这一最新添加反映了该公司对增强其生物信息学数据基础设施的持续承诺,从而使倡议扩大了澳大利亚/亚洲太平洋地区(Apac)地区的生物信息学产品的范围和使用 - 该地区包括澳大利亚,新西兰,新几内亚和周围的澳大利亚,新西兰和周围的岛屿。
图 3. 已发布的 CDS 轨道(顶部)、从头创建的 QIAGEN CLC Genomics Workbench 注释(2 个 CDS)和包含三个 CDS 的合并轨道的可视化。底部轨道是 QIAGEN CLC Genomics Workbench 预测转录本的读取映射支持。
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注意:主混合物应在指定的“洁净室”区域制备,并且切勿将提取液/模板带入“洁净室”。主混合物制备完成后,在制备主混合物的洁净罩中,或在打开 DNA/RNA 模板(脏)罩中的 DNA 模板(提取的样本)之前,向每个 PCR 反应管中添加 20 或 45 或 90μl 主混合物。
本应用说明介绍了使用 QIAGEN CLC Genomics Workbench 进行质体组装的三种不同工作流程。工具和工作流程的选择取决于目标物种中质体的结构以及测序数据的类型。组装具有长 IR 的质体需要足够长的读取以跨越重复。这种长读取通常保真度较低,组装需要完善。组装没有长 IR 的质体可以使用“较短”的高保真长读取来实现,并且不需要重叠群完善。我们强调的另一个步骤是在组装质体之前减少 NGS 数据集。我们描述了从全基因组测序数据中预选和不预选叶绿体读取的不同从头组装工作流程。
研究人员还可以使用 QIAseq 多模态 DNA/RNA 文库试剂盒生成仅含 DNA 或仅含 RNA 的文库。这是市场上第一款可兼容多种输入样本的 NGS 多模态试剂盒,包括血液、福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本和无细胞 DNA (cfDNA)。这在转化研究中尤其重要,例如在癌症研究中,可能会有不同类型的样本。该试剂盒灵敏度高,可检测 DNA 和 RNA 稀有变异。使用 QIAseq 多模态 DNA/RNA 文库试剂盒生成的 DNA 和 RNA 文库可直接与不同的测序平台兼容,例如 Illumina 仪器和 Element Aviti,并且可以通过增加转换步骤在其他测序仪上进行测序(Complete Genomics/MGI、Singular Genomics 和 Ultima Genomics)。
Qiagen的一个健康微生物中心行业的实习生是您对微生物组科学,生物技术的热情以及探索行业职业的渴望的高级研究生?一个健康微生物组中心兴奋地宣布,研究生候选人有一个非凡的机会,可以与Qiagen申请行业实习,Qiagen是全球领先的样本和分子诊断,应用测试和学术研究的分析技术的提供商。实习生将(i)在一家领先的生物技术公司中获得动手实践经验,(ii)在分子诊断,测试和测定领域的实力项目方面的工作,(iii)与行业专家和科学家合作,(iii)(iii)(iv)与Microbiobome Biotechnology of Microbiome Biotechnology consectionals consectionals consectionals consectionals consections consectionals consectionals consectionals secterants cessectionals cessect。实习详细信息:
大肠杆菌DNA污染单元测试了N/A N/A 100 100 100规格> 99%13,333 U/mg功能性功能性NO conversion <10份蛋白质来源:重组大肠杆菌菌株,携带毒液T7基因5和E. coli trxa基因。单位定义:1个单位定义为将10 nmol的总DNTPS转换为酸不溶性材料所需的聚合酶量,在37°C下30分钟内。分子量:92.1 KDA质量控制分析:使用2倍连续稀释方法测量单位活动。稀释酶,并将其添加到含有小腿胸腺DNA,1x T7 DNA聚合酶单位表征缓冲液(20 mM Tris-HCl,100 mm KCl,6 mM MGCL,6 mM MGCL 2,6mmmmmgcl 2,0.1 mm EDTA,5 mmβ-MMβ-MERCAPTOETOETHANANOL),3 H-DTT的反应中,3 H-DTT,在37°C下孵育10分钟,浸入冰上,并使用Sambrook和Russell的方法进行分析(6)。蛋白浓度(OD 280)由OD 280吸光度确定。物理纯度,然后进行银色染色检测。通过比较浓缩样品中污染物带的聚集质量与稀释样品中蛋白蛋白蛋白带的质量来评估纯度。单链核酸酶在含有放射性标记的单链DNA底物的50 µL反应中确定,在37°C下孵育4小时4小时。双链外切核酸酶在50 µL反应中确定,该反应含有放射性标记的双链DNA底物和10 µL的酶溶液在37°C下孵育4小时。双链核酸内切酶在50 µL反应中确定,该反应含有0.5 µg质粒DNA和10 µL的酶溶液在37°C下孵育4小时。大肠杆菌16S rDNA的污染是使用5 µL r菌酸溶液的样品变性的样品,并在Taqman QPCR分析中筛选,以使用与16S rRNA locus相应的寡核苷酸引物,使用污染的大肠杆菌Genomic DNA。
生物学资格结果,以评估NGS星MOA上QIASEQ靶向DNA Pro面板方法的生物学性能,使用带有4110引物的自定义面板执行了96个人类基因组DNA样品的库制备。作为输入DNA,使用了五个不同的基因型,每个基因型都使用了两个不同的输入量(10 ng和40 ng)(请参阅应用注释末尾的方法要求)。使用8个PCR循环进行了运行,以实现靶富集,并为25个PCR循环进行通用PCR。DNA浓度和总产率,该运行具有Quant-IT 1X DSDNA HS HS分析套件。使用具有高敏感性D5000试剂的高敏性D5000屏幕截图,用Agilent Tapestation 4150对图书馆DNA的尺寸分布进行了MEA(表1)。