nanjing University,Nanjing 210037。电子邮件:qzhuge@njfu.edu.cn; 19 ali_movahedi@njfu.edu.cn; yangliming@njfu.edu.cn;传真:+86 25 85428701 20 21§这些作者同样作为第一作者22 23 22 23 24跑步标题:高效通过XRCC4 Poplar中的XRCC4缺乏效率25 26 26 27 27 27 27 28 29 28 29 30 31 32 33 33 34 35 33 35 36 37 37 38 39 39 38 39 38 39 39 38 39 38 39 38 39 38 39电子邮件:qzhuge@njfu.edu.cn; 19 ali_movahedi@njfu.edu.cn; yangliming@njfu.edu.cn;传真:+86 25 85428701 20 21§这些作者同样作为第一作者22 23 22 23 24跑步标题:高效通过XRCC4 Poplar中的XRCC4缺乏效率25 26 26 27 27 27 27 28 29 28 29 30 31 32 33 33 34 35 33 35 36 37 37 38 39 39 38 39 38 39 39 38 39 38 39 38 39 38 39
Common Name Binomial Synonyms Group alligator juniper Juniperus deppeana trees aspen Populus tremuloides trees blue spruce Picea pungens trees bristlecone pine Pinus aristata trees corkbark fir Abies lasiocarpa sub-alpine fir trees Douglas fir Pseudotsuga menziesii trees Engelmann spruce Picea engelmannii trees Gambel橡木槲皮树树木树木弯曲的松树柔毛柔毛树木Pinderosa Pine Pinus Ponderosa树Rio Grande Cottorwood Populus Populus deltoides ssp。wislizeni populus wislizeni树落基山杜松子刺羊皮树俄罗斯橄榄伊利夫·埃拉努斯·安格斯蒂福利亚树saltcedar tamarix spp。trees southwestern white pine Pinus strobiformis trees twoneedle pinyon Pinus edulis trees wavyleaf oak Quercus X pauciloba Quercus undulata trees white fir Abies concolor trees blue grama Bouteloua gracilis grasses buffalo grass Bouteloua dactyloides Buchloe dactyloides grasses bush muhly Muhlenbergia porteri草小蓝色bluestem schizachyrium scoparium scoparium scwithgrass panicum virgatum virgatum virgatum草sand蓝色茎Andropogon hallii草hallii hallii hallii hallii pascopopyrum pascopyrum smithii smithii agropyron agropyron smithii smithii smithi smitha pleuraphis pleuraphis pleuraphis
通过与Populus建立合作伙伴关系,Pfizer经营着一个远程医疗平台,该平台将有兴趣接受其偏头痛药物的患者Nurtec与医疗保健提供者联系起来,他们实际上可以开处方该药物。这种制造商赞助的安排似乎是为了引导患者使用特定的药物,并创造了不适当的处方,从而增加了联邦医疗保健计划的支出。尽管我们了解NURTEC的这种远程医疗合作伙伴关系最近可能已经停止了,但我们写信进一步了解辉瑞和Populus之间的财务关系,鉴于对联邦反回扣法规(AKS)的潜在影响。
染色体结构:Kim等人(2020年)报告了Populus tremula var中染色体结构的相似性。Davidiana,Populus alba及其杂种通过鱼核型分析揭示。韩国阿斯彭的核型(P. tremula var.Davidiana),银杨(P. alba)及其两个杂种Suwon Aspen(P. tremula var.glandulosa)和Hyun Aspen(P. alba×P。tremula var。glandulsa)。所有物种的染色体组成与2n = 38。韩国阿斯彭,银杨,Suwon Aspen和Hyun Aspen的核型配方分别为28m + 6SM + 4ST(2SAT),26M + 10SM(2SAT) + 2ST + 2ST,26M + 12SM(2SAT)和28m + 10sm + 10sm(2SAT)。这四个物种有一对45s rDNA位点,一对5S rDNA位点与鱼核型共有。
森林是巨大陆地生态系统和水生生物多样性的潜在栖息地,在生态保护和气候调节中发挥着重要作用。人类对森林的压力导致森林消失、破碎化和退化。在气候变化制度下,可持续的森林保护方法的要求是重中之重。在林木中,杨树 (Populus L.) 在全球林业中引起了关注,因为它是改善城市景观质量和数量的有前途的材料。这些植物提供的木材可用作造纸业的原材料和潜在的生物燃料来源。然而,一些生物胁迫,如害虫和病原体的侵袭,严重影响杨树的生产和生产力。由于杨树的生命周期长,缺乏具有抗性基因的合适供体,通过传统的树木育种方法对杨树的改良受到限制。由于杨树具有高效的遗传转化能力,它已被用作研究基因功能的模型植物。本综述将全面概述杨树受到的害虫和病原体的侵袭,重点介绍其感染机制、传播途径和控制策略。此外,还将研究最广泛使用的遗传转化方法(基因枪介导、农杆菌介导、原生质体转化、micro-RNA 介导和 micro-RNA 成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关 (CRISPR-Cas) 系统方法和 RNA 干扰),以提高杨树对害虫和病原体的耐受性。此外,还将深入探讨分子生物学工具的前景、挑战和最新进展,以及它们在遗传转化以提高杨树抗虫害能力的安全应用。最后,讨论了通过各种基因工程技术开发的抗性转基因杨树的再生。
摘要:土壤侵蚀是中国西北部山西省桑迪 - 霍利地区的一个严重问题。由于植被恢复而逐渐改善,但是尚未广泛研究不同植被种植园类型的土壤微生物社区特征。为解决这个问题,我们分析了Caragana Korshinskii Kom。,Populus tomentosa Carr。,Populus Simonii Carr。,Salix Matsudana Matsudana Koid koid koid koid koid koid koid koid koid koid tabulaememememememismis carr中,分析了土壤细菌和真菌社区结构,多样性以及微生物和土壤环境因素。森林。在五种森林类型中,主要的细菌群落组成没有显着差异。细菌和真菌群落的α多样性表明,C. korshinskii森林中的ACE(基于丰度的覆盖量估计量),Chao1和Shannon指数明显高于其他四种森林类型中的ACE(P <0.05)。土壤有机物,总氮和脲酶对细菌群落组成的影响更大,而总氮,β-葡萄糖苷酶和尿素对真菌群落组成的影响更大。在所有森林类型中,有益和致病性微生物的相对丰度相似。基于微生物群落的组成,多样性和土壤肥力,我们将种植园从大多数到最不适合的人工林排名:C。Korshinskii,S。Matsudana,P。Tabulaeformis,P。Tomentosa和P. Simonii。