人类表皮生长因子2(HER2)表达的评估对于制定乳腺癌的精确治疗至关重要。HER2的常规评估是通过免疫组织化学技术(IHC)进行的,这非常昂贵。因此,我们首次生产了乳腺癌免疫组织化学(BCI)基准,试图将IHC数据直接与成对的苏木精(HE)染色图像合成。数据集包含4870个注册的图像对,涵盖了各种HER2表达水平。基于BCI,作为较小的贡献,我们进一步构建了一种金字塔PIX2PIX图像生成方法,它比其他当前流行算法更好地实现了IHC翻译结果。BCI的广泛实验对现有的Immig translation Research构成了新的挑战。此外,BCI还基于合成的IHC图像在HER2表达评估中为将来的病理研究打开了大门。BCI数据集可以从https://bupt-ai-cz.github下载。io/bci。
摘要 研究:AI 社会认知评估与建模。评估 LLM 中的心智理论及其在心理学中的应用 NLP:LLM IFT、表征学习(对比和三重态损失)、语义聚类、总结 DL:Transformers、MoE、EncDec、RNNs、DPO、LoRA 工具:Python、Pytorch、Deepspeed、AWS Sagemaker、hydra、SQL 管理:建立 ML 团队、职能、策略和 OKR、招聘和指导科学家和实习生以及建立数据和注释合作伙伴关系。
在此编码中,国家石油,天然气和生物燃料(ANP)的重新计划在提供有关巴西陆地盆地的全面数据方面起着至关重要的作用。根据Ferreira和Oliveira(2021)的说法,对这些数据的开放访问对于可以改变该行业的技术创新至关重要。这项研究使用与NOSQL数据库集成的Python和Typescript中开发的软件加深了此数据的处理,Melo和Santos(2020)(2020)将这种方法识别为对大型数据的有效管理必不可少的方法。
高光谱图像 (HSI) 分类旨在为每个像素分配一个唯一标签,以识别不同土地覆盖的类别。现有的 HSI 深度学习模型通常采用传统学习范式。作为新兴机器,量子计算机在嘈杂的中尺度量子 (NISQ) 时代受到限制。量子理论为设计深度学习模型提供了一种新的范式。受量子电路 (QC) 模型的启发,我们提出了一种受量子启发的光谱空间网络 (QSSN) 用于 HSI 特征提取。所提出的 QSSN 由相位预测模块 (PPM) 和受量子理论启发的类测量融合模块 (MFM) 组成,以动态融合光谱和空间信息。具体而言,QSSN 使用量子表示来表示 HSI 长方体,并使用 MFM 提取联合光谱空间特征。量子表示中使用了 HSI 长方体及其由 PPM 预测的相位。使用 QSSN 作为构建块,我们进一步提出了一种端到端的量子启发式光谱空间金字塔网络 (QSSPN),用于 HSI 特征提取和分类。在这个金字塔框架中,QSSPN 通过级联 QSSN 块逐步学习特征表示,并使用 softmax 分类器进行分类。这是首次尝试将量子理论引入 HSI 处理模型设计。在三个 HSI 数据集上进行了大量实验,以验证所提出的 QSSPN 框架相对于最新方法的优越性。
噬菌体FD,FL和OX174是已知的最小病毒之一。它们属于具有单链圆形DNA作为其遗传物质(1-4)的一组良好特征的副觉。他们的DNA的分子量约为2 x 106,仅包含有限数量的基因。fd和fl是丝状噬菌体,在血清学和遗传上相关。ox174是一个显然与丝状噬菌体无关的球形噬菌体。dev> deNhardt和Marvin(5)通过DNA-DNA杂交进行了表明,尽管这两种类型的噬菌体(即丝状和球形)在每种类型的DNA之间没有检测可检测的同源性,尽管在每种类型内部都有很高的同源性。最近,已经推出了一种相对较快的分馏和序列大嘧啶寡核苷酸的技术。已经确定了9-20个基碱残基的FD DNA中长嘧啶裂纹的序列(6)。在本报告中,提出了来自FL和OX174 DNA的大嘧啶产物的序列。将这些序列与先前从FD DNA获得的序列进行了比较。
要使用Pytorch中的数据增强,您将需要定义一组可以应用于培训数据的转换功能。您还需要确保将转换功能始终应用于输入图像和相应的注释。然后,您可以使用Torchvision.datasets.ObjectDetectionDataSet类使用批次的方式,将这些转换应用于培训数据。
“扩展的能源支持是实施项目的关键安全。这确保了一部分资金,并使我们能够全力推动完成总资金的工作。在新条件下,我们可以更确定地推动项目向前推进,这也可以使我们与外部金融家进行的持续对话建立稳定和信任。支持的范围清楚地说明了芬兰政府在Sens的“核心业务 - 可持续能源系统的设计和开发”中进行的投资,” Sens。
•在Fortran中复制一个网络,以使用Pytorch开发的模型,并仅使用Fortran重新实现它,从而从文件中加载了节省的权重。这可能需要大量的开发工作,重写已经存在的代码,以及缺少使用Torch的多样化和高度优化功能的机会。重新实施可能是错误的来源,需要其他测试以确保正确性。如果总体目标是将ML纳入Fortran,而不是使用Pytorch特定,那么另一种方法是利用基于Fortran的ML框架(例如Neural-Fortran)(Curcic,2019)。尽管它不允许与Pytorch相互作用,但神经fortran提供了许多直接在Fortran中建造网的神经网络组件。但是,一组功能并不像Pytorch那样丰富,而GPU卸载目前不受支持。目前,菲亚斯(Rouson&Rasmussen,2024年)库是直接在Fortran中开发,培训和部署ML模型的另一种方法,目前是实验性GPU支持。
1。生物信息学解决方案中心,InstitutfürMathematikund Informatik,FreieUniversität柏林,Takustr。9,14195柏林,德国2。生物和地球科学研究所(IBG-5),ForschungszentrumJülichGmbH,52428Jülich,德国3。美国加利福尼亚州斯坦福大学斯坦福大学医学院医学系4。根特大学医学与健康科学系生物分子医学系VIB-UCENT医学生物技术中心,VIB,TechnologiePark-Zwijnaarde 75,9052 Ghent,Belgium 6。欧洲分子生物学实验室,EMBL-欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI),欣克斯顿,剑桥,CB10 1SD,英国7。欧洲衰老生物学研究所,大学医学中心格罗宁根,9713 AV Groningen,荷兰8。安特卫普大学计算机科学系,2020年,比利时安特卫彭
我们引入了Inmoose,这是一种旨在OMIC数据分析的开源Python环境。我们说明了其批量转录组数据分析的功能。由于其广泛的采用,Python在对生物信息学管道(例如数据科学,机器学习或人工智能(AI))中越来越重要的领域中已成为一种事实上的标准。作为一种通用语言,Python的多功能性和可扩展性也被认可。Inmoose旨在将历史上用R的最先进的工具带入Python生态系统。我们的目的是为R工具提供替换,因此我们的方法专注于对原始工具成果的忠诚。第一个开发阶段集中于批量转录组数据,当前功能包括数据模拟,批处理效应校正以及差分分析和荟萃分析。