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蛋白质 - 蛋白质结合：酪氨酸提供
蛋白质 - 肽和蛋白质 - 蛋白结合物的合成可能很棘手，这是由于带来化学选择性和现场挑战的蛋白质中的多样化化学功能。2生物正交化学的使用已成功克服了其中的一些挑战，但通常需要冗长的合成才能掺入不自然的氨基酸。同时，使用天然蛋白质功能的使用通常仅限于N-或C-termini，或者导致非选择性标记亲核残基（例如半胱氨酸或赖氨酸）。由于这些原因，人们非常有兴趣扩展允许仔细阐述蛋白质体系结构的方法的工具箱。在他们在ACS Central Science发表的最新作品中，由Francis，Doudna和Fellman领导的团队描述了一种耦合两种生物分子的方法，分别含有酪氨酸和半胱氨酸残留物。酶酪氨酸酶用于将暴露于溶剂的酪氨酸残基氧化为正质酮弹性基团。该组随后与硫醇轴承成分反应，从而导致两种底物之间形成新的共价键（图1）。这建立在团队以前在利用原位形成的奎因酮功能的经验上
计算蛋白设计和蛋白质结构预测
图1。蛋白质结构的层次结构。主要：由DNA碱基三重态的相应序列确定的氨基酸序列。次要：形成α-螺旋和β-片的常规几何模式。第三纪：多肽链的详细3D形状。第四纪：几个多肽链或亚基的关联。
蛋白质的政治
致谢 本报告的概念化、开发和起草由主要作者 Philip Howard 和 IPES-Food 主任 Nick Jacobs 和 Chantal Clément 监督，Paul Uys 和 Francesco Ajena 也对报告的概念化做出了重要贡献。 本报告是在 IPES-Food 整个小组的支持下制定的，包括 Molly Anderson、Jennifer Clapp、Emile Frison、Melissa Leach、Lim Li Ching、Desmond McNeill、Maryam Rahmanian、Cecilia Rocha 和 Raj Patel 在工作组讨论和审查阶段所做的宝贵贡献。 研究得到了 Marina Yamaoka、Julia Laforge、Amber Clarke 和 Nicole Pita 的大力支持。Abby Bennett、Tara Garnett、Chris Gee、Richard Giles、Anne Mottet、Urvashi Rangan 以及欧盟食品政策联盟成员对报告材料提供了宝贵的外部评论和反馈。报告的设计和制作由 Chantal Clément 和 Robbie Blake 负责，平面设计由 Hearts & Minds 负责。感谢所有这些贡献者的远见和奉献。
脑损伤后的消化系统疾病的研究进度
水产养殖中的蓝色食物对于弥合蛋白质差距以在未来养活人群中至关重要。但是，要使水产养殖的生产具有可持续性，生产必须在行星范围内，而可持续原材料的采购是可持续生产中的关键驱动力。本文探讨了源自aquafeeds中微生物的单细胞蛋白（SCP）的作用。讨论了三个主要方面：可持续性，发酵技术的可扩展性和效果。此外，通过彩虹鳟鱼（Oncorhynchus Mykiss）的全面概念验证试验，本文证明了SCP在不影响生长和健康的情况下取代传统饲料成分方面的效率。该试验的发现表现出高蛋白质的消化率和平衡的氨基酸方面，以及通过氧化爆发反应测量的健康受益。迄今为止，SCP的商业采用受到了高生产成本的阻碍，并且需要大量投资来扩展发酵技术。但是，随着大型行业参与者公开致力于可持续性目标，可持续性格局正在发生变化，并意识到需要对未来的长期和投资思维。总而言之，SCP成为可持续水上航空的有前途的途径，为行星边界内的蛋白质供应挑战提供了解决方案。此外，就环境福利而言，SCP在土地使用，碳排放，生物多样性影响和用水方面显示出明显的优势。最终，将SCP成功整合到Aquafeeds中可能会为该行业的可持续发展目标做出重要贡献，并在确保未来的原材料蛋白质供应方面发挥着重要作用。
通过蛋白质转运偶联靶向蛋白质重新定位
标题：通过蛋白质传输耦合作者靶向蛋白质迁移：Christine S. C. Ng，1 Aofei Liu，1 Bianxiao Cui，1 Steven M. Banik 1,2 * 1化学系，斯坦福大学，斯坦福大学，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学，加利福尼亚州94305，美国。2 Sarafan Chem-H，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学94305，美国。 *通讯作者。 电子邮件：sbanik@stanford.edu摘要亚细胞蛋白定位调节蛋白质功能，并且可以在癌症1和神经退行性疾病中损坏2-4。 已经注释了许多蛋白质的定位5-7，并且在药理学上相关的方法来精确重新定位以解决疾病驱动表型，这将是一种有吸引力的目标治疗方法。 分子利用班车蛋白的运输来控制靶蛋白的亚细胞定位，可以为靶向蛋白质重新定位提供相互作用的培养基疗法的途径。 为了实现这一概念，我们采用了一种定量方法来识别控制劫持蛋白质运输能力，开发梭子蛋白和配体的收集能力的特征，并证明了具有内源性定位信号的蛋白质的重新定位。 使用自定义成像分析管道，我们表明，可以通过将靶蛋白与含有足够强的本地本地定位序列的靶蛋白进行分子偶联来克服内源性定位信号。 小分子介导的FUS R495X从细胞质中固定在细胞核中，在细胞应激模型中减少了细胞应激颗粒的数量。 简介2 Sarafan Chem-H，斯坦福大学，加利福尼亚州斯坦福大学94305，美国。*通讯作者。电子邮件：sbanik@stanford.edu摘要亚细胞蛋白定位调节蛋白质功能，并且可以在癌症1和神经退行性疾病中损坏2-4。已经注释了许多蛋白质的定位5-7，并且在药理学上相关的方法来精确重新定位以解决疾病驱动表型，这将是一种有吸引力的目标治疗方法。分子利用班车蛋白的运输来控制靶蛋白的亚细胞定位，可以为靶向蛋白质重新定位提供相互作用的培养基疗法的途径。为了实现这一概念，我们采用了一种定量方法来识别控制劫持蛋白质运输能力，开发梭子蛋白和配体的收集能力的特征，并证明了具有内源性定位信号的蛋白质的重新定位。使用自定义成像分析管道，我们表明，可以通过将靶蛋白与含有足够强的本地本地定位序列的靶蛋白进行分子偶联来克服内源性定位信号。小分子介导的FUS R495X从细胞质中固定在细胞核中，在细胞应激模型中减少了细胞应激颗粒的数量。简介我们将核激素受体作为可行的班车发展，可以用靶向固定化激活分子（TRAM）来利用，以重新分布驱动疾病的突变蛋白，例如SMARCB1 Q318X，TDP43 D NLS和FUS R495X。使用CAS9介导的敲入标签，我们证明了低丰度（FOXO3A）和高丰度（FKBP12）内源性蛋白质的核富集通过分子偶联到核激素受体运输。最后，在原代神经元中，小分子介导的NMNAT1从核向轴突重新分布能够减慢轴突变性，并在药理学上模仿WLDS从小鼠到某些类型的NeuroDegeneration 8。因此，靶向蛋白质重新定位的概念可以通过相互作用重新布线来治疗疾病的方法。
利用蛋白质语言模型通过少量学习实现蛋白质的快速进化
1 医学系 医学工程分部 哈佛医学院 布莱根妇女医院 美国马萨诸塞州 波士顿 02115 2 麻省总医院 基因与细胞治疗研究所 麻省理工学院 剑桥 02139 3 病毒学和疫苗研究中心 哈佛医学院 贝斯以色列女执事医疗中心 美国马萨诸塞州 波士顿 02115 4 生物工程系 麻省理工学院 剑桥 02139 5 圣加仑州立医院皮肤病学和过敏学系 瑞士圣加仑 9000 6 麻省理工学院科赫综合癌症研究中心 麻省理工学院 剑桥 02139 7 东京大学工程研究生院化学与生物技术系 东京都文京区本乡 7-3-1 邮编 113-8656 日本 8 东京大学先进科学技术研究中心结构生物学部4-6-1 Komaba, Meguro-ku, Tokyo 153-8904, Japan 9 稻盛科学研究所 620 Suiginya-cho, Shimogyo-ku, Kenya 600-8411, Japan †通讯地址：omar@abudayyeh.science 和 jgoot@mit.edu
基于凝血的血栓形成蛋白C和蛋白质缺乏症
摘要和相关性蛋白C（PC）和蛋白S（PS）测试特别容易受到临床状况的影响，这可能导致遗传缺陷的水平暂时降低和错误诊断。这些情况包括在急性疾病和血小板状态下的消耗量增加，肝病引起凝血因子降低，维生素K缺乏症或拮抗剂（例如，Warfarin）以及PS，妊娠特有的。此外，基于凝块的PC和PS活性测试易受肝素，口服直接因子XA抑制剂以及口服和肠胃外直接凝血酶抑制剂的干扰。进行测试的洞察力：•不应针对具有非常低的VTE复发风险（手术后和创伤）的患者或有高复发风险（自发的，无人驾驶的VTE）进行血小板测试，包括PC和PS。•临床判断应指导是否在激发因素较小的情况下进行血栓性测试，还是在异常位置（内脏或中枢神经系统）中进行的静脉血栓形成。何时进行测试：•在急性疾病和血小板事件，华法林和其他抗凝剂，怀孕或PT/INR升高时，不应进行PC和PS测试。•在门诊患者上进行的PC和PS测试虽然没有抗凝药，从而降低了检测误导性获得的缺陷的可能性。要执行的测试：•发色调PC活性测定最大化对检测I型和II型缺陷的敏感性，并避免使用LA和抗凝剂的干扰，除WARFARIN外。1例手术患者引发的VTE患者的复发风险非常低，不应接受测试。•游离PS抗原测定法避免了洛杉矶的干扰，VIII因子，V Leiden因子和抗凝剂，除了华法林以外，但不会检测到罕见的II型缺陷。•基于PS的基于凝块的活动分析容易受到可能导致虚假低或高结果的许多干扰，但可用于高临床怀疑的II型缺陷。对临床实用性有限的测试：•PC抗原，总PS抗原和PS/PC基因分型重复测试：•在诊断出遗传性PC和PS缺乏症患者之前，应在最大程度地诊断出临时缺乏症的风险之前重复测试任何异常低的PC和PS结果。背景止血专家之间的共识已经发展为限制临床情况，该情况需要在VTE之后进行血小板测试。有限的高质量证据指导基于血栓性疗法持续时间的决策，基于血栓性测试的持续时间导致来自其他短暂危险因素（例如怀孕，综合激素避孕）以及需要住院的医疗疾病等其他短暂危险因素的患者。无端VTE的患者不论血栓性测试结果如何，复发的风险增加，并且是无限期抗凝治疗的候选者。Standard laboratory evaluation of selected patients for thrombophilia risk factors associated with VTE consists of a lupus anticoagulant (LA) panel, and anticardiolipin and B2GP1 IgG and IgM serologies for acquired risks, and a panel of five tests for inherited risks: antithrombin, activated PC resistance/Factor V Leiden, prothrombin gene mutation G20210A, PC,和PS。1的PC和PS的肝合成取决于用于翻译后γ羧化的维生素K的降低形式，以产生凝结的功能调节剂。活化的蛋白C（APC）降解因子V A和VIII A导致因子X A和凝血酶的产生减少。PC的遗传杂合缺乏的患病率在献血者中约为0.2％，VTE患者约为3％。2 I型缺陷（低PC活性和抗原）比II型形式（PC活性降低，正常抗原）更为普遍。在临床表现和管理方面，两种类型的缺陷是无法区分的。功能性PC分析将同时识别定量（I型）和定性（II型）缺陷。通过PC抗原测量以将I型与I型缺乏症区分开来，很少有临床价值来跟踪PC抗原测量的反复较低的PC活性结果。基于凝块的PC活动分析，但不容易受到色彩PC活性测定。
TET蛋白抑制剂
十个时期的易位甲基二氧酶（TET Pro Teins）属于铁（II）和α-酮戊二酸依赖性二氧酶。他们（TET1，TET2和TET3）催化DNA（5-甲基胞菌素）中的连续氧合反应[1,2]。TET蛋白逐渐将5-甲基胞嘧啶转化为5-羟基甲基胞嘧啶，5-甲基环胞嘧啶，最后是5-羧基糖苷。然而，一些高影响力的研究表明，TET蛋白也可能参与RNA中5-甲基乳房的氧化[3-5]。TET蛋白在DNA脱甲基化中的作用如图1。DNA胞嘧啶改性（5-甲基胞嘧啶，5-羟基甲苯丁胺，5-甲基环胞嘧啶和5-羧基糖苷）在控制染色体功能的控制中起关键作用（例如，X-Chromome insct ins x-Chrome insctry and in Inmome insctive and x-chrome insive and in Inmome insctiv and in Inmome inscry and in Inmome inscry and insctiv and in Inmome inscry and insctiv and in Inmome。[6 - 8]。5-甲基胞霉素（5MC；称为第五碱）显着参与基因表达和转座的抑制和5-甲基胞霉素（5MC；称为第五碱）显着参与基因表达和转座的抑制和