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定量蛋白质组学揭示了麦芽盐的甘露糖诱导铁的应力反应，并降低了铜绿假单胞菌的群体感应
摘要基于凝胶剂的药物已被重新定义为抗菌治疗候选物，并显示出对抗药性病原体的替代治疗选择的巨大潜力。凝固膜的活性（Ga 3+）是其与铁铁（Fe 3+）的化学相似性，并取代了铁依赖性途径。ga 3+在典型的生理环境中是氧化还原性的，因此使铁代谢对细菌生长至关重要。麦芽盐（GAM）是一种众所周知的凝胶水溶性配方，由中央凝胶阳离子组成，该中央凝胶配位与三个麦芽糖配体配位，[GA（Maltol -1H）3]。这项研究实施了一种无标记的定量蛋白质组学方法，以观察GAM对细菌病原体Pseudomonas铜绿菌的影响。将铁替换为镀具有模拟铁限值的反应，如与铁采集和储存相关的蛋白质的增加所示。还发现了与法定感应和蜂群运动相关的蛋白质的丰度。这些过程是细菌毒力和传播的基本组成部分，因此暗示了GAM在治疗铜绿假单胞菌感染中的潜在作用。
土壤结构对荧光荧光在微观>的土壤中蔓延的影响
土壤微生物与土壤中发生的许多过程密切相关，包括向植物供应养分，通过生长激素的产生来刺激植物的生长，控制植物病原体的活性，维持土壤结构的活性，并促进无机污染物的浸出和矿物质污染物的矿物质（beave and in。 2000; Hayat，Ali，Amara，Khalid和Ahmed，2010年；这些微生物社区具有巨大的新陈代谢和生理性质，这使它们能够在土壤环境中生活，适应和扩散，这些土壤环境也表现出极高的结构和化学异性恋（Madigan，Clark，Clark，Stahl，Stahl，＆Martinko，2010年）。尽管在肥沃的土壤中细菌丰度较高，但细菌仅占土壤表面的一小部分（Young，Crawford，Nunan，Otten，Otten和Spiers，2008年）。在土壤中，微生物倾向于聚集（Ekschmitt，Liu，Vetter，Fox和Wolters，2005年），在非常小的土壤中形成微生物热点（<1 cm 3）。在评论中，Kuzyakov和Blagodatskaya（2015）认为，大多数生物地球化学过程都在这些热点中进行。这种热点本质上是短暂的，并且来自物理，化学和微生物过程之间的复杂相互作用。这种活动热点的例子包括根际，碎屑和土壤骨料表面。微生物活性的热点不存在。上述过程需要各种条件的托管。在这些热点示例中，根际是最动态的，热点持续日子，而与土壤结构相关的热点可以更持久，并且可以持续几个月。土壤孔在形成诸如土壤结构之类的热点的形成中起着重要作用，形成了相互联系的网络，通过该网络，包括氧的扩散，酶的运输以及分离的有机物，细菌的迁移率和细菌之间的相互作用。许多研究人员在微生物量表上观察到细菌分布中的空间模式（Kizungu等，2001; Nunan，Wu，Young，Crawford，＆Ritz，2003;VieubléGonod，Chadoeuf，Chadoeuf和Chenu，＆Chenu，2006年）。，例如VieubléGonod等。（2006）观察到土壤中2,4-D（2,4二氯苯氧基酸）的矿化的异质模式，从田间到微栖息地量表时的可变性增加。
HER2 特异性假单胞菌外毒素 A PE25...
1 KTH 皇家理工学院蛋白质科学系，Roslagstullsbacken 21, 114 17 斯德哥尔摩，瑞典； haozhong@kth.se（高清）； wenyin@kth.se (WY); slindbo@kth.se (SL); haoliu2@kth.se (HL); sophia@kth.se (SH) 2 肿瘤学和病理学系，Barngatan 4，隆德大学，222 42 隆德，瑞典； mohamed.altai@med.lu.se 3 免疫学、遗传学和病理学系，Dag Hammarskjölds väg 20，乌普萨拉大学，751 85 乌普萨拉，瑞典； javad.garousi@igp.uu.se (JG); tianqi.xu@igp.uu.se（德克萨斯州）； vladimir.tolmachev@igp.uu.se (VT) 4 药物化学系，达格·哈马舍尔兹街 14C；乌普萨拉大学，751 23 乌普萨拉，瑞典；anna.orlova@ilk.uu.se 5 肿瘤治疗学研究中心，托木斯克理工大学化学与应用生物医学科学研究院，634050 托木斯克，俄罗斯* 通讯地址：torbjorn@kth.se；电话：+ 46-(0)8-790-9627 † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。
通过热诱导 ssDNA 重组技术对假单胞菌进行高效多位点基因组编辑
单链 DNA 重组工程在肠道细菌以外物种的基因组编辑中的应用受到重组酶效率和内源性错配修复 (MMR) 系统作用的限制。在这项工作中，我们建立了一个遗传系统，用于在生物技术相关菌株 EM42 的染色体中输入多种变化。为此，设计了 PL / c I857 系统的控制下，rec2 重组酶和 P. putida 的等位基因 mutL E36K PP 的高水平热诱导共转录。短时间热转移循环，然后用一套诱变寡核苷酸进行转化，可产生不同类型的基因组变化，每次修饰的频率高达 10%。相同的方法有助于超级多样化短染色体部分，以创建功能性基因组片段文库——例如核糖体结合位点。这些结果使得假单胞菌基因组工程的多重化成为可能，这是这种重要合成生物学底盘代谢重编程所必需的。
假单胞菌属中甘油利用的生物化学、遗传学和生物技术
使用可再生废物原料是一种环境友好型选择，有助于降低废物处理成本并提高工业副产品的经济价值。甘油（1,2,3-丙三醇）是一种简单的多元醇化合物，广泛分布于生物系统中，是生物过程中相对便宜且易得的底物的主要例子。甘油被广泛用作食品和制药工业的成分，也是生物柴油生产的主要副产品，这导致底物价格多年来逐渐下降。因此，甘油已成为生物技术中一种有吸引力的底物，目前从石油中生产的几种化学商品已被证明是使用野生型和工程菌株的全细胞生物催化剂从这种多元醇中获得的。具有多功能和丰富代谢的假单胞菌种已被用于
具有异型的全细胞筛选方法
由于其直接电子传输到电极的能力，稀土金属作为辅因子的利用及其周质定位，吡咯烷二酚奎诺酮依赖性的醇dehydroge- nases（pqqq-adhs）代表了一类有趣的生物催化剂，用于各种生物技术应用程序。对于大多数生物催化剂而言，蛋白质稳定性是库的，要么在给定的过程条件下提高蛋白质的性能，要么最大程度地提高蛋白质对突变操纵的鲁棒性，通常需要增强或引入感兴趣的功能。在这项研究中，我们描述了一个全细胞筛选测定法，适用于探测Escherichia Coli BL21（DE3）细胞中的PQQ-ADH活动，并使用此测定法筛选智能突变库，以提高PQQ-ADH PEDE的热稳定性（PP_2674）（PP_2674）（ppseudomonas putida putida ktida KT22440）。在连续三轮筛选时，我们确定了三个不同的氨基酸位置，这显着改善了酶的稳定性。The subsequent combination of the bene fi cial mutations fi nally results in the triple mutant R91D/ E408P/N410K, which not only exhibits a 7 ° C increase in thermal stability but also a twofold increase in residual activity upon incubation with up to 50% dimethyl sulfoxide (DMSO), while showing no signi fi - cant difference in enzymatic ef fi ciency ( k cat / k m）。
假单胞菌天冬酰胺培养基
娱乐用水（例如游泳池中的水）是容纳结构的水体。令人担忧的微生物是那些引起耳部、皮肤和上呼吸道等感染的微生物。铜绿假单胞菌是占游泳池相关疾病很大比例的微生物之一。建议使用天冬酰胺培养基对水进行微生物分析。假单胞菌天冬酰胺肉汤是铜绿假单胞菌的极佳增菌培养基，因为它由矿物质基质组成，唯一的碳源是天冬酰胺。它还用于娱乐用水微生物分析的多管技术。假单胞菌天冬酰胺肉汤按照 APHA (1) 的建议配制，用于从娱乐或天然水中推定检测铜绿假单胞菌。假单胞菌天冬酰胺肉汤培养基是一种相对简单的培养基，含有氨基酸 DL-天冬酰胺和两种盐磷酸二钾和硫酸镁。天冬酰胺是氨基酸和碳源，而磷酸盐和硫酸盐为铜绿假单胞菌的生长提供离子。磷酸二钾也有助于维持培养基的缓冲条件。该培养基只是铜绿假单胞菌的推定培养基，需要进一步的确认试验才能确定。对于五管