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hamilton ngs ngs star v
生物学资格结果通过准备NGS库来评估hamilton ngs Star V上的Qiagen QiaSeq FX DNA方法的性能，并使用QIASEQ FX FX DNA库套件具有重复性，以下是不同的样品Buffer EB。进行了三种生物运行；两个使用大肠杆菌gDNA（DH10B）和QIASEQ珠或Agencourt Ampure XP珠（包括1个阴性对照）和一个使用Microbial社区组成ATCC MSA-1003（20个菌株），ATTC MSA-1001（10菌株）和E. Coli Gdna（dhsec）和QH10B（DH10B）（包括12个菌株）（包括12个菌株）和QASE（dhsseq）（QIACE）（QIACE），使用了八个样品，其中有八个样品和QIASEQ珠子或QIASEQ珠子或Agencourt Ampure XP珠（包括1个阴性对照）。在运行期间施加了10分钟的碎片时间和七个PCR周期。用于文库制备的生物学资格，用定量1x DSDNA HS分析套件确定最终文库浓度。随后，八样本运行的所有库的库大小分布，
Qiagen QiaSeq的自动化目标DNA Pro面板在汉密尔顿NGS STAR MOA上生成针对目标的下一代SEQ
生物学资格结果，以评估NGS星MOA上QIASEQ靶向DNA Pro面板方法的生物学性能，使用带有4110引物的自定义面板执行了96个人类基因组DNA样品的库制备。作为输入DNA，使用了五个不同的基因型，每个基因型都使用了两个不同的输入量（10 ng和40 ng）（请参阅应用注释末尾的方法要求）。使用8个PCR循环进行了运行，以实现靶富集，并为25个PCR循环进行通用PCR。DNA浓度和总产率，该运行具有Quant-IT 1X DSDNA HS HS分析套件。使用具有高敏感性D5000试剂的高敏性D5000屏幕截图，用Agilent Tapestation 4150对图书馆DNA的尺寸分布进行了MEA（表1）。
比较 QIAseq 肿瘤突变负担面板中的 TMB 评分和 MSI 状态
此外，DHS-8800Z QIAseq Targeted DNA panel 涵盖了可用于推断微卫星不稳定性状态的有用基因位点。该状态测量几个微卫星基因位点长度分布的统计变化，并将测试样本的统计变化与正常样本基线（包含在 QIAGEN 参考数据集中，可在 Workbench 中下载）进行比较。如果不稳定性微卫星基因位点的比例高于预定义阈值，则认为样本不稳定。许多 MSI-High 肿瘤患者对免疫疗法产生了积极的反应。此外，美国食品药品监督管理局 (FDA) 已加速批准 pembrolizumab 用于治疗微卫星不稳定性 (MSI)-High 的儿童和成人患者，这使其成为首个获批用于治疗具有这种生物标志物的实体瘤的药物，无论肿瘤来源如何 [ Chang et al., 2018 ]。
DPCR微生物DNA检测测定法和自定义DPCR微生物测定法包括
此概况说明了我们的Go Greener计划中的产品包含。该程序标识了Qiagen投资组合中的产品，这些产品与我们的传统产品相比更加环保。与标准面板相比，QIASEQ靶向DNA Pro面板通过切割移液步骤减少塑料废物，从而减少了需要减少68％的移液器尖端。所需的试剂数量也较低，尤其是对于索引板，它已经从两个单独的板转变为一个具有独特双索引（UDIS）的单个板。面板的稳定性有所改善，从7个月的保质期提高到12个月。
QIAseq® xHYB 病毒和细菌文库试剂盒手册
套件内容................................................................................................................ 4
QIASEQ®目标DNA Pro手册
†索引引物板（QUDI-96AA，QUDI-96BA，QUDI-96CA，QUDI-96DA QUDI-96EA，QUDI-96FA，QUDI-96FA，QUDI-96GA，QUDI-96HA）;每个板包含96对样品指数引物加上通用引物，每个板均与一对UDI样品指数相对应。每个索引都是一次使用。
超有效的自动化整个基因组测序：使用QIASEQ®FXDNA库套件和Qiaseq®normalizer套件的图书馆准备工作流程
图5。QIASEQ归一化器从具有不同输入DNA浓度的样品批次产生可重复的，归一化的DNA文库。为了证明这一点，我们创建了一批24个样本的e.coli DNA，范围为10至100 ng输入（CV = 64.67％）。我们使用QIASEQ FX PLUS QIASEQ归一化器（Workflow B）处理了样品，在库准备后，我们在归一化之前和之后删除了等分试样。归一化器产生的文库具有适当的测序浓度（平均1.8 ng/μl）和库浓度降低（CV从33.85％降低至13.53％）。
QIASEQ®珠，用于使用NGS的高质量DNA纯化...
图3。水溶液中珠与DNA比对碎片恢复的影响。 为了确定不同的珠与DNA比对DNA片段尺寸选择的影响，将DNA尺寸梯子稀释至总体积为50 µL，并与各种体积的QIASEQ珠子从25 µL（0.5倍）到75 µL（1.5x）孵育。 在室温下DNA结合5分钟后，将管子放在磁性台上，再将溶液清除为止。 接下来，将上清液丢弃，并用200 µl 80％乙醇洗涤两次珠子。 在最终的乙醇洗涤后，除去上清液并将磁珠完全干燥。 将沉淀在6 µL缓冲液EB中洗脱。 在Agilent生物分析仪高灵敏度芯片上分析了等分试样（1 µL）以及未覆盖的尺寸梯子（参考阶梯）。 （a）片段定量。 （b）片段分布的百分比与参考相比。水溶液中珠与DNA比对碎片恢复的影响。为了确定不同的珠与DNA比对DNA片段尺寸选择的影响，将DNA尺寸梯子稀释至总体积为50 µL，并与各种体积的QIASEQ珠子从25 µL（0.5倍）到75 µL（1.5x）孵育。在室温下DNA结合5分钟后，将管子放在磁性台上，再将溶液清除为止。接下来，将上清液丢弃，并用200 µl 80％乙醇洗涤两次珠子。在最终的乙醇洗涤后，除去上清液并将磁珠完全干燥。将沉淀在6 µL缓冲液EB中洗脱。在Agilent生物分析仪高灵敏度芯片上分析了等分试样（1 µL）以及未覆盖的尺寸梯子（参考阶梯）。（a）片段定量。（b）片段分布的百分比与参考相比。
QIAGEN QIAseq FX DNA 文库试剂盒的自动化...
简介 文库制备是新一代测序 (NGS) 应用的关键要求，也是测序工作流程中最昂贵的部分之一。这不仅是一个耗时的步骤，而且还可能由于操作错误导致样本丢失或输出文库 DNA 质量下降。为了减少这些问题，简化的 QIAseq FX DNA 文库协议经过优化，可在酶促碎裂后直接进行接头连接，而无需中间清理步骤。此外，简单的协议（仅包含三个步骤）可确保在 Hamilton NGS STARlet 上顺利完成高优先级样本和低通量样本数量的文库制备自动化（图 1）。