用分子胶化合物靶向蛋白质降解(TPD)是一种突破性的治疗方式,可消除以前认为不可用的疾病蛋白质。尽管具有巨大的潜力,但迄今为止,新型分子胶的系统发现及其细胞降解靶标仍然具有挑战性。在这里,我们提出了一个深度的蛋白质组学筛选和验证平台,以在各个阶段推进TPD药物发现计划,并创建新型高价值目标的广泛管道。深蛋白质组学筛选是基于数据独立的采集(DIA)技术,用于在空前的吞吐量,覆盖范围和敏感性下针对细胞蛋白质组的(潜在)分子胶的筛选化合物库。它从用分子胶水处理的细胞系中识别并量化了每样品的11,000多个蛋白质,从而实现了综合蛋白质组学的药物和药物靶标的发现。
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Evotec 的化学蛋白质组学方法使用高端定量质谱技术来揭示和验证特定的细胞靶标,在细胞辅助因子和天然复合伙伴存在的情况下,通过对天然、内源表达、翻译后修饰蛋白质进行蛋白质组范围分析来无偏见地识别靶标,Evotec Cellular Target Profiling™ 可识别
蛋白质组学是所有蛋白质的蛋白质,以及它们的细胞,组织,体液(例如血清/血浆或脑脊液)或各个基因组在给定时间点表达的整个生物体中的转化后修饰(PTM)。这可以扩展为包括对定义的刺激或疾病状态的蛋白质(和PTM)水平变化的深入定量分析。这些目标通常是通过样品分离技术(例如色谱方法和超高分辨率质谱法)(Nanolc-MS/ MS)的组合来实现的。蛋白质组学现在是一种标准的分析,非常有力的研究技术,可以在RWTH AACHEN的生物医学领域(生物化学,细胞生物学,分子医学,系统生物学等)中用于基本上进行的所有研究。)。
本课程向学生介绍蛋白质组学领域,其广泛使用和蛋白质组学分析的技术方面。我们首先回顾了DNA和蛋白质之间的相互关系以及在蛋白质组学中使用生物信息学的使用。此之后是使用各种方法的蛋白质分离,鉴定和定量的基础。将重点放在经过修改的蛋白质上,这是蛋白质组学研究的主要目标和所涉及的特定技术。学生还将暴露于确定相互作用蛋白质的各种可用技术,最后将讨论蛋白质组学在多个领域的应用。
1.2缩写和解决方案在:AA丙烯酰胺(戴手套)实验室3030 71 20 mm = 1.4毫克/毫升200 mm = 14 mg/ml水acni乙腈实验室3030 ABC氨基苯甲酸盐Bicarbonate Lab 3030 79 50 mm = 0.2 g/50 ml 2 ml 2 mm = 0.2 g/amm = 0.16 g.2 g/amm = 0.16 666666666 666666 666666 6666666666 6666 6666666666666 66666666 6666666616醋酸盐实验室3030 77 10 mm = 38.5 mg/50毫升水cystein fluka 30090,> 99%实验室3030 121 125 mm = 15 mg/ml 200 mm = 24 mg/ml水DTT DTT DTT DITHIOTOITOL(4C)新鲜!(recrig)154 20 mm = 3.1 mg/ml 150 mm = c水IAA IODOACETAMIDE(4 c)新鲜!(recrig)185 20 mm = 3.7 mg/ml 200 mm = 37 mg/ml水TFA TRIFLUORO-乙酸实验室3030安全橱柜MS Sutmer MS Sutm in in Fume Cupboard只有TCEP TRIS(羧乙基)磷酸-20 phosphine-20C287 100 mm = 29 mm = 29 mg/ml Water tris tris tris tris tris tris 10*。pH 8带HCl称重室121 1 m = 121 g/l 6.0 g/50 ml水
用分子胶化合物靶向蛋白质降解(TPD)是一种突破性的治疗方式,可消除以前认为不可用的疾病蛋白质。尽管具有巨大的潜力,但迄今为止,新型分子胶的系统发现及其细胞降解靶标仍然具有挑战性。在这里,我们提出了一个深度的蛋白质组学筛选和验证平台,以在各个阶段推进TPD药物发现计划,并创建新型高价值目标的广泛管道。深蛋白质组学筛选是基于数据独立的采集(DIA)技术,用于在空前的吞吐量,覆盖范围和敏感性下针对细胞蛋白质组的(潜在)分子胶的筛选化合物库。它从用分子胶水处理的细胞系中识别并量化了每样品的11,000多个蛋白质,从而实现了综合蛋白质组学的药物和药物靶标的发现。
蛋白质组是在特定时间由基因组,细胞,组织或生物体表达的完整蛋白质集。复杂性来自几个关键因素,包括:大量不同的蛋白质,给定蛋白质的潜在蛋白质成型数量以及生理相关蛋白质浓度的广泛动态范围。此外,蛋白质组处于恒定状态,并且可以随着时间的推移明显变化。在蛋白质组学中,这种变化用于将特定蛋白质与其功能和健康或疾病状态相关联。反过来,这些知识被利用用于诊断疾病和开发新药物靶标。
- 协调和管理研究团队,以确保与组织目标和项目目标保持一致。- 与内部和外部利益相关者合作,以设计EO的项目策略并优先考虑研究EOORTS。- 监督研究计划的日常运营,包括设定项目目标,管理预算和跟踪进度。- 代表外部利益相关者的组织,并建立伙伴关系,以利用资源并提高研究目标。- 保持清晰的沟通渠道,为高级管理层提供定期进度更新,并确保遵守质量标准和报告要求。