这项研究的主要目的是利用超声图像分割来提高从其平均像素强度(图像亮度)来确定RAM睾丸实质的化学成分的一致性和准确性。在纵向和横向平面中,用8 MHz线性阵列传感器扫描了从性成熟的Karakul公羊获得的十种睾丸,并将所有超声图作为数字图像保存。使用Kjeldahl方法来确定粗蛋白的量,使用一种烤箱干燥的方法来确定水分含量,并使用干燥样品的肥皂水提取来确定睾丸组织样品的脂肪含量。使用ImageProplus®分析软件(位图)对睾丸实质的数字图像进行标准化,并进行计算机化分析。然后,比较了两种不同的方法,即回声强度(EI)带和算法隔离的像素强度值(位图),以检测睾丸组织的数值像素值和邻近的化学化学成分之间的定量相关性。使用25个或50像素强度带对在纵向(长)和横向(跨)平面中获得的睾丸超声图进行睾丸超声图,我们确定了两个长EI频段(26-50和0-50),其中平均数值像素值(NPV)与脂肪含量和四个型号的npv显着相关,并显着相关。 (51-75、76-100和51-100具有蛋白质含量,以及0-50、51-75和51-100的水分)。For Long images, the accuracy of predicting the fat, moisture and protein content of the testicular parenchyma using r-Algo−identified pixel intensity clusters was 87.43±2.50% (pixels 99-114), 99.54±0.11% (84-89), and 90.66±1.18% (49-55), respectively.对于反式图像,各自的精度值为86.37±1.49%(52-58),99.34±0.13%(54-77)和91.19±2.02%(50-67)。特定像素强度范围的算法检测似乎是一种最佳的像素隔离方法,用于确定一阶声Xteral特性(即NPV,像素异质性和频率分布)和测试的化学成分之间的精确相关性。 我们目前的结果强调了将这种计算机辅助图像分析方法纳入睾丸生物化学/组织生理学变化的超声检查方法的重要性。算法检测似乎是一种最佳的像素隔离方法,用于确定一阶声Xteral特性(即NPV,像素异质性和频率分布)和测试的化学成分之间的精确相关性。我们目前的结果强调了将这种计算机辅助图像分析方法纳入睾丸生物化学/组织生理学变化的超声检查方法的重要性。
摘要:人神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y和IMR-32可以通过用全反替酸(ATRA)处理分化为神经元样的表型。分化后,这些细胞系被广泛用作体外模型来研究神经元细胞生物学的各个方面。然而,在ATRA诱导的分化中,SH-SY5Y和IMR-32细胞的蛋白质组和磷酸蛋白质组的时间和定量分析受到限制。在这里,我们在ATRA诱导的分化过程中,在多个时间点对SH-SY5Y和IMR-32细胞的蛋白质组和磷酸蛋白质组进行了相对定量。与随后的基因本体分析的蛋白质和磷酸肽的相对定量表明,包括细胞骨架组织,细胞分裂,伴侣伴侣功能和蛋白质折叠以及单碳代谢在内的几种生物学过程与两种细胞系中ATRA诱导的分化都相关。此外,激酶 - 基底富集分析预测了分化过程中几种激酶的活性改变。其中,CDK5表现出增加的活性,而CDK2的活性降低。提供的数据是研究在ATRA诱导的分化过程中SH-SY5Y和IMR-32细胞中时间蛋白和磷蛋白丰度变化的宝贵资源。
必需的材料(不包括)1。纯化的人尿DNA:应根据制造商协议2.DNA保存解决方案3。荧光PCR仪器能够阅读FAM通道(494 nm最大吸收,518 nm最大发射),VIC通道(520 nm最大吸收,558 nm最大激发),ROX通道(580 nm最大吸收,最大吸收),623 nm最大兴奋)和CY5(640 nm nm最大吸收,640 nm最大吸收,682 nm)。4。Vortex Mixer 5。微输出式6。移液器7。无菌核酸酶的无动移液尖端(建议使用屏障尖端)和微型试管8。兼容PCR板9。与我们的技术支持团队联系以获取有关兼容性的问题:TechSupport@raybiotech.com样本要求1。所有人类尿液标本都应被视为潜在的感染性,并谨慎处理。在测试任何样本时,应采取措施根据风险评估来最大程度地降低实验室传播的风险。这些预防措施至少应包括熟练度和能力测试,适当的PPE,避免气溶胶以及使用有效的消毒剂(第四纪铵化合物和0.5%的漂白剂)。2。我们建议在微量离心机中在5000 g处离心1 ml尿液,在室温下10分钟,然后去除800 µL上清液。剩余的上清液和沉淀应用于DNA提取**。最终提取的DNA应在100 µL的DNase,无RNase无RNase水中洗脱。实时PCR程序需要每个反应的10 µL提取的DNA。3。提取的人尿DNA是该试剂盒的起始材料。应根据制造商方案将DNA与PCR分析设置分开纯化,并具有DNA保存溶液,以使细菌失活和保存DNA。**本手册中显示的数据是基于DNA提取的,使用Thermo Fisher Scientific的Magmax™病毒/病原体核酸分离试剂盒。一般考虑1。为防止PCR反应的污染,清洁和净化所有工作表面,离心机,移液器和其他具有10%漂白剂或DNAave®的设备,然后在每次测定之前为70%乙醇。
摘要:2型糖尿病(T2D)是一种慢性代谢疾病,其特征是胰岛素抵抗和β细胞功能障碍,导致许多微血管并发症。在这项研究中,我们分析了使用下一代测序的44例T2D患者和22个健康个体的血浆样品中的循环miRNA表达纤维,并检测到229个差异表达的miRNA。在T2D患者中,miR-5588-5p,miR-125b-2-3p,miR-1284和miR-496降低的水平升高。我们还比较了同一组患者中的表达景观,具体取决于体重指数和鉴定的miR-144-3p和miR-99a-5p在肥胖个体中的差异表达。对miR-5588-5p,miR-125b-2-3p,miR-1284和miR-496进行了推定靶基因的识别和功能分析,显示染色质质量修饰酶和凋亡基因是在非常富集的途径之一。
基因表达分析(GEP)是一次实验室测试,它一次测量了数百至数千个基因的核糖核酸(RNA)的活性或表达,以提供基因活性的整体图景。GEP测试通常在肿瘤组织上进行,但也可以在其他标本(例如血液)上进行。这些测试通常使用其他方法,例如下一代测序(NGS),整个转录组测序和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)。GEP测试目前主要用于癌症的管理,最著名的是乳房。GEP用于估计复发转移的风险),并预测因化学疗法或扩展使用内分泌(激素)治疗的可能性,用于诊断为诊断为诊断患有早期浸润性淋巴结阴性(未在淋巴结中检测到的癌细胞)或淋巴结阳性(在淋巴结中检测到的癌细胞)(在淋巴结中检测到的癌细胞)的人。乳腺癌指数(BCI)是此类测试的一个例子。GEP检验与种系基因检测不同。GEP测试分析动态的RNA,对细胞环境信号响应,通常不代表个体的种系DNA,并且不可遗传。种系基因检测分析个体的脱氧核糖核酸(DNA)以检测遗传变异(突变)。种系突变是遗传的,在一个人的寿命中都是恒定的,并且在身体的每个细胞中都是相同的。
2.04.151 - 乳腺癌靶向治疗和免疫治疗的种系和体细胞生物标志物检测(包括液体活检) 2.04.155 - 前列腺癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测(包括液体活检)(BRCA1/2、同源重组修复基因变异) 2.04.156 - 卵巢癌靶向治疗的种系和体细胞生物标志物检测(包括液体活检)(BRCA1、BRCA2、同源重组缺陷) 2.04.45 - 非小细胞肺癌靶向治疗的体细胞生物标志物检测(包括液体活检)(EGFR、ALK、BRAF、ROS1、RET、MET、KRAS) 2.04.53 - 乳腺癌的体细胞生物标志物检测(包括液体活检)转移性结直肠癌的靶向治疗 (KRAS、NRAS、BRAF 和 HER2) 2.04.77 - 体细胞基因检测以选择患有黑色素瘤或神经胶质瘤的个体进行靶向治疗 (BRAF) 2.04.93 - 使用下一代测序技术进行癌症遗传易感性检测
我的签名证明我已经确定订购的测试在医学上对患者是必需的,证明该检查的结果将为患者的持续治疗计划提供信息,并证明我是患者的治疗医师,或者我已由患者的医生进行基因组检查的授权。i或患者的医生,已向患者解释了要执行并获得的测试的性质和目的,并在适用法律所需的范围内允许LabCorp或Labcorp所要求的任何实验室进行了签约,以(a)对(a)进行了其他测试,并在本文中进行了其他分析(b)进行了概述(b)(b)进行了其他测试(b)(b),(b)在(b)进行了其他测试(b)示例用于将来的诊断或监测使用,以及(c)根据需要以报销目的将测试结果和相关患者信息释放给患者的第三方付款人。Further, unless specified, the patient consents for Labcorp to retain the test results and any residual tissues, blood, plasma, cells, and genetic material, including DNA and RNA, and information generated during the testing process, for an indefinite period for internal quality assurance/operations purposes, and remove information that directly identifies the patient from the test results, tissues, blood, plasma, cells, and genetic material, including DNA and RNA,在测试过程中生成的信息,并将或披露此类信息和材料用于未来的未指定研究或其他目的。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本(未经同行评审认证)下提供的,作者/资助者已授予 bioRxiv 许可,可以在该版本中显示预印本。版权持有者于 2023 年 11 月 21 日发布了此版本。;https://doi.org/10.1101/2023.11.15.567180 doi:bioRxiv 预印本
背景:对不同情况下的药物组合进行研究可以提供有关抗癌机制的有用见解,并最终可以导致新的治疗方法。但是,常规药物组合筛查方法受吞吐量的限制。在高吞吐量筛选(HTS)格式中系统地确定最有效的活性组合和最佳分子环境的努力可以极大地加速组合处理的发展。脾酪氨酸激酶Syk是一种非受体酪氨酸激酶,已知通过基于免疫感受器酪氨酸酪氨酸酪氨酸的激活基序(ITAM)来调节细胞内信号传导,包括FLT3,AKT/MTOR和STAT5途径。放松管制的SYK信号传导在过敏和自身免疫性疾病的发病机理以及血液恶性肿瘤中起着核心作用。lanraplenib(lanra)是当前与吉尔特替尼(Gilteritib)(一种FLT3抑制剂)相结合评估的下一代SYK抑制剂,在复发或难治性(R/R)FLT3-Muthated-Muthated急性肌Myeloid骨髓性白血病(AML)(NCT0502877551)中。鉴于其在细胞内信号传导和与受体酪氨酸激酶(RTKS)相互作用中的关键作用,我们假设Lanraplenib可以与JAK抑制剂Ruxolitinib协同作用。为了解决这一假设,我们在混合物(Prism)平台中同时使用了广泛的研究所的分析相对抑制进行了高吞吐药物组合筛选,该平台可以在45个不同的谱系中快速筛选930细胞管线面板中的数千种化合物。