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评估用毒力抑制剂处理的铜绿假单胞菌中的外排泵表达与运动表型之间的联系
明尼苏达州明尼阿波利斯市宜人街207号的化学系 321 11 Church St SE, Minneapolis, Minnesota, United States of America 12 13 d Department of Medicinal Chemistry, University of Minnesota, 208 Harvard Street SE, 14 Minneapolis, Minnesota 55454, United States of America 15 16 e Department of Pharmacology, University of Minnesota, 321 Church St SE, Minneapolis, 17 Minnesota, United States of America 18 19 * Corresponding author 20
摘要 铜绿假单胞菌是医疗环境中的重要病原体，占获得性感染的 10% 至 20%。这种氧化酶阳性
摘要 铜绿假单胞菌是医疗环境中的重要病原体，占获得性感染的 10% 至 20%。这种氧化酶阳性的革兰氏阴性细菌因能够引起呼吸问题、伤口感染和与呼吸机使用相关的肺炎而闻名，尤其是在囊性纤维化患者中。在抗生素耐药性日益严重的情况下，尤其是利比亚医疗环境中耐药模式数据有限的情况下，及时准确地诊断铜绿假单胞菌至关重要。本研究检查了米苏拉塔医疗中心伤口中铜绿假单胞菌感染的发生率，并测试了针对 ecfX 基因的 RT-PCR 在检测病原体方面的有效性。本研究从患有伤口感染的患者身上获取了 165 个临床样本，使用传统方法和分子方法，我们能够识别铜绿假单胞菌。研究表明，与传统生化方法相比，针对 ecfX 基因的 RT-PCR 为快速准确地检测临床样本中的铜绿假单胞菌提供了一种可靠的技术。引用此文章。Teka I、Elfaitori A、Hajer Almuaget。使用 ecfX 基因作为从感染伤口中分离的铜绿假单胞菌的特定识别靶点。Alq J Med App Sci。2024；7(4):1566-1570。https://doi.org/10.54361/ajmas.247490引言铜绿假单胞菌是一种在医院环境中引起多种疾病的重要机会性病原体。其形成生物膜的能力、先天性耐药机制和对多种抗生素的获得性耐药性使治疗和管理变得复杂 [1,2]。抗生素耐药菌株的出现使这一问题更加严重，特别是在院内感染中，及时准确的鉴定对于成功治疗至关重要 [3]。传统的铜绿假单胞菌鉴定方法（包括基于培养的程序和生化测试）可能存在缺陷。据 Kidd 等人（2009 年）[4] 称，这些技术可能非常费力，并且可能无法总是区分密切相关的细菌种类。为了鉴定细菌，分子方法，特别是基于 PCR 的检测已经变得更加高效和准确 [5]。由于其高特异性和灵敏度，铜绿假单胞菌特异性 ecfX 基因已被建议作为基于 PCR 的检测的靶点 [7]。除了比较针对 ecf X 基因的 RT-PCR 与传统鉴定技术的有效性之外，本研究还尝试评估米苏拉塔医疗中心伤口感染中铜绿假单胞菌的发生率。
铜绿假单胞菌中的CRISPR-CAS提供瞬时人群水平的免疫力，以防止高噬菌体暴露
原核生物适应性免疫系统，CRISPR-CAS（群集定期间隔短的短滴虫重复序列；与CRISPR相关），需要靶向靶向入侵移动遗传元件（例如噬菌体）的间隔序列。先前的工作已经确定了驱动模型有机体基于CRISPR的免疫的进化的生态变量，铜绿假单胞菌PA14针对其噬菌体DMS3VIR，导致快速噬菌体灭绝。但是，尚不清楚这种获得的免疫力在细菌种群中是否以及如何稳定，以及这如何取决于环境。在这里，我们检查了30天的演化实验中CRISPR间隔者获取和损失的动态，并确定条件使免疫力长期维持之间的平衡与支持噬菌体持久性的替代抵抗策略之间的平衡。具体来说，我们发现初始噬菌体剂量和再感染频率都决定了是否长期保持获得的CRISPR免疫，并且噬菌体是否可以与细菌共存。在人口遗传学水平上，出现和CRISPR免疫的丧失与高水平的间隔多样性有关，随后由于携带菌毛相关突变的细菌的侵袭而下降。在一起，这些结果提供了CRISPR免疫获取和损失动态的高分辨率，并证明累积噬菌体负担决定了CRISPR对生态相关时间表的有效性。
乙酯：在多药耐药性假单胞菌中，MEXAB-OPRM外排泵有效的抑制剂
铜绿假单胞菌中的耐药性已通过多种机制介导，它们中排出泵介导的耐药性是耐药性最重要的机制之一。MEXAB-OPRM外排泵，能够识别和排出细菌细胞中各种结构无关的化合物，赋予对铜绿假单胞菌中广泛的抗生素的抗性。本研究的目的是筛选在印度传统医学中使用的药物，以发现一些能够抑制铜绿假单胞菌中的Mexab-Oprm泵的有效化合物，并研究具有抗抗性抗生素的特征性外排泵抑制剂的协同作用（MDR）抗生素（MDR）抗生素（MDR）菌株。在本研究中使用了100个临床分离株，四个敲除和1个MTCC-741标准菌株。所有100个临床分离株均已处理用于抗生素易感性测定法和ETBR琼脂卡特轮测定法以测定MDR表型。总共筛选了40种植物，以存在具有外排泵抑制活性的化合物。用三种不同的抗生素进一步探索了表现出EPI活性的植物的协同作用。十种植物提取物已显示出相当大的EPI活性，并且在10个活性提取物中，只有一种末期佳肴果实的甲醇提取物显示出与A组（环丙沙星，四环素和氯霉素）的协同活性。T. chebula果实提取物的分馏和纯化提供了乙酸乙酯，该乙酸酯与A组抗生素以及显着的EPI活性一起显示了协同活性。本研究的结果得出的结论是，乙酸酯是铜绿假单胞菌中过度表达Mexab-Oprm外排泵的有效EPI，可以与耐药组A抗生素一起使用，以抗多药抗性P. eruginosa。
使用磷酸盐溶解的假单胞菌的生物培训剂产生从根际土壤中分离出来的假单胞菌：朝向本土生物肥料，以增强
通讯电子邮件：bahauddeen.salisu@umyu.edu.ng引言化学农药和肥料对农业产量至关重要，但是它们对环境，植物，动物和人类健康的有害影响已导致对环保的植物保护植物保护（Patel等。，2014年）。生物肥料由从植物根或土壤中提取的活微生物组成（Aggani，2013年），它在化学肥料的替代品中广受欢迎。它们通过增加氮的可用性来降低农作物的生产成本，提高生长和产量，并促进生长促进性物质（如生长素，细胞分裂素和吉伯林林）的生产（Bhattacharjee和Dey，2014年）。含有有益微生物的生物肥料，而不是合成化学物质，而是通过提供必需的养分来改善植物的生长，同时保持环境健康和土壤生产率（Singh等，2011; Verma等，2017）。他们
从尼日利亚纳萨拉瓦州的人类肠道微生物组中分离出的假单胞菌的元基因组组装基因组
尼日利亚纳萨拉瓦州卡鲁大学科学学院生物化学系，尼日利亚纳萨拉瓦州，与：oluchukukwu.anunobi@binghamuni.edu.edu.ng; 07034439524; ORCID: 0000-0003-2047-5313 Abstract: The metagenome-assembled genome (MAG) sequences of Pseudomonas putida PP14A and PP20A were obtained by metagenomic sequencing from the gut microbiomes of a female and a male patient both 24 years old from the same household presenting to a health outreach laboratory with complaint of headache, and occasional diarrhoea in尼日利亚纳萨拉瓦州马拉拉巴。 两个PP MAG之间观察到的系统发育关系与其他假单胞菌SPP MAG之间观察到了从人类的人类活动和迁移到pseudomonas putida的全球传播。 关键字：假单胞菌，元基因组组装的基因组，肠道微生物组，毒力，系统发育，2024年6月12日获得；修订（加快）2024年6月17日； 2024年6月24日接受版权2024 AJCEM开放访问。 本文根据创意共享损耗4.0国际许可证 主编：S。S. Taiwo教授尼日利亚纳萨拉瓦州卡鲁大学科学学院生物化学系，尼日利亚纳萨拉瓦州，与：oluchukukwu.anunobi@binghamuni.edu.edu.ng; 07034439524; ORCID: 0000-0003-2047-5313 Abstract: The metagenome-assembled genome (MAG) sequences of Pseudomonas putida PP14A and PP20A were obtained by metagenomic sequencing from the gut microbiomes of a female and a male patient both 24 years old from the same household presenting to a health outreach laboratory with complaint of headache, and occasional diarrhoea in尼日利亚纳萨拉瓦州马拉拉巴。两个PP MAG之间观察到的系统发育关系与其他假单胞菌SPP MAG之间观察到了从人类的人类活动和迁移到pseudomonas putida的全球传播。关键字：假单胞菌，元基因组组装的基因组，肠道微生物组，毒力，系统发育，2024年6月12日获得；修订（加快）2024年6月17日； 2024年6月24日接受版权2024 AJCEM开放访问。本文根据创意共享损耗4.0国际许可证 主编：S。S. Taiwo教授主编：S。S. Taiwo教授
相关的pp2c磷酸酶PIC3和PIC12对番茄的免疫力负调节丁香假单胞菌的免疫力
。cc-by-nd 4.0国际许可在A未获得Peer Review的认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人（本版本发布于2024年5月13日。; https：//doi.org/10.1101/2024.02.02.08.579555 doi：biorxiv Preprint
分子鉴定细菌（klebsiella aerogenes，p35235）从街头食品（炒饭）中分离出来；研究果汁的抗生素灵敏度模式和益生菌强化（fragaria ananassa，spasiflora ligularis和phyllanthus
塑料污染的威胁已成为环境的全球关注点，从而探索了可持续措施，从而减少了其不利影响。生物修复就是一种使用微生物降解土壤和水污染物的方法，它具有成本效益，环保且可再生。假单胞菌是一种普遍存在的细菌属，可用于几种塑料的生物降解。目前的研究集中于利用铜绿假单胞菌用于聚乙烯的生物降解。假单胞菌菌株。基于形态学，生理，生化和色素沉着转移分离的菌株被确定为铜绿假单胞菌。这种菌株能够在孵育的16天内降解聚乙烯材料，最高百分比降低了11.5％。
基因组规模和途径工程，用于假单胞菌的可持续航空燃料前体异丙醇生产
可持续航空燃料（SAF）将显着影响航空部门的全球变暖，并且重要的SAF目标正在出现。异丙醇是有希望的SAF化合物DMCO（1,4-二甲基甲基氯辛烷）的先驱，并且已在几种工程的微生物中产生。 最近，假单胞菌Putida成为异丙肾生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物量的未来寄主，因为它可以利用廉价的植物生物量。 在这里，我们设计了代谢通用的宿主P. putida来生产异丙醇。 我们采用两种计算建模方法（双光线优化和约束最小切割组）来预测基因敲除靶标并优化P. p. putida中的“ IPP-Bypass”途径，以最大程度地提高异源醇的产生。 Alto gether，在喂养批处理条件下，以3.5 g/L的速度获得了p. p. p. p. p. p.的最高生产滴度。 用于高级生物燃料生产的P. Putida上计算建模和应变工程的这种组合在实现可以使用可再生碳流的生物生产过程中具有至关重要的意义。异丙醇是有希望的SAF化合物DMCO（1,4-二甲基甲基氯辛烷）的先驱，并且已在几种工程的微生物中产生。最近，假单胞菌Putida成为异丙肾生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物生物量的未来寄主，因为它可以利用廉价的植物生物量。在这里，我们设计了代谢通用的宿主P. putida来生产异丙醇。我们采用两种计算建模方法（双光线优化和约束最小切割组）来预测基因敲除靶标并优化P. p. putida中的“ IPP-Bypass”途径，以最大程度地提高异源醇的产生。Alto gether，在喂养批处理条件下，以3.5 g/L的速度获得了p. p. p. p. p. p.的最高生产滴度。用于高级生物燃料生产的P. Putida上计算建模和应变工程的这种组合在实现可以使用可再生碳流的生物生产过程中具有至关重要的意义。
通过分析孟加拉国旅行者的密集微生物时间序列数据预测的人类肠道细菌之间的生态关系
图2。用于这些研究的大肠杆菌生物孢子菌株的一般示意图和初始表征。A.LASR活性的大肠杆菌生物孢子蛋白生物孢子蛋白具有质粒PSC11-L，具有LASR诱导的P LASI启动子，融合到LACZ Reporter和质粒PJN105-L和阿拉伯糖诱导的LASR中。该菌株响应3OC12 -HSL和0.4％阿拉伯糖产生β-半乳糖苷酶。3OC12-HSL诱导是剂量反应，半最大浓度为65 nm。B.大肠杆菌菌株组成型表达LACZ的质粒PVT19与融合到本构APHA-3启动子的LACZ。在存在或不存在3OC12 -HSL的情况下，该菌株会产生β-半乳糖苷酶。结果是两个（a）或三（b）独立实验的平均值，误差线代表标准偏差。