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合成生物学工具包，用于微生物燃料电池中发电的新型假单胞菌的新物种
摘要：微生物燃料电池（MFC）为各种生物技术应用提供了可持续的解决方案，并且是生物技术研究的关键领域。MFC可以通过分解有机物并发电来有效治疗各种垃圾，例如废水和生物柴油废物。某些假单胞菌物种具有细胞外电子转移（EET）途径，使它们能够将电子从有机化合物转移到MFC阳极。此外，假单胞菌物种可以在低氧条件下生长，这是有利的，因为MFC中的电子转移过程通常会导致阳极处的氧气水平降低。这项研究的重点是评估与1 G.L - 1甘油生长的新假单胞菌接种的MFC，这是生物柴油生产的常见副产品。假单胞菌sp。BJA5的最大功率密度为39 mW.m -2。另外，观察到的伏安图和基因组分析表明，BJA5的新型氧化还原介质的潜在产生。此外，我们研究了该细菌作为合成生物学非模型底盘的潜力。通过测试各种遗传部分，包括构成启动子，使用PSEVA载体作为脚手架的复制起源和嘉戈斯，我们评估了细菌的适用性。总的来说，我们的发现提供了利用假单胞菌属的宝贵见解。bja5是MFC的新型底盘。合成生物学方法可以进一步增强该细菌在MFC中的性能，从而提供改进的途径。
通过对番茄和玉米分泌物的转录组反应揭示植物定植菌东湖假单胞菌 P482 的宿主适应性特征
假单胞菌具有代谢灵活性，可以在不同的植物宿主上茁壮成长。然而，宿主滥交所需的代谢适应性尚不清楚。在这里，我们通过采用 RNAseq 并比较东湖假单胞菌 P482 对两种植物宿主（番茄和玉米）根系分泌物的转录组反应来弥补这一知识空白。我们的主要目标是找出这两种反应之间的差异和共同点。仅由番茄分泌物上调的途径包括一氧化氮解毒、铁硫簇的修复、通过对氰化物不敏感的细胞色素 bd 进行呼吸以及氨基酸和/或脂肪酸的分解代谢。前两个表明测试植物的分泌物中存在 NO 供体。玉米特异性地诱导了 MexE RND 型外排泵的活性和铜耐受性。与运动相关的基因由玉米诱导，但被番茄抑制。对渗出液的共同反应似乎受到来自植物的化合物和来自其生长环境的化合物的影响：砷抗性和细菌铁蛋白合成上调，而硫同化、柠檬酸铁和/或其他铁载体的感知、血红素获取和极性氨基酸的运输下调。我们的研究结果为探索植物相关微生物的宿主适应机制提供了方向。
从奶牛，牛奶，环境和工人的手中分离出多药的抗铜铜的流行
1卫生和人畜共患系，曼苏拉大学兽医学院，曼苏拉大学35516，埃及； adelelgohary@yahoo.com（A.E.-G。）; monamohy@yahoo.com（M.M.E.）2个人畜共患系，本ha大学兽医学院，埃及13518； dr_samarmohame@yahoo.com 3曼苏拉大学兽医学院食品卫生与控制系35516，埃及； radwa.reda@yahoo.com（R.S.）; nahedkasem92@gmail.com（N.K.）4贾赞大学药学院临床药学系，贾赞82722，沙特阿拉伯； nrahman@jazanu.edu.sa（N.A。）; sriyazahmad@jazanu.edu.sa（S.A.）5临床药学系，国王哈利德大学药学院，阿巴62529，沙特阿拉伯； ss.alqahtani@kku.edu.sa 6 6贾桑大学药学系，贾赞82722，沙特阿拉伯； msali@jazanu.edu.sa 7内科和传染病系，曼苏拉大学兽医学院，曼苏拉大学35516，埃及； Alzhraa.6712@gmail.com 8诊断射线照相技术，应用医学科学学院，贾赞大学，贾赞82722，沙特阿拉伯； hbahkiry@jazanu.edu.sa（H.S.E.-B。）; rradwan@jazanu.edu.sa（r.m.r。）*信函：basma_moharam@mans.edu.eg（B.B.）; mzakaria@jazanu.edu.sa（m.z.s.-a.）
胎儿对母体炎症的反应需要小胶质细胞
图3。用大肠杆菌LASR和构成记者的甲醛活性。a。灰色线，甲醛依赖性生长抑制，占无甲醛的细胞的百分比。在大肠杆菌中与100 nm 3OC12-HSL的甲醛的剂量反应曲线在大肠杆菌培养物中具有阿拉伯糖诱导的LASR和LASR依赖性Lasi-Lacz Reporter（Black Line）或E. coli，或具有组成型APHA-3-LACZ RACZ REPORTER（RED RED REDERTER）。IC50值在表1中给出。结果显示，五个（LASR）或三个（LACZ控制）独立实验的平均值，误差线代表标准偏差。B.来自A的平均值（降低％降低％与Lasi-Lacz报告基因的抑制％），这些值用于确定Pearson的相关系数（R值）和显着性（P），并使用简单的线性回归模型生成拟合线。
评估用毒力抑制剂处理的铜绿假单胞菌中的外排泵表达与运动表型之间的联系
明尼苏达州明尼阿波利斯市宜人街207号的化学系 321 11 Church St SE, Minneapolis, Minnesota, United States of America 12 13 d Department of Medicinal Chemistry, University of Minnesota, 208 Harvard Street SE, 14 Minneapolis, Minnesota 55454, United States of America 15 16 e Department of Pharmacology, University of Minnesota, 321 Church St SE, Minneapolis, 17 Minnesota, United States of America 18 19 * Corresponding author 20
丁香假单胞菌和柔软腐烂的果皮细菌种群的比较丰度和多样性在整个Durance河流集水区中从其法国阿尔卑斯山到其delta
河流，小溪，溪流是在将源头与插座连接起来的土地覆盖物中发生的生物，化学和物理过程的集成商。在流域中人类和动物病原体的动态已在各种情况下进行了广泛研究，从而优化了疾病风险的降低。并行，有一种新兴的意识，即可能还可以通过地表水传播作物病原体，尤其是在用于灌溉时。但是，在整个过程中，没有关于潜在的植物病原体存在的程度 - 也没有关于其动态的程度。在这里，我们比较了假单胞菌（PSY）和软腐烂的果皮杆菌（SRP）种群的季节性动态，沿着Durance River的270公里，从上游高山河（Alpestream Alpine）到达了与Rhone河的下游农业生产区。在2016年和2017年秋季，冬季，春季和夏季在21个地点收集的168个样品中，在所有采样地点均检测到PSY菌株，在人口密度的156个样品中，在最高10 5细菌L -1的人口密度下都检测到PSY菌株。相比之下，在98个样品中检测到SRP菌株，主要来自河的南部，人口密度不超过3´10 4细菌L -1。在每个采样位点表征的生物学和化学参数中，温度是唯一解释了两个物种复合物种群大小的可变性的唯一因素。PSY密度随温度升高而降低，而SRP密度随温度升高而增加。SRP的河流种群主要由多功能胸膜杆菌和水生假子组成，它们的流行病学重要性鲜为人知。仅观察到少数几个因其流行病学影响而被称为其流行病学影响的果蝇菌株。相比之下，所有地点的PSY种群都是由从其他研究中以广泛宿主范围及其地理和栖息地无处不在的遗传谱系为主的。我们的观察结果表明，可以利用对SRP的河水进行监视来发出诊断和管理反应，以避免疾病爆发。相反，由于这组细菌，由于没有规则和广泛的疾病暴发，整个集水区的持续存在表明，监视应集中在土地使用，河水条件和农艺学实践的未来变化上，这些实践可能会破坏当前在检查中持Psy暴发的机制。
从尼日利亚纳萨拉瓦州的人类肠道微生物组中分离出的假单胞菌的元基因组组装基因组
尼日利亚纳萨拉瓦州卡鲁大学科学学院生物化学系，尼日利亚纳萨拉瓦州，与：oluchukukwu.anunobi@binghamuni.edu.edu.ng; 07034439524; ORCID: 0000-0003-2047-5313 Abstract: The metagenome-assembled genome (MAG) sequences of Pseudomonas putida PP14A and PP20A were obtained by metagenomic sequencing from the gut microbiomes of a female and a male patient both 24 years old from the same household presenting to a health outreach laboratory with complaint of headache, and occasional diarrhoea in尼日利亚纳萨拉瓦州马拉拉巴。 两个PP MAG之间观察到的系统发育关系与其他假单胞菌SPP MAG之间观察到了从人类的人类活动和迁移到pseudomonas putida的全球传播。 关键字：假单胞菌，元基因组组装的基因组，肠道微生物组，毒力，系统发育，2024年6月12日获得；修订（加快）2024年6月17日； 2024年6月24日接受版权2024 AJCEM开放访问。 本文根据创意共享损耗4.0国际许可证 主编：S。S. Taiwo教授尼日利亚纳萨拉瓦州卡鲁大学科学学院生物化学系，尼日利亚纳萨拉瓦州，与：oluchukukwu.anunobi@binghamuni.edu.edu.ng; 07034439524; ORCID: 0000-0003-2047-5313 Abstract: The metagenome-assembled genome (MAG) sequences of Pseudomonas putida PP14A and PP20A were obtained by metagenomic sequencing from the gut microbiomes of a female and a male patient both 24 years old from the same household presenting to a health outreach laboratory with complaint of headache, and occasional diarrhoea in尼日利亚纳萨拉瓦州马拉拉巴。两个PP MAG之间观察到的系统发育关系与其他假单胞菌SPP MAG之间观察到了从人类的人类活动和迁移到pseudomonas putida的全球传播。关键字：假单胞菌，元基因组组装的基因组，肠道微生物组，毒力，系统发育，2024年6月12日获得；修订（加快）2024年6月17日； 2024年6月24日接受版权2024 AJCEM开放访问。本文根据创意共享损耗4.0国际许可证 主编：S。S. Taiwo教授主编：S。S. Taiwo教授
使用2元组语言Q-Rung Orthopair模糊集和Schweizer-Sklar加权电源平均操作员
结果：在本研究中，假单胞菌属，20EI1能够降低黄曲霉的生长。此外，我们确定这种生长抑制是铁的。此外，假单胞菌20EI1减少或阻断了黄曲霉毒素的产生，以及环皮二唑酸和曲酸。在细菌的存在下改变了铁相关基因的表达，而参与产生黄曲霉毒素的基因被下调。铁补充部分重新建立了它们的表达。细菌还降低了其他继发代谢产物（SM）基因的表达，包括参与环皮二唑酸，曲酸和imizoquin生物合成的簇的基因，而聚类的基因与曲霉菌素相对应。有趣的是，全局SM调节基因MTFA被20EI1显着上调，这可能有助于观察到的SM发生变化。
定量蛋白质组学揭示了麦芽盐的甘露糖诱导铁的应力反应，并降低了铜绿假单胞菌的群体感应
摘要基于凝胶剂的药物已被重新定义为抗菌治疗候选物，并显示出对抗药性病原体的替代治疗选择的巨大潜力。凝固膜的活性（Ga 3+）是其与铁铁（Fe 3+）的化学相似性，并取代了铁依赖性途径。ga 3+在典型的生理环境中是氧化还原性的，因此使铁代谢对细菌生长至关重要。麦芽盐（GAM）是一种众所周知的凝胶水溶性配方，由中央凝胶阳离子组成，该中央凝胶配位与三个麦芽糖配体配位，[GA（Maltol -1H）3]。这项研究实施了一种无标记的定量蛋白质组学方法，以观察GAM对细菌病原体Pseudomonas铜绿菌的影响。将铁替换为镀具有模拟铁限值的反应，如与铁采集和储存相关的蛋白质的增加所示。还发现了与法定感应和蜂群运动相关的蛋白质的丰度。这些过程是细菌毒力和传播的基本组成部分，因此暗示了GAM在治疗铜绿假单胞菌感染中的潜在作用。
通过分析孟加拉国旅行者的密集微生物时间序列数据预测的人类肠道细菌之间的生态关系
图2。用于这些研究的大肠杆菌生物孢子菌株的一般示意图和初始表征。A.LASR活性的大肠杆菌生物孢子蛋白生物孢子蛋白具有质粒PSC11-L，具有LASR诱导的P LASI启动子，融合到LACZ Reporter和质粒PJN105-L和阿拉伯糖诱导的LASR中。该菌株响应3OC12 -HSL和0.4％阿拉伯糖产生β-半乳糖苷酶。3OC12-HSL诱导是剂量反应，半最大浓度为65 nm。B.大肠杆菌菌株组成型表达LACZ的质粒PVT19与融合到本构APHA-3启动子的LACZ。在存在或不存在3OC12 -HSL的情况下，该菌株会产生β-半乳糖苷酶。结果是两个（a）或三（b）独立实验的平均值，误差线代表标准偏差。