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1088P：晚期黑色素瘤患者的分子分析和匹配靶向治疗：
1 澳大利亚黑色素瘤研究所，悉尼大学，新南威尔士州，澳大利亚；2 意大利热那亚热那亚大学医学院内科和医学专业系；3 澳大利亚新南威尔士州悉尼大学医学与健康学院；4 澳大利亚新南威尔士州布莱克敦和韦斯特米德医院；5 澳大利亚新南威尔士州皇家阿尔弗雷德王子医院和新南威尔士州健康病理学部组织病理学和诊断肿瘤学；6 澳大利亚新南威尔士州麦考瑞大学医学院、医学、健康和人类科学学院；7 皇家
meti：通过整合细胞形态和空间转录组学的深度分析肿瘤生态系统
空间转录组学（ST）技术的最新进展为肿瘤微环境（TME）内细胞相互作用提供了宝贵的见解。但是，大多数分析工具都缺乏对组织学特征的考虑，并且依赖于匹配的单细胞RNA测序数据，从而限制了它们在TME研究中的有效性。为了解决这个问题，我们介绍了形态增强的空间转录组分析集成仪（Meti），这是一个端到端框架，绘制癌细胞和TME成分，层状细胞类型和状态，并分析细胞的共同定位。通过整合空间转录组学，细胞形态和策划的基因特征，可以增强我们对组织内部骨骼景观和细胞相互作用的理解。我们评估了从各种肿瘤组织产生的ST数据（包括胃，肺和膀胱癌）以及前态组织中产生的ST数据的性能。我们还对现有的聚类和细胞反卷积工具进行了定量比较，证明了Meti的稳健性和一致的性能。
实体瘤的综合基因组分析和基因检测
免责声明州和联邦法律以及合同语言，包括定义和特定的包含/排除，优先于临床政策，必须首先考虑确定覆盖范围的资格。根据任何适用的医疗保险和医疗补助服务中心（CMS）覆盖范围的报表，包括国家覆盖范围确定（NCD），当地医疗审查政策（LMRP）和/或地方覆盖范围的确定，我们的Medicare和/或Medicaid成员的承保范围也可能有所不同。请参阅CMS网站。必须使用成员的健康计划福利，这是对渲染日期服务的生效。临床政策无意旨在避免审查医学主管的判断，也不是向医疗保健提供者裁定如何执业医学。医疗保健提供者应在提供适当的护理方面行使其医疗判断。在医疗保险策略中识别设备，测试和程序的选定品牌名称仅供参考，并且不是对其他设备，测试或程序对另一个设备的认可。临床技术正在不断发展，我们保留定期审查和更新该政策的权利。未经Humana的许可，可以复制该出版物的任何部分，以任何形式或形式存储在检索系统中或以任何形式或形式传输，无论是电子，机械，复印还是其他方式。例子包括Altera肿瘤基因组分析，Guardant360，Neogenomics实体肿瘤NGS融合面板和Tissuenext。相关的医学/药房覆盖政策遗传检测血液学恶性肿瘤和可疑的髓样疾病液体活检药物基因组学和伴侣诊断描述说明全面的基因组分析（CGP）（CGP）（CGP）（也称为全面的分子分析）是一种属于遗传学方法（tumor）的方法（tumor），是一种遗传学方法（Tumor）的一种象征性，评估肿瘤组织中大量生物标志物的大量生物标志物，以帮助管理晚期实体瘤，包括指导治疗决策以及确定临床试验资格。技术可能因测试而异，并且可能包括下一代测序（NGS），荧光原位杂交（FISH）和免疫组织化学（IHC），并且通常提供有关肿瘤突变负担（TMB），微卫星不稳定性（MSI）和同源性重组不足（HRD）的信息。
AZD8205（一种抗B7-H4抗体 - 药物结合物）广泛的生物转化分析，阐明了其在体内稳定性的途径
体内大分子会发生什么？是什么驱动抗体 - 药物缀合物（ADC）的结构活性关系和体内稳定性？这些相互关联的问题越来越相关，因为ADC作为有影响力的治疗方式的重新重要性以及我们对ADC结构决定因素的理解中存在的差距，而ADC是体内稳定性的ADC结构决定因素。复杂的大分子（例如ADC）可能会因其复杂的结构而发生变化，因为它们可能会在接头，有效载荷和/或在修饰的共轭位点上发生生物转化。此外，由于难以识别或量化大型大分子上的较小变化，ADC代谢的解剖提出了重大的分析挑战。我们采用了免疫接触LCMS方法来评估四种不同铅ADC中药物抗体比（DAR）谱的体内变化。这种全面的特征表明，随着互联网的选择，有助于ADC设计的关键结构决定因素是选择接头，因为复古 - 米克尔脱糖与硫二酰亚胺的水解反应之间的竞争导致体内出色的共轭稳定性。这些数据与其他因素结合了其他因素，告知AZD8205，B7-H4指导的半胱氨酸结合的ADC，带有新型的拓扑异构酶I抑制剂有效载荷，并具有耐用的DAR，目前正在临床上研究固体恶性肿瘤（NCT051223482）。这些结果突出了研究大分子生物转化并阐明ADC结构 - 体内稳定性关系的相关性。这项工作的全面性质增加了对我们的
空间分析揭示了特定于绝经前三重阴性乳腺癌
图1。A。DSP研究设计和工作流的示意图。TNBC-Triple阴性乳腺癌； CTA-癌转录组图集； Panck-Pan-Cytokeratin;感兴趣的地区；光明区域；使用表达数据估计恶性肿瘤中基质和免疫细胞的估计；尖端肿瘤免疫表型。
黑色素瘤的基因表达分析
Dermtech色素性病变测定（PLA）测试测量六个基因的表达（Prame，Linc00518，CMIP，B2M，ACTB，PPIA）。对通过直径至少5 mm的皮肤样品进行了测试，这些病变是通过角质层标本的非侵入性，专有的粘合剂斑块活检获得的。该测试在手掌，脚底，指甲或粘膜的手掌上不起作用，不应用于出血或溃疡病变。PLA测试报告包括两个结果。第一个是PLA MAGE（黑色素瘤相关的基因表达），它表明风险较低（未检测到Prame和Linc00518表达），中等风险（检测到Prame或Linc00518的表达）或高风险（同时检测到Prame和Linc00518的表达）。第二个结果是算法PLA评分，范围为0至100，得分较高，表明对恶性疾病的怀疑更高。尚不清楚PLA测试是否应用作皮肤镜检查的替代，分类或附加测试。PLAPLUS™测试还包括对TERT变体的测试。
蛋白质组学分析揭示了
Xujia Zhou 1，Mina Azimi 1，Niklas Handin 2，Andrew Riselli 1，Bianca Vora 1，Eden Chun 1，Sook Wah Yee 1，Per Artursson 2，Kathleen M Giacomini 1*隶属1*隶属关系：加利福尼亚大学加利福尼亚州加利福尼亚大学的加利福尼亚大学生物工程和治疗科学系。 2。 瑞典乌普萨拉大学的药学系，瑞典。 *信件：kathy.giacomini@ucsf.edu加利福尼亚大学加利福尼亚州加利福尼亚大学的加利福尼亚大学生物工程和治疗科学系。2。瑞典乌普萨拉大学的药学系，瑞典。*信件：kathy.giacomini@ucsf.edu
基于血浆的全面基因组分析DNA分析非小细胞肺癌：建议
委员会成员同意，证据支持液体活检测试（确定癌症遗传组成的血液测试）有效地识别可起作用的基因组改变（肿瘤DNA的特定遗传或分子变化，预测对靶向疗法的反应），而这些疗法被组织测试所遗漏的（涉及组织生物易于造成的组织），因为它会导致组织造成的under undor tumor turoudf samplane samplane samplane samplane samplane samplane samplane samplane samplane samplane samplane。此外，委员会承认，在所有非小细胞肺癌（NSCLC）的情况下，液体活检测试不应替代组织测试，因为与液体活检测试相比，组织测试具有较高的敏感性。委员会认识到，对可行的基因组改变的准确及时识别可以促进获得目标NSCLC治疗。
微生物群落概况的土壤元蛋白质组学
抽象土壤代表一个复杂而动态的生态系统，拥有无数的微生物，它们在营养循环和有机物转化中共存并起着至关重要的作用。在这些微生物中，细菌和真菌是微生物群落的关键成员，在陆地环境中深刻影响了氮，硫和碳的命运。构成了土壤生态系统的复杂性和微生物群落策划的生物过程，因此需要深入研究其组成和代谢活动。下一代测序和“魔术”技术（例如宏基因组学和元蛋白质组学）的出现，彻底改变了我们对微生物生态学的理解和土壤微生物群落的功能动态。宏基因组学可以鉴定土壤中的微生物群落组成，而元蛋白质组学则阐明了这些社区所执行的当前生物学功能。但是，元蛋白质组学提出了技术和计算的几个挑战。诸如腐殖酸的存在和提取方法中的变化等因素会影响蛋白质产量，而没有高分辨率的质谱和全面的蛋白质数据库限制了蛋白质鉴定的深度。尽管存在这些局限性，MEDAPRO-TEMOMICS仍然是揭示土壤微生物群落的复杂生物学过程和功能的有效工具。在这篇综述中，我们深入研究了土壤研究中元蛋白质组学的方法和挑战，涵盖了诸如蛋白质提取，鉴定和生物信息学分析等方面。此外，我们探讨了元蛋白质组学在土壤生物修复中的应用，强调了其在应对环境挑战方面的潜力。
评估小分子抑制剂马立马司他对蛇毒毒素的靶向特异性：热蛋白质组分析的新应用
能够规避传统抗蛇毒疗法缺陷的新疗法对于解决全球蛇咬伤问题至关重要。许多蛇毒毒素抑制剂已显示出在体内和体外有希望的跨物种中和医学上重要的蛇毒毒素的效果。开发用于筛选此类抑制剂的高通量方法可以加速它们的鉴定、测试和实施，因此具有改善全球蛇咬伤治疗和结果的巨大潜力。基于能量学的蛋白质组学方法，包括热蛋白质组分析和蛋白质组整体溶解度改变 (PISA) 检测，代表了用于高通量、全蛋白质组鉴定药物靶点和配体的“深度蛋白质组学”方法。在以下研究中，我们应用热蛋白质组分析和 PISA 方法来表征 Crotalus atrox（西部响尾蛇）的毒液毒素蛋白质形式与蛇毒金属蛋白酶 (SVMP) 抑制剂马立马司他之间的相互作用。我们研究了其对毒液蛋白质组的影响，并表征了其与特定 SVMP 蛋白质形式的相互作用，以及其对非 SVMP 毒液毒素家族的潜在靶向性。我们还使用两种抑制剂浓度比较了 PISA 热窗口和可溶性上清液与不溶性沉淀物的性能，首次证明了灵敏的高通量基于 PISA 的方法来评估蛇毒小分子抑制剂的直接靶标的实用性。