目前,使用猪污染的食物成分和或加工食品已成为当前的关注和加强问题。这种情况鼓励开发准确的方法,以特别检测猪污染的存在。本研究使用两种样品:(1)新鲜猪肉作为阳性内部控制和(2)用猪肉(碎肉,肉丸,咸牛肉和香肠)制成的加工肉类产品,这些产品使用DNA标记进行了测试。使用猪肉处理的样品是确定加工对DNA片段的影响,并在所使用的检测过程中测试提取方法的刚性。本研究旨在使用定量聚合酶链反应(QPCR)方法检测猪DNA片段。研究首先使用RNA提取试剂盒,DNA提取试剂盒和盐提取方法提取新鲜的猪肉和加工产品,然后使用分光光度计测量DNA/RNA的纯度和浓度。RNA提取物被转化为互补DNA(cDNA),并与使用QPCR分析的DNA提取物(SUS SCROFA)。结果表明,获得的RNA和DNA提取物的浓度为71.1-296,025 ng/ul,纯度不同。在CT 23-28 ng/ul范围内,所有加工产品和阳性内部的样品都是放大的对照,在这种情况下,肉的加工不会影响分析的加工产品的DNA,因此可以检测到DNA片段。关键字:beta aktin,循环阈值,新鲜猪肉,DNA猪肉,qpcrqPCR DNA在工作时间上比cDNA qPCR更有效,因为它不需要RNA的转录阶段。
摘要。随着基因和细胞治疗产品数量的不断增加,分子技术在生物分析实验室中的应用也变得越来越普遍。目前,这些技术尚无生物分析监管指南,合同研究组织依赖科学判断和最佳实践来执行这项工作,以符合 GxP 要求,用于支持生物分布和载体脱落的临床前和临床研究。本文介绍了定量聚合酶链反应 (qPCR) 和数字 PCR (dPCR) 检测的开发和验证过程和原理,如 2021 年 AAPS 为期两天的 qPCR 协调研讨会上所述。本文的范围包括利用这些技术的生物分析验证参数和验收标准。此外,本文还将重点介绍这些分子技术的优缺点,并说明应避免的常见陷阱。本文旨在提供最佳实践、工作建议和促进未来的监管指导。
定量 PCR (qPCR) 和数字 PCR (dPCR) 用于定量生物样本中的特定核酸。这两种技术都适用于许多应用,但在从通量到灵敏度等许多方面存在差异。那么,哪种方法更适合您的实验室应用呢?
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它是在预印本(未经同行评审认证)下提供的,作者/资助者已授予 bioRxiv 许可,可以在该版本中显示预印本。此版本的版权持有者于 2021 年 8 月 25 日发布。;https://doi.org/10.1101/2021.08.21.457202 doi:bioRxiv 预印本
如果您的样本产生了强劲的阳性结果,则数据解释不需要内部提取控制,并且可以忽略。如果您的样品产生了负结果,则内部提取控制对于解释结果很有用。内部提取控制中的CQ值会根据样品中的DNA量而有所不同。晚期信号(CQ> 28)表明您的样品中只有少量的宿主衍生DNA。您可能希望重复样本收集,然后重复测试以确认负面结果。
##生成模拟数据集##生成回归观察y <-mass :: mvrnorm(n = 1,mu = ant + nat,sigma = cov)##生成强迫响应mruns <-c(1,1,1,1,1) mass :: mvrnorm(n = 1,mu = nat,sigma = cov / mruns [2]))##控制运行ctlruns <-mass <-mass :: mvrnorm(100,mu = rep = rep(0,nrow(cov)),sigma = cov cov ctlruns.sigma for Point和ctlar estions.s.s.s.s. ctlruns.sigma <-ctlruns.bhvar <-ctlruns ##位置数s <-25 ##年度步骤t <-10
摘要 丛枝菌根真菌 (AMF) 是一种有益的土壤真菌,可以促进宿主植物的生长。准确量化植物根部中的 AMF 非常重要,因为定植水平通常可以表明这些真菌的活性。根定植传统上用显微镜方法测量,该方法可以看到根内的真菌结构。显微镜方法劳动密集型,结果取决于观察者。在本研究中,我们提出了一种相对 qPCR 方法来量化 AMF,其中我们根据植物基因标准化了 AMF qPCR 信号。首先,我们在计算机上验证了引物对 AMG1F 和 AM1,并表明这些引物涵盖了植物根部存在的大多数 AMF 物种,而不会扩增宿主 DNA。接下来,我们基于对矮牵牛植物的温室实验将相对 qPCR 方法与传统显微镜检查进行了比较,这些植物的 AMF 根定植水平从非常高到非常低不等。最后,通过使用 MiSeq 对 qPCR 扩增子进行测序,我们通过实验证实引物对排除了植物 DNA,而主要扩增了 AMF。最重要的是,我们的相对 qPCR 方法能够区分 AMF 根定植的定量差异,并且与传统显微镜定量结果高度相关(Spearman Rho = 0.875)。最后,我们对显微镜和 qPCR 方法的优缺点进行了平衡的讨论。总之,测试的相对 qPCR 方法提供了一种可靠的替代方法来量化 AMF 根定植,与传统显微镜相比,该方法对操作员的依赖性更低,并且可扩展到高通量分析。
9.6如果样品为负,但抑制控制表现出ΔCT≥3,则可能会抑制qPCR反应。在表格22208-05的注释部分中指出这一点,然后重新纯化并重新测试样本。如果样品是支原体阳性的,但抑制控制表现为ΔCT≥3,则该样品据报道为支原体阳性。在22208-05的评论部分中指示此结果。
可风干血液直扩 RNA/DNA qPCR 预混液采用蓝冰运输。到货后储存于 -20°C 下,以获得 最佳稳定性。应避免反复冻融循环。运输过程中解冻不影响产品性能。每次解冻后应混合 / 平衡溶液 以避免分相。 有效期: 在外包装盒标签上的有效期内,在推荐条件下储存并正确处理时,试剂盒可保持完整活性。 安全预防措施: 处理试剂前请阅读并理解 SDS (安全数据表)。首次发货时提供 SDS 的纸质版文件,此后可应要求提 供。 质量控制: Meridian 遵守 ISO 13485 质量管理体系运行。 Air-Dryable